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基于WGCNA与GSEA方法挖掘调控中卫山羊羊毛弯曲相关基因 被引量:5
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作者 李晓波 刘占发 +4 位作者 刘悦 陈倩 马月辉 赵倩君 叶绍辉 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期2930-2943,共14页
旨在探究中卫山羊羊毛弯曲随生长发生变化的分子机制,挖掘不同发育时期影响羊毛弯曲度的关键基因。试验采集了3只中卫山羊出生后45日龄(弯曲毛)和365日龄(直毛)的皮肤组织,进行转录组测序(RNA-seq),使用WGCNA与GSEA分析找出Hub基因。以P... 旨在探究中卫山羊羊毛弯曲随生长发生变化的分子机制,挖掘不同发育时期影响羊毛弯曲度的关键基因。试验采集了3只中卫山羊出生后45日龄(弯曲毛)和365日龄(直毛)的皮肤组织,进行转录组测序(RNA-seq),使用WGCNA与GSEA分析找出Hub基因。以P-value<0.05和|logFoldChange|≥1作为差异表达基因筛选的标准,45日龄为对照组,365日龄为试验组共筛选得到1 252个显著差异表达基因,包括812个表达上调基因和440个下调基因。基于WGCNA方法分析共得到14个模块,其中黄色和绿松石模块与被毛弯曲表型相关。利用String和Cytoscape构建网络,筛选到20个影响羊毛弯曲度的核心基因。从GSEA结果中筛选的被显著富集通路Hedgehog signaling pathway、JAK/STAT signaling pathway、TGF/BETA signaling pathway等参与了毛囊发育调控。综合KEGG、WGCNA、分子网络构建、GSEA分析结果,共同筛选得到基因CCL27、IL7、WNT2,推断这3个基因在调控毛囊发育中起到了关键的调控作用。本研究为进一步阐明动物毛发弯曲的分子机制提供了理论基础。 展开更多
关键词 中卫山羊 转录组测序 羊毛弯曲 WGCNA GSEA
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血清25羟基维生素D、胱抑素-C、同型半胱氨酸与高血压合并骨质疏松症的相关性分析
2
作者 赵黔军 朱颜鑫 +2 位作者 陈祖江 卢钰 王超 《海军医学杂志》 2023年第9期990-994,共5页
目的 探讨血清25羟基维生素D[25-hydroxyvitamin D,25(OH)D]、胱抑素-C(cystatin C,Cys-C)、同型半胱氨酸(homocysteine,Hcy)与高血压合并骨质疏松症(osteoporosis,OP)的关系。方法 选取2019年10月至2022年10月北京积水潭医院贵州医院... 目的 探讨血清25羟基维生素D[25-hydroxyvitamin D,25(OH)D]、胱抑素-C(cystatin C,Cys-C)、同型半胱氨酸(homocysteine,Hcy)与高血压合并骨质疏松症(osteoporosis,OP)的关系。方法 选取2019年10月至2022年10月北京积水潭医院贵州医院收治的185例单纯原发性高血压患者作为研究对象,根据是否合并OP划分为不伴OP组(103例)与伴OP组(82例)。另于同期选取本院80名体检健康者,设为对照组。比较3组研究对象临床资料差异,采用Pearson相关性分析各项指标与L2~4骨密度的关系,采用多元Logistic回归模型分析高血压并发OP的相关因素。结果 3组研究对象年龄、性别、三酰甘油(triacylglycerol,TC)比较差异无统计学意义(P>0.05)。3组研究对象体重指数(body mass index,BMI)、收缩压、舒张压、高密度脂蛋白胆固醇(high density lipoprotein cholesterol,HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(low-density lipoprotein cholesterol,LDL-C)、25(OH)D、Cys-C、Hcy、L2~4骨密度比较差异有统计学意义(P<0.05)。