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嗜酸硫杆菌Acidithiobacillus抗砷基因多样性分析 被引量:5
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作者 赵永红 张静 +2 位作者 周丹 彭艳平 余水静 《生态环境学报》 CSCD 北大核心 2013年第7期1141-1147,共7页
为探讨嗜酸硫杆菌(Acidithiobacillus)抗砷基因多样性特征,利用生物信息学方法挖掘出嗜酸氧化亚铁硫杆菌(A.ferrooxidans)、喜温嗜酸硫杆菌(A.caldus)和耐冷嗜酸硫杆菌(A.ferrivorans)共49个抗砷基因,主要包括构成ars操纵子模式的arsA、... 为探讨嗜酸硫杆菌(Acidithiobacillus)抗砷基因多样性特征,利用生物信息学方法挖掘出嗜酸氧化亚铁硫杆菌(A.ferrooxidans)、喜温嗜酸硫杆菌(A.caldus)和耐冷嗜酸硫杆菌(A.ferrivorans)共49个抗砷基因,主要包括构成ars操纵子模式的arsA、arsB、arsC、arsD、arsH和arsR基因,为嗜酸硫杆菌重要的抗砷遗传因子。研究了49个抗砷基因的聚类与进化关系、理化性质、二级结构、跨膜区、亚细胞定位、砷结合位点等特征。结果表明:这些抗砷基因聚类为11个组,第2组抗砷基因(arsB)为嗜酸硫杆菌所共有,编码泵砷内膜蛋白(ArsB),该基因可能为嗜酸硫杆菌抗砷机制所必需;聚类和进化分析表明其中5个抗砷基因可能源于基因水平迁移;脂溶指数分析显示25个抗砷蛋白脂溶指数大于100,为亲水性蛋白,其余24个抗砷蛋白脂溶指数均小于100,为疏水性蛋白;从不稳定指数分析结果可知,大部分抗砷转录调控因子ArsR是不稳定的,49个抗砷基因蛋白二级结构均由α-螺旋、无规则卷曲和扩展链结构3种形式组成。亚细胞定位分析发现抗砷蛋白在细菌内膜、细菌外膜和细胞周质空间均有出现,ArsB具有10-11个跨膜区;所有抗砷蛋白均无信号肽。对嗜酸硫杆菌的ArsC、ArsD和ArsH抗砷功能蛋白与砷结合位点进行预测和建模,发现活性位点均存在Cys残基;与其他抗砷蛋白结合位点(含Cys残基)不同的是,Acife1530(ArsA)2个甲硫氨酸(Met)与As(III)直接结合,暗示着Met残基中存在与Cys残基功能相同的巯基,由此可见,Cys残基或Met残基的巯基对于构成嗜酸硫杆菌抗砷功能蛋白与砷结合的活性位点是必不可少的。 展开更多
关键词 嗜酸硫杆菌 抗砷基因 聚类分析 多样性分析 生物信息学
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土壤氮循环微生物过程的分子生态学研究进展 被引量:52
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作者 侯海军 秦红灵 +1 位作者 陈春兰 魏文学 《农业现代化研究》 CSCD 北大核心 2014年第5期588-594,共7页
固氮作用、硝化作用和反硝化作用是土壤微生物参与氮素循环的三个重要方面。自分子生态学方法应用于土壤学后,土壤微生物作用于氮素循环过程的机理研究取得了若干重要进展。包括:1)利用固氮菌的nifH基因作为分子标记研究有机质、氮素与... 固氮作用、硝化作用和反硝化作用是土壤微生物参与氮素循环的三个重要方面。自分子生态学方法应用于土壤学后,土壤微生物作用于氮素循环过程的机理研究取得了若干重要进展。包括:1)利用固氮菌的nifH基因作为分子标记研究有机质、氮素与固氮微生物之间的关系,发现固氮微生物的丰度和群落结构与土壤有机质含量呈正相关。然而,固氮微生物的丰度和群落结构与土壤速效N含量呈负相关,施用氮肥会抑制固氮微生物的生长,施氮土壤固氮微生物数量减少,多样性降低。2)以氨氧化微生物功能基因为探针,揭示了土壤pH与氨氧化微生物分布关系密切,碱性土壤中氨氧化细菌是硝化作用主要参与者,而酸性土壤中氨氧化古菌是硝化作用的主导者。土壤中N素的含量也影响氨氧化微生物的数量和群落结构,施入氮肥后氨氧化微生物的数量和活性增加。3)利用反硝化功能基因为分子标记研究土壤因子对反硝化细菌群落的影响,阐明了土壤可溶性有机碳、pH和土壤水分是影响反硝化细菌数量和群落结构的重要因子,并且发现土壤反硝化细菌与土壤反硝化能力和氧化亚氮释放之间存在着一定的联系,但这种联系在不同研究对象中存在差异,需要进一步确认。目前,利用分子生物学技术解析土壤氮素循环微生物生态功能取得了重要的进展,但还需进一步深入。今后,将采用包括同位素在内的示踪技术与分子生物学方法相结合共同分析氮循环不同代谢过程微生物种群间的相互关系以及氧化亚氮产生与硝化和反硝化微生物之间的关系。 展开更多
