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喀斯特洞穴滴水细菌群落组成及其代谢功能的季节性变化 被引量:7
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作者 云媛 程晓钰 +1 位作者 王纬琦 王红梅 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第36期3932-3944,共13页
洞穴是研究地下生物圈的天然实验室,而滴水是连接洞穴内部和外部环境的桥梁,对滴水微生物群落结构以及代谢功能进行研究,可以为洞穴中微生物组成、来源以及微生物驱动的元素循环提供重要信息.本研究采用Illumina Miseq平台的16S rRNA二... 洞穴是研究地下生物圈的天然实验室,而滴水是连接洞穴内部和外部环境的桥梁,对滴水微生物群落结构以及代谢功能进行研究,可以为洞穴中微生物组成、来源以及微生物驱动的元素循环提供重要信息.本研究采用Illumina Miseq平台的16S rRNA二代测序技术及Biolog-ECO微平板检测法,对湖北和尚洞弱光带滴水中的细菌群落多样性、细菌群落代谢功能多样性以及环境因子进行了为期2年的动态监测.结果表明:洞穴滴水中优势细菌属为不动杆菌属(Acinetobacter)和假单胞菌属(Pseudomonas)并表现出明显的季节性变化,不动杆菌属(Acinetobacter)相对丰度在夏季最高、冬季最低,而假单胞菌属(Pseudomonas)相对丰度的季节性变化正好相反;这种季节性差异与宜昌地区的月平均降水量紧密相关.同时,基于16SrRNA的PICRUSt代谢功能预测及Biolog-ECO微平板法均显示洞穴滴水中细菌群落代谢功能具有季节性变化,并且这种代谢能力的季节性变化与不动杆菌属(Acinetobacter)相对丰度的季节性变化显著正相关.总之,湖北宜昌和尚洞弱光区滴水中的细菌群落结构的季节性变化与降水量密切相关,同时优势类群不动杆菌属(Acinetobacter)是滴水代谢能力的主要贡献者.此研究将环境因子、滴水细菌群落组成及群落代谢能力三者紧密结合起来,为进一步解译洞穴这一特殊的地下生态系统中微生物群落组成及其代谢特征的变化规律奠定了基础. 展开更多
关键词 洞穴滴水 细菌群落 碳源代谢功能 环境因子 季节变化
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桂林罗汉肚洞细菌群落的环境驱动机制及群落构建过程 被引量:6
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作者 杨梓琪 程晓钰 +5 位作者 王红梅 曾智霖 刘晓燕 曹静 苏春田 黄奇波 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期4118-4136,共19页
【目的】洞穴被认为是黑暗、寡营养的极端环境,是研究深地生物圈的天然实验室。洞穴内部小生境丰富,不同洞穴水文条件和环境因子等差异大,尽管微生物群落在不同的洞穴中均显示出较强的生境特异性,但对不同相态(固相和液相)环境样本中微... 【目的】洞穴被认为是黑暗、寡营养的极端环境,是研究深地生物圈的天然实验室。洞穴内部小生境丰富,不同洞穴水文条件和环境因子等差异大,尽管微生物群落在不同的洞穴中均显示出较强的生境特异性,但对不同相态(固相和液相)环境样本中微生物群落的环境驱动机制以及群落构建的生态学过程的认识却十分薄弱。为了回答上述科学问题。【方法】本文选择了桂林地区典型的喀斯特洞穴罗汉肚洞,针对洞穴中不同生境(岩壁、沉积物、水潭积水、滴水和地下河河水)进行系统采样以及16S rRNA扩增子的高通量测序分析和理化参数的测试。【结果】结果表明洞穴中不同生境微生物群落结构具有显著的生境特异性。岩壁样品以放线菌门(Actinobacteria)为优势类群,沉积物中的优势类群则为酸杆菌门(Acidobacteria),所有水样微生物群落均以γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)为主。温度、风化指数以及SO;浓度显著影响罗汉肚岩壁和沉积物等固相样本中微生物的群落结构,其中USCγ和假单胞菌属(Pseudomonas)与温度呈正相关,假诺卡氏菌属(Pseudonocardia)、土壤红色杆形菌(Solirubrobacter)和芽单胞菌属(Gemmatimonas)则与温度显著负相关。而滴水、水潭积水以及地下河河水等液相样本中微生物群落则与电导率(EC)和溶解氧(DO)的含量显著相关。细菌群落的共生网络具有明显的模块性,不同微生物类群间以正相关的合作关系为主,以共同抵抗洞穴中的极端条件。固相样本中群落构建确定性过程(48.75%)与随机性过程(51.25%)的贡献基本相等,但液相样本中微生物的群落构建则以随机过程占主导(64.76%)。【结论】本研究结果首次揭示了洞穴微生物在不同相态样品中微生物群落的分布规律以及环境驱动机制、网络互作方式以及群落构建等生态学过程的差异,为深刻认识洞穴这一深地生物圈的微生物� 展开更多
关键词 极端环境 喀斯特洞穴 细菌群落 环境驱动机制 共生网络 群落构建
