目的探究蒙古黄芪Astragalus membranaceus三萜皂苷的合成基因及参与后加工修饰的CYP、UGT基因。方法对两、三年生蒙古黄芪进行转录组测序和生物信息学分析。结果Illumina HiSeq平台测序共得到42.22 Gb数据,Trinity软件拼接得到369790条...目的探究蒙古黄芪Astragalus membranaceus三萜皂苷的合成基因及参与后加工修饰的CYP、UGT基因。方法对两、三年生蒙古黄芪进行转录组测序和生物信息学分析。结果Illumina HiSeq平台测序共得到42.22 Gb数据,Trinity软件拼接得到369790条Transcripts和336068条Unigene,与非冗余蛋白质序列(non-redundant protein sequence database,Nr)、基因本体论(gene ontology consortium,GO)、同源蛋白质簇(cluster of orthologous groups of proteins,egg NOG/COG)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)、Swiss-Prot、Pfam等数据库比对注释,结果显示蒙古黄芪与植物鹰嘴豆Cicer arietinum同源序列最多。KEGG分析表明蒙古黄芪差异基因主要富集在萜类骨架生物合成、二萜类生物合成、氨基酰基-tRNA生物合通路中,进一步从萜类骨架生物合成通路中鉴别出114条差异表达Unigene,包含15种关键酶基因,其中三年生蒙古黄芪hexPS表达均显著上调,ACAT、HMGCS、HMGCR、MVK、MVAK2、MVD、IDI、FDPS、GGPS1、FNTB、STE24、STE14、FCLY、DHDDS有上调也有下调表达的Unigene。进一步挖掘蒙古黄芪三萜皂苷生物合成后修饰基因,发现8条CYP差异表达关键酶基因,分别为acyP、PPID/CYPD、PPIH/CYPH、CYP26A、CYP51、CYP84A、CYP61A、cypD_E/CYP102A/CYP505;2条UGT差异表达关键酶基因HUGT、SUGT1。结论两、三年生蒙古黄芪的皂苷合成基因和CYP、UGT基因表达存在显著差异,这些基因共同参与黄芪皂苷的合成、加工与修饰。展开更多
文摘目的探究蒙古黄芪Astragalus membranaceus三萜皂苷的合成基因及参与后加工修饰的CYP、UGT基因。方法对两、三年生蒙古黄芪进行转录组测序和生物信息学分析。结果Illumina HiSeq平台测序共得到42.22 Gb数据,Trinity软件拼接得到369790条Transcripts和336068条Unigene,与非冗余蛋白质序列(non-redundant protein sequence database,Nr)、基因本体论(gene ontology consortium,GO)、同源蛋白质簇(cluster of orthologous groups of proteins,egg NOG/COG)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)、Swiss-Prot、Pfam等数据库比对注释,结果显示蒙古黄芪与植物鹰嘴豆Cicer arietinum同源序列最多。KEGG分析表明蒙古黄芪差异基因主要富集在萜类骨架生物合成、二萜类生物合成、氨基酰基-tRNA生物合通路中,进一步从萜类骨架生物合成通路中鉴别出114条差异表达Unigene,包含15种关键酶基因,其中三年生蒙古黄芪hexPS表达均显著上调,ACAT、HMGCS、HMGCR、MVK、MVAK2、MVD、IDI、FDPS、GGPS1、FNTB、STE24、STE14、FCLY、DHDDS有上调也有下调表达的Unigene。进一步挖掘蒙古黄芪三萜皂苷生物合成后修饰基因,发现8条CYP差异表达关键酶基因,分别为acyP、PPID/CYPD、PPIH/CYPH、CYP26A、CYP51、CYP84A、CYP61A、cypD_E/CYP102A/CYP505;2条UGT差异表达关键酶基因HUGT、SUGT1。结论两、三年生蒙古黄芪的皂苷合成基因和CYP、UGT基因表达存在显著差异,这些基因共同参与黄芪皂苷的合成、加工与修饰。