关键词 氮循环 固氮作用 硝化作用 反硝化作用 分子生态学 功能基因
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环境温度对动物肠道微生物菌群影响的研究进展 被引量:6
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作者 郭新羽 沙玉柱 +7 位作者 蒲小宁 吕卫兵 刘秀 胡江 罗玉柱 王继卿 李少斌 赵志东 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期2858-2866,共9页
温度是一个重要的非生物环境变量,能够驱动动物谱系的适应轨迹和动物群落的组成。环境温度作为影响动物肠道微生物菌群变化的众多因素之一,能够影响肠道微生物菌群的组成及丰度,进而调控宿主生长、发育、繁殖、免疫等生物学过程及功能... 温度是一个重要的非生物环境变量,能够驱动动物谱系的适应轨迹和动物群落的组成。环境温度作为影响动物肠道微生物菌群变化的众多因素之一,能够影响肠道微生物菌群的组成及丰度,进而调控宿主生长、发育、繁殖、免疫等生物学过程及功能。动物肠道核心菌群的组成及其代谢产物在不同温度下存在显著差异,在单胃动物、反刍动物等中都有相应的报道。极端温度主要通过诱导肠道微生物菌群产生结构和功能上的差异,进而对宿主表型产生影响。目前,对于温度如何影响动物肠道菌群的了解仍非常有限。本文针对不同环境温度条件下,肠道微生物菌群结构和功能的差异及相关研究进行了总结及综述。探讨由环境温度引起的肠道微生物菌群与宿主适应机制之间的关系,包括对宿主产热机制、消化系统和免疫系统等其他方面的影响并开展研究,将为肠道微生物对宿主健康的调节提供参考和思路。 展开更多
关键词 环境温度 肠道微生物 免疫系统 适应机制
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微生物生态学领域的研究动向 被引量:1
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作者 余龙江 李为 《国际学术动态》 2007年第6期20-22,共3页
第11届国际微生物生态大会(ISME-11,11th International Symposiumon Microbial Ecology)于2006年8月20-25日在奥地利首都维也纳召开。本届大会的主题是“隐藏的力量——微生物群落的作用(The Hidden Powers-Microbial Communitiesi... 第11届国际微生物生态大会(ISME-11,11th International Symposiumon Microbial Ecology)于2006年8月20-25日在奥地利首都维也纳召开。本届大会的主题是“隐藏的力量——微生物群落的作用(The Hidden Powers-Microbial Communitiesin Action)”。参加会议的代表来自60多个国家,共2000余人。中国大陆地区有19名代表到会。 展开更多
关键词 微生物生态学 中国大陆地区 微生物群落 维也纳 奥地利
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应用PCR-DGGE技术研究四角蛤蜊的细菌多样性 被引量:4
5
作者 马悦欣 王颖 +2 位作者 杨凤 闫喜武 霍忠明 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期243-246,共4页
