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1株NSP2蛋白5个氨基酸缺失的PRRSV遗传进化分析
被引量:
2
1
作者
张勋
赵庆亮
+4 位作者
杨素芳
陈新凯
吴鹏
梁田
盛金良
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2017年第2期37-43,共7页
【目的】研究新疆猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的遗传变异情况。【方法】提取PRRSV感染病猪肺脏RNA,通过RT-PCR方法对PRRSV NSP2部分基因和ORF5基因进行扩增、克隆和测序,分析其分子变异特征。【结果】成功克隆到1株PRRSV,命名为XJzx1...
【目的】研究新疆猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的遗传变异情况。【方法】提取PRRSV感染病猪肺脏RNA,通过RT-PCR方法对PRRSV NSP2部分基因和ORF5基因进行扩增、克隆和测序,分析其分子变异特征。【结果】成功克隆到1株PRRSV,命名为XJzx1株,其NSP2基因编码蛋白第472~476位存在5个氨基酸的连续缺失,有别于高致病毒株第482、533~561位30个氨基酸的典型缺失,位于经典毒株HB-2(sh)/2002第471~482位12个氨基酸缺失区域内;XJzx1与HK13株NSP2部分基因核苷酸序列相似性最高,为87.5%,系统进化树分析显示,XJzx1株与我国高致病毒株JXA1、HUN4、SX2009等同属一个分支;XJzx1 ORF5基因与我国经典毒株CH-1a、BJ-4、HK6等同属一个分支,其GP5蛋白不存在氨基酸的缺失或插入,而表现为多位点的突变。【结论】PRRSV XJzx1株具有独特的遗传进化特征,其毒性较经典毒株有所加强,推测为新型变异株。
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关键词
PRRSV
NSP2基因缺失
GP5基因
序列分析
下载PDF
职称材料
题名
1株NSP2蛋白5个氨基酸缺失的PRRSV遗传进化分析
被引量:
2
1
作者
张勋
赵庆亮
杨素芳
陈新凯
吴鹏
梁田
盛金良
机构
石河子大学动物科技学院
黔西南民族职业技术学院生物工程系
巴音郭楞职业技术学院生物工程系
出处
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2017年第2期37-43,共7页
基金
国家自然科学基金项目(30960276
31360589)
文摘
【目的】研究新疆猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的遗传变异情况。【方法】提取PRRSV感染病猪肺脏RNA,通过RT-PCR方法对PRRSV NSP2部分基因和ORF5基因进行扩增、克隆和测序,分析其分子变异特征。【结果】成功克隆到1株PRRSV,命名为XJzx1株,其NSP2基因编码蛋白第472~476位存在5个氨基酸的连续缺失,有别于高致病毒株第482、533~561位30个氨基酸的典型缺失,位于经典毒株HB-2(sh)/2002第471~482位12个氨基酸缺失区域内;XJzx1与HK13株NSP2部分基因核苷酸序列相似性最高,为87.5%,系统进化树分析显示,XJzx1株与我国高致病毒株JXA1、HUN4、SX2009等同属一个分支;XJzx1 ORF5基因与我国经典毒株CH-1a、BJ-4、HK6等同属一个分支,其GP5蛋白不存在氨基酸的缺失或插入,而表现为多位点的突变。【结论】PRRSV XJzx1株具有独特的遗传进化特征,其毒性较经典毒株有所加强,推测为新型变异株。
关键词
PRRSV
NSP2基因缺失
GP5基因
序列分析
Keywords
PRRSV
deletion in NSP2gene
GP5gene
sequence analysis
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
1株NSP2蛋白5个氨基酸缺失的PRRSV遗传进化分析
张勋
赵庆亮
杨素芳
陈新凯
吴鹏
梁田
盛金良
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2017
2
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