目的应用宏基因组学二代测序(metagenomics next generation sequencing,mNGS)技术检测重症肺炎真菌感染患者病原体,探讨其诊断重症肺炎真菌感染的临床应用价值。方法重症肺炎真菌感染患者20例,其中经传统病原微生物培养(痰培养、肺泡...目的应用宏基因组学二代测序(metagenomics next generation sequencing,mNGS)技术检测重症肺炎真菌感染患者病原体,探讨其诊断重症肺炎真菌感染的临床应用价值。方法重症肺炎真菌感染患者20例,其中经传统病原微生物培养(痰培养、肺泡灌洗液/胸腔积液培养)明确病原学17例,另3例符合临床诊断标准,但未明确病原学。收集患者肺泡灌洗液标本19例,胸腔积液1例,并采用mNGS进一步检测病原体。结果经传统病原学检测明确病原学17例中,7例肺孢子菌,4例白色念珠菌,3例曲霉菌,1例肺孢子菌混合鲍曼不动杆菌,1例根霉菌,1例隐球菌;另3例符合真菌感染临床诊断者,经mNGS确定病原体1例为肺孢子菌感染合并白色念珠菌,2例为肺孢子菌感染合并鲍曼不动杆菌感染。7例传统培养明确肺孢子菌感染标本中,mNGS检测发现3例同时合并曲霉菌感染。1例mNGS测定未发现真菌,而肺泡灌洗液中培养出霉菌菌丝。20例患者mNGS检测检出肺孢子菌11例,曲霉菌6例,念珠菌5例,根霉菌1例,新型隐球菌感染(胸腔积液标本)1例。曲霉菌核酸序列数分别为3、42、6788、206、46、2条,测序深度为1~1.2,覆盖度为0.004%~11.000%;念珠菌核酸序列数分别为6、152、17、4、96条,测序深度为1~1.4,覆盖度为0.009%~18.000%;肺孢子菌核酸序列数分别为17、56737、40、1050、19153、3419、420、32828、45487、5、87条,测序深度为1~1.3,覆盖度为0.05%~16.00%;新型隐球菌1例,序列数52条;根霉菌1例,序列数11条。结论mNGS可快速检测真菌感染的病原体,提高重症肺炎病原学诊断的敏感性,可作为传统微生物检测手段的有效补充方法。展开更多
目的新冠肺炎疫情暴露了我国公共卫生体系中长期以来积累的短板,其中最难以忽视的是优秀公共卫生人才的短缺,而作为培养高素质人才的公共卫生硕士(master of public health,MPH)传统教育已不能满足社会的需求,文章旨在为深化我国MPH教...目的新冠肺炎疫情暴露了我国公共卫生体系中长期以来积累的短板,其中最难以忽视的是优秀公共卫生人才的短缺,而作为培养高素质人才的公共卫生硕士(master of public health,MPH)传统教育已不能满足社会的需求,文章旨在为深化我国MPH教育改革提出参考性建议。方法采用案例比较的方法选取中英美三国中六所具有典型代表的高校进行研究。结果围绕其培养目标、招生生源、培养方式、课程设置、实践基地、毕业考核等方面进行中外对比和深入剖析,发现我国MPH培养过程中存在一些不足。结论应针对我国MPH培养体系中的诸多问题开展深入讨论并进行相应的改革。展开更多
文摘目的应用宏基因组学二代测序(metagenomics next generation sequencing,mNGS)技术检测重症肺炎真菌感染患者病原体,探讨其诊断重症肺炎真菌感染的临床应用价值。方法重症肺炎真菌感染患者20例,其中经传统病原微生物培养(痰培养、肺泡灌洗液/胸腔积液培养)明确病原学17例,另3例符合临床诊断标准,但未明确病原学。收集患者肺泡灌洗液标本19例,胸腔积液1例,并采用mNGS进一步检测病原体。结果经传统病原学检测明确病原学17例中,7例肺孢子菌,4例白色念珠菌,3例曲霉菌,1例肺孢子菌混合鲍曼不动杆菌,1例根霉菌,1例隐球菌;另3例符合真菌感染临床诊断者,经mNGS确定病原体1例为肺孢子菌感染合并白色念珠菌,2例为肺孢子菌感染合并鲍曼不动杆菌感染。7例传统培养明确肺孢子菌感染标本中,mNGS检测发现3例同时合并曲霉菌感染。1例mNGS测定未发现真菌,而肺泡灌洗液中培养出霉菌菌丝。20例患者mNGS检测检出肺孢子菌11例,曲霉菌6例,念珠菌5例,根霉菌1例,新型隐球菌感染(胸腔积液标本)1例。曲霉菌核酸序列数分别为3、42、6788、206、46、2条,测序深度为1~1.2,覆盖度为0.004%~11.000%;念珠菌核酸序列数分别为6、152、17、4、96条,测序深度为1~1.4,覆盖度为0.009%~18.000%;肺孢子菌核酸序列数分别为17、56737、40、1050、19153、3419、420、32828、45487、5、87条,测序深度为1~1.3,覆盖度为0.05%~16.00%;新型隐球菌1例,序列数52条;根霉菌1例,序列数11条。结论mNGS可快速检测真菌感染的病原体,提高重症肺炎病原学诊断的敏感性,可作为传统微生物检测手段的有效补充方法。
文摘目的新冠肺炎疫情暴露了我国公共卫生体系中长期以来积累的短板,其中最难以忽视的是优秀公共卫生人才的短缺,而作为培养高素质人才的公共卫生硕士(master of public health,MPH)传统教育已不能满足社会的需求,文章旨在为深化我国MPH教育改革提出参考性建议。方法采用案例比较的方法选取中英美三国中六所具有典型代表的高校进行研究。结果围绕其培养目标、招生生源、培养方式、课程设置、实践基地、毕业考核等方面进行中外对比和深入剖析,发现我国MPH培养过程中存在一些不足。结论应针对我国MPH培养体系中的诸多问题开展深入讨论并进行相应的改革。
