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人类胞内蛋白半衰期与其亚细胞定位的相关性研究 被引量:70
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作者 贾浩 张小白 宋晓峰 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期411-414,共4页
胞内蛋白的稳定性直接影响着生命活动与细胞周期。蛋白的选择性降解是通过泛素-蛋白酶体途径实现的,它是蛋白消亡的主要方式之一,同时也是细胞主动调节自身状态的体现。蛋白的稳定性除了与自身序列和结构相关外,还和成熟蛋白所处的细胞... 胞内蛋白的稳定性直接影响着生命活动与细胞周期。蛋白的选择性降解是通过泛素-蛋白酶体途径实现的,它是蛋白消亡的主要方式之一,同时也是细胞主动调节自身状态的体现。蛋白的稳定性除了与自身序列和结构相关外,还和成熟蛋白所处的细胞内环境,即蛋白的亚细胞定位有关。本文主要从蛋白质在细胞中的区域化分布角度研究其与蛋白寿命的关系。结合大量的蛋白半衰期实验数据以及生物信息数据库,文章统计并分析了每个蛋白的定位信息,并进一步研究了与定位有关的信号肽情况,以及应用F检验筛选出了部分能够显著区分长短寿命蛋白的N端序列特征。结果表明胞内蛋白半衰期与其亚细胞定位之间存在一定的关联性。短寿命蛋白往往定位于细胞膜或者膜性囊泡结构上,大多由信号肽引导定位,作为细胞的分泌蛋白、信号转导蛋白或者功能性蛋白发挥作用并迅速降解;而长寿命蛋白多数属于持家蛋白,定位于细胞胞浆中或直接在胞浆中合成,作为细胞骨架或者发挥着支撑细胞的作用。另外,蛋白的区域化分布影响着蛋白质的折叠、聚合以及翻译后修饰,这些过程与蛋白的稳定性有着密切的联系。本研究为将来蛋白稳定性的深入研究提供了新的思路,同时也为生物信息学中开发蛋白质稳定性相关的预测工具提供了参考。 展开更多
关键词 蛋白质半衰期 亚细胞定位 胞内蛋白选择性降解 信号肽
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ERK信号通路的信号转导调控机制 被引量:51
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作者 赵明哲 刘靖华 +1 位作者 李玉花 姜勇 《国际病理科学与临床杂志》 CAS 2009年第1期15-19,共5页
胞外信号调控激酶(ERK)是发现的第1个丝裂原活化蛋白激酶(MAPK),它调控多种重要的细胞生物学过程,包括细胞增殖、分化和凋亡等。ERK信号级联反应能够特异地介导广泛的生物学过程,其机制主要是通过信号的反馈调控,与支架蛋白的相互作用,... 胞外信号调控激酶(ERK)是发现的第1个丝裂原活化蛋白激酶(MAPK),它调控多种重要的细胞生物学过程,包括细胞增殖、分化和凋亡等。ERK信号级联反应能够特异地介导广泛的生物学过程,其机制主要是通过信号的反馈调控,与支架蛋白的相互作用,亚细胞定位的改变,在级联反应的每一个环节存在不同功能的多种组分,细胞内非磷酸酶抑制物和G蛋白等的调控实现的。 展开更多
关键词 激酶 亚细胞定位 支架蛋白 信号调控
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植物蛋白质的亚细胞定位研究进展 被引量:41
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作者 邢浩然 刘丽娟 刘国振 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2006年第B11期1-6,共6页
细胞是生命形式的基本组成单元,各种蛋白质按照其功能有序地分布在细胞的每个分区中。植物细胞的主要分区包括细胞膜和其他内膜系统、细胞核、细胞质以及位于其中的线粒体、叶绿体、高尔基体和内质网等各种细胞器。植物蛋白质的亚细胞... 细胞是生命形式的基本组成单元,各种蛋白质按照其功能有序地分布在细胞的每个分区中。植物细胞的主要分区包括细胞膜和其他内膜系统、细胞核、细胞质以及位于其中的线粒体、叶绿体、高尔基体和内质网等各种细胞器。植物蛋白质的亚细胞定位是功能基因组学的重要内容。主要的植物蛋白质亚细胞定位技术包括:融合报告基因定位法、免疫组织化学定位法、蛋白质组学定位技术以及共分离标记酶辅助定位法,而生物信息学预测也成为亚细胞定位研究的一种重要手段。高通量蛋白质亚细胞定位技术的发展和应用,为构建定位数据库积累了数据。在模式植物拟南芥中,有亚细胞定位信息的蛋白质已经超过4 000个。 展开更多
关键词 蛋白质 亚细胞定位 细胞分区 蛋白质组学 高通量
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蛋白质亚细胞定位的生物信息学研究 被引量:39
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作者 张松 黄波 +1 位作者 夏学峰 孙之荣 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第6期573-579,共7页
细胞中蛋白质合成后被转运到特定的细胞器中,只有转运到正确的部位才能参与细胞的各种生命活动,如果定位发生偏差,将会对细胞功能甚至生命产生重大影响.蛋白质的亚细胞定位是蛋白质功能研究的重要方面,也是生物信息学中的热点问题,数据... 细胞中蛋白质合成后被转运到特定的细胞器中,只有转运到正确的部位才能参与细胞的各种生命活动,如果定位发生偏差,将会对细胞功能甚至生命产生重大影响.蛋白质的亚细胞定位是蛋白质功能研究的重要方面,也是生物信息学中的热点问题,数据库的构建和亚细胞定位分析及预测加速了蛋白质结构和功能的研究. 展开更多
关键词 亚细胞定位 生物信息学 数据库 预测 蛋白质
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应用激光扫描共聚焦显微成像术研究光敏剂亚细胞定位 被引量:30