应用PCR-DGGE技术对盘锦某滩涂四角蛤蜊Mactra venerformis体内的细菌多样性进行了分析。使用SDS裂解法提取样品的总DNA,采用大多数细菌通用引物F338GC/R518从总DNA中成功扩增出16S rDNA片段,然后对PCR产物进行DGGE分析,并将DGGE图谱上... 应用PCR-DGGE技术对盘锦某滩涂四角蛤蜊Mactra venerformis体内的细菌多样性进行了分析。使用SDS裂解法提取样品的总DNA,采用大多数细菌通用引物F338GC/R518从总DNA中成功扩增出16S rDNA片段,然后对PCR产物进行DGGE分析,并将DGGE图谱上部分条带回收、再扩增、克隆和测序;将所测序列在GenBank核酸数据库中进行检索,用BLASTN分析DNA序列获得相似性最近的细菌。DGGE图谱显示,四角蛤蜊体内的细菌种类比较丰富,且不同时间样品细菌的优势菌群结构有一定的差异。将所测条带序列进行比对,结果表明,细菌种群中包括支原体属Mycoplasma、假单胞菌属Pseudomonas、弧菌属Vibrio、红球菌属Rhodococcus和鞘氨醇单胞菌属Sphingomonas及不可培养的细菌。 展开更多
关键词 四角蛤蜊 PCR—DGGE 细菌多样性
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甲烷氧化与氨氧化微生物及其耦合功能 被引量:4
6
作者 赵吉 李靖宇 +2 位作者 周玉 白玉涛 于景丽 《地球科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期651-659,共9页
甲烷氧化与氨氧化过程分别对控制温室气体甲烷和氧化亚氮方面有着特殊作用,土壤及湿地等环境中的甲烷氧化菌和氨氧化菌在生态系统碳、氮生物循环中扮演着重要的角色。论述了甲烷氧化与氨氧化过程的微生物学机制,甲烷氧化菌和氨氧化菌的... 甲烷氧化与氨氧化过程分别对控制温室气体甲烷和氧化亚氮方面有着特殊作用,土壤及湿地等环境中的甲烷氧化菌和氨氧化菌在生态系统碳、氮生物循环中扮演着重要的角色。论述了甲烷氧化与氨氧化过程的微生物学机制,甲烷氧化菌和氨氧化菌的群落结构变化,分析了甲烷氧化菌和氨氧化菌在碳、氮循环以及它们在控制重要温室气体排放中的环境功能,阐述了甲烷氧化菌和氨氧化菌的关联作用机制。以期深入揭示甲烷氧化菌与氨氧化菌的空间分异与耦合机制,为深入探讨这类微生物的生态机制和环境功能提供科学线索。 展开更多
关键词 甲烷氧化菌 氨氧化菌 微生物学机制 温室气体 耦合作用
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河西走廊盐碱土细菌种群结构多样性的研究 被引量:16
7
作者 牛世全 景彩虹 +2 位作者 廖世齐 朱学泰 韩建山 《西北师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2013年第2期90-95,共6页
土壤盐碱化是引起土壤生态环境恶化的主要原因之一,盐碱土的改良利用是目前研究的热点.本文采用构建16SrRNA基因文库,研究了位于中国西北部的河西走廊盐碱土中细菌群落结构多样性.结果表明,原生盐碱土、次生盐碱土和农田土三种不同类型... 土壤盐碱化是引起土壤生态环境恶化的主要原因之一,盐碱土的改良利用是目前研究的热点.本文采用构建16SrRNA基因文库,研究了位于中国西北部的河西走廊盐碱土中细菌群落结构多样性.结果表明,原生盐碱土、次生盐碱土和农田土三种不同类型的土壤中细菌种群结构的组成和丰度具有明显差异.作为对照的农田土中存在3大细菌类群,其中Firmicutes为优势菌群;原生盐碱土中存在9大细菌类群,Firmicutes和γ-proteobacteria为优势菌群;三个次生盐碱土样品存在很大差异,γ-proteobacteria为其共同优势菌群.Marinobacter,Halomonas和Pseudomonas这些嗜盐菌普遍存在于盐碱土中. 展开更多
关键词 盐碱土 16SrRNA基因文库 细菌种群结构多样性