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Image segmentation of exfoliated two-dimensional materials by generative adversarial network-based data augmentation
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作者 程晓昱 解晨雪 +6 位作者 刘宇伦 白瑞雪 肖南海 任琰博 张喜林 马惠 蒋崇云 《Chinese Physics B》 SCIE EI CAS CSCD 2024年第3期112-117,共6页
Mechanically cleaved two-dimensional materials are random in size and thickness.Recognizing atomically thin flakes by human experts is inefficient and unsuitable for scalable production.Deep learning algorithms have b... Mechanically cleaved two-dimensional materials are random in size and thickness.Recognizing atomically thin flakes by human experts is inefficient and unsuitable for scalable production.Deep learning algorithms have been adopted as an alternative,nevertheless a major challenge is a lack of sufficient actual training images.Here we report the generation of synthetic two-dimensional materials images using StyleGAN3 to complement the dataset.DeepLabv3Plus network is trained with the synthetic images which reduces overfitting and improves recognition accuracy to over 90%.A semi-supervisory technique for labeling images is introduced to reduce manual efforts.The sharper edges recognized by this method facilitate material stacking with precise edge alignment,which benefits exploring novel properties of layered-material devices that crucially depend on the interlayer twist-angle.This feasible and efficient method allows for the rapid and high-quality manufacturing of atomically thin materials and devices. 展开更多
关键词 two-dimensional materials deep learning data augmentation generating adversarial networks
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广西桂林新村屯洞穴细菌群落的生境特异性及网络分析 被引量:5
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作者 曹静 程晓钰 +7 位作者 曾智霖 杨梓琪 刘晓燕 王红梅 马丽媛 鲁小璐 苏春田 黄奇波 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第31期4003-4016,共14页
