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口蹄疫病毒结构蛋白P1研究进展 被引量：5
1
作者 廖德芳 李华春 《动物医学进展》 CSCD 2007年第B08期23-26,共4页
口蹄疫病毒P1基因编码的结构蛋白是构成口蹄疫病毒衣壳的基础,对诱导动物机体产生中和抗体和其他保护性免疫反应有重要作用。文章综述了口蹄疫病毒结构蛋白的结构、抗原特性以及利用重组P1基因制备口蹄疫新型疫苗和诊断检测制剂的最新... 口蹄疫病毒P1基因编码的结构蛋白是构成口蹄疫病毒衣壳的基础,对诱导动物机体产生中和抗体和其他保护性免疫反应有重要作用。文章综述了口蹄疫病毒结构蛋白的结构、抗原特性以及利用重组P1基因制备口蹄疫新型疫苗和诊断检测制剂的最新研究进展。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 P1基因 结构蛋白
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我国羊巴贝斯虫trap基因结构及遗传进化分析 被引量：4
2
作者 何欣 刘军龙 +6 位作者 刘爱红 王锦明 牛庆丽 李有全 殷宏 罗建勋 关贵全 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期1332-1341,共10页
本研究拟解析我国羊巴贝斯虫trap基因的结构特征,并以其为分子标志开展遗传进化分析,为理清我国羊巴贝斯虫的分类关系提供数据。用公布的巴贝斯虫trap基因序列BLAST两个羊巴贝斯虫全基因组本地数据库,以获得的保守序列片段为模板,设计PC... 本研究拟解析我国羊巴贝斯虫trap基因的结构特征,并以其为分子标志开展遗传进化分析,为理清我国羊巴贝斯虫的分类关系提供数据。用公布的巴贝斯虫trap基因序列BLAST两个羊巴贝斯虫全基因组本地数据库,以获得的保守序列片段为模板,设计PCR引物;克隆我国分离的6株羊巴贝斯虫trap基因全长序列,分析其序列结构特征;比对序列相似性,构建系统发生树,分析其遗传进化关系。结果克隆获得6株羊巴贝斯虫trap基因,分析结果显示,其具有3、4、5个内含子的三种内含子数目,预测的开放阅读框(ORF)大小分别为1 944、2 100/2 142和2 286bp;氨基酸序列分析显示,其都具有TRAP蛋白家族特征性的vWFA、TSR、跨膜域和CTD结构域;进化关系分析显示,感染我国羊的巴贝斯虫被分成3组,组内序列相似性为99.8%~100%,而组间为43.6%~74.6%。系统发生树上6株羊巴贝斯虫被分到两大枝,羊巴贝斯虫未定种和莫氏巴贝斯虫,而且莫氏巴贝斯虫又被分成两小枝。6株羊巴贝斯虫trap基因结构存在差异,但其蛋白特征性的结构域较为保守;我国分离的羊巴贝斯虫为两个种,但莫氏巴贝斯虫中可能存在两个亚种。 展开更多
关键词 羊巴贝斯虫 trap基因 基因结构 系统发生树
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牛MAGEL2的基因结构及在组织和胎盘中印记状态分析 被引量：1
3
作者 陈玮娜 马超 +3 位作者 李瑾 张层层 李若梅 李世杰 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期2006-2013,共8页
本研究旨在揭示牛PWS/AS(Prader-willi syndrome/angelman syndrome)印记区域中的MAGEL2(Melanoma antigen-like gene 2)基因的结构特点及其在成年牛组织及胎盘中的印记状态。生物信息学软件分析发现,牛MAGEL2基因位于21号染色体,为单... 本研究旨在揭示牛PWS/AS(Prader-willi syndrome/angelman syndrome)印记区域中的MAGEL2(Melanoma antigen-like gene 2)基因的结构特点及其在成年牛组织及胎盘中的印记状态。生物信息学软件分析发现,牛MAGEL2基因位于21号染色体,为单外显子蛋白编码基因,编码长为1183个氨基酸的多肽序列,其产物为MAGE家族成员之一。构建MAGEL2基因的进化树,发现牛MAGEL2基因与羊相似性最高。MAGEL2在不同物种之间具有较高的保守性。应用基于单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)的RTPCR产物直接测序的方法分析MAGEL2在牛8个组织和器官(心,肝,脾,肺,肾,肌肉,脂肪和大脑)及胎盘的印记状态。比较杂合牛基因组PCR产物和RT-PCR产物在SNP位点的测序结果发现,MAGEL2基因在成年牛组织及胎盘中均为单等位表达,提示MAGEL2基因在牛中是印记的。 展开更多
