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一种基于多路纳米孔测序技术的多种血清型沙门菌快速分型方法
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作者 王东帅 师丹阳 +1 位作者 李君文 金敏 《军事医学》 CAS CSCD 2024年第5期389-394,共6页
目的构建基于多路纳米孔测序技术的本地化沙门菌血清型分型方法,评估血清型数量和测序时间对分型结果的影响,为多种血清型沙门菌的同时快速分型提供方法。方法首先,利用纳米孔测序技术建立多菌株测序方法。其次,基于沙门菌核心基因组数... 目的构建基于多路纳米孔测序技术的本地化沙门菌血清型分型方法,评估血清型数量和测序时间对分型结果的影响,为多种血清型沙门菌的同时快速分型提供方法。方法首先,利用纳米孔测序技术建立多菌株测序方法。其次,基于沙门菌核心基因组数据库构建本地化沙门菌血清型分型流程。最后评估血清型数量和测序时间对分型结果的影响。结果建立的多种血清型沙门菌分型方法准确率和特异性均可达到100%,且在2 h测序时间内可完成6株以上不同血清型的沙门菌快速准确分型。结论该方法能够同时对多株血清型沙门菌快速分型,有效提高沙门菌血清型的鉴定效率,为环境水体中沙门菌血清型的快速鉴定提供有力支持。 展开更多
关键词 多路纳米孔测序 沙门菌 血清型 快速分型
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核糖体谱测序在病毒学研究中的应用
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作者 林永权 杨之龙 乔文涛 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期984-990,共7页
核糖体谱测序结合了RNA深度测序和核酸酶足迹技术,可同时检测细胞内全部基因的转录和翻译。用此方法检测被病毒感染的细胞,不但有可能发现新的病毒蛋白,完善病毒基因组注释,而且还可能发现新的基因翻译现象,为研究翻译机制指明方向。同... 核糖体谱测序结合了RNA深度测序和核酸酶足迹技术,可同时检测细胞内全部基因的转录和翻译。用此方法检测被病毒感染的细胞,不但有可能发现新的病毒蛋白,完善病毒基因组注释,而且还可能发现新的基因翻译现象,为研究翻译机制指明方向。同时,该方法能够检测到被病毒感染后宿主翻译水平的动态变化,为研究病毒和宿主之间的相互作用提供线索。目前,学者已经利用核糖体谱测序法分析了6个DNA病毒和4个RNA病毒感染细胞后翻译相关的特征。本文对核糖体谱测序方法在病毒学中的相关研究进行总结和分析,希望为广大病毒学研究者提供新的方法与思路。 展开更多
关键词 核糖体谱测序 组学 翻译调控 病毒-宿主相互作用
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