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EXO1基因单核苷酸多态性与云南汉族人群胃癌的相关性研究
被引量：
1
1
作者
张洁莹
寿涛
+7 位作者
杨红菊
罗丽琳
杨文娟
李琴
李苏华
李雪萍
卢春燕
郑冰蓉
《云南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期120-127,共8页
胃癌是一种由基因和环境因素相互作用、在世界范围内最常见的恶性肿瘤之一.该研究用PCRRFLP的方法,在270名健康对照个体和239名胃癌患者共509人的云南汉族人群中,对核酸外切酶1(exonuclease 1,EXO1)基因rs1635517、rs1776177、rs851797...
胃癌是一种由基因和环境因素相互作用、在世界范围内最常见的恶性肿瘤之一.该研究用PCRRFLP的方法,在270名健康对照个体和239名胃癌患者共509人的云南汉族人群中,对核酸外切酶1(exonuclease 1,EXO1)基因rs1635517、rs1776177、rs851797、rs1635498和rs1776148五个单核苷酸多态(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点进行多态检测.结果采用SPSS16.0、PHASE、HaploView4.2软件进行数据统计分析,用Logistic模型在95%置信区间内进行相关性风险度测算.结果显示,位于EXO1基因5’UTR的位点rs1635517的CC基因型携带者和C等位基因携带者患胃癌的相对风险度显著升高(p<0.05),提示该多态位点可能与胃癌发生相关.其余4个位点虽检测到多态,但它们的基因型和等位基因频率在病例和对照中无显著差异,提示这4个位点可能与云南汉族人群的胃癌发生不相关.
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关键词
核酸外切酶1基因
单核苷酸多态性
胃癌
云南汉族
原文传递
黄土丘陵区不同植被类型土壤细菌群落多样性特征
被引量：
5
2
作者
张健
徐明
《生态与农村环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期225-235,共11页
植被类型影响陆地生态系统的结构、功能及景观格局变化,也深刻地影响着土壤微生物群落的结构与功能。选取黄土丘陵区的坡耕地、淤地坝农地、果园、人工柠条灌丛、人工刺槐林、退耕地、铁杆蒿草地、杠柳群落灌丛、狼牙刺灌丛和侧柏林10...
植被类型影响陆地生态系统的结构、功能及景观格局变化,也深刻地影响着土壤微生物群落的结构与功能。选取黄土丘陵区的坡耕地、淤地坝农地、果园、人工柠条灌丛、人工刺槐林、退耕地、铁杆蒿草地、杠柳群落灌丛、狼牙刺灌丛和侧柏林10种植被类型样地,采用高通量测序技术研究不同植被类型下土壤细菌群落组成结构及其潜在功能特征,并探讨了土壤理化性质与土壤细菌群落间的相关性。结果表明,变形菌门、放线菌门为土壤细菌群落的绝对优势类群,其次包括酸杆菌门、绿湾菌门、芽单胞杆菌门、拟杆菌门和疣微菌门等次优势类群;天然植被类型的土壤细菌群落α多样性指数略大于人工植被类型,但仅有基于丰度的覆盖率估计指数(ACE)在不同植被类型土壤细菌群落间存在显著差异(P<0.05);基于优势属的相似性聚类分析发现,土壤细菌群落间相似度与植被类型特征关联密切;未知功能及氨基酸转运和代谢是土壤细菌群落的优势功能类群;冗余分析表明,全碳含量、全氮含量、有机碳含量、电导率、pH值、硝态氮含量和土壤水分含量是影响土壤细菌群落的关键环境因子;相关性热图分析表明优势属类群与环境因子间存在显著的相关关系;植被类型对土壤细菌群落组成结构和功能具有重要的影响,土壤微生物群落特征表现出其对植被类型的优势种生物学特性、植被演替、土壤性质和人为管理方式等方面的综合响应。因此,植被类型是影响黄土丘陵区土壤细菌群落结构和功能的重要驱动因素。
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关键词
植被类型
土壤微生物
高通量测序
多样性
环境因子
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职称材料
题名
EXO1基因单核苷酸多态性与云南汉族人群胃癌的相关性研究
被引量：
1
1
作者
张洁莹
寿涛
杨红菊
罗丽琳
杨文娟
李琴
李苏华
李雪萍
卢春燕
郑冰蓉
机构
云南大学医学院人类遗传学研究中心
昆明理工大学附属昆华医院
昆明医科大学第一附属医院
出处
《云南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期120-127,共8页
基金
云南省应用基础研究重点项目(2011FA004)
云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目(2009CI044)
云南大学中青年骨干教师培养计划(XT412003)
文摘
胃癌是一种由基因和环境因素相互作用、在世界范围内最常见的恶性肿瘤之一.该研究用PCRRFLP的方法,在270名健康对照个体和239名胃癌患者共509人的云南汉族人群中,对核酸外切酶1(exonuclease 1,EXO1)基因rs1635517、rs1776177、rs851797、rs1635498和rs1776148五个单核苷酸多态(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点进行多态检测.结果采用SPSS16.0、PHASE、HaploView4.2软件进行数据统计分析,用Logistic模型在95%置信区间内进行相关性风险度测算.结果显示,位于EXO1基因5’UTR的位点rs1635517的CC基因型携带者和C等位基因携带者患胃癌的相对风险度显著升高(p<0.05),提示该多态位点可能与胃癌发生相关.其余4个位点虽检测到多态,但它们的基因型和等位基因频率在病例和对照中无显著差异,提示这4个位点可能与云南汉族人群的胃癌发生不相关.