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作者 戴维德 王雷 +4 位作者 刘凡光 顾瑛 李晓松 丁新民 曾晶 《中国激光医学杂志》 CAS CSCD 2004年第1期12-17,共6页
目的应用激光扫描共聚焦显微成像系统及荧光定量分析方法,探讨血卟啉单甲醚(HMME)在靶细胞亚细胞结构中的精确定位及定量分析的可行性。方法将传代培养的鼠肺内皮细胞与HMME共同孵育24h。应用激光扫描共聚焦显微成像系统,选择特异性细... 目的应用激光扫描共聚焦显微成像系统及荧光定量分析方法,探讨血卟啉单甲醚(HMME)在靶细胞亚细胞结构中的精确定位及定量分析的可行性。方法将传代培养的鼠肺内皮细胞与HMME共同孵育24h。应用激光扫描共聚焦显微成像系统,选择特异性细胞器荧光探针若丹明(rhodamine)-123、荧光素黄(luciferyellow)、DiOC6(3)和BODIPY分别标记细胞内线粒体、溶酶体、内质网和高尔基体。采取不同的采集顺序激发染色细胞样品,通过预先设置的相应的发射滤光片分别采集细胞内HMME与细胞器探针的荧光图像。通过计算机图像处理,采用像素-荧光强度分析方法对光敏剂进行亚细胞定位。结果采用先激发探针后激发HMME的顺序,HMME及荧光探针的荧光强度及形态特征保持较好;细胞质与细胞核内HMME平均荧光光强差异有显著意义,前者是后者的2倍以上;HMME在4种细胞器区域平均荧光光强与细胞平均荧光光强(J1/J2)比值的差异有显著意义;随参数m的增高,HMME在4种细胞器区域J1/J2比值呈下降趋势。结论HMME在细胞内线粒体、溶酶体、内质网和高尔基体均有分布;应用激光共聚焦显微成像系统结合荧光定量分析法能对荧光效率极低的光敏剂进行精确的亚细胞定位及分布定量比较。 展开更多
关键词 激光扫描共聚焦显微成像术 光敏剂 亚细胞定位 荧光定量分析法
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砷超富集植物蜈蚣草中磷和钙的亚细胞分布及其与耐砷毒的关系 被引量:30
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作者 肖细元 廖晓勇 +4 位作者 陈同斌 阎秀兰 谢华 翟丽梅 武斌 《环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期954-961,共8页
为了在研究砷超富集植物蜈蚣草中磷和钙的亚细胞分布,并探讨其与蜈蚣草耐砷毒的关系进行了试验研究.结果表明,蜈蚣草吸收的磷主要分布在胞质组分中(平均占各部位总磷含量的44%以上),吸收的钙主要分布在细胞壁组分中(平均占各部位总钙含... 为了在研究砷超富集植物蜈蚣草中磷和钙的亚细胞分布,并探讨其与蜈蚣草耐砷毒的关系进行了试验研究.结果表明,蜈蚣草吸收的磷主要分布在胞质组分中(平均占各部位总磷含量的44%以上),吸收的钙主要分布在细胞壁组分中(平均占各部位总钙含量的48%以上).与低钙(0.03和2.5mmol·L-1)处理相比,高钙(5.0mmol·L-1)处理时,根部的胞质组分和叶柄的细胞器组分中磷含量较高.各器官的亚细胞组分中钙含量随着介质中添加钙浓度的提高而增加.介质钙浓度过高会抑制蜈蚣草的生长.在加砷处理下,根部和叶柄细胞壁组分的磷含量有所减少,但地上部细胞器组分的磷含量及其含磷总量占植株含磷总量的相对比例、根部细胞壁组分的钙含量增加.蜈蚣草自主调节磷和钙的亚细胞水平分布可能是其耐砷毒的机制之一. 展开更多
关键词 蜈蚣草 毒害 亚细胞定位
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植物脂肪氧化酶的研究进展 被引量:25
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作者 胡廷章 胡宗利 +2 位作者 屈霄霄 任彦荣 陈国平 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期1-9,共9页
植物脂肪氧化酶(LOX)是一个多基因家族,是由单一的多肽链组成的含有非血红素铁、不含硫的过氧化物酶。LOX催化具有顺,顺-1,4-戊二烯结构的多元不饱和脂肪酸的双加氧反应。植物中,不同脂肪氧化酶的最适pH、pI、底物和产物特异性、时空表... 植物脂肪氧化酶(LOX)是一个多基因家族,是由单一的多肽链组成的含有非血红素铁、不含硫的过氧化物酶。LOX催化具有顺,顺-1,4-戊二烯结构的多元不饱和脂肪酸的双加氧反应。植物中,不同脂肪氧化酶的最适pH、pI、底物和产物特异性、时空表达特性、亚细胞定位等存在差异。LOX参与的生理过程涉及损伤、病原攻击、种子萌芽、果实熟化、植物衰老、脱落酸和茉莉酸合成,LOX也在正常的植物生长和生殖生长过程中作为营养储藏蛋白,参与脂类迁移、响应营养胁迫、调节"源"与"库"的分配。对LOX家族的深入理解,将有助于LOX在作物新品种的选育、新型植保素的开发、食品加工等方面得到广泛的应用。 展开更多
关键词 脂肪氧化酶 结构 催化反应 功能 基因表达 亚细胞定位
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A Genome-wide Functional Characterization of Arabidopsis Regulatory Calcium Sensors in Pollen Tubes 被引量:23