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养殖塘和市售小龙虾肠道细菌多样性的比较 被引量:6
8
作者 邓祥宜 李池茜 +3 位作者 张涵池 柯奥 鲍晓龙 李继伟 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2021年第3期44-52,共9页
养殖塘与市售小龙虾在摄食、存活率方面存在明显差异。为了揭示这些差异是否与肠道细菌群落组成有关,通过Illumina高通量测序技术研究了养殖塘和市售小龙虾肠道细菌群落组成,并对群落功能进行了分析。结果显示,养殖塘小龙虾肠道细菌群... 养殖塘与市售小龙虾在摄食、存活率方面存在明显差异。为了揭示这些差异是否与肠道细菌群落组成有关,通过Illumina高通量测序技术研究了养殖塘和市售小龙虾肠道细菌群落组成,并对群落功能进行了分析。结果显示,养殖塘小龙虾肠道细菌群落组成与市售小龙虾差异明显。养殖塘小龙虾肠道细菌优势门为变形菌门(Proteobacteria)(占49.98%~58.11%)、厚壁菌门(Firmcutes)(9.51%~36.76%)、软壁菌门(Tenericutes)(6.02%~26.96%)和拟杆菌门(Bacteroidetes)(4.06%~4.14%);市售小龙虾肠道细菌主要优势门为拟杆菌门(21.05%~39.22%)、厚壁菌门(20.51%~35.94%)、暂定门RsaHF231(11.55%~46.34%)和变形菌门(4.29%~11.04%)。在属水平上,柠檬酸杆菌属和哈夫尼菌属是养殖塘小龙虾肠道中的正常核心菌群,但其在市售样本中占比较低;暂定门RsaHF231未分类属、拟杆菌属、丹毒丝菌科的[Anaerorhabdus]_furcosa_group和g_ZOR0006是市售小龙虾肠道中的优势类群,但在养殖塘样本中含量较低。COG功能预测结果显示,养殖塘小龙虾肠道细菌群落的代谢功能较市场样本旺盛。与养殖塘小龙虾相比,市售小龙虾肠道细菌群落组成和功能有较大差异,这可能与其摄食减少、存活率降低有关。 展开更多
关键词 小龙虾(克氏原螯虾) 肠道微生物 细菌群落多样性 高通量测序 功能预测
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哈尼梯田稻-渔共作模式下杂交黄颡鱼肠道微生物研究 被引量:7
9
作者 朱昊俊 强俊 +3 位作者 徐钢春 陶易凡 包景文 徐跑 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期1232-1242,共11页
为了探究哈尼梯田稻-鱼共作综合种养模式(稻渔组,DY组)和传统池塘养殖模式(池塘组,CT组)下杂交黄颡鱼(Tachysurus fulvidraco♀×Pseudobagrus vachellii♂)肠道微生物结构变化,试验采用16S rDNA测序技术对不同养殖模式下黄颡鱼肠... 为了探究哈尼梯田稻-鱼共作综合种养模式(稻渔组,DY组)和传统池塘养殖模式(池塘组,CT组)下杂交黄颡鱼(Tachysurus fulvidraco♀×Pseudobagrus vachellii♂)肠道微生物结构变化,试验采用16S rDNA测序技术对不同养殖模式下黄颡鱼肠道微生物进行分析。测序结果显示,CT组和DY组优势菌门均为变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和梭杆菌门(Fusobacteria)。和CT组相比,在门水平上DY组厚壁菌门和拟杆菌门相对丰度显著上升,而变形菌门相对丰度显著下降。在属水平上DY组梭状芽孢杆菌属、Romboutsia属、Paludibacter属、Epulopiscium属和拟杆菌属相对丰度显著上升,而邻单胞菌属丰度显著下降。不同的养殖模式没有显著影响黄颡鱼肠道微生物的丰富度(Richness),但DY组拥有更高的微生物均匀度(Evenness)。BugBase表型预测结果如下,CT组革兰氏阴性菌,兼性厌氧菌丰度更高,DY组则革兰氏阳性菌,厌氧菌丰度更高。同时DY组肠道菌群相较于CT组具有更低的潜在致病性和生物膜形成能力。DY组黄颡鱼肠道微生物多样性更高,稳定性更好,对疾病的抵抗力可能更强。水稻-黄颡鱼新型稻渔综合种养模式具有更佳的经济和生态效应。 展开更多
