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题名贵州地方山羊RBP4基因多态性及生物信息学分析
被引量：3
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作者
邓位喜
孙振梅
李鹏程
冯文武
陈祥
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机构
遵义市畜牧站
贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室
贵州省种畜禽种质测定中心
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出处
《生物技术》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期482-486,共5页
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基金
贵州省科技重大专项子项目(“黔北麻羊高繁殖力配套系建设及产业化示范”,黔科合重大专项字[2013]6008)
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文摘
[目的]对贵州黑山羊和黔北麻羊进行RBP4基因多态位点的筛选,为从分子水平探究RBP4基因对动物繁殖性能的调控机制提供理论依据。[方法]采用DNA混池结合直接测序法分析RBP4基因外显子4在贵州黑山羊和黔北麻羊中的单核苷酸多态性,利用生物信息学软件分析SNP位点对RBP4基因mRNA二级结构的影响。[结果]RBP4基因外显子4在贵州黑山羊和黔北麻羊中均存在4-T214C突变位点,且为同义突变。生物信息学分析结果表明,外显子4-T214C突变导致RBP4基因mRNA二级结构发生变化,自由能降低,结构稳定性增大。[结论]在贵州黑山羊和黔北麻羊中检测到RBP4基因外显子4的1个SNP位点,该突变位点影响了RBP4基因mRNA的二级结构。
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关键词
黑山羊
黔北麻羊
RBP4
SNPS
生物信息学
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Keywords
Guizhou Black goat, Qianbei Ma goat, RBP4, SNPs, bioinformatics
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分类号
S827
[农业科学—畜牧学]
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