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作者 Liming Zhou1,2, Ying Fu1,2 and Zhenbiao Yang2,3 (1State Key Laboratory of Plant Physiology and Biochemistry, Department of Plant Sciences, College of Biological Sciences, China Agricultural University, Beijing 100193, China 2China Agricultural University (CAU)-University of California, Riverside (UCR) Joint Center for Biological Sciences and Biotechnology, College of Biological Sciences, China Agricultural University, Beijing 100193, China 3Center for Plant Cell Biology and Department of Botany and Plant Sciences, University of California, Riverside, CA 92521, USA) 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2009年第8期751-761,共11页
Calcium, an ubiquitous second messenger, plays an essential and versatile role in cellular signaling. The diverse function of calcium signals is achieved by an excess of calcium sensors. Plants possess large numbers o... Calcium, an ubiquitous second messenger, plays an essential and versatile role in cellular signaling. The diverse function of calcium signals is achieved by an excess of calcium sensors. Plants possess large numbers of calcium sensors, most of which have not been functionally characterized. To identify physiologically relevant calcium sensors in a specific cell type, we conducted a genome-wide functional survey in pollen tubes, for which spatiotemporal calcium signals are well-characterized and required for polarized tip growth. Pollen.specific members of calrnodulin (CAM), CaM-like (CML), calcium-dependent protein kinase (CDPK) and calcineurin B-like protein (CBL) families were tagged with green fluorescence protein (GFP) and their localization patterns and overexpression phenotypes were characterized in tobacco pollen tubes. We found that several fusion proteins showed distinct overexpression phenotypes and subcellular localization patterns. CDPK24-GFP was localized to the vegetative nucleus and the generative cell/sperms. CDPK32-GFP caused severe growth depolarization. CBL2-GFP and CBL3-GFP exhibited dynamic patterns of subcellular localization, including several endomembrane compartments, the apical plasma membrane (PM), and cytoskeleton-like structures in pollen tubes. Their overexpression also inhibited pollen tube elongation and induced growth depolarization. These putative calcium sensors are excellent candidates for the calcium sensors responsible for the regulation of calcium homeostasis and calciumdependent tip growth and growth oscillation in pollen tubes. 展开更多
关键词 ARABIDOPSIS calcium sensor calcium signaling Rho-related GTPase from plants subcellular localization tip growth
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Subcellular localization of copper in tolerant and non-tolerant plant 被引量:17