关键词 牛 MAGEL2 基因结构 印记状态 SNP
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植物抗性基因研究新趋势 被引量：7
4
作者 杨典洱 王岳光 +2 位作者 张承亮 陈翠霞 王斌 《生物技术通报》 CAS CSCD 2001年第6期1-4,共4页
多种生物基因组的大规模测序结果表明 ,抗性基因在基因组上成簇存在 ,从结构基因组、比较基因组。
关键词 抗性基因 结构基因组 比较基因组 功能基因组 生物信息学 植物
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基于RNA-Seq技术的谷子新基因发掘及基因结构优化 被引量：7
5
作者 穆彩琴 张瑞娟 +3 位作者 屈聪玲 韩渊怀 王兴春 杨致荣 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期1066-1072,共7页
尽管谷子(Setaria italica)全基因组序列图谱已经公布,但其基因注释很不完善。为此,本文应用RNA-Seq技术开展了谷子新基因发掘和已注释基因结构优化工作。以‘晋谷21’谷子叶片为材料提取总RNA,构建测序文库并利用Illumina HiSeq2500测... 尽管谷子(Setaria italica)全基因组序列图谱已经公布,但其基因注释很不完善。为此,本文应用RNA-Seq技术开展了谷子新基因发掘和已注释基因结构优化工作。以‘晋谷21’谷子叶片为材料提取总RNA,构建测序文库并利用Illumina HiSeq2500测序平台进行双端测序,最终获得37 072 949条高质量的干净读段(clean reads)。将其进一步与‘豫谷1号’谷子参考基因组进行序列比对,鉴定出614个新基因。在此基础上,利用COG、GO、KEGG、Swiss-Prot和NR等数据库对其进行了功能注释,获得了438个新基因的注释信息。此外,还优化了7 175个已注释基因的结构,延伸了4 330个基因的5′端和5 362个基因的3′端。本研究旨在为后续谷子功能基因组学研究和其他生物基因组注释信息的完善提供有益的借鉴。 展开更多
关键词 谷子 RNA-SEQ 转录组 新基因发掘 基因结构优化
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基于RNA-Seq技术苹果基因结构优化与新转录本预测 被引量：2
6
作者 倪伟 高付凤 +5 位作者 杨恒峰 张佳腾 徐金 毛志泉 陈学森 沈向 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期1532-1538,共7页
苹果(Malus domestica)已经完成全基因组测序并公布全基因组图谱,但是基因注释信息很不完善,因此本试验利用RNA-Seq技术对苹果已注释基因结构进行优化和新转录本预测。以‘富士’花后15、30、45、60 d的果肉为材料提取总RNA,构建文库并... 苹果(Malus domestica)已经完成全基因组测序并公布全基因组图谱,但是基因注释信息很不完善,因此本试验利用RNA-Seq技术对苹果已注释基因结构进行优化和新转录本预测。以‘富士’花后15、30、45、60 d的果肉为材料提取总RNA,构建文库并使用Illumina双末端测序HiSeq 2500平台进行测序,获得高质量的序列(clean reads)。将得到的结果与苹果‘金冠’参考基因组进行比对,共优化了13 272个已注释基因的结构,优化基因5′端和3′端数目分别为8 843个和8 955个,另外,共鉴定得到1 604个新的转录本,部分基因参与了苹果的转录表达调控、生长调节、氨基酸和糖类等的代谢过程。 展开更多
关键词 苹果 RNA-SEQ 基因结构优化 新转录本预测
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牛趋化因子受体4基因的克隆表达及序列分析 被引量：2
7
作者 李小庆 何延华 +4 位作者 陈国华 房永祥 冯海燕 赵娜 景志忠 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期1003-1009,共7页