Pearson相关性分析显示,BMI与L2~4骨密度无明显相关性(P>0.05);HDL-C、25(OH)D与L2~4骨密度呈显著正相关(P<0.05);TG、Cys-C、Hcy与L2~4骨密度呈显著负相关(P<0.05)。多元Logistic回归分析显示,LDL-C、Cys-C、Hcy为高血压并发OP的独立危险因素(P<0.05),HDL-C、25(OH)D为高血压并发OP的保护因素(P<0.05)。结论 高血压合并OP患者血清25(OH)D、L2~4骨密度水平下降,Cys-C、Hcy水平升高。25(OH)D、Cys-C、Hcy与L2~4骨密度变化、高血压并发OP紧密相关。 展开更多
关键词 高血压 骨质疏松症 25羟基维生素D 胱抑素-C 同型半胱氨酸
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切换网络控制系统鲁棒H;容错控制 被引量:1
3
作者 赵千钧 付兴建 《机床与液压》 北大核心 2022年第1期144-149,共6页
研究一类具有参数不确定的网络化控制系统,同时考虑数据丢包和网络时延对系统性能产生的影响,将服从伯努利丢包的网络控制系统视为以一定速率切换的开关。针对既有传感器失效又有执行器失效的故障情形,引入一种状态反馈控制器,并基于Lya... 研究一类具有参数不确定的网络化控制系统,同时考虑数据丢包和网络时延对系统性能产生的影响,将服从伯努利丢包的网络控制系统视为以一定速率切换的开关。针对既有传感器失效又有执行器失效的故障情形,引入一种状态反馈控制器,并基于Lyapunov理论和异步动态系统理论,对网络控制系统进行鲁棒容错控制问题的研究,给出系统在此情形下保持渐近稳定的充分条件,通过求解线性矩阵不等式,得到了执行器和传感器同时失效情况下的容错控制器。最后通过算例仿真证明了所提方法的有效性。 展开更多
关键词 切换网络控制系统 多故障并发 状态反馈 鲁棒容错
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生肌调节因子在绵羊不同胎儿期心肌和骨骼肌中的表达 被引量:2
4
作者 韩建刚 关伟军 +4 位作者 何晓红 浦亚斌 赵倩军 蒋琳 马月辉 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第10期3123-3131,共9页
本试验旨在探究生肌调节因子(myogenic regulatory factors,MRFs)在绵羊不同胎儿发育时期心肌和骨骼肌组织中的表达情况。选取妊娠60(E60)、70(E70)、80(E80)和90 d(E90)4个不同时期的滩羊胎儿作为研究对象,采集骨骼肌和心肌组织,通过H... 本试验旨在探究生肌调节因子(myogenic regulatory factors,MRFs)在绵羊不同胎儿发育时期心肌和骨骼肌组织中的表达情况。选取妊娠60(E60)、70(E70)、80(E80)和90 d(E90)4个不同时期的滩羊胎儿作为研究对象,采集骨骼肌和心肌组织,通过HE和油红染色观察心肌和骨骼肌在胎儿发育过程中发生的组织形态学变化;通过实时荧光定量PCR研究绵羊胎儿发育过程中MRFs在心肌和骨骼肌组织中的表达规律以及同一胎儿期MRFs在心肌和骨骼肌中的表达差异。HE染色结果显示,心肌组织和骨骼肌组织的微观结构差异明显,心肌肌纤维密度大,纵横交错成网状,和骨骼肌相比发育的更加成熟;骨骼肌组织肌纤维密度小,间隙大,E60~E90肌纤维数量逐渐增加,肌纤维束结构清晰分明。油红染色结果显示,心肌和骨骼肌组织在4个时期均未出现被染成红色的脂滴,表明E60~E90两个组织均没有分化出脂肪。实时荧光定量PCR结果显示,E60~E90胎儿心肌组织中MYOG、Myf5和Myf6基因表达量持续降低,但是没有MYOD基因表达;E60~E90骨骼肌组织中MYOD、MYOG和Myf6基因表达量持续上升,其中MYOG基因表达水平最高,Myf5基因的表达发生周期性波动。以上结果表明,E60~E90胎儿骨骼肌正处于快速发育阶段,而心肌组织此时已大致成型。因此,骨骼肌组织中MRFs的表达量远远高于心肌组织,且MYOG基因对于维持骨骼肌的快速发育发挥了重要作用。 展开更多
