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高通量测序分析PIK3CA突变型与野生型结直肠癌的肠道菌群特征
被引量:
3
1
作者
尚付梅
任中海
+7 位作者
万里新
张敬伟
李长生
马慧利
张蕾
冀叶
袁小笋
刘红利
《中国肿瘤临床》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期280-285,共6页
目的:采用16S rDNA二代高通量测序技术,研究PIK3CA突变型与野生型结直肠癌患者中的肠道菌群特征。方法:选取2016年12月至2017年12月华中科技大学同济医学院附属协和医院结直肠癌患者19例,采用16S rDNA高通量测序技术分析PIK3CA突变型(n...
目的:采用16S rDNA二代高通量测序技术,研究PIK3CA突变型与野生型结直肠癌患者中的肠道菌群特征。方法:选取2016年12月至2017年12月华中科技大学同济医学院附属协和医院结直肠癌患者19例,采用16S rDNA高通量测序技术分析PIK3CA突变型(n=4)和PIK3CA野生型(n=15)之间肿瘤组织中微生物多样性和组成差异。结果:在门水平上,结直肠癌患者的肠道菌群主要由变形菌门、栖热菌门、放线菌门、厚壁菌门和拟杆菌门组成,占总群落的98%以上。Alpha多样性分析显示,PIK3CA突变型与野生型结直肠癌患者之间微生物多样性有显著性差异,且PIK3CA突变型患者中微生物多样性明显高于野生型。Beta多样性分析显示PIK3CA突变型与野生型结直肠癌患者的肿瘤微生物特征有显著性差异。Spearman关联网络分析结果显示,在PIK3CA野生型结直肠癌肿瘤组织中,双歧杆菌属与假单胞菌呈正相关。结论:PIK3CA突变型与野生型结直肠癌患者肿瘤组织中的微生物群落结构有显著性差异,且PIK3CA突变患者中的肠道微生物多样性更丰富。
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关键词
高通量测序
肠道菌群
PIK3CA
结直肠癌
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职称材料
国家政策对中西部地区新生儿遗传代谢病筛查覆盖率的影响
被引量:
2
2
作者
刘檑
朱军
+9 位作者
万立新
邓奎
阎亚琼
李敏
姚永娜
向良成
袁雪莲
李琪
刘铮
李小洪
《中华妇幼临床医学杂志(电子版)》
CAS
2022年第4期410-418,共9页
目的探讨国家政策对中西部地区(以下简称为研究地区)新生儿遗传代谢病(NIMD)筛查覆盖率的影响。方法选择2006—2020年国家出台NIMD筛查相关政策背景下的中西部22个省、市、自治区(以下简称为研究地区22个区域)NIMD筛查覆盖率为研究对象...
目的探讨国家政策对中西部地区(以下简称为研究地区)新生儿遗传代谢病(NIMD)筛查覆盖率的影响。方法选择2006—2020年国家出台NIMD筛查相关政策背景下的中西部22个省、市、自治区(以下简称为研究地区22个区域)NIMD筛查覆盖率为研究对象。收集影响中西部地区NIMD筛查覆盖率的主要因素,包括研究地区的经济水平[采用人均国内生产总值(GDP)表示],文化教育水平(采用大专及以上文化程度人口比例表示),卫生服务水平(采用住院分娩率表示)、国家相关政策与措施等。根据国家NIMD筛查相关政策特点,将2006—2020年分为第1~4政策阶段,分别为2006—2009年、2010—2012年、2013—2015年、2016—2020年。采用主成分分析法构建反映经济与文化教育水平的综合指标(以下简称为E&C),并采用混合线性模型分析4个政策阶段、E&C及住院分娩率对研究地区NIMD筛查覆盖率的影响。本研究遵循的程序符合2013年新修订的《世界医学协会赫尔辛基宣言》要求。结果①对研究地区E&C的主成分分析结果显示,构建反映E&C:C=0.7071z1+0.7071z2,其中z1和z2分别表示2006—2020年研究地区人均GDP和大专及以上文化程度人口比例。②对研究地区NIMD筛查覆盖率影响因素采用混合线性模型分析结果显示,E&C和住院分娩率均为研究地区NIMD筛查覆盖率的独立影响因素(回归系数=7.89、0.42,Z=3.448、2.477,P=0.001、0.013);与第1政策阶段研究地区NIMD筛查覆盖率相比,至第2、3、4政策阶段,研究地区NIMD筛查覆盖率绝对增加值分别为16.80%(95%CI:11.66%~21.94%,Z=6.407、P<0.001),34.87%(95%CI:27.87%~41.86%,Z=9.770、P<0.001)与38.05%(95%CI:29.05%~47.06%,Z=8.280、P<0.001)。③第1~4政策阶段研究地区NIMD筛查平均覆盖率分别为31.34%、59.60%、85.43%、95.09%,第2~4政策阶段较上一政策阶段绝对增加值分别为28.26%、25.83%、9.66%,可被国家NIMD筛查相关政策解释的绝对增加值分别�
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关键词
代谢疾病
代谢缺陷
先天性
新生儿筛查
政府政策
卫生政策
社会经济因素
教育程度
卫生服务
混合线性模型
婴儿
新生
原文传递
题名
高通量测序分析PIK3CA突变型与野生型结直肠癌的肠道菌群特征
被引量:
3
1
作者
尚付梅
任中海
万里新
张敬伟
李长生
马慧利
张蕾
冀叶
袁小笋
刘红利
机构
南阳市中心医院肿瘤内科
华中科技大学同济医学院附属协和医院肿瘤中心腹部肿瘤科
出处
《中国肿瘤临床》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期280-285,共6页
基金
国家重点研发计划项目(编号:2018YFC1313300)