洞穴是研究深地生物圈的天然实验室,对认识深地生物圈微生物多样性及群落分布特征至关重要.以我国岩溶最为发育的广西桂林市为研究区,对新村屯洞穴内不同小生境进行了系统采样,通过Illumina高通量测序和生物信息学的分析,发现洞穴中细... 洞穴是研究深地生物圈的天然实验室,对认识深地生物圈微生物多样性及群落分布特征至关重要.以我国岩溶最为发育的广西桂林市为研究区,对新村屯洞穴内不同小生境进行了系统采样,通过Illumina高通量测序和生物信息学的分析,发现洞穴中细菌群落以放线菌门(Actinobacteria)和变形菌门(Proteobacteria)占优势,不同生境间细菌群落α多样性存在显著差异,以洞穴上覆土壤α多样性最高,洞穴内微生物席α多样性最低.洞穴内细菌组成按生境聚类,不同生境具有独自的指示类群,干燥石笋表面生物膜指示属为Nitrospira和Polycyclovoran;上覆土壤、微生物席、沉积物和风化结皮的指示属分别为Candidatus Udaeobacter、Vicinamibacter、Bacillus和Longimicrobium,显示出洞穴细菌群落的生境特异性.冗余分析结果证实pH和TOC(total organic carbon)对微生物群落的空间分布具有重要影响.共现性网络分析表明,洞穴细菌群落网络高度模块化,γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)、Candidatus Udaeobacter和嗜热油菌纲(Thermoleophilia)为排名前三的关键种,对维持细菌网络的稳定性起着重要作用.共现性网络节点之间以正相关连接占主导,表明微生物主要通过相互协作以共同抵抗洞穴中的极端条件.这些结果揭示了新村屯洞穴生态系统中微生物群落的生境特异性和微生物之间的相互作用,提升了人们对洞穴生态系统这一陆地深地生物圈的认识. 展开更多
关键词 细菌群落 共现性网络分析 深地生物圈 喀斯特洞穴 生境特异性
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加强帕金森病消化道症状的管理和研究 被引量:1
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作者 毛成洁 程筱雨 刘春风 《中华神经科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期1209-1214,共6页
消化道症状是帕金森病常见的非运动症状, 贯穿疾病全程, 与帕金森病的发生发展有着密切关系:如便秘可以是帕金森病前驱期重要症状, 胃轻瘫可对药代动力学产生不利作用, 进而减弱药物疗效。但目前对帕金森病消化道症状的关注及研究较少,... 消化道症状是帕金森病常见的非运动症状, 贯穿疾病全程, 与帕金森病的发生发展有着密切关系:如便秘可以是帕金森病前驱期重要症状, 胃轻瘫可对药代动力学产生不利作用, 进而减弱药物疗效。但目前对帕金森病消化道症状的关注及研究较少, 对其早期识别、诊断及管理没有统一规范的推荐, 消化道症状也严重影响了患者生活质量。而针对肠脑轴、胃肠道屏障、胃肠道微生物的研究和干预有可能在改善消化道症状和延缓疾病进程中起到积极作用。 展开更多
关键词 帕金森病 消化道症状 疾病管理
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长白山垂直带森林叶片-凋落物-土壤连续体有机碳动态——基于稳定性碳同位素分析 被引量:28
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作者 司高月 李晓玉 +5 位作者 程淑兰 方华军 于贵瑞 耿静 何舜 于光夏 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第16期5285-5293,共9页
稳定性碳同位素自然丰度(δ^(13)C)记录着生态系统碳循环过程的关键信息,常被用于评价全球变化情景下陆地生态系统碳的动态。以长白山北坡垂直带4种典型森林生态系统为研究对象,测定乔木建群种叶片、凋落物以及不同深度土壤有机碳(SOC)... 稳定性碳同位素自然丰度(δ^(13)C)记录着生态系统碳循环过程的关键信息,常被用于评价全球变化情景下陆地生态系统碳的动态。以长白山北坡垂直带4种典型森林生态系统为研究对象,测定乔木建群种叶片、凋落物以及不同深度土壤有机碳(SOC)含量和δ^(13)C值,探讨植物叶片-凋落物-土壤连续体碳含量、δ^(13)C丰度的分布格局及其生态学暗示。研究结果表明:植物叶片碳含量随海拔高度的增加呈现抛物线型变化,且阔叶树叶片碳含量显著低于针叶树,体现气候要素和植被功能型的支配作用,并且暗示针叶树种潜在的碳蓄积能力更强。此外,植物叶片δ^(13)C随海拔高度升高而降低,表明高海拔植物叶片水分利用效率较低,即固碳耗水成本更高。凋落物碳含量随海拔增加逐渐下降,而矿质表层土壤则表现为阔叶红松林、岳桦林显著高于暗针叶林,体现了植被类型和土壤质地的共同支配作用。总体上,岳桦林SOC周转最快,其次是暗针叶林,位于基带的阔叶红松林最慢。可见,小尺度上气候因子并不是温带森林地下碳循环的主导因素,植被功能型和土壤属性对SOC周转与稳定的影响更大。在探讨环境因子对陆地生态系统碳循环和碳平衡的影响时需要考虑研究尺度,不同的研究尺度影响SOC周转的驱动因子并不相同。研究方法方面,基于log SOC和δ^(13)C的SOM周转模型能够很好地概括不同生态系统类型下SOM周转的相对快慢,可用来评价SOC动态对全球变化的响应。 展开更多
关键词 13C自然丰度 叶片-凋落物-土壤连续体 水分利用效率 土壤碳周转 山地垂直带
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重引入丹顶鹤野放初期活动范围及变化规律 被引量:8