关键词 哈尼梯田 稻-鱼综合种养 杂交黄颡鱼 肠道微生物
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沙棘内生菌的分离与初步鉴定 被引量:20
10
作者 李琦 孙广宇 《中国农学通报》 CSCD 2006年第10期300-302,共3页
植物内生菌广泛存在于各种植物中,在与宿主的协同进化过程中形成了两者的互惠共生关系。通过对采集的野生沙棘健康的根、茎、叶进行组织分离共计获得内生真菌327株,分别归属于链格孢属、青霉属、根霉属、芽枝霉属、毛壳菌属、曲霉菌属... 植物内生菌广泛存在于各种植物中,在与宿主的协同进化过程中形成了两者的互惠共生关系。通过对采集的野生沙棘健康的根、茎、叶进行组织分离共计获得内生真菌327株,分别归属于链格孢属、青霉属、根霉属、芽枝霉属、毛壳菌属、曲霉菌属、盘多毛孢属、向基孢属、枝顶孢属、头孢霉属等10个真菌属,内生菌表现出丰富生物多样性。从组织分离以及对内生真菌初步鉴定的结果看一些物种还具有组织专化性。 展开更多
关键词 内生菌 分离 鉴定
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地下水生态系统中微生物生存的影响因素 被引量:2
11
作者 张湄农 狄建强 王雷 《地下水》 2010年第4期18-19,共2页
综述了地下水生态系统对微生物生存的影响因素。影响微生物生长、活性及存在的因素很多,包括非生物因素如温度、pH、Eh、化学成分等和微生物之间的相互影响。最后提出生物修复优化控制法和理论将是未来环境生物技术的重要研究方向,并指... 综述了地下水生态系统对微生物生存的影响因素。影响微生物生长、活性及存在的因素很多,包括非生物因素如温度、pH、Eh、化学成分等和微生物之间的相互影响。最后提出生物修复优化控制法和理论将是未来环境生物技术的重要研究方向,并指出了地下水生态系统研究的发展方向。 展开更多
关键词 地下水生态系统 生物修复 微生物生存 影响因素
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天津海河流域水体及自来水细菌检测及分析 被引量:1
12
作者 张庆民 邓瑞君 +1 位作者 丁蕊 庞丽娟 《实验室科学》 2012年第3期91-94,共4页
利用平板菌落计数法和多管发酵法检测天津海河流域水体和自来水中的细菌总数、总大肠杆菌群及粪大肠菌数,以期对天津海河流域水体微生物污染状况进行分析。结果表明,在1mL的天津自来水水样中总菌数小于1,没有检测出大肠杆菌和粪大肠菌,... 利用平板菌落计数法和多管发酵法检测天津海河流域水体和自来水中的细菌总数、总大肠杆菌群及粪大肠菌数,以期对天津海河流域水体微生物污染状况进行分析。结果表明,在1mL的天津自来水水样中总菌数小于1,没有检测出大肠杆菌和粪大肠菌,符合《生活饮用水卫生标准》(GB5749-2005)的规定。对海河水的检测结果为大肠杆菌平均70 000个/L,超出III类水标准,粪大肠菌平均700个/L,属于II类水标准。粪大肠菌群的存在可认为河水直接或间接的受到了比较近期的人或动物粪便污染,应引起人们的重视。 展开更多
关键词 天津海河 细菌总数 总大肠杆菌群数 粪大肠菌
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植物内生菌在建设节水型园林中的潜在应用
13
作者 张岩峰 谷媛媛 +3 位作者 范晓珑 刘峰涛 尹会荣 李焱波 《河北省科学院学报》 CAS 2023年第2期69-74,共6页
植物内生菌是生活于健康植物内,与宿主植物建立互惠互利的共生关系的微生物,具有促进植物生长、提高植物抗干旱胁迫能力等作用。本文总结了植物内生菌的种类,综述了其抗干旱胁迫作用机理和在园林绿化植物抗干旱胁迫中的应用研究,以期为... 植物内生菌是生活于健康植物内,与宿主植物建立互惠互利的共生关系的微生物,具有促进植物生长、提高植物抗干旱胁迫能力等作用。本文总结了植物内生菌的种类,综述了其抗干旱胁迫作用机理和在园林绿化植物抗干旱胁迫中的应用研究,以期为植物内生菌资源在园林绿化、建设节水型园林等方面提供参考。 展开更多