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作者 NICai-ying CHENYing-xv +1 位作者 LINQi TIANGuang-ming 《Journal of Environmental Sciences》 SCIE EI CAS CSCD 2005年第3期452-456,共5页
The ability of Elsholtzia splendens Naki(E. splendens) to accumulate copper appears to be governed by its high degree of copper tolerance. However, the tolerance mechanism on the physiological basis is unknown. Using ... The ability of Elsholtzia splendens Naki(E. splendens) to accumulate copper appears to be governed by its high degree of copper tolerance. However, the tolerance mechanism on the physiological basis is unknown. Using transmission electron microscope(TEM) and energy dispersive analysis of X-rays(EDX), the likely location of copper within the cells of the tolerant and non-tolerant was determined. Here the role of vacuolar and cell wall compartmentalization in this copper tolerant plant were investigated. A direct comparison of copper locations of E. splendens and the non-tolerant Astragalus sinicus L.(A. sinicus) showed that the majority of copper in the tolerant was localized primarily in the vacuolar, cell wall, on the plasmamembrane, beside lipid grains induced by copper pollution, in the chloroplasts and amyloids; but in the non-tolerant, copper precipitates only be observed on the plasmamembrane, in the chloroplasts and cytoplasm under copper exposure conditions that were toxic to both species. This revealed that the tolerant accumulates more copper in the vacuole and cell wall than the non-tolerant, where was regarded as the storage compartment of tolerant plant or hyperaccumulator for heavy metals. 展开更多
关键词 A. sinicus copper(Cu) E. splendens localization subcellular
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谷子F-box家族基因的鉴定、分类及干旱响应 被引量:23
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作者 霍冬英 郑炜君 +6 位作者 李盼松 徐兆师 周永斌 陈明 马有志 闵东红 张小红 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第9期1585-1594,共10页
F-box蛋白参与细胞周期调控、细胞凋亡及信号转导等多种生命活动,对维持植物正常生长发育a和介导非生物胁迫响应等过程发挥重要作用。谷子具有显著的耐旱耐瘠薄等特性,本研究根据谷子转录组分析结果,从525个F-box家族成员中鉴定出19个... F-box蛋白参与细胞周期调控、细胞凋亡及信号转导等多种生命活动,对维持植物正常生长发育a和介导非生物胁迫响应等过程发挥重要作用。谷子具有显著的耐旱耐瘠薄等特性,本研究根据谷子转录组分析结果,从525个F-box家族成员中鉴定出19个在干旱胁迫下表达量上调的F-box基因,根据序列相似性将其分为6类,同一类基因具有相似的内含子-外显子结构。染色体定位分析发现,这些基因分别分布在谷子的8条染色体上,其中,第2条染色体上含F-box基因最多,有6个。结构域分析结果表明,19个F-box蛋白均含保守的F-box结构域,而C端含FBD、WD40、FBA、ZnF、Kelch和LRR等结构域。启动子元件分析表明,谷子19个F-box基因均含逆境应答元件,其中,MYB和MYC元件的数量最多(9-78个),说明这些基因对干旱应答反应可能主要受MYB、MYC转录因子调控。转录组分析结果表明,SiF-box18基因对干旱胁迫的响应远远高于其他F-box成员,对干旱、高盐、ABA、SA和JA都有响应;亚细胞定位结果显示,SiF-box18蛋白定位在细胞核中。本研究为进一步深入了解SiF-box18基因的功能提供了依据。 展开更多
关键词 谷子 F-BOX蛋白 亚细胞定位 干旱响应 诱导机制
