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江苏省2013至2015年人H7N9流感病毒的分子特征
被引量:
3
1
作者
易丽娴
陶鸿
崔大伟
《临床检验杂志》
CAS
CSCD
2016年第7期612-616,共5页
目的探讨江苏省2013至2015年人源H7N9禽流感病毒的分子特征。方法从全球禽流感共享数据库(GISAID)中下载江苏省2013至2015年上传的人感染H7N9禽流感病毒株(37株)和禽源性H7N9病毒株(7株)的全基因序列,用MEGA6.0软件分析人感染H7N...
目的探讨江苏省2013至2015年人源H7N9禽流感病毒的分子特征。方法从全球禽流感共享数据库(GISAID)中下载江苏省2013至2015年上传的人感染H7N9禽流感病毒株(37株)和禽源性H7N9病毒株(7株)的全基因序列,用MEGA6.0软件分析人感染H7N9禽流感病毒HA、NA、M及PB2等基因的分子遗传特征、关键氨基酸位点的改变情况,并构建HA和NA的系统进化树。结果江苏省内人源和禽源H7N9禽流感毒株与参考株相比较,HA蛋白的差异均较小,其同源性分别为97.2%~100%和98.2%~100%;NA蛋白之间的差异也较小,其同源性分别为99.8%~100%和99.9%~100%;人源与禽源H7N9病毒HA或NA之间的同源性分别为98.5%~100%和99.8%~100%。人源和禽源H7N9毒株的HA蛋白均发生G186V和D225G变异,44株发生Q226L变异,4株出现A134V变异,但HA的裂解位点均未发生改变。2013年1株NA蛋白出现R294K耐药位点的变异。PB2蛋白分析显示:所有毒株均发现L89V变异,其中人源H7N9毒株中,26株发现E627K变异,5株发现D701N变异。所有毒株的M2蛋白均发生S31N变异。结论江苏省2013-2015年人感染H7N9流感病毒与禽源性H7N9毒株的氨基酸序列高度同源,关键氨基酸位点的变异与人感染该病毒密切相关,应加强人源和禽源H7N9病毒的分子监测。
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关键词
H7N9禽流感病毒
分子特征
遗传
变异
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职称材料
题名
江苏省2013至2015年人H7N9流感病毒的分子特征
被引量:
3
1
作者
易丽娴
陶鸿
崔大伟
机构
苏州卫生职业技术学院
浙江大学医学院附属第一医院检验科
出处
《临床检验杂志》
CAS
CSCD
2016年第7期612-616,共5页
基金
浙江省医药卫生科技项目(2015KYB149)
浙江省自然基金项目(LY16H200001)
浙江省教育厅项目(Y201534117)
文摘
目的探讨江苏省2013至2015年人源H7N9禽流感病毒的分子特征。方法从全球禽流感共享数据库(GISAID)中下载江苏省2013至2015年上传的人感染H7N9禽流感病毒株(37株)和禽源性H7N9病毒株(7株)的全基因序列,用MEGA6.0软件分析人感染H7N9禽流感病毒HA、NA、M及PB2等基因的分子遗传特征、关键氨基酸位点的改变情况,并构建HA和NA的系统进化树。结果江苏省内人源和禽源H7N9禽流感毒株与参考株相比较,HA蛋白的差异均较小,其同源性分别为97.2%~100%和98.2%~100%;NA蛋白之间的差异也较小,其同源性分别为99.8%~100%和99.9%~100%;人源与禽源H7N9病毒HA或NA之间的同源性分别为98.5%~100%和99.8%~100%。人源和禽源H7N9毒株的HA蛋白均发生G186V和D225G变异,44株发生Q226L变异,4株出现A134V变异,但HA的裂解位点均未发生改变。2013年1株NA蛋白出现R294K耐药位点的变异。PB2蛋白分析显示:所有毒株均发现L89V变异,其中人源H7N9毒株中,26株发现E627K变异,5株发现D701N变异。所有毒株的M2蛋白均发生S31N变异。结论江苏省2013-2015年人感染H7N9流感病毒与禽源性H7N9毒株的氨基酸序列高度同源,关键氨基酸位点的变异与人感染该病毒密切相关,应加强人源和禽源H7N9病毒的分子监测。
关键词
H7N9禽流感病毒
分子特征
遗传
变异
Keywords
H7N9 avian influenza virus
molecular characteristics
phylogenetic tree
mutation
分类号
R446.5 [医药卫生—诊断学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
江苏省2013至2015年人H7N9流感病毒的分子特征
易丽娴
陶鸿
崔大伟
《临床检验杂志》
CAS
CSCD
2016
3
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职称材料
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