关键词 植物内生菌 干旱胁迫 园林植物 潜在应用
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螺旋粉虱体内共生菌的研究 被引量:1
14
作者 黄武仁 牛黎明 +3 位作者 朱文静 韩冬银 张方平 符悦冠 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2012年第1期137-142,共6页
采用变性梯度凝胶电泳技术[denaturing gradient gel electrophoresis(DGGE)]、16S rDNA文库构建技术,以及使用Wolbachia菌特异引物研究在不同寄主上取食繁殖的螺旋粉虱自然种群体内共生菌。结果显示,在不同寄主植物取食的新入侵螺旋粉... 采用变性梯度凝胶电泳技术[denaturing gradient gel electrophoresis(DGGE)]、16S rDNA文库构建技术,以及使用Wolbachia菌特异引物研究在不同寄主上取食繁殖的螺旋粉虱自然种群体内共生菌。结果显示,在不同寄主植物取食的新入侵螺旋粉虱体内共生菌均稳定存在有初级共生菌(Candidatus Portiera aleyrodidarum),属于变形菌门(Proteobacteria),γ-变形菌纲,共生菌多样性较少;研究同时发现取食不同寄主植物的螺旋粉虱个体间共生菌群落多样性有一定差异,一些螺旋粉虱个体内还生存有葡萄球菌(Staphylococcus sp.);此外,研究还发现新入侵的螺旋粉虱体内尚未检测到Wolbachia菌。表明取食不同寄主的螺旋粉虱体内均稳定存在有共生菌,同时取食不同的寄主其共生菌群落也会发生变化;Wolbachia菌尚未在新入侵海南的螺旋粉虱中建立共生关系。 展开更多
关键词 共生菌 16S rDNA文库 DGGE Wolbachia菌
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定位培肥对东北黑土土壤固氮菌多样性的影响
15
作者 王大庆 刘朴方 +3 位作者 孙泰朋 孟雨田 赵伟 王宏燕 《国土与自然资源研究》 2016年第2期67-69,共3页
基于10年的黑土培肥定位试验,本试验采用PCR-DGGE、克隆测序技术的方法,研究了培肥处理对大豆固氮菌多样性的影响。DGGE图谱分析表明对照土壤固氮菌多样性指数最高,其次为农肥低量处理、农化1:1处理、化肥低量处理和农肥高量处理,化肥... 基于10年的黑土培肥定位试验,本试验采用PCR-DGGE、克隆测序技术的方法,研究了培肥处理对大豆固氮菌多样性的影响。DGGE图谱分析表明对照土壤固氮菌多样性指数最高,其次为农肥低量处理、农化1:1处理、化肥低量处理和农肥高量处理,化肥高量处理土壤固氮菌多样性指数最低。在相似度60%水平上化肥处理聚成一群,对照、农肥处理和农化1:1处理量聚成一群。培肥处理降低了土壤固氮菌的多样性,影响了土壤中固氮菌的群落结构,其中培肥高量处理比低量处理降低土壤固氮菌多样性的效果更显著。 展开更多
关键词 农肥 化肥 大豆固氮菌 NIFH PCR-DGGE
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不同益生菌对产气荚膜梭菌抑制效果的比较 被引量:2
16
作者 阳艳林 肖建根 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2011年第14期60-62,共3页
克洛生誖所富含的PB6活性菌株是从健康鸡肠道中分离出来的一种枯草芽孢杆菌,它能通过分泌多种细菌素来抑制产气荚膜梭菌的生长,其抑菌能力与市面上常见的其他6种枯草芽孢杆菌制剂及恩拉霉素相比,克洛生誖组对各型产气荚膜梭菌抑菌圈的... 克洛生誖所富含的PB6活性菌株是从健康鸡肠道中分离出来的一种枯草芽孢杆菌,它能通过分泌多种细菌素来抑制产气荚膜梭菌的生长,其抑菌能力与市面上常见的其他6种枯草芽孢杆菌制剂及恩拉霉素相比,克洛生誖组对各型产气荚膜梭菌抑菌圈的直径均显著大于各益生菌组。与恩拉霉素(4%)相比,克洛生誖100 g/t添加量与250 g/t恩拉霉素(4%)抑制效果相当,而克洛生誖200 g/t添加量对A型产气荚膜梭菌的抑制效果甚至优于与500 g/t恩拉霉素(4%)。 展开更多
