为探究藏羊(Ovis aries)BMPR-ⅠB基因的序列特征、表达特征及其多态性对产羔性状的影响,本研究利用RT-qPCR、克隆测序、生物信息学方法和iMLDR技术等检测藏羊BMPR-ⅠB基因的组织表达特性,克隆了藏羊BMPR-ⅠB基因的编码区,分析了BMPR-Ⅰ...为探究藏羊(Ovis aries)BMPR-ⅠB基因的序列特征、表达特征及其多态性对产羔性状的影响,本研究利用RT-qPCR、克隆测序、生物信息学方法和iMLDR技术等检测藏羊BMPR-ⅠB基因的组织表达特性,克隆了藏羊BMPR-ⅠB基因的编码区,分析了BMPR-ⅠB理化性质和蛋白质结构,并检测了其在臧羊群体中的多态性。RT-qPCR结果表明,BMPR-ⅠB基因在下丘脑、垂体、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、卵巢、输卵管、子宫、瘤胃、十二指肠、臂三头肌、半腱肌、股四头肌和背最长肌等16个组织中均有表达,其中在卵巢、输卵管和子宫中的表达量高于其他组织的,在肌肉组织中的表达量最低。生物信息学分析结果表明,藏羊BMPR-ⅠB基因包含1个长为1509 bp的开放阅读框,编码502个氨基酸,其编码区氨基酸序列与绵羊的关系最近;BMPR-ⅠB蛋白的分子式为C_(2511)H_(3986)N_(694)O_(747)S_(33),分子量为56907.45 Da,总原子数为7971,理论等电点为7.78,T_(1/2)为30 h,不稳定指数为54.07,亲水性均值(grand average of hydropa-thicity,GRAVY)为-0.357;BMPR-ⅠB蛋白含信号肽,1个跨膜区,属于跨膜蛋白;存在87个潜在的磷酸化位点、2个N-糖基化修饰位点;α-螺旋、延伸链、β-转角和无规卷曲所占的比例分别为34.86%、13.15%、3.39%和48.61%,属于混合性蛋白。基因分型结果表明,藏羊BMPR-ⅠB基因编码区FecB位点存在A>G突变,且存在3种基因型,分别为野生++型、杂合突变B+型和纯合突变BB型,多态信息含量为0.07,属于低度多态,且该位点处于Hardy-Weinberg平衡状态。藏羊平均产羔数在野生++型和杂合突变+型之间差异显著(P<0.05)。本研究结果为进一步研究BMPR-ⅠB基因对藏羊繁殖性能的调控作用提供参考数据。展开更多
文摘为探究藏羊(Ovis aries)BMPR-ⅠB基因的序列特征、表达特征及其多态性对产羔性状的影响,本研究利用RT-qPCR、克隆测序、生物信息学方法和iMLDR技术等检测藏羊BMPR-ⅠB基因的组织表达特性,克隆了藏羊BMPR-ⅠB基因的编码区,分析了BMPR-ⅠB理化性质和蛋白质结构,并检测了其在臧羊群体中的多态性。RT-qPCR结果表明,BMPR-ⅠB基因在下丘脑、垂体、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、卵巢、输卵管、子宫、瘤胃、十二指肠、臂三头肌、半腱肌、股四头肌和背最长肌等16个组织中均有表达,其中在卵巢、输卵管和子宫中的表达量高于其他组织的,在肌肉组织中的表达量最低。生物信息学分析结果表明,藏羊BMPR-ⅠB基因包含1个长为1509 bp的开放阅读框,编码502个氨基酸,其编码区氨基酸序列与绵羊的关系最近;BMPR-ⅠB蛋白的分子式为C_(2511)H_(3986)N_(694)O_(747)S_(33),分子量为56907.45 Da,总原子数为7971,理论等电点为7.78,T_(1/2)为30 h,不稳定指数为54.07,亲水性均值(grand average of hydropa-thicity,GRAVY)为-0.357;BMPR-ⅠB蛋白含信号肽,1个跨膜区,属于跨膜蛋白;存在87个潜在的磷酸化位点、2个N-糖基化修饰位点;α-螺旋、延伸链、β-转角和无规卷曲所占的比例分别为34.86%、13.15%、3.39%和48.61%,属于混合性蛋白。基因分型结果表明,藏羊BMPR-ⅠB基因编码区FecB位点存在A>G突变,且存在3种基因型,分别为野生++型、杂合突变B+型和纯合突变BB型,多态信息含量为0.07,属于低度多态,且该位点处于Hardy-Weinberg平衡状态。藏羊平均产羔数在野生++型和杂合突变+型之间差异显著(P<0.05)。本研究结果为进一步研究BMPR-ⅠB基因对藏羊繁殖性能的调控作用提供参考数据。
