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灰楸CfPPR1基因的克隆及表达分析
被引量:
1
1
作者
赵林姣
杨英英
+5 位作者
付鹏跃
张玉
费越
王楠
张大才
王军辉
《温带林业研究》
2022年第1期21-29,共9页
【目的】挖掘调控‘麦缘锦楸’黄色边缘形成的关键基因,明确该候选基因的保守结构域、进化关系及表达特征,为下一步揭示该基因的分子生物学功能奠定基础。【方法】基于前期RNA-seq数据,筛选并克隆了与叶色相关的三角状五肽重复(pentatri...
【目的】挖掘调控‘麦缘锦楸’黄色边缘形成的关键基因,明确该候选基因的保守结构域、进化关系及表达特征,为下一步揭示该基因的分子生物学功能奠定基础。【方法】基于前期RNA-seq数据,筛选并克隆了与叶色相关的三角状五肽重复(pentatricopeptide repeat,CfPPR1)基因全长;利用ExPASy、InterProScan和CBS等在线工具对CfPPR1进行等电点、蛋白质结构及不同物种同源序列的进化关系和保守结构域分析;比较了CfPPR1基因在不同光照强度下的表达模式。【结果】该CDS序列全长为1902 bp,编码633个氨基酸,推测蛋白相对分子质量为71.31 kD,理论等电点(pI)为7.26;二级结构分析发现,CfPPR1序列编码的蛋白质空间结构是相对稳定的。系统进化树结果显示,CfPPR1不仅与黄化风铃木、芝麻、丹参等菊分支植物聚为一支,还与非菊分支的苹果、桃和橡胶树等具有较高的同源性,说明CfPPR1具有较高的保守性。对CfPPR1基因的表达模式分析发现,CfPPR1基因表达的上调很可能参与调控了‘麦缘锦楸’黄色边缘的形成。【结论】首次克隆得到了与叶色相关的CfPPR1基因,该基因的获得为进一步后期转基因验证CfPPR1基因功能提供有价值的参考。
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关键词
‘麦缘锦楸’
CfPPR1
克隆
基因表达
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职称材料
红河州柚木种源试验五年评价
被引量:
20
2
作者
张荣贵
蓝猛
+2 位作者
乔光明
王永刚
谢先荣
《林业科学研究》
CSCD
北大核心
1999年第2期190-196,共7页
在云南省红河自治州河口县对35个柚木种源的5a试验结果表明:种源间在树高、胸径上呈极显著差异,其中超过标准种源(相当于平均水平)的分别有16个和17个。以胸径超过标准种源10%,材积超过40%为选择标准,则8507、...
在云南省红河自治州河口县对35个柚木种源的5a试验结果表明:种源间在树高、胸径上呈极显著差异,其中超过标准种源(相当于平均水平)的分别有16个和17个。以胸径超过标准种源10%,材积超过40%为选择标准,则8507、8602、8603、8021、1307、8022、85131、8508号被选为适生优良种源,其树高、胸径、材积的现实增益平均分别为17.0%,19.9%和70.3%;其中前2个种源的材积现实增益达128%和107%;树高、胸径、材积的期望遗传增益约分别为10.0%,11.4%和45.8%。生长的年—年秩次呈紧密相关,表明早期选择有相当高的效率。
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关键词
柚木
种源试验
生长评价
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职称材料
檫树选作行道树的可行性分析研究
被引量:
2
3
作者
周照鑫
《绿色科技》
2013年第7期110-112,共3页
对檫树生态学、形态学进行了研究,结合杭州地质土壤气候条件等对其选作行道树优势与限制因素进行了分析,说明其是合适树种。为克服传统品种单一、色彩单调变化少、不能满足生态平衡且易集中爆发病虫害的缺点,提高抗灾能力,提出了具体应...