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作者 崔多英 杜洋 +6 位作者 刘佳 赵永强 吴晓宇 成海 吕士成 贾婷 张金国 《野生动物学报》 北大核心 2017年第1期28-34,共7页
动物园是野生动物迁地保护的重要基地,可以为濒危物种重引入项目提供动物来源。2013年11月、12月和2015年1月、3月,在江苏盐城湿地珍禽国家级自然保护区(14只)和黑龙江林甸自然保护区(2只)共释放16只圈养丹顶鹤。利用卫星定位信号发射器... 动物园是野生动物迁地保护的重要基地,可以为濒危物种重引入项目提供动物来源。2013年11月、12月和2015年1月、3月,在江苏盐城湿地珍禽国家级自然保护区(14只)和黑龙江林甸自然保护区(2只)共释放16只圈养丹顶鹤。利用卫星定位信号发射器(platform transmitter terminals,PTT)和野外直接观察法进行跟踪监测研究。结果显示,释放后1 a内丹顶鹤在野外的存活率在50.00%~68.75%之间;其中9只丹顶鹤放飞后PTT监测时间超过60 d,放飞后的移动距离为(8.95±8.00)km,活动范围(118.14±311.11)km2;4只丹顶鹤的PTT监测时间超过240 d,1只监测时间118 d,这5只个体放飞后的移动距离为(16.69±21.82)km,活动范围(418.67±888.74)km2。丹顶鹤野放初期移动距离和活动范围逐渐增大,放飞后第4个月总体移动距离和活动范围达到最大,野外释放半年以后移动距离和活动范围逐渐减小,趋于稳定。放归年龄小于1岁的幼鹤移动距离和活动范围较大,而年龄大于2岁的个体移动距离和活动范围相对较小,且年龄组间差异极显著(P<0.01)。亲鸟哺育的幼鹤释放后活动能力较大,人工育幼的丹顶鹤则相反,但是差异并不显著(P>0.05)。软释放和硬释放对放飞后活动能力影响不大(P>0.05)。目前为止,野外研究尚未观察到重引入丹顶鹤与野生个体的繁殖配对现象,也未发现放归个体的迁徙行为。 展开更多
关键词 丹顶鹤 重引入 移动距离 活动范围
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葛根配方颗粒对小鼠前列腺增生的影响 被引量:3
8
作者 黄霆 王安喜 +2 位作者 朱晓雨 程义东 徐玉峰 《世界中医药》 CAS 2017年第9期2160-2163,2167,共5页
目的:探讨葛根配方颗粒抑制小鼠前列腺增生的作用机制。方法:将60只4周龄的雄性昆明种小鼠随机分为6组:葛根颗粒10,20,30 mg/kg组、对照组(保列治组)1 mg/kg、造模组及正常组。将除正常组外的小鼠手术去势7 d后,给予丙酸睾酮5 mg(/kg... 目的:探讨葛根配方颗粒抑制小鼠前列腺增生的作用机制。方法:将60只4周龄的雄性昆明种小鼠随机分为6组:葛根颗粒10,20,30 mg/kg组、对照组(保列治组)1 mg/kg、造模组及正常组。将除正常组外的小鼠手术去势7 d后,给予丙酸睾酮5 mg(/kg·d)皮下注射,同时分别给予不同剂量的葛根配方颗粒、保列治灌胃3周。后摘取各组小鼠前列腺,称重并计算前列腺指数(PI),免疫组化检测前列腺组织FGF2,Ki67,TGF-β1蛋白的表达,免疫酶联吸附试验(ELISA)检测5-还原酶活性,TUNEL试剂盒检测细胞凋亡情况。结果:与造模组比较,各给药组小鼠前列腺质量、PI均显著减小(P<0.05),FGF2,Ki67,TGF-β1抗原表达、5-还原酶活性均显著降低(P<0.05),细胞凋亡指数显著增高(P<0.05);而各项指标在葛根20,30 mg/kg组与对照组比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论:葛根配方颗粒对小鼠前列腺增生有明显抑制作用,其可能的机制是抑制FGF2,Ki67,TGF-β1抗原表达,降低5-还原酶活性,增加细胞凋亡,从而机制鼠前列腺增生。 展开更多
关键词 葛根配方颗粒 前列腺增生 昆明种小鼠 保列治
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陕西烟蚜茧蜂冬季保种寄主及规模化繁殖的适宜条件研究 被引量:1
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作者 李晓宇 成巨龙 +4 位作者 汝冰璐 陈雅寒 田佳 王颖 安德荣 《中国植保导刊》 北大核心 2017年第10期50-53,共4页
在温室中对烟蚜繁育的最适替代寄主展开筛选,测定蚜茧蜂羽化的最适温、湿度,并对烟蚜与僵蚜回接烟苗后的成活率和羽化率进行了测定。结果表明:(1)小白菜繁殖蚜虫量较大,效果优于萝卜和油菜寄主,回接烟苗后烟蚜成活率达85%以上,可作为替... 在温室中对烟蚜繁育的最适替代寄主展开筛选,测定蚜茧蜂羽化的最适温、湿度,并对烟蚜与僵蚜回接烟苗后的成活率和羽化率进行了测定。结果表明:(1)小白菜繁殖蚜虫量较大,效果优于萝卜和油菜寄主,回接烟苗后烟蚜成活率达85%以上,可作为替代寄主用于烟蚜的冬季保种及规模化繁殖。(2)蚜茧蜂僵蚜羽化的最适温度为20~25℃,最适相对湿度为80%~90%。 展开更多
关键词 烟蚜 蚜茧蜂 小白菜 寄生植物 冬季保种
