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珊瑚来源真菌Parengyodontium album SCSIO SX7W11中聚酮化合物的发现及其生物合成途径分析
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作者 周晓雪 杨佳凡 +4 位作者 李明哲 宋永相 鞠建华 李晓帆 王立岩 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期3631-3641,共11页
海洋来源真菌的天然产物因其独特的结构与生物学活性而备受关注,而利用基因组信息对其代谢产物进行深入挖掘也成为研究策略之一。【目的】本文以一株南海珊瑚来源的真菌Parengyodontium album SCSIO SX7W11为目标菌株,挖掘其生产聚酮类... 海洋来源真菌的天然产物因其独特的结构与生物学活性而备受关注,而利用基因组信息对其代谢产物进行深入挖掘也成为研究策略之一。【目的】本文以一株南海珊瑚来源的真菌Parengyodontium album SCSIO SX7W11为目标菌株,挖掘其生产聚酮类化合物的潜能。【方法】本研究利用Illumina Miseq技术对SX7W11菌株进行全基因组扫描测序,运用生物信息学手段对其基因组的生物合成基因簇进行预测和基因功能注释,挖掘可能产生新颖聚酮化合物的基因簇。对SX7W11进行放大发酵后,利用正相色谱、中压反相色谱、Sephadex LH-20凝胶色谱、HPLC半制备等分离手段分离纯化出单体化合物。再利用高分辨质谱(HR-ESI-MS)、^(1)H NMR、^(13)C NMR、X-ray单晶衍射等波谱手段确定化合物的结构,并根据生物合成基因簇对化合物的生物合成途径进行推导。【结果】全基因组扫描测序结果显示,P.album SCSIO SX7W11基因组大小为34.0 Mb,含有24个生物合成基因簇,包括6个聚酮合酶基因簇以及3个萜烯合酶基因簇。从发酵产物中分离鉴定到3个聚酮类化合物:emodin(1)、alternaphenol B(2)和sydowinin A(3),其中化合物3获得了单晶结构数据。通过生物信息学方法从菌株基因组中定位到了sydowinin A的生物合成基因簇。结合文献对emodin(1)、alternaphenol B(2)和sydowinin A(3)的生物合成途径进行了分析。【结论】本研究通过基因组挖掘及培养基优化,发现1株珊瑚来源的真菌P.album SCSIO SX7W11具有生产sydowinins类聚酮类化合物的能力,为该类化合物生物合成机制深入研究奠定了基础。 展开更多
关键词 Parengyodontium album SCSIO SX7W11 sydowinin A 生物合成基因簇 基因组 海洋真菌
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石英粉尘对小鼠气道结构及黏蛋白Muc5b表达的影响 被引量：2
2
作者 邹晓雪 周婷 +5 位作者 李妍 李周洲 付国庆 刘跃伟 叶方立 张志兵 《华中科技大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期633-638,660,共7页
目的探讨石英粉尘对小鼠肺组织内气道结构及黏蛋白Muc5b表达的影响。方法将54只雄性C57BL/6小鼠随机分为空白对照组、生理盐水组、石英染尘组,每组18只。空白对照组不作任何处理,生理盐水组和石英染尘组分别给予一次性气管灌注50μL无... 目的探讨石英粉尘对小鼠肺组织内气道结构及黏蛋白Muc5b表达的影响。方法将54只雄性C57BL/6小鼠随机分为空白对照组、生理盐水组、石英染尘组,每组18只。空白对照组不作任何处理,生理盐水组和石英染尘组分别给予一次性气管灌注50μL无菌生理盐水和50mg/mL石英粉尘悬液,于灌注后第1、7、28天每组分别处死6只。取小鼠右肺中叶置于4%多聚甲醛中固定,石蜡包埋,进行苏木精-伊红、AB-PAS和Masson染色,观察小鼠肺组织内支气管结构的改变,采用免疫组织化学法分析肺组织内黏蛋白Muc5b的表达。结果在各个时间点,空白对照组和生理盐水组小鼠肺组织内支气管结构正常,表面分布有极少量黏蛋白;石英染尘组在灌注后第1天小鼠肺组织内支气管结构基本正常,周围炎性细胞浸润,分泌少量黏蛋白;灌注后第7天肺组织内支气管壁增厚,管腔变窄,肺泡间隔增厚,内有大量炎性细胞浸润,黏蛋白分泌量较多;灌注后第28天小鼠支气管壁、肺泡间隔明显增厚,部分支气管完整性被破坏,周围可见少量胶原沉积,偶见小块状纤维化,黏蛋白分泌量增多。石英染尘组小鼠肺组织内黏蛋白Muc5b主要定位于支气管黏膜层表面及肺泡间隔,其表达水平随染毒时间的延长而逐渐升高,且均高于同期空白对照组和生理盐水组,差异均有统计学意义(均P<0.01)。结论石英粉尘可导致小鼠肺组织内支气管壁增厚,管腔变窄,炎性反应明显,出现不同程度的纤维化改变,黏蛋白Muc5b表达量显著增加。 展开更多
关键词 石英粉尘 气道结构 黏蛋白 Muc5b
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