目的:通过对当归四逆汤的网络药理学分析,探讨当归四逆汤治疗肝细胞癌的潜在抗肿瘤靶点及作用机制,为后续研究提供有针对性的指导。方法:利用Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform(TCMSP...目的:通过对当归四逆汤的网络药理学分析,探讨当归四逆汤治疗肝细胞癌的潜在抗肿瘤靶点及作用机制,为后续研究提供有针对性的指导。方法:利用Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform(TCMSP)网站及Swiss Target Prediction网站建立当归四逆汤有效成分及靶点数据库,利用Comparative Toxicogenomics Database(CTD),Therapeutic Target Database(TTD),Human Phenotype Ontology(HPO)网站建立肝细胞癌相关靶点数据库,并与当归四逆汤靶点数据库相匹配。在匹配结果的基础上,应用STRING网站分析靶标之间的相互作用,并利用The Database for Annotation,Visualization and Integrated Discovery(DAVID)网站进行基因本体论(gene ontology,GO)生物学过程分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,运用Cytoscape 3. 6. 0软件进行网络分析。结果:共发现当归四逆汤治疗肝细胞癌的56个可能的重要靶点,经GO富集分析得到106个细胞生物学过程,经KEGG富集分析得到23个相关通路,其中主要包括TNF信号通路,FoxO信号通路,Toll样受体信号通路,p53信号通路,磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路,腺苷酸激活蛋白激酶(AMPK)信号通路,两面神激酶(JAK)/信号传导及转录激活因子(STAT)信号通路等。结论:当归四逆汤对肝细胞癌的治疗作用可能是多靶点、多途径、多层次的。并且可以推测槲皮素和山柰酚可能是其中比较重要的2个有效成分,PI3K/Akt信号通路和MAPK信号通路可能是本方发挥作用比较重要的两条信号通路。本研究不仅有助于更好地理解当归四逆汤抗肝细胞癌的作用机制,而且提供了利用网络药理学开发新的中医药候选药物的策略。展开更多
为了检测牛传染性鼻气管炎病毒,本研究建立了牛传染性鼻气管炎病毒SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法。通过设计特异性引物扩增病毒基因,将扩增的目的片段(119 bp)连接到pMD19-T载体中,构建重组质粒。将重组质粒作为阳性标准品,用于S...为了检测牛传染性鼻气管炎病毒,本研究建立了牛传染性鼻气管炎病毒SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法。通过设计特异性引物扩增病毒基因,将扩增的目的片段(119 bp)连接到pMD19-T载体中,构建重组质粒。将重组质粒作为阳性标准品,用于SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法的建立。结果显示,特异性引物扩增的目的片段约为119 bp,符合预期的大小,经测序鉴定所扩增的目的片段正确。敏感性结果显示,用该方法检测阳性质粒标准品的最低限度为3.04 X101 copies/mL,是Nano-PCR的10倍。将牛病毒性腹泻病毒、牛呼吸道合胞体病毒、牛副流感病毒3型与牛传染性鼻气管炎病毒进行特异性检测。结果显示,只有牛传染性鼻气管炎病毒被检测到,其他病毒均未有特异性的扩增曲线,表明该方法的特异性良好。批内和批间重复变异系数均小于1%,显示该方法具有良好的重复性。用建立的方法对20份疑似IBRV的临床样品进行检测,并与Nano-PCR检测方法进行对比,结果显示本方法的阳性样晶率高于Nano-PCR检测方法。本研究建立的牛传染性鼻气管炎病毒SYBR Green I实时荧光定量PCR方法特异性好、灵敏度高、重复性好,可用于牛传染性鼻气管炎病毒的检测。展开更多