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农杆菌介导的MpASR蛋白在洋葱表皮细胞的定位研究 被引量:21
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作者 刘海燕 冯冬茹 +3 位作者 刘兵 何炎明 王宏斌 王金发 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期218-222,共5页
通过比较不同侵染液浓度、侵染时间、取材部位、预处理等条件下的转化效果,优化了农杆菌介导的洋葱鳞茎内表皮细胞转化系统,并且成功检测到大蕉ASR蛋白(MpASR)与GFP的融合蛋白在洋葱表皮细胞中的分布。
关键词 MpASR蛋白 亚细胞定位 洋葱 内表皮细胞 绿色荧光蛋白 农杆菌
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MAPK的细胞内定位与激活后移位机制 被引量:11
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作者 龚小卫 姜勇 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第4期509-513,共5页
信号蛋白的亚细胞定位和激活后移位已成为细胞信号转导研究中的重要内容 .MAPK信号通路是真核细胞中的重要信号转导系统 .MAPK在细胞中有着相对固定的定位 ,在适宜的刺激作用下会移位入核并产生相应的生理效应 .目前认为 ,MAPK的磷酸化... 信号蛋白的亚细胞定位和激活后移位已成为细胞信号转导研究中的重要内容 .MAPK信号通路是真核细胞中的重要信号转导系统 .MAPK在细胞中有着相对固定的定位 ,在适宜的刺激作用下会移位入核并产生相应的生理效应 .目前认为 ,MAPK的磷酸化状态及与其他蛋白质 ,如上游激酶、磷酸酶和下游底物之间的相互作用 ,可能在其特异性定位与激活后移位中起作用 .MAPK的定位与移位机制的阐明 。 展开更多
关键词 MAPK 细胞 定位 激活 移位 丝裂原活化蛋白激酶 磷酸化 信号转导
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Cell proliferation, apoptosis and the related regulators p27, p53 expression in hepatocellular carcinoma 被引量:17
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作者 ZhaoJing Ke-JunNan Mei-LongHu 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2005年第13期1910-1916,共7页
AIM: To investigate the expression of cell apoptosis,proliferation and the related regulators p27, p53 in hepatocellular carcinoma (HCC).METHODS: The expression of p27, p53, proliferating cell nuclear antigen (PCNA) a... AIM: To investigate the expression of cell apoptosis,proliferation and the related regulators p27, p53 in hepatocellular carcinoma (HCC).METHODS: The expression of p27, p53, proliferating cell nuclear antigen (PCNA) and apoptosis in 47 HCC specimens and 42 surrounding non-cancerous tissues were detected by the immunohistochemistry and terminal deoxy-nudeotidyl transferase-mediated nick end labeling (TUNEL) technique.Meanwhile, the clinical significance of them was analyzed combining with the clinicopathological factors and followup data.RESULTS: (1) The average proliferating index and apoptotic index in HCC were significantly higher than that in adjacent liver tissues. The proliferating index was associated with extrahepatic metastasis. The apoptotic index was significantly lower in TNM stage Ⅰ-Ⅱ than in stage Ⅲ-Ⅳ. The proliferating index of groups with p53-/p27+ was significantly lower than that in group with p53+/p27- (P = 0.030); (2) The level of p27 in the cytoplasmic fraction was higher in non-tumoral liver tissues and was associated with clinical stage; (3) Survival