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一种基于多路纳米孔测序技术的多种血清型沙门菌快速分型方法
1
作者
王东帅
师丹阳
+1 位作者
李君文
金敏
《军事医学》
CAS
CSCD
2024年第5期389-394,共6页
目的构建基于多路纳米孔测序技术的本地化沙门菌血清型分型方法,评估血清型数量和测序时间对分型结果的影响,为多种血清型沙门菌的同时快速分型提供方法。方法首先,利用纳米孔测序技术建立多菌株测序方法。其次,基于沙门菌核心基因组数...
目的构建基于多路纳米孔测序技术的本地化沙门菌血清型分型方法,评估血清型数量和测序时间对分型结果的影响,为多种血清型沙门菌的同时快速分型提供方法。方法首先,利用纳米孔测序技术建立多菌株测序方法。其次,基于沙门菌核心基因组数据库构建本地化沙门菌血清型分型流程。最后评估血清型数量和测序时间对分型结果的影响。结果建立的多种血清型沙门菌分型方法准确率和特异性均可达到100%,且在2 h测序时间内可完成6株以上不同血清型的沙门菌快速准确分型。结论该方法能够同时对多株血清型沙门菌快速分型,有效提高沙门菌血清型的鉴定效率,为环境水体中沙门菌血清型的快速鉴定提供有力支持。
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关键词
多路纳米孔测序
沙门菌
血清型
快速分型
原文传递
核糖体谱测序在病毒学研究中的应用
2
作者
林永权
杨之龙
乔文涛
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第6期984-990,共7页
核糖体谱测序结合了RNA深度测序和核酸酶足迹技术,可同时检测细胞内全部基因的转录和翻译。用此方法检测被病毒感染的细胞,不但有可能发现新的病毒蛋白,完善病毒基因组注释,而且还可能发现新的基因翻译现象,为研究翻译机制指明方向。同...
核糖体谱测序结合了RNA深度测序和核酸酶足迹技术,可同时检测细胞内全部基因的转录和翻译。用此方法检测被病毒感染的细胞,不但有可能发现新的病毒蛋白,完善病毒基因组注释,而且还可能发现新的基因翻译现象,为研究翻译机制指明方向。同时,该方法能够检测到被病毒感染后宿主翻译水平的动态变化,为研究病毒和宿主之间的相互作用提供线索。目前,学者已经利用核糖体谱测序法分析了6个DNA病毒和4个RNA病毒感染细胞后翻译相关的特征。本文对核糖体谱测序方法在病毒学中的相关研究进行总结和分析,希望为广大病毒学研究者提供新的方法与思路。
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关键词
核糖体谱测序
组学
翻译调控
病毒-宿主相互作用
原文传递
题名
一种基于多路纳米孔测序技术的多种血清型沙门菌快速分型方法
1
作者
王东帅
师丹阳
李君文
金敏
机构
军事科学院军事医学研究院
出处
《军事医学》
CAS
CSCD
2024年第5期389-394,共6页
文摘
目的构建基于多路纳米孔测序技术的本地化沙门菌血清型分型方法,评估血清型数量和测序时间对分型结果的影响,为多种血清型沙门菌的同时快速分型提供方法。方法首先,利用纳米孔测序技术建立多菌株测序方法。其次,基于沙门菌核心基因组数据库构建本地化沙门菌血清型分型流程。最后评估血清型数量和测序时间对分型结果的影响。结果建立的多种血清型沙门菌分型方法准确率和特异性均可达到100%,且在2 h测序时间内可完成6株以上不同血清型的沙门菌快速准确分型。结论该方法能够同时对多株血清型沙门菌快速分型,有效提高沙门菌血清型的鉴定效率,为环境水体中沙门菌血清型的快速鉴定提供有力支持。
关键词
多路纳米孔测序
沙门菌
血清型
快速分型
Keywords
multiplex nanopore sequencing
Salmonella
serotypes
rapid detection
分类号
Q93‐332 [生物学—微生物学]
Q939.123
原文传递
题名
核糖体谱测序在病毒学研究中的应用
2
作者
林永权
杨之龙
乔文涛
机构
分子微生物学与技术教育部重点实验室
Division of Biology
出处
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第6期984-990,共7页
基金
国家自然科学基金(项目号:81571988),题目:翻译后修饰在IFITM蛋白抗病毒功能中的作用及机制研究
国家基础研究973计划(项目号:2013CB911104),题目:重要病毒转录复制蛋白复合体的结构功能研究~~
文摘
核糖体谱测序结合了RNA深度测序和核酸酶足迹技术,可同时检测细胞内全部基因的转录和翻译。用此方法检测被病毒感染的细胞,不但有可能发现新的病毒蛋白,完善病毒基因组注释,而且还可能发现新的基因翻译现象,为研究翻译机制指明方向。同时,该方法能够检测到被病毒感染后宿主翻译水平的动态变化,为研究病毒和宿主之间的相互作用提供线索。目前,学者已经利用核糖体谱测序法分析了6个DNA病毒和4个RNA病毒感染细胞后翻译相关的特征。本文对核糖体谱测序方法在病毒学中的相关研究进行总结和分析,希望为广大病毒学研究者提供新的方法与思路。
关键词
核糖体谱测序
组学
翻译调控
病毒-宿主相互作用
Keywords
Ribosome profiling
RNA-Seq
Translation regulation
Virus-host interaction
分类号
Q93‐33 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种基于多路纳米孔测序技术的多种血清型沙门菌快速分型方法
王东帅
师丹阳
李君文
金敏
《军事医学》
CAS
CSCD
2024
0
原文传递
2
核糖体谱测序在病毒学研究中的应用
林永权
杨之龙
乔文涛
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
0
原文传递
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