牛病毒性腹泻是阻碍养牛业发展的一种重大疾病。患病动物以发热、腹泻、流产、产乳量下降、产出死胎或畸形胎为主要症状。其病原体(BVDV)除感染牛外,也能感染猪、骆驼、羊驼及其他反刍动物。该病呈世界性流行分布,国际病毒分类委员会(In...牛病毒性腹泻是阻碍养牛业发展的一种重大疾病。患病动物以发热、腹泻、流产、产乳量下降、产出死胎或畸形胎为主要症状。其病原体(BVDV)除感染牛外,也能感染猪、骆驼、羊驼及其他反刍动物。该病呈世界性流行分布,国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)已将BVDV分为BVDV-1与BVDV-22个型。2种基因型的BVDV均能造成牛群的大范围发病,但临床症状稍有不同。本文从流行特点与致病机制、最新检测方法及病毒基因组结构几个方面介绍了当下牛病毒性腹泻分子机制的研究进展。展开更多
目的淋巴转移是恶性肿瘤最常见的转移途径之一。黄芪对肿瘤淋巴转移具有积极的治疗作用。本文通过对黄芪的网络药理学分析,探讨黄芪治疗淋巴转移的潜在靶点及作用机制,为后续研究提供有针对性的指导。方法利用中药系统药理学数据库与分...目的淋巴转移是恶性肿瘤最常见的转移途径之一。黄芪对肿瘤淋巴转移具有积极的治疗作用。本文通过对黄芪的网络药理学分析,探讨黄芪治疗淋巴转移的潜在靶点及作用机制,为后续研究提供有针对性的指导。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台、台湾中医药数据库、中药整合数据库及瑞士靶点预测网站建立黄芪有效成分和靶点数据库,利用比较基因组数据库、DisGeNET数据库及在线人类孟德尔遗传数据库建立淋巴转移相关靶点数据库,并与黄芪靶点数据库相匹配。在匹配结果的基础上,应用STRING数据库分析靶标之间的相互作用,并利用生物学信息注释数据库进行靶点基因本体(gene ontology,GO)生物学过程分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析,运用Cytoscape3.6.0软件进行网络分析。结果共发现黄芪治疗肿瘤淋巴转移有51个可能的重要靶点,经GO富集分析得到炎症相关的20个细胞生物学过程(P<0.05),经KEGG富集分析得到炎症相关的8个通路(P<0.05),其中主要包括肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路、Toll样受体(Toll like receptor,TLR)信号通路及核因子κB(nuclear factor kappa-B,NF-κB)信号通路等。结论黄芪对肿瘤淋巴转移的治疗作用可能是多靶点、多途径、多层次的,槲皮素和山奈酚可能是其中较重要的两个有效成分,而TNF信号通路、TLR信号通路及NF-κB信号通路可能是本药发挥作用较重要的三条信号通路。展开更多
文摘目的:通过对当归四逆汤的网络药理学分析,探讨当归四逆汤治疗肝细胞癌的潜在抗肿瘤靶点及作用机制,为后续研究提供有针对性的指导。方法:利用Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform(TCMSP)网站及Swiss Target Prediction网站建立当归四逆汤有效成分及靶点数据库,利用Comparative Toxicogenomics Database(CTD),Therapeutic Target Database(TTD),Human Phenotype Ontology(HPO)网站建立肝细胞癌相关靶点数据库,并与当归四逆汤靶点数据库相匹配。在匹配结果的基础上,应用STRING网站分析靶标之间的相互作用,并利用The Database for Annotation,Visualization and Integrated Discovery(DAVID)网站进行基因本体论(gene ontology,GO)生物学过程分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,运用Cytoscape 3. 6. 0软件进行网络分析。结果:共发现当归四逆汤治疗肝细胞癌的56个可能的重要靶点,经GO富集分析得到106个细胞生物学过程,经KEGG富集分析得到23个相关通路,其中主要包括TNF信号通路,FoxO信号通路,Toll样受体信号通路,p53信号通路,磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路,腺苷酸激活蛋白激酶(AMPK)信号通路,两面神激酶(JAK)/信号传导及转录激活因子(STAT)信号通路等。结论:当归四逆汤对肝细胞癌的治疗作用可能是多靶点、多途径、多层次的。并且可以推测槲皮素和山柰酚可能是其中比较重要的2个有效成分,PI3K/Akt信号通路和MAPK信号通路可能是本方发挥作用比较重要的两条信号通路。本研究不仅有助于更好地理解当归四逆汤抗肝细胞癌的作用机制,而且提供了利用网络药理学开发新的中医药候选药物的策略。
