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题名芋头过氧化物酶基因克隆
被引量：4
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作者
莫俊杰
梁钾贤
胡汉桥
黄红
陈妤
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机构
广东海洋大学农学院
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出处
《广东农业科学》
CAS
2016年第9期37-43,共7页
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基金
国家公益性行业(农业)科研专项经费子课题分项目(200903017-08)
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文摘
根据芋头的密码子使用频率,用i CODEHOP设计简并引物扩增芋头过氧化物酶基因序列,待芋头过氧化物酶基因非侧翼序列扩增成功后,依据其序列合成hiTAIL-PCR引物扩增芋头过氧化物酶基因的两侧序列。结果从芋头基因组DNA中克隆出1 165 bp序列,经同源性分析为过氧化物酶基因的部分序列;再利用hiTAIL-PCR技术可以扩增出芋头过氧化物酶基因的两侧序列,扩增序列为689 bp,测序结果能与1 165 bp序列拼接到一起,长1 854 bp。与已知的过氧化物酶进行序列比对,发现两侧还有氨基酸的编码序列,因此进行第2次hiTAIL-PCR,扩增出165 bp芋头过氧化物酶基因的侧翼序列,拼接后得到2 019bp。用Softberry上的基因预测软件分析后,发现包含过氧化物酶4个外显子,同源性分析表明,此过氧化物酶基因为含血红素的第三类过氧化物酶。
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关键词
芋头
过氧化物酶基因
hiTAIL—PCR
克隆
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Keywords
taro
peroxidase gene
hiTAIL-PCR
cloning
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分类号
S632.3
[农业科学—蔬菜学]
Q781
[农业科学—园艺学]
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