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中国辣椒低温响应转录因子CBF全基因组鉴定与分析
被引量:
4
1
作者
叶正
高崇伦
+6 位作者
zakaria
gagoshidze
舒黄英
包文龙
朱婕
成善汉
朱国鹏
汪志伟
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021年第15期4903-4910,共8页
CBF(C-repeat binding factor)转录因子在植物应对低温等非生物胁迫和提高耐寒性中发挥着重要作用。为了探究中国辣椒(Capsicum chinense Jacq.)CBF基因家族的基本特性,利用生物信息学方法,在中国辣椒基因组中鉴定获得8个CBF基因家族转...
CBF(C-repeat binding factor)转录因子在植物应对低温等非生物胁迫和提高耐寒性中发挥着重要作用。为了探究中国辣椒(Capsicum chinense Jacq.)CBF基因家族的基本特性,利用生物信息学方法,在中国辣椒基因组中鉴定获得8个CBF基因家族转录因子,对其理化性质、蛋白结构、系统发育、作用元件和基因转录进行了分析。结果表明,8个CBF蛋白长度为156~290 aa,蛋白分子量为17.75~32.21 kD;这些蛋白均包含AP2结构域。系统发育分析表明,中国辣椒8个CBF基因可分为两个亚组,其中A组包含7个基因,B组仅包含1个基因。表达分析表明,8个CBF基因对低温冷胁迫均有不同程度的响应。研究结果概括了中国辣椒CBF基因家族的基本特性,为CBF转录因子的深入研究和应用积累了基础数据。
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关键词
中国辣椒(Capsicum
chinense)
低温响应
CBF转录因子
基因家族
原文传递
题名
中国辣椒低温响应转录因子CBF全基因组鉴定与分析
被引量:
4
1
作者
叶正
高崇伦
zakaria
gagoshidze
舒黄英
包文龙
朱婕
成善汉
朱国鹏
汪志伟
机构
海南大学园艺学院
出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021年第15期4903-4910,共8页
基金
国家重点研发计划(2018YFD1000800)
海南省研究生创新基金(Hyb 2017-18)
海南大学高层次人才启动基金(KYQD1656)共同资助。
文摘
CBF(C-repeat binding factor)转录因子在植物应对低温等非生物胁迫和提高耐寒性中发挥着重要作用。为了探究中国辣椒(Capsicum chinense Jacq.)CBF基因家族的基本特性,利用生物信息学方法,在中国辣椒基因组中鉴定获得8个CBF基因家族转录因子,对其理化性质、蛋白结构、系统发育、作用元件和基因转录进行了分析。结果表明,8个CBF蛋白长度为156~290 aa,蛋白分子量为17.75~32.21 kD;这些蛋白均包含AP2结构域。系统发育分析表明,中国辣椒8个CBF基因可分为两个亚组,其中A组包含7个基因,B组仅包含1个基因。表达分析表明,8个CBF基因对低温冷胁迫均有不同程度的响应。研究结果概括了中国辣椒CBF基因家族的基本特性,为CBF转录因子的深入研究和应用积累了基础数据。
关键词
中国辣椒(Capsicum
chinense)
低温响应
CBF转录因子
基因家族
Keywords
Capsicum chinense
Cold response
C-repeat binding transcription factor
Gene family
分类号
S641.3 [农业科学—蔬菜学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中国辣椒低温响应转录因子CBF全基因组鉴定与分析
叶正
高崇伦
zakaria
gagoshidze
舒黄英
包文龙
朱婕
成善汉
朱国鹏
汪志伟
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021
4
原文传递
已选择
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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