文摘为了检测牛传染性鼻气管炎病毒,本研究建立了牛传染性鼻气管炎病毒SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法。通过设计特异性引物扩增病毒基因,将扩增的目的片段(119 bp)连接到pMD19-T载体中,构建重组质粒。将重组质粒作为阳性标准品,用于SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法的建立。结果显示,特异性引物扩增的目的片段约为119 bp,符合预期的大小,经测序鉴定所扩增的目的片段正确。敏感性结果显示,用该方法检测阳性质粒标准品的最低限度为3.04 X101 copies/mL,是Nano-PCR的10倍。将牛病毒性腹泻病毒、牛呼吸道合胞体病毒、牛副流感病毒3型与牛传染性鼻气管炎病毒进行特异性检测。结果显示,只有牛传染性鼻气管炎病毒被检测到,其他病毒均未有特异性的扩增曲线,表明该方法的特异性良好。批内和批间重复变异系数均小于1%,显示该方法具有良好的重复性。用建立的方法对20份疑似IBRV的临床样品进行检测,并与Nano-PCR检测方法进行对比,结果显示本方法的阳性样晶率高于Nano-PCR检测方法。本研究建立的牛传染性鼻气管炎病毒SYBR Green I实时荧光定量PCR方法特异性好、灵敏度高、重复性好,可用于牛传染性鼻气管炎病毒的检测。
文摘牛病毒性腹泻是阻碍养牛业发展的一种重大疾病。患病动物以发热、腹泻、流产、产乳量下降、产出死胎或畸形胎为主要症状。其病原体(BVDV)除感染牛外,也能感染猪、骆驼、羊驼及其他反刍动物。该病呈世界性流行分布,国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)已将BVDV分为BVDV-1与BVDV-22个型。2种基因型的BVDV均能造成牛群的大范围发病,但临床症状稍有不同。本文从流行特点与致病机制、最新检测方法及病毒基因组结构几个方面介绍了当下牛病毒性腹泻分子机制的研究进展。
文摘目的淋巴转移是恶性肿瘤最常见的转移途径之一。黄芪对肿瘤淋巴转移具有积极的治疗作用。本文通过对黄芪的网络药理学分析,探讨黄芪治疗淋巴转移的潜在靶点及作用机制,为后续研究提供有针对性的指导。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台、台湾中医药数据库、中药整合数据库及瑞士靶点预测网站建立黄芪有效成分和靶点数据库,利用比较基因组数据库、DisGeNET数据库及在线人类孟德尔遗传数据库建立淋巴转移相关靶点数据库,并与黄芪靶点数据库相匹配。在匹配结果的基础上,应用STRING数据库分析靶标之间的相互作用,并利用生物学信息注释数据库进行靶点基因本体(gene ontology,GO)生物学过程分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析,运用Cytoscape3.6.0软件进行网络分析。结果共发现黄芪治疗肿瘤淋巴转移有51个可能的重要靶点,经GO富集分析得到炎症相关的20个细胞生物学过程(P<0.05),经KEGG富集分析得到炎症相关的8个通路(P<0.05),其中主要包括肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路、Toll样受体(Toll like receptor,TLR)信号通路及核因子κB(nuclear factor kappa-B,NF-κB)信号通路等。结论黄芪对肿瘤淋巴转移的治疗作用可能是多靶点、多途径、多层次的,槲皮素和山奈酚可能是其中较重要的两个有效成分,而TNF信号通路、TLR信号通路及NF-κB信号通路可能是本药发挥作用较重要的三条信号通路。
