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20^#-5菌株代谢产物中抗菌成分的纯化和结构测定 被引量：2
1
作者 蓝希钳 谢洁 +3 位作者 袁志辉 胡军华 肖杰 周泽扬 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期16-19,共4页
为弄清假单胞菌20#-5菌株代谢产物中的抗菌活性成分物质种类,先通过有机溶剂萃取、硅胶柱层析分离和HPLC C-18柱纯化得到纯品,再利用UV、IR、MS、1H-NMR及13C-NMR等光谱分析,确定其中的两个活性成分为phenazine-1-carboxylic ac id和3-n... 为弄清假单胞菌20#-5菌株代谢产物中的抗菌活性成分物质种类,先通过有机溶剂萃取、硅胶柱层析分离和HPLC C-18柱纯化得到纯品,再利用UV、IR、MS、1H-NMR及13C-NMR等光谱分析,确定其中的两个活性成分为phenazine-1-carboxylic ac id和3-n-heptyl-3-hydroxy-1,2,3,4-tetrahydroqu inoline-2,4-d ione。 展开更多
关键词 活性成分 纯化 结构测定
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磷酸类脂快速测定方法
2
作者 阮继生 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期190-192,共3页
磷酸类脂快速测定经修订和多年试用验证,方法简单快速,试验结果可靠。
关键词 磷酸类脂 快速测定
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Bacillus subtilis fmbJ脂肽类抗菌物质的分离和鉴定 被引量：18
3
作者 别小妹 吕凤霞 +2 位作者 陆兆新 黄现青 沈娟 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期644-649,共6页
对BacillussubtilisfmbJ脂肽类抗菌物质的分离和鉴定进行了系统研究。通过HPLC层析确定BacillussubtilisfmbJ抗菌物质由多种组分构成,其中含有保留时间与surfactin相似的成分。通过TLC层析和原位酸解确定BacillussubtilisfmbJ抗菌物质... 对BacillussubtilisfmbJ脂肽类抗菌物质的分离和鉴定进行了系统研究。通过HPLC层析确定BacillussubtilisfmbJ抗菌物质由多种组分构成,其中含有保留时间与surfactin相似的成分。通过TLC层析和原位酸解确定BacillussubtilisfmbJ抗菌物质含有两个具有闭合肽键类的物质,其中之一为迁移率Rf与标样surfactin非常相近的组分。通过ESI-MS分析检测到BacillussubtilisfmbJ抗菌物质含有分子量与fengicin相同的m/z1449.9、m/z1463.8、m/z1477.8、m/z1491.9和m/z1505.9五种同系物,和分子量与surfactin相同的m/z1008.8、m/z1022.8和m/z1036.8三种同系物。 展开更多
关键词 BACILLUS SUBTILIS fmbJ 脂肽 分离 纯化
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黄孢原毛平革菌产生的具有氧化性活力低分子肽类物质的分离纯化与性质鉴定 被引量：7
4
作者 胡明 张为灿 +1 位作者 卢雪梅 高培基 《中国科学（C辑）》 CSCD 北大核心 2006年第1期43-50,共8页
从黄孢原毛平革菌(Phanerochetechrysosporium)发酵液中分离纯化到一个新的具有酚氧化活力的低分子组分,命名为Pc因子.该组分分子量在600Da左右,含Glu,Gly,Val三种氨基酸残基,其紫外和红外光谱也显示Pc因子含有氨基酸,氨基酸的Cα信号在... 从黄孢原毛平革菌(Phanerochetechrysosporium)发酵液中分离纯化到一个新的具有酚氧化活力的低分子组分,命名为Pc因子.该组分分子量在600Da左右,含Glu,Gly,Val三种氨基酸残基,其紫外和红外光谱也显示Pc因子含有氨基酸,氨基酸的Cα信号在13C-NMR方法中也可检测到.该物质对热稳定,在酸性条件下易失活,弱碱性条件下保持稳定.它具有螯合Fe3+的能力,并能够将Fe3+还原为Fe2+,但不能产生羟基自由基HO·.在不需要Mn2+和H2O2激活的条件下能够氧化酚型木素模型物2,6-二甲氧基酚(2,6-dimethoxyphenol,2,6-DMP),2,2′-连氮二(3-乙基苯并噻唑-6-磺酸)(2,2′-azinobis(3-ethylbenzathiazoline-6-sulfinicacid),ABTS)和丁香醛连氮,其氧化作用需要金属离子和O2的参与,为木素生物降解过程中的一类新的氧化机制,Pc因子在此氧化还原体系中执行电子传递体的功能. 展开更多