analysis showed advanced stage (P = 0.031) and with extrahepatic metastasis (P = 0.045) was significantly associated with shorter survival. In addition, the prognosis of patients with p53-/p27+ was longer than that of patients with p53+/p27- (P = 0.0356).CONCLUSION: The p53 mutation and decreased p27 expression might be involved in the imbalance of proliferation and apoptosis in HCC. Cytoplasmic displacement might lead to the inactivation of p27 protein in HCC cells and acts early during carcinogenesis of HCC. The combined examination of p27, and p53 expression allows reliable estimation of prognosis for patients with primary hepatic carcinoma. 展开更多
关键词 Hepatocellular carcinoma APOPTOSIS subcellular localization
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紫花苜蓿盐诱导HD-Zip类转录因子MsHB2的克隆及功能分析 被引量:19
14
作者 李明娜 龙瑞才 +3 位作者 杨青川 沈益新 康俊梅 张铁军 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期622-632,共11页
【目的】在已有的一条紫花苜蓿(Medicago sativa L.cv.Zhongmu-1)盐诱导未知基因的EST序列基础上,克隆其(MsHB2)全长序列并分析其功能,以进一步了解其在紫花苜蓿中的耐盐调控机理。【方法】以先前获得的EST序列为基础设计引物,使用RACE... 【目的】在已有的一条紫花苜蓿(Medicago sativa L.cv.Zhongmu-1)盐诱导未知基因的EST序列基础上,克隆其(MsHB2)全长序列并分析其功能,以进一步了解其在紫花苜蓿中的耐盐调控机理。【方法】以先前获得的EST序列为基础设计引物,使用RACE法从紫花苜蓿中克隆得到MsHB2的3′和5′末端序列,经DNAMAN软件拼接后得到其全长序列。使用多种生物信息学软件对MsHB2的开放阅读框,编码蛋白等电点、分子量、疏水性、亚细胞定位、进化关系等进行预测分析。构建MsHB2的亚细胞定位瞬时表达载体,使用基因枪转化法将MsHB2与GFP在洋葱表皮细胞中融合瞬时表达并观察其亚细胞定位荧光信号。将生长30 d的中苜一号分别进行300 mmol·L-1NaCl和0.1 mmol·L-1 ABA胁迫处理,取胁迫处理0、2、4、10、24 h后的根和茎叶组织提取总RNA并进行荧光定量PCR分析。构建了MsHB2的植物超表达载体,转化农杆菌GV3101菌株,使用农杆菌花序侵染法转化拟南芥并在盐胁迫条件下对转基因株系进行相关表型分析。【结果】将RACE法克隆得到MsHB2的3′和5′末端序列拼接后得到1 126 bp的全长序列,序列分析表明,其编码蛋白包含247个氨基酸,具有一个同源异型结构域和一个亮氨酸拉链结构域,与拟南芥HD-Zip第I类转录因子ATHB12具有较高相似性。进化树聚类分析表明MsHB2属于第Ⅰ类同源异型域亮氨酸拉链蛋白。洋葱亚细胞定位分析表明MsHB2定位于细胞核。转录水平表达分析表明MsHB2受300mmol·L-1 NaCl和0.1 mmol·L-1 ABA胁迫诱导而表达量显著升高。转基因研究表明在NaCl和ABA胁迫下,过量表达MsHB2的转基因拟南芥表现比野生型拟南芥更敏感。【结论】从紫花苜蓿中克隆得到一个定位于细胞核的同源异型域亮氨酸拉链蛋白基因MsHB2,其在紫花苜蓿中受NaCl和ABA胁迫诱导,并在NaCl和ABA胁迫条件下抑制转基因拟南芥的生长。推测MsHB2可能通过A 展开更多
关键词 紫花苜蓿 同源异型结构域 亮氨酸拉链 亚细胞定位 功能分析 转录因子
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枳SPL9和SPL13全长cDNA克隆、亚细胞定位和表达分析 被引量:18
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作者 宋长年 钱剑林 +4 位作者 房经贵 王化坤 邱学林 章镇 张晓莹 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第10期2105-2114,共10页