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葛根素对大鼠肾脏草酸钙结石形成的影响 被引量:8
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作者 王安喜 朱晓雨 +2 位作者 黄霆 程义东 徐玉峰 《新中医》 CAS 2017年第3期5-9,共5页
目的:初步探讨葛根素对大鼠肾脏草酸钙结石的防治效果及其作用机制。方法:雄性4周龄SD大鼠随机分为6组,分别为空白组、模型组、友莱特组、低剂量葛根素组、中剂量葛根素组、高剂量葛根素组,每组10只。空白组自由饮取自来水,其他各组予... 目的:初步探讨葛根素对大鼠肾脏草酸钙结石的防治效果及其作用机制。方法:雄性4周龄SD大鼠随机分为6组,分别为空白组、模型组、友莱特组、低剂量葛根素组、中剂量葛根素组、高剂量葛根素组,每组10只。空白组自由饮取自来水,其他各组予以1%乙二醇溶液构成的成石液建立大鼠肾脏草酸钙结石模型。2周后,低、中、高各剂量葛根素组分别予5 mg/kg、10 mg/kg、20 mg/kg的葛根素灌胃,友莱特组给予1 g/kg的枸橼酸氢钾钠颗粒(友莱特)灌胃,持续3周。检测各组大鼠24 h尿液中草酸和尿钙的含量;血清尿素氮(BUN)、肌酐(Cr)、Ca^+、Na^+及K^+含量;肾组织中丙二醛(MDA)、超氧化物歧化酶(SOD)、一氧化氮(NO)含量;骨桥蛋白(OPN)的表达水平;肾组织行HE染色,光镜下观察各组肾小管腔内的结石晶体及肾小管扩张情况;TUNEL凋亡染色观察各组凋亡情况。结果:与空白组比较,其他各组的尿草酸含量、尿钙含量、血清BUN含量、血清Cr含量、OPN mRNA相对表达量、NO含量、MDA含量均显著升高,SOD活性均显著降低,差异均有统计学意义(P<0.05,P<0.01)。与模型组比较,高、中剂量葛根素组、友莱特组的尿草酸含量、尿钙含量、血清BUN含量、血清Cr含量、OPN mRNA相对表达量、NO含量、MDA含量均显著降低,SOD活性均显著升高,差异均有统计学意义(P<0.05,P<0.01)。与友莱特组比较,高、中、低各剂量葛根素组尿草酸含量、尿钙含量、血清BUN含量、血清Cr含量、OPN mRNA相对表达量、NO含量、MDA含量均较高,SOD活性均较低,差异均有统计学意义(P<0.05,P<0.01)。结论:葛根素可以减少大鼠的肾脏草酸钙结石的形成,作用机制可能是通过抗氧化应激反应和降低骨桥蛋白的表达来实现的。 展开更多
关键词 肾结石 草酸钙结石 葛根素 枸橼酸氢钾钠颗粒 动物实验 大鼠
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科技政策语义分析方法研究 被引量:3
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作者 王小玉 董诚 曾文 《情报工程》 2015年第6期102-108,共7页
本文对科技政策及语义分析方法研究现状的进行了调研,重点对句子相似度匹配算法和段落相似度匹配算法,以及倾向性分析算法等几种语义分析方法进行了对比分析,并总结其各自的适用性和优缺点,为下一步科技政策语义分析模型的构建研究提供... 本文对科技政策及语义分析方法研究现状的进行了调研,重点对句子相似度匹配算法和段落相似度匹配算法,以及倾向性分析算法等几种语义分析方法进行了对比分析,并总结其各自的适用性和优缺点,为下一步科技政策语义分析模型的构建研究提供研究基础。 展开更多
关键词 科技政策 语义分析方法 相似度计算 倾向性分析
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Box-Behnken法优化加酸超声提取瞿麦中大黄素的工艺 被引量:1
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作者 杨晓宇 李程 +1 位作者 马思跃 李建恒 《河北大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2017年第4期369-377,共9页
采用响应面法优化瞿麦中大黄素的提取工艺.利用单因素法进行考察,以大黄素提取量为指标,考察液固比、超声时间、温度、盐酸质量分数及用量对大黄素提取量的影响,并结合Design-Expert软件中的Box-Behnken实验设计和响应面分析方法对超声... 采用响应面法优化瞿麦中大黄素的提取工艺.利用单因素法进行考察,以大黄素提取量为指标,考察液固比、超声时间、温度、盐酸质量分数及用量对大黄素提取量的影响,并结合Design-Expert软件中的Box-Behnken实验设计和响应面分析方法对超声提取瞿麦中大黄素的工艺进行优化,再与药典中虎杖提取大黄素方法进行比较,确定大黄素超声提取最佳工艺:液固比为61倍,温度为40℃,超声30 min,加质量分数为8%的盐酸1 m L.通过优化得到的大黄素超声提取工艺省时,稳定,且与回流法相比提取量高. 展开更多
关键词 大黄素 超声提取 响应面法
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