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多重耐药肺炎克雷伯菌62种耐药基因元件的检测与gyrA基因突变的发现
被引量：
4
1
作者
丘江
张洁
+1 位作者
孙杨
糜祖煌
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第6期539-544,共6页
目的 调查一组临床检出的肺炎克雷伯菌可能存在的耐药基因状况,以及各菌株间可能存在的亲缘关系。方法 25株肺炎克雷伯菌均分离自2016-2017年江汉油田总医院医院住院病人标本。菌种鉴定为gyrA基因测序上网BLASTn比对法,用PCR方法检测35...
目的 调查一组临床检出的肺炎克雷伯菌可能存在的耐药基因状况,以及各菌株间可能存在的亲缘关系。方法 25株肺炎克雷伯菌均分离自2016-2017年江汉油田总医院医院住院病人标本。菌种鉴定为gyrA基因测序上网BLASTn比对法,用PCR方法检测35种β-内酰胺酶基因,15种氨基糖苷类药物耐药基因,1种喹诺酮类药物耐药相关基因和11种可移动遗传元件。再用DNA测序法分析基因突变。最后对62种耐药元件基因的检测结果作样本聚类分析(UPGMA法)。结果 25株耐药肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类耐药率低(亚胺培南、美罗培南均只有8%),对其它8种抗菌药物的耐药率较高(40%~96%)。每株均检出β-内酰胺类药物耐药相关基因(总阳性率100.00%);有24株菌检出氨基糖苷类药物耐药相关基因(总阳性率96.00%);有20株菌检出喹诺酮类药物耐药相关基因gyrA突变(即突变率为80.00%);每株均检出可移动遗传元件遗传标记基因(总阳性率100.00%)。共检出5种β-内酰胺酶基因(bla TEM、bla LAP、bla KPC、bla DHA群、bla OXA-1群),6种氨基糖苷类药物耐药基因(aac(3)-Ⅱ、aac(6’)-Ⅰb、ant(3”)-Ⅰ、aph 3’-Ⅰ、aad A5、rmt B),20株存在喹诺酮类药物耐药相关基因gyrA第83位密码子发生了同样的突变,且均无第87位密码子的突变。检出8种可移动遗传元件(intⅠ1、tnp U、tnp 513、ISEcp1、IS26、IS903、ISKpn6、trbC),且检出率较高。样本聚类分析显示本组菌可分A与B 2个簇群,2个簇群中均有克隆传播。A簇群中有2个克隆,分别为2-3-5-16等4株、13-14等2株;B簇群中有1个克隆,为19-20号2株。结论 多种β-内酰胺类药物耐药基因、氨基糖苷类药物耐药基因,gyrA第83位密码子突变和可移动遗传元件共同导致本组肺炎克雷伯菌对10种抗菌药物的耐药。本组肺炎克雷伯菌3个克隆传播提示可能有医院感染的存在。
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关键词
肺炎克雷伯菌
Β-内酰胺类
氨基糖苷类
GYRA
突变
可移动遗传元件
聚类分析
耐药
下载PDF
职称材料
20株耐药阴沟肠杆菌可移动耐药元件检测及样本聚类分析
被引量：
3
2
作者
茅孝莹
常燕子
+2 位作者
糜祖煌
许小敏
陈琳
《中华医院感染学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第23期5302-5304,共3页
目的调查一组耐药阴沟肠杆菌中可移动耐药元件(可移动遗传元件遗传标记与耐药基因)的携带情况,以及本组菌株的亲缘关系。方法收集医院2015年1至12月住院病人痰液标本中分离的耐药阴沟肠杆菌共20株,采用聚合酶链反应(PCR)及序列分析的方...
目的调查一组耐药阴沟肠杆菌中可移动耐药元件(可移动遗传元件遗传标记与耐药基因)的携带情况,以及本组菌株的亲缘关系。方法收集医院2015年1至12月住院病人痰液标本中分离的耐药阴沟肠杆菌共20株,采用聚合酶链反应(PCR)及序列分析的方法分析11种可移动遗传元件与20种β-内酰胺类耐药基因、16种氨基糖苷类耐药基因。并对结果进行了样本聚类分析。结果有19株阴沟肠杆菌检出可移动遗传元件遗传标记、β-内酰胺类和氨基糖苷类耐药基因。20株耐药阴沟肠杆菌共检出5种可移动遗传元件遗传标记:tnp513、tnpU、IS26、IS903、intⅠ1,4种β-内酰胺类耐药基因:blaTEM、blaOXA-1群、blaDHA、blaACT/MIR群,6种氨基糖苷类耐药基因:aac(3)-Ⅱ、aac(6′)-Ⅰb、ant(3″)-Ⅰ、ant(2″)-Ⅰ、aph3′-Ⅵ、rmtB。样本聚类分析提示,除2号菌与18号菌外,其余18株显聚集性。3-9-10-16号菌株,1-17号菌株,5-14号菌株,15-19号菌株均为克隆传播。结论本组耐药阴沟肠杆菌检出的可移动耐药元件是导致对β-内酰胺类、氨基糖苷类耐药的重要原因,并且耐药表型和基因型一一对应。本组菌中4个不同的克隆传播,有医院感染的可能。
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关键词
阴沟肠杆菌
可移动遗传元件
耐药基因
耐药
样本聚类分析
原文传递
题名
多重耐药肺炎克雷伯菌62种耐药基因元件的检测与gyrA基因突变的发现
被引量：
4
1
作者
丘江
张洁
孙杨
糜祖煌
机构
湖北江汉油田总医院检验科
无锡市克隆遗传技术研究所
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第6期539-544,共6页