关键词 生肌调节因子 心肌 骨骼肌 胎儿发育
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基于瘤胃转录组探究双峰驼沙漠适应性分子机制 被引量:1
5
作者 方艳 周俊文 +5 位作者 关伟军 蒋琳 浦亚斌 赵倩君 何晓红 马月辉 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期77-87,共11页
旨在比较胚胎期和成年期双峰驼瘤胃在组织形态、编码基因表达上的变化,挖掘影响双峰驼瘤胃发育的关键基因和通路,从消化系统探究双峰驼的沙漠适应性机制。本研究选取3峰10~12岁健康状况良好的成年期阿拉善双峰驼,以及3峰9~10月龄健康状... 旨在比较胚胎期和成年期双峰驼瘤胃在组织形态、编码基因表达上的变化,挖掘影响双峰驼瘤胃发育的关键基因和通路,从消化系统探究双峰驼的沙漠适应性机制。本研究选取3峰10~12岁健康状况良好的成年期阿拉善双峰驼,以及3峰9~10月龄健康状况良好的胚胎期阿拉善双峰驼,采集瘤胃组织样品,制作石蜡组织切片,观察成年期与胚胎期双峰驼瘤胃,比较其组织结构之间的差异。分别提取成年期和胚胎期双峰驼的瘤胃组织总RNA,利用Illumination Hiseq 2000测序平台分别进行转录组测序,对转录组数据进行质控、比对、差异基因筛选、GO、KEGG富集分析。随机选择6个差异表达基因进行荧光定量试验,关联转录组数据与荧光定量试验的表达趋势。结果表明,胚胎期瘤胃组织中上皮细胞和肌纤维细胞清晰可见,分布密集,在成年期的瘤胃组织中,可见明显的肌纤维,肌纤维直径较宽,肌纤维间的空隙较大。转录组测序结果显示,每个样本获得至少10G的数据量,各样本的质控率都在90%以上,Q30数据都在88%以上。对测序数据进行分析,以胚胎期为对照组,成年期为试验组,筛选到1 207个差异表达基因,其中上调基因456个,下调基因751个;对差异表达基因进行层次聚类分析,结果显示,成年期的3个个体(M1、M2、M3)表达模式接近,胚胎期的3个个体(T1、T2、T3)表达模式接近。对差异表达基因进行GO和KEGG富集分析,结果显示,上调差异表达基因显著富集到62条显著的GO条目,下调差异表达基因显著富集到366条显著的GO条目,73条显著的KEGG通路。差异表达基因主要富集在代谢过程的负调控、RNA生物合成过程的负调控、基因表达的负调控等GO条目中,KEGG主要富集到MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号、胰岛素信号通路、醛固酮的合成与分泌等通路中。同时筛选到MAPK12、MAPK13、FABP5、PPA 展开更多
关键词 双峰驼 瘤胃 差异表达基因 适应性 转录组测序
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WOD序列移动平均过程的完全矩收敛性
6
作者 赵倩君 杨炬 《合肥学院学报(综合版)》 2022年第5期15-20,33,共7页
设{Y_(n),-∞<n<+∞}是双侧无穷的随机变量序列,{a_(n),-∞<n<+∞}是绝对可和的实值常数序列。证明WOD下移动平均过程X_(n)=∑^(+∞)_(i=-∞)a_(i)Y_(i+n),n≥1的完全矩收敛性.这一结果部分地推广和改进了已有的研究结果。
关键词 WOD随机变量 移动平均过程 完全矩收敛
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多故障网络控制系统鲁棒H∞容错控制
7
作者 赵千钧 付兴建 《北京信息科技大学学报(自然科学版)》 2020年第5期43-50,共8页