【目的】从枳[Poncirus trifoliata(L.)Raf.]中克隆SBP类[SQUAMOSA(SQUA)promoter-binding-like]转录因子基因SPL9和SPL13全长,构建SPL9和SPL13亚细胞定位表达载体验证其是否具有核定位功能,利用荧光定量PCR研究其在枳不同组织的表达特... 【目的】从枳[Poncirus trifoliata(L.)Raf.]中克隆SBP类[SQUAMOSA(SQUA)promoter-binding-like]转录因子基因SPL9和SPL13全长,构建SPL9和SPL13亚细胞定位表达载体验证其是否具有核定位功能,利用荧光定量PCR研究其在枳不同组织的表达特性,初步确定SPL9和SPL13在枳生长发育过程中的作用。【方法】利用生物信息学结合RACE技术以枳花器官的cDNA为模板,克隆出SPL9和SPL13基因全长,分别命名Pt-SPL9和Pt-SPL13,大小分别是1519bp和1824bp,在GenBank的登录号分别是FJ502237和FJ502238;构建Pt-SPL9和Pt-SPL13亚细胞定位载体35S-GW-FJ502237/FJ502238-GFP,基因枪转化洋葱表皮细胞,暗培养24h后激光共聚焦显微镜下观察;利用SYBR Green I实时定量RT-PCR方法检测Pt-SPL9和Pt-SPL13在根、茎、叶、花序、花和果等不同组织中的表达。【结果】生物信息学分析表明,Pt-SPL9和Pt-SPL13的cDNA序列中都有microRNA156的识别位点,Pt-SPL9与金鱼草、拟南芥和玉米SPL9的同源性分别为48.9%、42.5%和41.7%;Pt-SPL13与拟南芥SPL13、水稻的SPL16和玉米的TGA1同源性分别为40.8%、38.1%和35.8%。Pt-SPL9和Pt-SPL13与其它植物的SBP一样有着高度保守的序列,即SBP结构域和一个双向核定位信号KRXXXRRRK。亚细胞定位结果表明,Pt-SPL9和Pt-SPL13均定位于细胞核中。SYBR Green I实时定量RT-PCR结果表明,Pt-SPL9和Pt-SPL13在各个器官均有表达,但表达量不同,Pt-SPL9在茎中的表达量最高,在花和叶中的表达量次之,在根、花芽和幼果中的表达量最低;Pt-SPL13在幼果中的表达量最高,在茎和花芽中的表达量相当,其次为叶,在花和根中的表达量很低。【结论】转录因子Pt-SPL9和Pt-SPL13均具有核定位功能,Pt-SPL9和Pt-SPL13对枳的茎和果实的发育可能有着重要作用。 展开更多
关键词 SPL9和SPL13 亚细胞定位 荧光定量RT-PCR
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苹果液泡膜蔗糖转运蛋白基因MdSUT4的表达分析与功能鉴定 被引量:18
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作者 许海峰 曲常志 +7 位作者 刘静轩 王意程 王得云 左卫芳 姜生辉 王楠 张宗营 陈学森 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期1235-1243,共9页
以新疆红肉苹果杂种一代优系‘红脆1号’为试材,克隆MdSUT4并原核诱导获得其重组蛋白,对其进行生物信息学分析,测定其在不同组织及不同发育时期果实中的表达,通过亚细胞定位及转基因鉴定其功能。结果发现,MdSUT4编码的蛋白大小为55 kD左... 以新疆红肉苹果杂种一代优系‘红脆1号’为试材,克隆MdSUT4并原核诱导获得其重组蛋白,对其进行生物信息学分析,测定其在不同组织及不同发育时期果实中的表达,通过亚细胞定位及转基因鉴定其功能。结果发现,MdSUT4编码的蛋白大小为55 kD左右,定位于8号染色体,由5个外显子和4个内含子组成;糖代谢相关基因系统进化树分析发现,MdSUT4与AtSUC4、PpSUT4在同一个进化支上;定量表达分析发现,MdSUT4在苹果的花、叶和幼果中均有较高的表达,且在果实发育中的表达水平与蔗糖含量显著负相关;MdSUT4启动子含有与糖信号及激素信号相关的顺式作用元件;在‘王林’苹果愈伤组织中过表达MdSUT4,能降低蔗糖含量,但却提高类黄酮含量;MdSUT4定位于‘王林’愈伤组织原生质体的液泡膜上。以上结果表明,MdSUT4可能参与了蔗糖从液泡膜中的外排,并可能促进类黄酮的合成。 展开更多
关键词 苹果 液泡膜蔗糖转运蛋白 SUT4 表达分析 功能鉴定 亚细胞定位
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多年生黑麦草P5CS基因的cDNA克隆、表达及亚细胞定位 被引量:15
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作者 曹丽 孙振元 +2 位作者 义鸣放 韩蕾 辛海波 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第9期1477-1484,共8页
以多年生黑麦草(Lolium perenne)‘Derby'为试材,采用RT-PCR结合RACE技术,克隆获得1个Δ1–吡咯啉–5–羧酸合成酶基因(P5CS)的cDNA序列,全长2528bp,推断其编码716个氨基酸,命名为LpP5CS。序列分析表明:LpP5CS基因与小麦TaP5CS和水... 以多年生黑麦草(Lolium perenne)‘Derby'为试材,采用RT-PCR结合RACE技术,克隆获得1个Δ1–吡咯啉–5–羧酸合成酶基因(P5CS)的cDNA序列,全长2528bp,推断其编码716个氨基酸,命名为LpP5CS。序列分析表明:LpP5CS基因与小麦TaP5CS和水稻OsP5CS基因核苷酸序列的相似性分别为92.05%和85.82%,氨基酸序列的相似性分别为93.99%和87.99%。半定量PCR结果表明,LpP5CS基因在多年生黑麦草根、茎,叶均有表达。盐处理下,表达量高于对照,其中叶片中表达量最高,根中最低。200mmol·L-1NaCl处理下,LpP5CS基因表达量随处理时间延长,有先升高后降低的趋势。洋葱鳞茎表皮细胞的瞬时表达显示,LpP5CS蛋白定位于细胞膜和细胞核。 展开更多
关键词 多年生黑麦草 P5CS 渗透胁迫 克隆 亚细胞定位内容
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植物中钙依赖蛋白激酶(CDPK)的研究进展 被引量:17
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作者 武志刚 武舒佳 +1 位作者 王迎春 郑琳琳 《草业学报》 CSCD 北大核心 2018年第1期204-214,共11页
