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基于SwissPdbViewer和MATLAB对人类SOX蛋白三级结构建模及分析(英文)
1
作者
陈启龙
郑文岭
+2 位作者
姚文娟
吴飞珍
马文丽
《系统仿真学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008年第14期3637-3643,共7页
SOX蛋白具有一个与DNA特异结合的高保守HMG-box结合域。利用MATLAB的Sequence Analysis工具从Genbank中下载人类SOX蛋白序列信息,二次筛选获得22个有效的序列数据。以三级结构已知的SOX2、SRY、SOX5为模板,联合SwissPdbViewer与MATLAB,...
SOX蛋白具有一个与DNA特异结合的高保守HMG-box结合域。利用MATLAB的Sequence Analysis工具从Genbank中下载人类SOX蛋白序列信息,二次筛选获得22个有效的序列数据。以三级结构已知的SOX2、SRY、SOX5为模板,联合SwissPdbViewer与MATLAB,采用同源建模方法对SOX蛋白HMG-box进行建模、预测;利用MATLAB的Visualization Tool分析预测结果的三维结构。结果显示SOX蛋白HMG-box的三级结构极为相似,由3个α螺旋和2个热力学结构不稳定的loop区构成;表面静电分析显示SOX蛋白C端有一个可能与其它小分子或蛋白质的相互作用位点的N/C腔。SOX蛋白的上述空间结构可能与其活性与功能的调控有关。
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关键词
MATLAB
SwissPdbViewer
同源建模
三级结构预测
SOX蛋白
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职称材料
浅谈计算机网络
2
作者
高芳
《甘肃科技》
2003年第9期52-52,146,共2页
具体详实地论述了有关计算机网络知识以及其在生活与工作中的应用
关键词
局城网
广城网
通信子网
资源子网
通讯协议
资源共享
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职称材料
题名
基于SwissPdbViewer和MATLAB对人类SOX蛋白三级结构建模及分析(英文)
1
作者
陈启龙
郑文岭
姚文娟
吴飞珍
马文丽
机构
上海大学电子生物技术研究中心
出处
《系统仿真学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008年第14期3637-3643,共7页
基金
国家自然科学基金(39880032)
安徽省高校青年教师资助基金(2006jql235)
上海大学博士研究生创新基金(2007053)
文摘
SOX蛋白具有一个与DNA特异结合的高保守HMG-box结合域。利用MATLAB的Sequence Analysis工具从Genbank中下载人类SOX蛋白序列信息,二次筛选获得22个有效的序列数据。以三级结构已知的SOX2、SRY、SOX5为模板,联合SwissPdbViewer与MATLAB,采用同源建模方法对SOX蛋白HMG-box进行建模、预测;利用MATLAB的Visualization Tool分析预测结果的三维结构。结果显示SOX蛋白HMG-box的三级结构极为相似,由3个α螺旋和2个热力学结构不稳定的loop区构成;表面静电分析显示SOX蛋白C端有一个可能与其它小分子或蛋白质的相互作用位点的N/C腔。SOX蛋白的上述空间结构可能与其活性与功能的调控有关。
关键词
MATLAB
SwissPdbViewer
同源建模
三级结构预测
SOX蛋白
Keywords
MATLAB
SwissPdbViewer
homology modeling
tertiary structure prediction
SOX protein
分类号
TP208.6 [自动化与计算机技术—检测技术与自动化装置]
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职称材料
题名
浅谈计算机网络
2
作者
高芳
机构
兰州医学院第一附属医院
出处
《甘肃科技》
2003年第9期52-52,146,共2页
文摘
具体详实地论述了有关计算机网络知识以及其在生活与工作中的应用
关键词
局城网
广城网
通信子网
资源子网
通讯协议
资源共享
分类号
TP208.6 [自动化与计算机技术—检测技术与自动化装置]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于SwissPdbViewer和MATLAB对人类SOX蛋白三级结构建模及分析(英文)
陈启龙
郑文岭
姚文娟
吴飞珍
马文丽
《系统仿真学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008
0
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职称材料
2
浅谈计算机网络
高芳
《甘肃科技》
2003
0
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