研究了一类具有参数不确定性的非线性网络化控制系统,同时考虑数据丢包和网络时延的影响,利用T-S模糊模型对其进行描述。针对既有传感器失效,又有执行器失效的故障情形,引入一种状态反馈控制器,并基于Lyapunov稳定定理以及引入的积分不... 研究了一类具有参数不确定性的非线性网络化控制系统,同时考虑数据丢包和网络时延的影响,利用T-S模糊模型对其进行描述。针对既有传感器失效,又有执行器失效的故障情形,引入一种状态反馈控制器,并基于Lyapunov稳定定理以及引入的积分不等式,给出了在传感器失效和执行器失效故障下具有鲁棒完整性的充分条件,并进行了证明。最后通过算例仿真证明了这种设计方法的有效性和可行性。 展开更多
关键词 网络控制系统 多故障并发 鲁棒容错
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NA随机变量对数律的收敛速度
8
作者 邱德华 赵倩君 《应用概率统计》 CSCD 北大核心 2023年第5期659-666,共8页
设{X,X_(n),n>1}是同分布的NA随机变量序列,h(·)>0是定义在(0,∞)上的不减函数且满足∫_(1)^(∞)[th(t)^(-1)dt=∞.令ψ(t)=∫_(1)^(t)[sh(s)]^(-1)ds,t≥1,S_(n)=Σ_(i=1)^(n)X_(i),n≥1,Lt=ln max{e,t}.本文证明了Σ_(n)^(... 设{X,X_(n),n>1}是同分布的NA随机变量序列,h(·)>0是定义在(0,∞)上的不减函数且满足∫_(1)^(∞)[th(t)^(-1)dt=∞.令ψ(t)=∫_(1)^(t)[sh(s)]^(-1)ds,t≥1,S_(n)=Σ_(i=1)^(n)X_(i),n≥1,Lt=ln max{e,t}.本文证明了Σ_(n)^(∞)=1[nh(n)]^(-1)P(max_(1)≤j≤n|S_(j)|≥(1+ε)σ√2nLψ(n))<∞,∀ε>0成立的充要条件是E(X)=0和E(X^(2))=σ^(2)∈(0,∞).这一结果部分地推广了文献[7]的结论. 展开更多
关键词 NA随机变量 对数律 收敛速度
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青海省绵羊品种与引进品种先天性免疫研究 被引量:3
9
作者 张潆月 汪文强 +3 位作者 马利青 浦亚斌 马月辉 赵倩君 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第7期1873-1880,共8页
为研究青海本地绵羊品种与引进品种的先天性免疫水平和品种特性,本研究选取青海省不同海拔地区的2个本地品种(欧拉羊、白藏羊)和1个引进品种(无角道赛特羊)共186只绵羊,采集新鲜血样,进行血常规检测(白细胞数(WBC)、红细胞数(RBC)、平... 为研究青海本地绵羊品种与引进品种的先天性免疫水平和品种特性,本研究选取青海省不同海拔地区的2个本地品种(欧拉羊、白藏羊)和1个引进品种(无角道赛特羊)共186只绵羊,采集新鲜血样,进行血常规检测(白细胞数(WBC)、红细胞数(RBC)、平均红细胞血红蛋白(HGB)、红细胞压积(HCT)、平均红细胞体积(MCV)、平均红细胞血红蛋白浓度(MCH)、血红蛋白浓度(MCHC)、血小板(PLT)、红细胞分布宽度(RDW-CV)、淋巴细胞百分比(LYM%));制备血清,用绵羊ELISA试剂盒测定白介素-1(IL-1)、白介素-2(IL-2)、白介素-6(IL-6)、白介素-18(IL-18)、γ-干扰素(IFN-γ)、免疫球蛋白G(IgG)和主要组织相容性复合体(MHC)等免疫指标;分别以品种和品种来源地为因变量对检测结果进行比较分析。结果发现,以品种为因变量,无角道赛特羊的免疫水平最高,白藏羊的抗病性稍高于欧拉羊;以品种来源地为因变量时,本地绵羊品种的先天性免疫水平低于引进绵羊品种,对疾病的抵抗力较弱,除MCH、MCHC和RDW-CV外,无角道赛特羊在血液生化水平上均高于青海本地品种,说明无角道赛特羊是具有高抗病能力的优良品种。本试验为不同绵羊品种机体先天性免疫水平的研究提供了参考数据,对青海藏羊的选育工作和品种改良具有指导意义。 展开更多
关键词 绵羊 先天性免疫 ELISA