关键词
核酸外切酶1基因
单核苷酸多态性
胃癌
云南汉族
Keywords
exonuclease 1 （ EX01 ） gene
single nucleotide polymorphism （SNP）
gastric cancer （ GC ）
Yunnan Han Population
分类号
Q398 [生物学—遗传学]
原文传递
题名
黄土丘陵区不同植被类型土壤细菌群落多样性特征
被引量：
5
2
作者
张健
徐明
机构
贵州大学生命科学学院/真菌资源研究所
出处
《生态与农村环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期225-235,共11页
基金
国家自然科学基金(31960234,31660150)
贵州省农业资源环境管理站-农业与农村部项目(091821104022292027-4)。
文摘
植被类型影响陆地生态系统的结构、功能及景观格局变化,也深刻地影响着土壤微生物群落的结构与功能。选取黄土丘陵区的坡耕地、淤地坝农地、果园、人工柠条灌丛、人工刺槐林、退耕地、铁杆蒿草地、杠柳群落灌丛、狼牙刺灌丛和侧柏林10种植被类型样地,采用高通量测序技术研究不同植被类型下土壤细菌群落组成结构及其潜在功能特征,并探讨了土壤理化性质与土壤细菌群落间的相关性。结果表明,变形菌门、放线菌门为土壤细菌群落的绝对优势类群,其次包括酸杆菌门、绿湾菌门、芽单胞杆菌门、拟杆菌门和疣微菌门等次优势类群;天然植被类型的土壤细菌群落α多样性指数略大于人工植被类型,但仅有基于丰度的覆盖率估计指数(ACE)在不同植被类型土壤细菌群落间存在显著差异(P<0.05);基于优势属的相似性聚类分析发现,土壤细菌群落间相似度与植被类型特征关联密切;未知功能及氨基酸转运和代谢是土壤细菌群落的优势功能类群;冗余分析表明,全碳含量、全氮含量、有机碳含量、电导率、pH值、硝态氮含量和土壤水分含量是影响土壤细菌群落的关键环境因子;相关性热图分析表明优势属类群与环境因子间存在显著的相关关系;植被类型对土壤细菌群落组成结构和功能具有重要的影响,土壤微生物群落特征表现出其对植被类型的优势种生物学特性、植被演替、土壤性质和人为管理方式等方面的综合响应。因此,植被类型是影响黄土丘陵区土壤细菌群落结构和功能的重要驱动因素。
关键词
植被类型
土壤微生物
高通量测序
多样性
环境因子
Keywords
vegetation types
soil microbe
high-throughput sequencing
diversity
environmental factor
分类号
Q398 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
EXO1基因单核苷酸多态性与云南汉族人群胃癌的相关性研究
张洁莹
寿涛
杨红菊
罗丽琳
杨文娟
李琴
李苏华
李雪萍
卢春燕
郑冰蓉
《云南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2014
1
原文传递
2
黄土丘陵区不同植被类型土壤细菌群落多样性特征
张健
徐明
《生态与农村环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
5
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