Ca^(2+)是植物细胞信号转导中重要的第二信使,在植株受到外界逆境胁迫时,细胞中的钙信号经钙传感蛋白(CaMs、CaMLs、CBLs和CDPKs)传递到下游组分引起相关基因的表达,从而响应环境的各种变化。钙依赖性蛋白激酶(CDPK)是Ca^(2+)传感器,可... Ca^(2+)是植物细胞信号转导中重要的第二信使,在植株受到外界逆境胁迫时,细胞中的钙信号经钙传感蛋白(CaMs、CaMLs、CBLs和CDPKs)传递到下游组分引起相关基因的表达,从而响应环境的各种变化。钙依赖性蛋白激酶(CDPK)是Ca^(2+)传感器,可以将细胞内Ca^(2+)信号传递到可以与14-3-3蛋白相互作用的靶蛋白从而刺激靶蛋白发生磷酸化。CDPK在植物生长的诸多方面发挥关键作用,如花粉管的伸长、植物的生长发育以及对生物胁迫、非生物胁迫的应激反应。大多数CDPK具有明显的亚细胞分布,使它们能够"感受"局部Ca^(2+)浓度的变化并与其靶细胞发生特异性作用。14-3-3蛋白是一类通过磷酸化激活的真核蛋白,它可以与不同靶蛋白相互作用,调控植物重要的生理生化过程。近年来研究发现,14-3-3蛋白作为CDPK的靶蛋白和CDPK交叉磷酸化形成CDPK/14-3-3复合物,进一步调节植物初级代谢、开花和激素合成。将从CDPK的结构、亚细胞定位、靶蛋白、生物学功能,特别是CDPK与14-3-3之间的交叉调节及其在植物信号通路中的协同作用方面进行全面的综述,旨在为未来CDPK研究提供参考和新的方向。 展开更多
关键词 CDPK 14-3-3蛋白 非生物胁迫 亚细胞定位
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铅(Pb)在凤眼莲(Eichhornia Crassipes Solms)体细胞中分布的电镜观察 被引量:12
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作者 徐勤松 施国新 +4 位作者 王学 丁秉中 陈苏雅 许丙军 赵娟 《南京师大学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期81-85,共5页
用10 mg/L和100 mg/L浓度的Pb(NO3)2培养10 d的凤眼莲为实验材料,用透射电镜观察了重金属Pb在其细胞内的分布及造成的结构损伤情况.定位结果显示:在10 mg/L浓度处理的凤眼莲植株中,Pb颗粒主要沉积在根上:根的表面、胞间隙、细胞壁、细... 用10 mg/L和100 mg/L浓度的Pb(NO3)2培养10 d的凤眼莲为实验材料,用透射电镜观察了重金属Pb在其细胞内的分布及造成的结构损伤情况.定位结果显示:在10 mg/L浓度处理的凤眼莲植株中,Pb颗粒主要沉积在根上:根的表面、胞间隙、细胞壁、细胞膜和液泡,没有观察到明显的细胞器超微结构损伤,而在叶细胞中则没有观察到颗粒分布.随处理浓度增大(100 mg/L),Pb在根细胞各细胞组分中明显增多,对细胞的损伤亦加剧,表现为:质体解体和染色质凝集.同时,一部分Pb被运输到茎叶部分,主要分布在叶细胞的细胞膜、液泡内和叶绿体上,而在根和叶的其它细胞器都没有观察到颗粒分布.同时,各Pb处理浓度都没对叶细胞超微结构产生破坏.我们的观察结果证明凤眼莲抗重金属Pb的重要耐性机制是:根对重金属的积累,细胞壁的金属沉淀作用和液泡的区域化作用等. 展开更多
关键词 重金属 PB 风眼莲 亚细胞定位
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普通烟草CESA基因家族成员的鉴定、亚细胞定位及表达分析 被引量:16
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作者 徐宗昌 孔英珍 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期512-524,共13页
纤维素合成酶蛋白(cellulose-synthase proteins,CESA)是一类质膜定位蛋白,以蛋白复合体的形式存在于质膜上合成纤维素,在细胞壁建成和植物生长发育过程中起着非常重要的作用。本研究利用CESA蛋白保守域序列PF03552检索普通烟草(Nicotia... 纤维素合成酶蛋白(cellulose-synthase proteins,CESA)是一类质膜定位蛋白,以蛋白复合体的形式存在于质膜上合成纤维素,在细胞壁建成和植物生长发育过程中起着非常重要的作用。本研究利用CESA蛋白保守域序列PF03552检索普通烟草(Nicotiana tabacum L.)蛋白序列,并通过拟南芥(Arabidopsis thaliana)10个CESA蛋白序列在普通烟草基因组数据库中利用TBLASTN程序进行比对,共获得21条NtCESA基因候选序列,对这些序列进行蛋白序列理化性质分析、系统进化树构建、基因结构分析、保守结构域及跨膜区分析和组织表达模式分析,并对NtCESA9和NtCESA14两个蛋白进行了亚细胞定位实验。结果表明:获得的21条NtCESA蛋白序列的理化性质相似;系统进化分析将21个NtCESA基因和10个At CESA基因分成5个分支,每一个分支各成员之间的进化相对保守,基因结构类似,不同分支之间的基因结构差异也较小;NtCESA蛋白结构域相对保守,都含有CESA蛋白典型的N端锌指结构、C端跨膜区和DDD-QXXRW保守功能域;组织表达分析结果表明,大部分NtCESA基因在幼苗和成熟期烟草的根、叶、胚芽和愈伤组织中都有表达,同一个分支中的基因表达模式基本一致,并且NtCESA基因参与初/次生细胞壁纤维素的合成与该基因编码蛋白的跨膜区数目存在关联,表明NtCESA基因家族成员功能上的复杂性;亚细胞定位结果证实NtCESA9和NtCESA14为质膜定位蛋白。本研究为烟草CESA基因家族功能的深入研究奠定了基础。 展开更多
关键词 普通烟草 CESA基因家族 基因表达 亚细胞定位
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