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羊毛弯曲及毛囊发育相关生物学机制研究进展 被引量:3
10
作者 丁洋洋 刘占发 +3 位作者 孟详人 马月辉 浦亚斌 赵倩君 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期9-17,共9页
羊毛弯曲是影响羊毛品质高低的关键因素之一,毛股弯曲的减少以及毛股由紧实变得蓬松会导致羊毛品质下降,从而影响皮毛价值。毛囊是调控毛发生长的皮肤附属器官,对于毛发弯曲形状的形成具有重要作用。近年来,有关羊、小鼠等动物毛发纤维... 羊毛弯曲是影响羊毛品质高低的关键因素之一,毛股弯曲的减少以及毛股由紧实变得蓬松会导致羊毛品质下降,从而影响皮毛价值。毛囊是调控毛发生长的皮肤附属器官,对于毛发弯曲形状的形成具有重要作用。近年来,有关羊、小鼠等动物毛发纤维弯曲形成的相关研究以及毛囊发育调控等取得了一定进展。本文介绍了羊毛纤维结构的特点,阐述了毛囊发育相关重要调控信号通路及其对毛发弯曲的影响,最后,基于羊毛弯曲相关的基因和蛋白的研究进展进行综述。通过对羊毛弯曲及毛囊发育相关生物学机制进行总结,以期对羊毛弯曲及毛囊发育的相关分子机制的研究提供理论依据,同时也对改良羊毛弯曲性状的工作提供一些参考。 展开更多
关键词 羊毛弯曲 毛囊发育 蛋白 机制
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染色质开放性与动物胚胎发育关系的研究进展 被引量:1
11
作者 刘悦 薛翔澜 +5 位作者 李晓波 蒋琳 浦亚斌 何晓红 马月辉 赵倩君 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期680-687,共8页
染色质开放性是指核小体或转录因子等蛋白与真核生物染色质DNA结合后,对其他蛋白能否再结合的开放程度,这一特性能够反映转录活性。染色质结构是动态变化的,染色质开放性与动物生长发育、细胞分化等过程密切相关,基因组开放染色质高效... 染色质开放性是指核小体或转录因子等蛋白与真核生物染色质DNA结合后,对其他蛋白能否再结合的开放程度,这一特性能够反映转录活性。染色质结构是动态变化的,染色质开放性与动物生长发育、细胞分化等过程密切相关,基因组开放染色质高效精准定位可为解析基因表达调控机制提供重要线索。本文介绍染色质开放性检测方法、染色质开放性的影响因素,重点阐述染色质开放性与动物发育的关系并对其发展及应用前景进行阐述,以期为动物发育基因表达调控等相关研究提供参考依据。 展开更多
关键词 染色质开放性 表观遗传 基因表达 胚胎发育
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山羊毛乳头细胞分离鉴定及TGF-β/smad通路相关基因的表达 被引量:1
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作者 丁洋洋 赵会静 +5 位作者 关伟军 何晓红 浦亚斌 蒋琳 马月辉 赵倩君 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第9期2724-2731,共8页
试验旨在分离山羊毛乳头细胞,并探索其中TGF-β/smad通路相关基因的表达,为体外开展山羊毛囊发育的相关机制研究提供良好模型。采用中性蛋白酶与胶原酶两步消化法对山羊背部皮肤做处理,在体视显微镜下分离毛乳头细胞并进行纯化。细胞免... 试验旨在分离山羊毛乳头细胞,并探索其中TGF-β/smad通路相关基因的表达,为体外开展山羊毛囊发育的相关机制研究提供良好模型。采用中性蛋白酶与胶原酶两步消化法对山羊背部皮肤做处理,在体视显微镜下分离毛乳头细胞并进行纯化。细胞免疫荧光和Western blotting验证平滑肌肌动蛋白(α-smooth muscle actin,α-SMA)和波形蛋白(vimentin,VIM)在体外培养的毛乳头细胞中的表达,并检测TGF-β/smad通路中相关基因在山羊毛乳头细胞中的表达情况。