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题名基于Hi-C技术哺乳动物三维基因组研究进展
被引量：9
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作者
宁椿游
何梦楠
唐茜子
朱庆
李明洲
李地艳
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机构
四川农业大学动物科技学院动物遗传育种研究所
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出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期215-233,共19页
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基金
国家重点研发计划项目(编号:2018YFD0500403)
国家自然科学基金项目(编号:31772576)资助~~
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文摘
基因组DNA在细胞核中并不是呈线性的一字排列,而是以三维结构高度折叠并浓缩成染色质的方式储存于核内,具有特定的高级空间结构和构象。高通量染色体构象捕获(high-througnput chromosome conformationcapture, Hi-C)技术于2009年首次被提出,目前已得到大规模运用,使得人们对于三维基因组学有了更深刻的认识。研究表明,哺乳动物基因组三维层级结构单元由大到小依次为染色体疆域(chromosome territory, CT)、染色质区室(chromatin compartment A/B)、拓扑关联结构域(topological associated domain, TAD)和染色质环(chromatin loop),这些层级结构单元在基因转录和表达调控过程中发挥着重要作用。本文基于Hi-C技术从染色质的三维层级结构划分、构象单元作用以及三维基因组在发育、疾病等方面的应用进行阐述,旨在为更深入地了解哺乳动物三维基因组学研究提供参考。
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关键词
三维基因组学
染色质空间构象
Hi-C技术
基因表达调控
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Keywords
three dimensional(3D)genomics
chromatin spatial organization
Hi-C technology
gene transcriptional regulation
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分类号
Q953
[生物学—动物学]
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