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低温胁迫下杜鹃杂交后代优良株系的转录组分析 被引量:5
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作者 吴月燕 明萌 +5 位作者 何静雯 卢丹 沈梓力 邱甜 吴燕燕 谢晓鸿 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2017年第5期52-60,共9页
为探索杜鹃抗寒的分子机制,筛选抗寒相关基因,利用人工模拟低温,以杜鹃杂交后代优良株系繁景-6℃(T)处理和25℃(CK)对照为试验材料,进行转录组测序和数据从头组装及生物信息学分析,通过组装得到Unigenes序列122 654个,功能注释结果显示... 为探索杜鹃抗寒的分子机制,筛选抗寒相关基因,利用人工模拟低温,以杜鹃杂交后代优良株系繁景-6℃(T)处理和25℃(CK)对照为试验材料,进行转录组测序和数据从头组装及生物信息学分析,通过组装得到Unigenes序列122 654个,功能注释结果显示,有大量Unigenes可以注释到基因本体(GO)和蛋白质直系同源数据库(COG)等数据库上,部分Unigenes无匹配信息,可能为杜鹃特有的基因序列。按GO功能分类,繁景杜鹃中的Unigenes分为细胞组分、分子功能以及生物学过程3类,包括51个分支,其中有大量的Unigenes与代谢进程、催化活性和细胞进程相关。上调差异表达基因有6 347个,下调差异表达基因4 482个。通过对转录结果中差异表达显著的4个转录因子家族中的24个基因,其中,上调12个,下调12个,在低温胁迫下的表达水平验证,发现其与转录结果基本一致,证明该转录组数据可靠。 展开更多
关键词 杜鹃 低温胁迫 转录组 抗寒基因
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新疆维吾尔族群体19个STR基因座遗传多态性 被引量:2
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作者 陈鹏宇 王斌 +2 位作者 韩岩岩 谢成明 余舰 《遵义医学院学报》 2016年第5期491-496,共6页
目的对新疆地区维吾尔族人群19个短串联重复序列(Short tandem repeats,STR)基因座的遗传多态性进行研究,评价其在法医学个体识别、亲子鉴定中的应用价值,并分析与其它不同群体的遗传关系。方法应用GoldeneyeTM20A试剂盒对来自新疆维吾... 目的对新疆地区维吾尔族人群19个短串联重复序列(Short tandem repeats,STR)基因座的遗传多态性进行研究,评价其在法医学个体识别、亲子鉴定中的应用价值,并分析与其它不同群体的遗传关系。方法应用GoldeneyeTM20A试剂盒对来自新疆维吾尔族的101例无关个体进行19个STR基因座的复合扩增,ABI 3130XL全自动测序仪对扩增产物进行电泳分离,Gene Mapper v3.2软件进行基因分型,统计各基因座等位基因频率及法医学参数,并结合已公开报道的其他17个群体遗传多态性数据,计算群体间遗传距离,构建系统发生树。结果 Goldeneye^(TM)20A系统的19个STR基因座在新疆维吾尔族人群的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡,且各基因座之间均不存在连锁现象,19个STR累积的个人识别率为0.99999999999999999999993,累积的非父排除率为0.999999997481278。群体间遗传关系分析显示,新疆维吾尔族与新疆哈萨克族首先聚类,其它14个汉族群体及云南白族,辽宁满族聚为一大类。结论 19个STR组成的复合检测系统在新疆维吾尔族人群中具有高度的多态性和鉴别能力,可用于该群体法医学个体识别、亲权鉴定及群体遗传学研究。 展开更多
关键词 短串联重复序列 遗传多态性 新疆维吾尔族 群体遗传
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富氢液激活自噬减轻带状疱疹后神经痛大鼠痛敏并降低炎症因子的水平 被引量:16
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作者 马洪涛 陈红光 +3 位作者 董艾莉 王妍妍 边映雪 谢克亮 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期155-158,163,共5页
目的探讨自噬在富氢液治疗带状疱疹后神经痛(PHN)中的作用。方法雄性SD大鼠100只,采用随机数字表法,将其分为5组(n=20):对照组、PHN组、富氢液处理的PHN组(PHN-H2组)、富氢液和3-MA同时处理的PHN组(PHN-H2-3-MA组)、富氢液和雷帕霉素(R... 目的探讨自噬在富氢液治疗带状疱疹后神经痛(PHN)中的作用。方法雄性SD大鼠100只,采用随机数字表法,将其分为5组(n=20):对照组、PHN组、富氢液处理的PHN组(PHN-H2组)、富氢液和3-MA同时处理的PHN组(PHN-H2-3-MA组)、富氢液和雷帕霉素(Rap)同时处理的PHN组(PHN-H2-Rap组)。通过水痘带状疱疹病毒(VZV)接种建立PHN大鼠模型。造模成功的大鼠给予腹腔注射15 mg/kg 3-MA或10 mg/kg Rap,隔日1次,连续3次。富氢液处理方式为于造模后每天2次,腹腔注射富氢液10 m L/kg,连续7 d。50只大鼠分别于造模后3、7、14、21 d,测定机械缩足反应阈(PWT);另50只大鼠,于造模后7 d,收集脊椎腰膨大处,ELISA测定肿瘤坏死因子α(TNF-α)、白细胞介素1β(IL-1β)和IL-6的含量,Western blot法测定自噬蛋白微管相关蛋白1轻链3、beclin 1、P62的水平。结果与对照组比较,PHN组大鼠PWT值减少,TNF-α、IL-1β、IL-6、LC3Ⅱ和beclin 1水平增加,P62含量减少;与PHN组比较,PHN-H2组和PHN-H2-Rap组大鼠PWT值增加,TNF-α、IL-1β和IL-6水平降低,LC3和beclin 1表达进一步增加,P62含量增加;与PHN-H2组比较,PHN-H2-3-MA组大鼠PWT值明显减少,TNF-α、IL-1β、IL-6水平增加、LC3和beclin 1水平降低、P62含量增加。结论富氢液可以通过激活自噬减轻PHN大鼠的机械痛敏和炎症因子的释放。 展开更多
关键词 带状疱疹后神经痛 富氢液 自噬 炎症因子
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