对檫树生态学、形态学进行了研究,结合杭州地质土壤气候条件等对其选作行道树优势与限制因素进行了分析,说明其是合适树种。为克服传统品种单一、色彩单调变化少、不能满足生态平衡且易集中爆发病虫害的缺点,提高抗灾能力,提出了具体应用的思路和设想。
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关键词
檫树
行道树
种植技术
可行分析
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职称材料
题名
灰楸CfPPR1基因的克隆及表达分析
被引量:
1
1
作者
赵林姣
杨英英
付鹏跃
张玉
费越
王楠
张大才
王军辉
机构
西南林业大学林学院
林木遗传育种国家重点实验室
三峡大学生物技术研究中心
东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室
出处
《温带林业研究》
2022年第1期21-29,共9页
基金
樟楠木等珍贵树种彩叶新品种选育与产业化关键技术(2021SY02)。
文摘
【目的】挖掘调控‘麦缘锦楸’黄色边缘形成的关键基因,明确该候选基因的保守结构域、进化关系及表达特征,为下一步揭示该基因的分子生物学功能奠定基础。【方法】基于前期RNA-seq数据,筛选并克隆了与叶色相关的三角状五肽重复(pentatricopeptide repeat,CfPPR1)基因全长;利用ExPASy、InterProScan和CBS等在线工具对CfPPR1进行等电点、蛋白质结构及不同物种同源序列的进化关系和保守结构域分析;比较了CfPPR1基因在不同光照强度下的表达模式。【结果】该CDS序列全长为1902 bp,编码633个氨基酸,推测蛋白相对分子质量为71.31 kD,理论等电点(pI)为7.26;二级结构分析发现,CfPPR1序列编码的蛋白质空间结构是相对稳定的。系统进化树结果显示,CfPPR1不仅与黄化风铃木、芝麻、丹参等菊分支植物聚为一支,还与非菊分支的苹果、桃和橡胶树等具有较高的同源性,说明CfPPR1具有较高的保守性。对CfPPR1基因的表达模式分析发现,CfPPR1基因表达的上调很可能参与调控了‘麦缘锦楸’黄色边缘的形成。【结论】首次克隆得到了与叶色相关的CfPPR1基因,该基因的获得为进一步后期转基因验证CfPPR1基因功能提供有价值的参考。
关键词
‘麦缘锦楸’
CfPPR1
克隆
基因表达
Keywords
‘Maiyuanjinqiu’
CfPPR1
gene clone
gene expression
分类号
S722.99 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
红河州柚木种源试验五年评价
被引量:
20
2
作者
张荣贵
蓝猛
乔光明
王永刚
谢先荣
机构
云南省红河自治州林业科学研究所
出处
《林业科学研究》
CSCD
北大核心
1999年第2期190-196,共7页
基金
国家"七五"攻关项目
文摘
在云南省红河自治州河口县对35个柚木种源的5a试验结果表明:种源间在树高、胸径上呈极显著差异,其中超过标准种源(相当于平均水平)的分别有16个和17个。以胸径超过标准种源10%,材积超过40%为选择标准,则8507、8602、8603、8021、1307、8022、85131、8508号被选为适生优良种源,其树高、胸径、材积的现实增益平均分别为17.0%,19.9%和70.3%;其中前2个种源的材积现实增益达128%和107%;树高、胸径、材积的期望遗传增益约分别为10.0%,11.4%和45.8%。生长的年—年秩次呈紧密相关,表明早期选择有相当高的效率。
关键词
柚木
种源试验
生长评价
Keywords
teak
provenance test
growth evaluation
分类号
S722.9 [农业科学—林木遗传育种]
S792.990.4 [农业科学—林学]
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职称材料
题名
檫树选作行道树的可行性分析研究
被引量:
2
3
作者
周照鑫
机构
浙江省杭州市下城区城市管理局
出处
《绿色科技》
2013年第7期110-112,共3页
文摘
对檫树生态学、形态学进行了研究,结合杭州地质土壤气候条件等对其选作行道树优势与限制因素进行了分析,说明其是合适树种。为克服传统品种单一、色彩单调变化少、不能满足生态平衡且易集中爆发病虫害的缺点,提高抗灾能力,提出了具体应用的思路和设想。
关键词
檫树
行道树
种植技术
可行分析
分类号
S722.9 [农业科学—林木遗传育种]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
灰楸CfPPR1基因的克隆及表达分析
赵林姣
杨英英
付鹏跃
张玉
费越
王楠
张大才
王军辉
《温带林业研究》
2022
1
下载PDF
职称材料
2
红河州柚木种源试验五年评价
张荣贵
蓝猛
乔光明
王永刚
谢先荣
《林业科学研究》
CSCD
北大核心
1999
20
下载PDF
职称材料
3
檫树选作行道树的可行性分析研究
周照鑫
《绿色科技》
2013
2
下载PDF
职称材料
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