【目的】分析不同含油量油梨果肉的转录组、生理生化和细胞学水平差异,为挖掘油梨果肉脂肪酸合成过程的相关基因及油梨新品种选育提供参考依据。【方法】以3个油梨品种Hass、RL-1和RL-2成熟果肉为试验材料,采用IlluminaHiSeq2500测序平...【目的】分析不同含油量油梨果肉的转录组、生理生化和细胞学水平差异,为挖掘油梨果肉脂肪酸合成过程的相关基因及油梨新品种选育提供参考依据。【方法】以3个油梨品种Hass、RL-1和RL-2成熟果肉为试验材料,采用IlluminaHiSeq2500测序平台完成测序,以|log2FoldChange|>1和P<0.05为标准,通过DEGseq(v2)获得差异表达Unigenes,通过韦恩图和火山图分析3个比较组(RL-1vsHass、RL-2vsHass和RL-2vsRL-1)差异表达Unigenes,并进行GO功能注释、KEGG信号通路富集和聚类分析,采用实时荧光定量PCR验证转录组测序结果,测定3个油梨品种的含油量,采用激光共聚焦技术在40倍物镜下观察油梨成熟果肉中的油体。【结果】3个油梨品种成熟果肉的转录本中,在至少2个样品间有显著差异的Unigenes共19007条(P<0.05,下同);在3个比较组间相对表达量有明显差异的Unigenes共3000个。在RL-2 vs Hass比较组中有9个功能条目显著富集,RL-1 vs Hass比较组中只有细胞组分类别下的3个功能条目显著富集;仅2个KEGG信号通路在RL-2 vs Hass比较组中显著富集。筛选到32条参与油梨果肉脂肪酸合成的差异表达Unigenes;聚类分析结果显示,差异表达Unigenes表达模式分为2组。实时荧光定量PCR验证结果表明转录组测序数据可靠。3个油梨品种成熟果肉含油量排序为Hass>RL-2>RL-1,油梨果肉油体差异观察结果显示,Hass成熟果肉中油体较大,最大的直径达15~20μm。【结论】筛选到与油梨果肉脂肪酸成分合成相关的32条差异表达Unigenes,其中5条Unigenes[PaPDH(E1β)、PaACP4-1、PaACP4-2、PaSAD(FAB2)和PaFaTA]在3个油梨品种成熟果肉中的相对表达量较高。展开更多
文摘【目的】分析不同含油量油梨果肉的转录组、生理生化和细胞学水平差异,为挖掘油梨果肉脂肪酸合成过程的相关基因及油梨新品种选育提供参考依据。【方法】以3个油梨品种Hass、RL-1和RL-2成熟果肉为试验材料,采用IlluminaHiSeq2500测序平台完成测序,以|log2FoldChange|>1和P<0.05为标准,通过DEGseq(v2)获得差异表达Unigenes,通过韦恩图和火山图分析3个比较组(RL-1vsHass、RL-2vsHass和RL-2vsRL-1)差异表达Unigenes,并进行GO功能注释、KEGG信号通路富集和聚类分析,采用实时荧光定量PCR验证转录组测序结果,测定3个油梨品种的含油量,采用激光共聚焦技术在40倍物镜下观察油梨成熟果肉中的油体。【结果】3个油梨品种成熟果肉的转录本中,在至少2个样品间有显著差异的Unigenes共19007条(P<0.05,下同);在3个比较组间相对表达量有明显差异的Unigenes共3000个。在RL-2 vs Hass比较组中有9个功能条目显著富集,RL-1 vs Hass比较组中只有细胞组分类别下的3个功能条目显著富集;仅2个KEGG信号通路在RL-2 vs Hass比较组中显著富集。筛选到32条参与油梨果肉脂肪酸合成的差异表达Unigenes;聚类分析结果显示,差异表达Unigenes表达模式分为2组。实时荧光定量PCR验证结果表明转录组测序数据可靠。3个油梨品种成熟果肉含油量排序为Hass>RL-2>RL-1,油梨果肉油体差异观察结果显示,Hass成熟果肉中油体较大,最大的直径达15~20μm。【结论】筛选到与油梨果肉脂肪酸成分合成相关的32条差异表达Unigenes,其中5条Unigenes[PaPDH(E1β)、PaACP4-1、PaACP4-2、PaSAD(FAB2)和PaFaTA]在3个油梨品种成熟果肉中的相对表达量较高。