关键词 克洛生 益生菌 恩拉霉素 产气荚膜梭菌 抑菌圈
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热带西太平洋M4海山超微型浮游生物的生态分布特点
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作者 赵燕楚 赵丽 +4 位作者 董逸 张武昌 李学刚 赵苑 肖天 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期1001-1011,共11页
获取并分析了2017年8月热带西太平洋M4海山水体中的超微型浮游生物样品,根据流式细胞术的散射光和荧光信号,检测到M4海山各水层中普遍存在四个超微型自养浮游生物类群(聚球藻、原绿球藻、微微型真核浮游生物、微型真核浮游生物)和两个... 获取并分析了2017年8月热带西太平洋M4海山水体中的超微型浮游生物样品,根据流式细胞术的散射光和荧光信号,检测到M4海山各水层中普遍存在四个超微型自养浮游生物类群(聚球藻、原绿球藻、微微型真核浮游生物、微型真核浮游生物)和两个超微型异养原核生物类群(低核酸含量和高核酸含量异养原核生物)。聚球藻丰度高值出现在100m以浅;原绿球藻和微微型真核浮游生物丰度高值区在深层叶绿素最大值附近(75—150m);微型真核浮游生物和异养原核生物分布范围较广,150m以浅丰度较高。异养原核生物的生物量(1.68—11.25μgC/L)高于自养浮游生物(0.05—6.02μgC/L)的生物量。在超微型自养浮游生物中,原绿球藻生物量在100—150m水层占优势(53.83%±6.32%),微型真核浮游生物的生物量在75m以浅(58.62%±8.53%)和200—300m水层占优势(46.18%±7.82%)。在异养原核生物中,高核酸含量异养原核生物的生物量所占百分比(61.05%±3.98%)高于低核酸含量异养原核生物(38.95%±3.98%),然而在海山附近DCM层低核酸含量异养原核生物比例最高可达58.64%。冗余分析表明,超微型浮游生物的丰度与温度呈正相关,与深度和营养盐呈负相关关系。在M4海山超微型自养浮游生物分布没有明显的“海山效应”,但海山的存在会对异养原核生物两个类群生物量的比例产生影响。 展开更多
关键词 超微型浮游生物 丰度 生物量 M4海山 西太平洋
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气候变化新常态下对西藏水资源的保护研究
18
作者 李洁 《区域治理》 2021年第39期17-19,共3页
我国的水资源发源地主要集中在青藏高原,西藏自治区是我国河流数量最多的省区之一。湖泊面积将近28900km2,占全国湖泊总面积的30%,冰川总量将近3000亿立方米。由于西藏独特复杂的地理位置,西藏的水资源大多处于天然状态。但在当今气候... 我国的水资源发源地主要集中在青藏高原,西藏自治区是我国河流数量最多的省区之一。湖泊面积将近28900km2,占全国湖泊总面积的30%,冰川总量将近3000亿立方米。由于西藏独特复杂的地理位置,西藏的水资源大多处于天然状态。但在当今气候变化新常态下,西藏水资源面临诸多问题,气候的变化严重影响着西藏的生态系统。为了更好地推动西藏水资源的持续发展,基于此,我们将对在气候变化新常态下西藏水资源的保护展开研究。 展开更多
关键词 水资源 气候变化新常态 西藏
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微生物相互作用研究进展:从观察到预测 被引量:6
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作者 郝祎祺 张全国 《北京师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期809-815,共7页