结果显示,分离后进行贴壁培养的毛乳头细胞生长较慢,在分离15 d后具有成熟形态,可进行传代培养。细胞免疫荧光和Western blotting结果表明,α-SMA和VIM在体外培养的毛乳头细胞中均表达,TGF-β/smad通路中smad4、smad5基因的表达水平显著高于对照组(P<0.05),smad2、smad6、smad7基因的表达量极显著高于对照组(P<0.01),这些与毛囊发育相关的关键基因均呈现高表达,表明毛乳头细胞可能通过TGF-β/smad通路的调控从而影响毛囊的发育。本研究成功分离出山羊毛乳头细胞,为体外研究山羊毛囊发育机制奠定良好的理论基础和细胞模型。 展开更多
关键词 山羊 毛乳头细胞 酶消化法 TGF-Β/SMAD 毛囊发育
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基因间长链非编码RNA在骨骼肌发育中的研究进展
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作者 鲍晶晶 浦亚斌 +1 位作者 马月辉 赵倩君 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期461-473,共13页
骨骼肌是肉用动物机体最重要的组成部分,维持机体运动并为人类提供生活必需的肉产品,骨骼肌生长发育过程中调控机制的不同会引起肌肉产量和肉品质的差异。基因间长链非编码RNA (long intergenic noncoding RNA,lincRNA)是一类位于基因间... 骨骼肌是肉用动物机体最重要的组成部分,维持机体运动并为人类提供生活必需的肉产品,骨骼肌生长发育过程中调控机制的不同会引起肌肉产量和肉品质的差异。基因间长链非编码RNA (long intergenic noncoding RNA,lincRNA)是一类位于基因间区,具有较低蛋白编码潜能的长度大于200 nt的RNA。lincRNA的表达具有时空特异性和组织特异性,在表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等多个方面发挥生物学功能。近年来,高通量RNA-seq技术的迅猛发展已经鉴定出了许多与骨骼肌发育相关的lincRNAs,人和小鼠等模式生物研究表明,lincRNA参与调控骨骼肌生长发育、肌细胞的生长增殖、迁移、分化和凋亡等各个环节。本文综述了lincRNA的进化保守性、与mRNAs相比lincRNA的特征、lincRNA在骨骼肌发育中的调控机制及其在畜禽中的研究进展。 展开更多
关键词 lincRNA 保守性 骨骼肌发育 调控机制
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基于调节级压力的汽轮机最佳滑压运行方式 被引量:8
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作者 赵家毅 李千军 +1 位作者 杨涛 李友良 《广东电力》 2017年第5期1-4,共4页
针对电厂机组滑压曲线随着外界条件变化产生偏移的问题,结合汽轮机的变工况理论,提出了一种以调节级压力为自变量的滑压曲线。基于该曲线,提出了一种汽轮机最佳滑压运行方式控制方法,克服了供热抽汽量和排汽压力等热力参数变化对滑压曲... 针对电厂机组滑压曲线随着外界条件变化产生偏移的问题,结合汽轮机的变工况理论,提出了一种以调节级压力为自变量的滑压曲线。基于该曲线,提出了一种汽轮机最佳滑压运行方式控制方法,克服了供热抽汽量和排汽压力等热力参数变化对滑压曲线的影响;该方法采用先"粗调"后"精调"逐步逼近的自适应控制模式,能够保持较快的响应速度,便于在电厂分散控制系统(distributed control system,DCS)实施,实现对汽轮机运行工况的精确调节,提高机组运行经济性。 展开更多
关键词 汽轮机 滑压曲线 调节级压力 滑压运行优化 最佳运行方式
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