基于中药分子机理的生物信息学分析工具(bioinformatics analysis tool for molecular mechanism of traditional Chinese medicine,BATMAN-TCM)研究长春花治疗癌症的分子机制。应用BATMAN-TCM平台,预测长春花的潜在作用靶点,使用GeneCa...基于中药分子机理的生物信息学分析工具(bioinformatics analysis tool for molecular mechanism of traditional Chinese medicine,BATMAN-TCM)研究长春花治疗癌症的分子机制。应用BATMAN-TCM平台,预测长春花的潜在作用靶点,使用GeneCards数据库检索癌症靶点。然后利用Cytoscape 3.7.0软件构建化合物-疾病-靶点相互作用网络。针对长春花的抗癌靶点,进行了基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,以确定长春花抗癌的基因功能。最后,从长春花中筛选出9种活性成分,构建了化合物-疾病-靶点网络。基于STRING建立的长春花靶点的PPI网络包括55个节点和328个相互作用关系。关键节点包括CTNNB1、JUN、VEGFA、ESR1、HIF1A、FOS、MTOR。此外,GO富集分析共确定了73个通路,包括RNA聚合酶II特异性DNA结合转录因子结合、DNA结合转录因素结合、泛素蛋白连接酶结合、泛蛋白样蛋白连接酶类结合。此外,在KEGG通路富集分析中,获得了106条信号通路,其中PI3K-Akt信号通路和HIF-1信号通路是与癌症相关的关键通路。本研究发现长春花通过多组分-多靶点-多途径的协同调控实现了抗癌作用,为长春花的应用提供了理论依据和科学依据。展开更多
基于黄河流域101个气象站点的实测气象数据和国际耦合模式比较计划第5阶段(coupled model intercomparison project phase 5,CMIP5)3种排放情景下的6个模型1961—2099年的降水和气温数据,采用等距离累积分布函数法(equidistant cumulati...基于黄河流域101个气象站点的实测气象数据和国际耦合模式比较计划第5阶段(coupled model intercomparison project phase 5,CMIP5)3种排放情景下的6个模型1961—2099年的降水和气温数据,采用等距离累积分布函数法(equidistant cumulative distribution function matching method,EDCDFm)进行统计降尺度;通过历史阶段(1961—2005年)实测站点数据对降尺度后的降水和气温进行精度评估;在此基础上,通过标准化降水指数(standardprecipitation index,SPI)对黄河流域气象干旱进行预估。结果表明,EDCDFm的降尺度方法能够明显提高气候模式所模拟的气温和降水精度,尤其对极值的模拟精度;黄河流域气象干旱的预估显示,3种气候情景下21世纪初的干旱情况相对于基准期均变得比较严重,但是世纪末的干旱程度均明显减轻,近期黄河流域的防旱工作形势仍然严峻。展开更多
基金Hebei Administration of Traditional Chinese Medicine (Gr ant No. 2021150)。
文摘基于中药分子机理的生物信息学分析工具(bioinformatics analysis tool for molecular mechanism of traditional Chinese medicine,BATMAN-TCM)研究长春花治疗癌症的分子机制。应用BATMAN-TCM平台,预测长春花的潜在作用靶点,使用GeneCards数据库检索癌症靶点。然后利用Cytoscape 3.7.0软件构建化合物-疾病-靶点相互作用网络。针对长春花的抗癌靶点,进行了基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,以确定长春花抗癌的基因功能。最后,从长春花中筛选出9种活性成分,构建了化合物-疾病-靶点网络。基于STRING建立的长春花靶点的PPI网络包括55个节点和328个相互作用关系。关键节点包括CTNNB1、JUN、VEGFA、ESR1、HIF1A、FOS、MTOR。此外,GO富集分析共确定了73个通路,包括RNA聚合酶II特异性DNA结合转录因子结合、DNA结合转录因素结合、泛素蛋白连接酶结合、泛蛋白样蛋白连接酶类结合。此外,在KEGG通路富集分析中,获得了106条信号通路,其中PI3K-Akt信号通路和HIF-1信号通路是与癌症相关的关键通路。本研究发现长春花通过多组分-多靶点-多途径的协同调控实现了抗癌作用,为长春花的应用提供了理论依据和科学依据。
文摘基于黄河流域101个气象站点的实测气象数据和国际耦合模式比较计划第5阶段(coupled model intercomparison project phase 5,CMIP5)3种排放情景下的6个模型1961—2099年的降水和气温数据,采用等距离累积分布函数法(equidistant cumulative distribution function matching method,EDCDFm)进行统计降尺度;通过历史阶段(1961—2005年)实测站点数据对降尺度后的降水和气温进行精度评估;在此基础上,通过标准化降水指数(standardprecipitation index,SPI)对黄河流域气象干旱进行预估。结果表明,EDCDFm的降尺度方法能够明显提高气候模式所模拟的气温和降水精度,尤其对极值的模拟精度;黄河流域气象干旱的预估显示,3种气候情景下21世纪初的干旱情况相对于基准期均变得比较严重,但是世纪末的干旱程度均明显减轻,近期黄河流域的防旱工作形势仍然严峻。