地球上的微生物有着极高的丰富度和多样性.它们的生命活动和相互作用对维持生态系统稳定性起到关键作用;生存在宿主体内的微生物对其宿主的健康有重要影响.第二代测序技术的发展使得科学家获得了大量的关于微生物群落和功能基因组成的数... 地球上的微生物有着极高的丰富度和多样性.它们的生命活动和相互作用对维持生态系统稳定性起到关键作用;生存在宿主体内的微生物对其宿主的健康有重要影响.第二代测序技术的发展使得科学家获得了大量的关于微生物群落和功能基因组成的数据;而微生物群落和生态系统生态学的重点,正在从获得观测数据转变到理解微生物相互作用过程,并预测群落结构和功能的动态变化.近年来发展了很多针对第二代测序数据的算法和数学模型,以推测微生物种间相互作用网络,但这种自上而下的研究仍存在局限性.自下而上的实验研究可以对微生物种间作用进行直接验证,并帮助我们理解更高层次上的生态学模式和过程.与此同时,基于数学分析或模拟的理论研究展示了微生物相互作用的动态及其对群落动态和功能的影响.今后的研究应该结合观测数据、实验验证、理论模型多种研究方法,增进我们对微生物种间相互作用的理解并做出预测,以应对全球气候变化、传染病暴发、抗生素抗性进化等诸多挑战. 展开更多
关键词 微生物相互作用 相互作用推断 微生物群落动态 生态功能 第二代测序技术 相关分析 时间序列分析
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鸡生长发育中盲肠微生物菌群结构的PCR-DGGE分析 被引量:3
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作者 李永洙 Yongquan_Cui 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期118-126,共9页
研究依莎褐蛋鸡和艾维茵肉鸡发育正常及迟缓鸡群的盲肠细菌种群结构和多样性变化。使用基于16S rDNA的PCR-DGGE技术,结合割胶回收DNA进行克隆和测序,分别对4、6、10、16、20和40周龄蛋鸡及1、2、4、6、7和8周龄肉鸡发育正常、迟缓鸡群... 研究依莎褐蛋鸡和艾维茵肉鸡发育正常及迟缓鸡群的盲肠细菌种群结构和多样性变化。使用基于16S rDNA的PCR-DGGE技术,结合割胶回收DNA进行克隆和测序,分别对4、6、10、16、20和40周龄蛋鸡及1、2、4、6、7和8周龄肉鸡发育正常、迟缓鸡群盲肠内容物的细菌群落进行特异性引物图谱指纹和聚类分析,鉴定特异性和共性群落。结果表明,Lactobacillus属在两品种发育正常鸡群盲肠内容物细菌的相似性均高于迟缓鸡群,两品种各周龄和发育正常、迟缓鸡群间指纹图谱平均条带数差异显著(P<0.05)。而Bacteroides属在发育正常鸡群盲肠内容物细菌的相似性与迟缓鸡群较为相近;发育正常、迟缓鸡群间平均条带数差异显著(P<0.05)。Clostridium属在蛋鸡20、40周龄的平均条带数差异不显著(P>0.05),但肉鸡各周龄和发育正常、迟缓鸡群间的平均条带数差异显著(P<0.05)。序列测序结果,Lactobacillus属在蛋鸡产蛋期发育正常、迟缓鸡群均定居于Lactobacillus agilis;而育雏和育成期定居于Lactobacillus aviaries和不可培养的细菌。两品种发育正常、迟缓鸡群均定居于Bacteroides属的Bacteroides acidifaciens、Uncultured bacterium,而发育正常、迟缓蛋鸡群存在Clostridium属Uncultured proteobacterium,发育正常肉鸡群定居Shigella sonnei,而两品种发育迟缓鸡群均缺乏此类菌种。结果显示,依莎褐蛋鸡和艾维茵肉鸡群各饲养阶段盲肠细菌群落差异显著,对鸡群正常生长发育影响较大。 展开更多
关键词 盲肠 菌落 变性梯度凝胶电泳(DGGE)
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