吴阶平医学基金会医学科研专项基金项目(编号:320.6750.2021-02-126)资助。
文摘
目的:采用16S rDNA二代高通量测序技术,研究PIK3CA突变型与野生型结直肠癌患者中的肠道菌群特征。方法:选取2016年12月至2017年12月华中科技大学同济医学院附属协和医院结直肠癌患者19例,采用16S rDNA高通量测序技术分析PIK3CA突变型(n=4)和PIK3CA野生型(n=15)之间肿瘤组织中微生物多样性和组成差异。结果:在门水平上,结直肠癌患者的肠道菌群主要由变形菌门、栖热菌门、放线菌门、厚壁菌门和拟杆菌门组成,占总群落的98%以上。Alpha多样性分析显示,PIK3CA突变型与野生型结直肠癌患者之间微生物多样性有显著性差异,且PIK3CA突变型患者中微生物多样性明显高于野生型。Beta多样性分析显示PIK3CA突变型与野生型结直肠癌患者的肿瘤微生物特征有显著性差异。Spearman关联网络分析结果显示,在PIK3CA野生型结直肠癌肿瘤组织中,双歧杆菌属与假单胞菌呈正相关。结论:PIK3CA突变型与野生型结直肠癌患者肿瘤组织中的微生物群落结构有显著性差异,且PIK3CA突变患者中的肠道微生物多样性更丰富。
关键词
高通量测序
肠道菌群
PIK3CA
结直肠癌
Keywords
high-throughput sequencing
gut microbiota
PIK3CA
colorectal cancer
分类号
R735.34 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
国家政策对中西部地区新生儿遗传代谢病筛查覆盖率的影响
被引量:
2
2
作者
刘檑
朱军
万立新
邓奎
阎亚琼
李敏
姚永娜
向良成
袁雪莲
李琪
刘铮
李小洪
机构
四川大学华西第二医院中国出生缺陷监测中心/全国妇幼卫生监测办公室
四川大学华西第二医院出生缺陷与相关妇儿疾病教育部重点实验室
吉林省妇幼保健院妇幼保健部
山西省妇幼保健院新生儿疾病筛查中心
西北妇女儿童医院保健部
四川大学华西第二医院四川省出生缺陷临床医学研究中心
出处
《中华妇幼临床医学杂志(电子版)》
CAS
2022年第4期410-418,共9页
基金
国家重点研发计划项目(2018YFC1002200)。
文摘
目的探讨国家政策对中西部地区(以下简称为研究地区)新生儿遗传代谢病(NIMD)筛查覆盖率的影响。方法选择2006—2020年国家出台NIMD筛查相关政策背景下的中西部22个省、市、自治区(以下简称为研究地区22个区域)NIMD筛查覆盖率为研究对象。收集影响中西部地区NIMD筛查覆盖率的主要因素,包括研究地区的经济水平[采用人均国内生产总值(GDP)表示],文化教育水平(采用大专及以上文化程度人口比例表示),卫生服务水平(采用住院分娩率表示)、国家相关政策与措施等。根据国家NIMD筛查相关政策特点,将2006—2020年分为第1~4政策阶段,分别为2006—2009年、2010—2012年、2013—2015年、2016—2020年。采用主成分分析法构建反映经济与文化教育水平的综合指标(以下简称为E&C),并采用混合线性模型分析4个政策阶段、E&C及住院分娩率对研究地区NIMD筛查覆盖率的影响。本研究遵循的程序符合2013年新修订的《世界医学协会赫尔辛基宣言》要求。结果①对研究地区E&C的主成分分析结果显示,构建反映E&C:C=0.7071z1+0.7071z2,其中z1和z2分别表示2006—2020年研究地区人均GDP和大专及以上文化程度人口比例。②对研究地区NIMD筛查覆盖率影响因素采用混合线性模型分析结果显示,E&C和住院分娩率均为研究地区NIMD筛查覆盖率的独立影响因素(回归系数=7.89、0.42,Z=3.448、2.477,P=0.001、0.013);与第1政策阶段研究地区NIMD筛查覆盖率相比,至第2、3、4政策阶段,研究地区NIMD筛查覆盖率绝对增加值分别为16.80%(95%CI:11.66%~21.94%,Z=6.407、P<0.001),34.87%(95%CI:27.87%~41.86%,Z=9.770、P<0.001)与38.05%(95%CI:29.05%~47.06%,Z=8.280、P<0.001)。③第1~4政策阶段研究地区NIMD筛查平均覆盖率分别为31.34%、59.60%、85.43%、95.09%,第2~4政策阶段较上一政策阶段绝对增加值分别为28.26%、25.83%、9.66%,可被国家NIMD筛查相关政策解释的绝对增加值分别�
关键词
代谢疾病
代谢缺陷
先天性
新生儿筛查
政府政策
卫生政策
社会经济因素
教育程度
卫生服务
混合线性模型
婴儿
新生
Keywords
Metabolic diseases
Metabolism,inborn errors
Neonatal screening
Public policy
Health policy
Socioeconomic factors
Educational status
Health services
Mixed linear model
Newborn,infant
分类号
F12 [经济管理—世界经济]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高通量测序分析PIK3CA突变型与野生型结直肠癌的肠道菌群特征
尚付梅
任中海
万里新
张敬伟
李长生
马慧利
张蕾
冀叶
袁小笋
刘红利
《中国肿瘤临床》
CAS
CSCD
北大核心
2022
3
下载PDF
职称材料
2
国家政策对中西部地区新生儿遗传代谢病筛查覆盖率的影响
刘檑
朱军
万立新
邓奎
阎亚琼
李敏
姚永娜
向良成
袁雪莲
李琪
刘铮
李小洪
《中华妇幼临床医学杂志(电子版)》
CAS
2022
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