文摘
目的 调查一组临床检出的肺炎克雷伯菌可能存在的耐药基因状况,以及各菌株间可能存在的亲缘关系。方法 25株肺炎克雷伯菌均分离自2016-2017年江汉油田总医院医院住院病人标本。菌种鉴定为gyrA基因测序上网BLASTn比对法,用PCR方法检测35种β-内酰胺酶基因,15种氨基糖苷类药物耐药基因,1种喹诺酮类药物耐药相关基因和11种可移动遗传元件。再用DNA测序法分析基因突变。最后对62种耐药元件基因的检测结果作样本聚类分析(UPGMA法)。结果 25株耐药肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类耐药率低(亚胺培南、美罗培南均只有8%),对其它8种抗菌药物的耐药率较高(40%~96%)。每株均检出β-内酰胺类药物耐药相关基因(总阳性率100.00%);有24株菌检出氨基糖苷类药物耐药相关基因(总阳性率96.00%);有20株菌检出喹诺酮类药物耐药相关基因gyrA突变(即突变率为80.00%);每株均检出可移动遗传元件遗传标记基因(总阳性率100.00%)。共检出5种β-内酰胺酶基因(bla TEM、bla LAP、bla KPC、bla DHA群、bla OXA-1群),6种氨基糖苷类药物耐药基因(aac(3)-Ⅱ、aac(6’)-Ⅰb、ant(3”)-Ⅰ、aph 3’-Ⅰ、aad A5、rmt B),20株存在喹诺酮类药物耐药相关基因gyrA第83位密码子发生了同样的突变,且均无第87位密码子的突变。检出8种可移动遗传元件(intⅠ1、tnp U、tnp 513、ISEcp1、IS26、IS903、ISKpn6、trbC),且检出率较高。样本聚类分析显示本组菌可分A与B 2个簇群,2个簇群中均有克隆传播。A簇群中有2个克隆,分别为2-3-5-16等4株、13-14等2株;B簇群中有1个克隆,为19-20号2株。结论 多种β-内酰胺类药物耐药基因、氨基糖苷类药物耐药基因,gyrA第83位密码子突变和可移动遗传元件共同导致本组肺炎克雷伯菌对10种抗菌药物的耐药。本组肺炎克雷伯菌3个克隆传播提示可能有医院感染的存在。
关键词
肺炎克雷伯菌
Β-内酰胺类
氨基糖苷类
GYRA
突变
可移动遗传元件
聚类分析
耐药
Keywords
Klebsiella pneumoniae
beta-lactam
aminoglycoside
gyrA
mutation
mobile genetic element
cluster analysis
drug-resistant
分类号
R378 [医药卫生—病原生物学]
下载PDF
职称材料
题名
20株耐药阴沟肠杆菌可移动耐药元件检测及样本聚类分析
被引量：
3
2
作者
茅孝莹
常燕子
糜祖煌
许小敏
陈琳
机构
宁波市医疗中心李惠利医院检验科
无锡市克隆遗传技术研究所
宁波市第二医院医院感染管理科
出处
《中华医院感染学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第23期5302-5304,共3页
基金
浙江省医药卫生科技计划(2014KYA197)
宁波市科技局社发择优委托项目(2011C51002)
文摘
目的调查一组耐药阴沟肠杆菌中可移动耐药元件(可移动遗传元件遗传标记与耐药基因)的携带情况,以及本组菌株的亲缘关系。方法收集医院2015年1至12月住院病人痰液标本中分离的耐药阴沟肠杆菌共20株,采用聚合酶链反应(PCR)及序列分析的方法分析11种可移动遗传元件与20种β-内酰胺类耐药基因、16种氨基糖苷类耐药基因。并对结果进行了样本聚类分析。结果有19株阴沟肠杆菌检出可移动遗传元件遗传标记、β-内酰胺类和氨基糖苷类耐药基因。20株耐药阴沟肠杆菌共检出5种可移动遗传元件遗传标记:tnp513、tnpU、IS26、IS903、intⅠ1,4种β-内酰胺类耐药基因:blaTEM、blaOXA-1群、blaDHA、blaACT/MIR群,6种氨基糖苷类耐药基因:aac(3)-Ⅱ、aac(6′)-Ⅰb、ant(3″)-Ⅰ、ant(2″)-Ⅰ、aph3′-Ⅵ、rmtB。样本聚类分析提示,除2号菌与18号菌外,其余18株显聚集性。3-9-10-16号菌株,1-17号菌株,5-14号菌株,15-19号菌株均为克隆传播。结论本组耐药阴沟肠杆菌检出的可移动耐药元件是导致对β-内酰胺类、氨基糖苷类耐药的重要原因,并且耐药表型和基因型一一对应。本组菌中4个不同的克隆传播,有医院感染的可能。
关键词
阴沟肠杆菌
可移动遗传元件
耐药基因
耐药
样本聚类分析
Keywords
Enterobacter cloacae
Mobile genetic element
Resistant gene
Drug resistance
Sample cluster analysis
分类号
R378 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
多重耐药肺炎克雷伯菌62种耐药基因元件的检测与gyrA基因突变的发现
丘江
张洁
孙杨
糜祖煌
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
4
下载PDF
职称材料
2
20株耐药阴沟肠杆菌可移动耐药元件检测及样本聚类分析
茅孝莹
常燕子
糜祖煌
许小敏
陈琳
《中华医院感染学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016
3
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