目的建立一种低成本、高效率、操作简便的单核苷酸多态性(SNP)检测技术。方法采用自行设计的"ShineRoar 探针",结合融解曲线技术检测目的基因 SNP。并根据其工作原理分别对肿瘤坏死因子受体Ⅱ(TNFRⅡ)和载脂蛋白 M(apoM)的基...目的建立一种低成本、高效率、操作简便的单核苷酸多态性(SNP)检测技术。方法采用自行设计的"ShineRoar 探针",结合融解曲线技术检测目的基因 SNP。并根据其工作原理分别对肿瘤坏死因子受体Ⅱ(TNFRⅡ)和载脂蛋白 M(apoM)的基因多态性进行检测;同时用 DNA 测序技术鉴定 ShineRoar 探针技术的准确性。结果融解曲线分析结果显示,某一基因的野生型及突变型纯合子分别在2个不同的融解温度出现融解谷。TNFRⅡ基因第6外显子196位突变(ATG→AGG)所产生的 T 和 G 等位基因的融解温度分别为(52.84±0.75)℃和(58.38±0.61)℃;apoM T-778C 突变所产生的 T 和 C 等位基因的融解温度分别为(42.55±0.73)℃和(49.19±0.57)℃。一致性 Kappa 检验显示 ShineRoar 探针技术与 DNA 测序技术的 SNP 检测结果一致(Kappa=1,P=0.000)。结论ShineRoar 探针技术简单、快速、准确,适用于大批量基因分型的研究。展开更多
文摘目的建立一种低成本、高效率、操作简便的单核苷酸多态性(SNP)检测技术。方法采用自行设计的"ShineRoar 探针",结合融解曲线技术检测目的基因 SNP。并根据其工作原理分别对肿瘤坏死因子受体Ⅱ(TNFRⅡ)和载脂蛋白 M(apoM)的基因多态性进行检测;同时用 DNA 测序技术鉴定 ShineRoar 探针技术的准确性。结果融解曲线分析结果显示,某一基因的野生型及突变型纯合子分别在2个不同的融解温度出现融解谷。TNFRⅡ基因第6外显子196位突变(ATG→AGG)所产生的 T 和 G 等位基因的融解温度分别为(52.84±0.75)℃和(58.38±0.61)℃;apoM T-778C 突变所产生的 T 和 C 等位基因的融解温度分别为(42.55±0.73)℃和(49.19±0.57)℃。一致性 Kappa 检验显示 ShineRoar 探针技术与 DNA 测序技术的 SNP 检测结果一致(Kappa=1,P=0.000)。结论ShineRoar 探针技术简单、快速、准确,适用于大批量基因分型的研究。
