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利用糖酵解相关LncRNA构建肺腺癌患者的预后模型
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作者 丁丹 赵荣昌 +2 位作者 丁燕 张丹丹 蔡建 《医学信息》 2024年第5期1-11,19,共12页
目的利用糖酵解相关LncRNA构建肺腺癌患者的预后模型,帮助临床预测个体化药物疗效和疾病复发情况。方法综合TCGA和GSEA数据库,筛选与肺腺癌中糖酵解相关lncRNA表达数据,利用LASSO和Cox回归分析构建预后模型,绘制受试者工作特征曲线(ROC... 目的利用糖酵解相关LncRNA构建肺腺癌患者的预后模型,帮助临床预测个体化药物疗效和疾病复发情况。方法综合TCGA和GSEA数据库,筛选与肺腺癌中糖酵解相关lncRNA表达数据,利用LASSO和Cox回归分析构建预后模型,绘制受试者工作特征曲线(ROC)并加以校准,将临床病理特征和风险评分进行整合构建列线图,分析免疫细胞分布、免疫相关分子和药物敏感性的差异与风险评分的关系。结果在GSEA数据库中共选取出4个有效糖酵解基因集(BioCarta、Hallmark、KEGG、REACTOME和WP),与TCGA数据中的lncRNA表达数据结合获得1025个与糖酵解相关的lncRNA。差异分析获得186个在肿瘤组织和正常组织间差异表达的糖酵解相关lncRNA;单因素Cox、LASSO回归分析获得19个与预后相关的lncRNA。多因素Cox比例风险回归分析获得了由12个lncRNA组成的预测模型。模型ACU提示预测性能较好,1、3、5年生存时间的AUC分别为0.711、0.713和0.699,并且可将肺腺癌区分为高、低风险组,高、低风险组的总生存期(OS)比较,差异有统计学意义(P<0.05)。单因素和多因素Cox分析显示,风险评分可作为预测肺腺癌生存状态的独立预后指标,并且风险评分的预测性能优于其它临床病理特征。此外,不同的性别、T、N、M和Stage分期的风险评分比较,差异有统计学意义(P<0.05)。风险评分与临床病理特征构建的列线图对1、3、5年预后的预测能力均有提升(1、3、5年生存时间的AUC分别为0.741、0.750和0.715)。高、低风险组间免疫微环境比较,差异有统计学意义(P<0.05),表现为多数免疫细胞与低风险评分呈正相关。药物敏感性分析提示丝裂霉素C、紫杉醇、雷帕霉素、多西他赛和厄洛替尼的药物敏感性在高、低风险组间也存在区别。结论糖酵解相关lncRNA构建的肺腺癌预后模型可以高效准确的预测肺腺癌患者的预后,具有一定的临床意义。 展开更多
关键词 肺腺癌 糖酵解 lncRNA 预后 列线图 药物敏感性
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GIS支持下的西北干旱区地下侧向径流量的计算研究——以新疆淖毛湖盆地为例 被引量：1
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作者 赵荣昌 王春磊 《甘肃地质》 2019年第1期85-90,共6页
在总结研究区各断面地下水侧向径流量常规算法的基础上,通过分析已有钻孔、物探成果,结合研究区水文地质条件确定达西公式各计算参数沿断面的空间分布特征,生成计算断面参数栅格,并基于GIS采用栅格空间叠加分析计算各计算断面上的地下... 在总结研究区各断面地下水侧向径流量常规算法的基础上,通过分析已有钻孔、物探成果,结合研究区水文地质条件确定达西公式各计算参数沿断面的空间分布特征,生成计算断面参数栅格,并基于GIS采用栅格空间叠加分析计算各计算断面上的地下水侧向径流量,结果表明前人计算结果与栅格叠加分析法计算结果大体上一致,但也存在一定差异。常规的分段计算方法,常用一个参数来表征较大尺度断面,人为因素对计算结果影响较大,基于GIS的栅格叠加分析法充分考虑了各计算参数在二维空间上的各向异性,参数选取更符合实际,结果也更为可靠,计算值可直接耦合为地下水数值模型中的二类边界(定流量边界),避免流量边界上的人为分配情况,提高模型计算精度。 展开更多
关键词 GIS 地下水侧向径流量 常规计算方法 栅格叠加分析 西北干旱区
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