关键词 黄孢原毛平革菌 Pc因子 分离纯化 酚氧化活性 木素
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秀丽小杆线虫分泌蛋白组的计算机分析 被引量：6
5
作者 吴红芝 李成云 +1 位作者 朱有勇 毕玉芬 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期470-478,共9页
结合计算机技术和生物信息学的方法,采用组合的信号肽分析软件SignalP V3.0、TargetP V1.01、Big-PIPredictor和TMHMM V2.0,预测了秀丽小杆线虫(Caenorthaditis elegansws123)的全基因组19 855个ORF编码蛋白的信号肽,同时系统分析了信... 结合计算机技术和生物信息学的方法,采用组合的信号肽分析软件SignalP V3.0、TargetP V1.01、Big-PIPredictor和TMHMM V2.0,预测了秀丽小杆线虫(Caenorthaditis elegansws123)的全基因组19 855个ORF编码蛋白的信号肽,同时系统分析了信号肽的特征。结果表明,在19 855个秀丽小杆线虫的蛋白中,有1 990条为带有信号肽的分泌型蛋白,其中,1 936条为典型的分泌型信号肽(即信号肽酶Ⅰ型信号肽),53条为信号肽酶Ⅱ型信号肽,1条为信号肽酶Ⅳ型信号肽;在Ⅰ型信号肽中,有41条为RR-motif亚组型信号肽。在1 990条信号肽中,有742条没有典型的N-区,其余1 248条包含典型的3个区。比较了秀丽小杆线虫与原核生物分泌蛋白信号肽中20种氨基酸残基在信号肽酶切位点的使用情况,表明:在Ⅰ型信号肽酶切位点,其信号肽中使用的氨基酸总体趋势与原核生物基本相似,但秀丽小杆线虫选用的氨基酸种类更多,变化更大;在Ⅱ型信号肽酶切位点,秀丽小杆线虫脂蛋白信号肽中使用的氨基酸的种类与原核生物有很大的不同。通过与真核单细胞生物比较,作为真核多细胞生物的秀丽小杆线虫,其分泌蛋白信号肽所占比例更高、种类更多,可知线虫信号肽的组成具有很高的多态性,表明该物种的分泌蛋白具有多种功能。此外,分析结果显示,脂蛋白信号肽在结构上比分泌型信号肽更为保守。在秀丽小杆线虫分泌蛋白中出现了少数氨基酸组成完全一致的信号肽,采用BLAST 2 SEQUENECES对具有相同信号肽的分泌蛋白进行了序列比对,结果表明具有相同信号肽的分泌蛋白同源性非常高,它们的存在是生物进化过程中基因倍加(duplication)及环境选择的结果,信号肽特征的详细描述必将对这些蛋白功能的研究提供重要的帮助。 展开更多
关键词 秀丽小杆线虫 分泌蛋白组 信号肽 分泌途径
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亲和磷酸蛋白组学——筛选LPS信号通路中调节蛋白的新方法
6
作者 邹志鹏 李煜生 +1 位作者 陈娟 姜勇 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期766-770,共5页
目的建立并优化亲和磷酸蛋白组学方法,发现脂多糖(LPS)刺激Thp-1巨噬细胞所诱导的磷酸化蛋白图谱的差异,以初步筛选LPS通路中的新信号分子。方法使用佛波酯刺激Thp-1单核细胞48h使之分化成为成熟的巨噬细胞,静息48h后,先后以等体积的培... 目的建立并优化亲和磷酸蛋白组学方法,发现脂多糖(LPS)刺激Thp-1巨噬细胞所诱导的磷酸化蛋白图谱的差异,以初步筛选LPS通路中的新信号分子。方法使用佛波酯刺激Thp-1单核细胞48h使之分化成为成熟的巨噬细胞,静息48h后,先后以等体积的培养基或100ng/mlLPS刺激30min。采用PMAC富集磷酸化蛋白,经超滤除盐后进行二维凝胶电泳,比较对照组和LPS组的磷酸化蛋白图谱的差异并挑选部分斑点进行质谱鉴定。结果相对于对照组,LPS刺激的细胞(LPS组)中,29个磷酸化蛋白斑点在双向电泳图谱中表现出重复的差异。其中8个斑点发生了上调,并且新出现了7个斑点;10个发生了下调,并且消失了4个斑点。选择新出现或消失的蛋白斑点进行质谱测试,鉴定出其中4个,这些蛋白参与信号转导和宿主防御反应等,其中LPS刺激后,proteasome C2亚基的磷酸化显著上调,这与文献报道的结果相符合,证实了该方法的有效性,而Z-DNA-binding protein1的磷酸化尚未见诸报道,需要进一步的验证和研究。结论亲和磷酸蛋白组学方法是筛选信号分子的有效策略,可以广泛应用于信号通路的系统性研究。 展开更多
关键词 脂多糖 双向电泳 亲和磷酸蛋白组学 蛋白图谱
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