采用RT-PCR技术,从被刺激诱导的牛外周血单个核细胞（PBMC）中克隆了牛趋化因子受体4（CXCR4）全长基因,并将CXCR4基因和CXCR4基因N端1~126 bp（CXCR442 aa）片段分别亚克隆到原核表达载体pGEX-4T-1中,命名为pGEX-4T-1-CXCR4、pGEX-4T-1... 采用RT-PCR技术,从被刺激诱导的牛外周血单个核细胞（PBMC）中克隆了牛趋化因子受体4（CXCR4）全长基因,并将CXCR4基因和CXCR4基因N端1~126 bp（CXCR442 aa）片段分别亚克隆到原核表达载体pGEX-4T-1中,命名为pGEX-4T-1-CXCR4、pGEX-4T-1-CXCR442 aa。获得重组菌株后,采用不同的IPTG浓度、不同诱导时间、不同温度和不同培养基等组合诱导表达这两种重组菌,其中pGEX-4T-1-CX-CR442 aa重组菌获得了表达,并在37℃、IPTG浓度为0.8 mmol/L、诱导6 h时表达量最大,约占菌体总蛋白的45%,目的蛋白主要以包涵体的形式存在;而pGEX-4T-1-CXCR4重组菌未表达出目的蛋白。 展开更多
关键词 牛 CXCR4基因 克隆 表达 结构预测
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玉米SNAC转录因子的基因结构特征与逆境调控预测
8
作者 罗平 庞博 +6 位作者 崔进鑫 于爽 王晓楠 程名 陈勇 高文伟 郝转芳 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期35-44,共10页
NAC蛋白是植物特有的转录因子,在植物发育和各种非生物逆境应答中发挥着重要作用。为更好地揭示玉米SNAC(stress-responsive NAM,ATAF1/2,CUC2)家族的耐逆境胁迫功能,对其基因的结构特征及可能的调控机理进行了预测。利用生物信息学方法... NAC蛋白是植物特有的转录因子,在植物发育和各种非生物逆境应答中发挥着重要作用。为更好地揭示玉米SNAC(stress-responsive NAM,ATAF1/2,CUC2)家族的耐逆境胁迫功能,对其基因的结构特征及可能的调控机理进行了预测。利用生物信息学方法,鉴定了玉米16个SNAC家族基因,并对该基因家族各编码蛋白的理化性质、基因结构、潜在的磷酸化位点、蛋白质二级结构、基因进化关系、基因组序列结构和启动子结合元件等信息进行分析。分析结果表明:玉米16个SNACs不具有跨膜结构,且均具有N-末端保守结构域和高度可变的C-末端结构域。系统发育分析表明,同一亚群中密切相关的成员具有相似的基因结构,推测在不同植物中会具有类似的耐逆功能。磷酸化位点分析表明,玉米SNAC家族存在着大量的磷酸化位点。二级结构预测表明,玉米SNAC的转录调控区具有高度的内在灵活性。启动子分析表明,玉米SNAC家族基因启动子区域均含有大量的逆境胁迫应答顺式作用元件。这些结果为玉米耐逆境研究提供了候选基因,对促进玉米SNAC家族功能分析的进展具有重要意义。 展开更多
关键词 玉米(Zea Mays L.) SNAC基因家族 基因结构特征 逆境胁迫
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唾液链球菌尿素酶结构亚基的克隆和表达 被引量：1
9
作者 栾晓玲 王艳 冯希平 《口腔医学研究》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期549-551,554,共4页
目的:克隆和表达唾液链球菌尿素酶结构亚基UreA、UreB、UreC。方法:用已构建的含唾液链球菌57.I尿素酶基因簇的重组质粒为模板,分别克隆、双酶切、连接、转化,构建含结构基因的表达质粒,IPTG诱导表达,亲和层析纯化蛋白。结果:成功构建... 目的:克隆和表达唾液链球菌尿素酶结构亚基UreA、UreB、UreC。方法:用已构建的含唾液链球菌57.I尿素酶基因簇的重组质粒为模板,分别克隆、双酶切、连接、转化,构建含结构基因的表达质粒,IPTG诱导表达,亲和层析纯化蛋白。结果:成功构建表达质粒,经诱导、亲和层析,获得高纯度、高浓度的UreA、UreB、UreC 3种目的蛋白。结论:成功诱导纯化唾液链球菌尿素酶的结构亚基,为今后各亚基的酶活分析和抗体制备等研究奠定基础。 展开更多
关键词 克隆 表达 唾液链球菌 尿素酶 结构亚基
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