为了挖掘与荷花花器官性状显著相关的分子标记,对60份荷花种质资源的18个花器官性状进行鉴定描述,用筛选得到的16个具有多态性的SSR标记进行遗传多样性分析,并使用TASSEL5.0软件的广义线性模型(general linear mode,GLM)和混合线性模型(...为了挖掘与荷花花器官性状显著相关的分子标记,对60份荷花种质资源的18个花器官性状进行鉴定描述,用筛选得到的16个具有多态性的SSR标记进行遗传多样性分析,并使用TASSEL5.0软件的广义线性模型(general linear mode,GLM)和混合线性模型(mixed linear mode,MLM)对18个花器官性状进行关联分析。研究结果显示,16个SSR标记以二核苷酸重复和三核苷酸重复类型为主,两者占比均为43.75%;在60份荷花种质中扩增出105个多态性位点,平均多态性位点为6.5625;引物多态性含量(PIC)为0.2898~0.7029,平均值为0.5242;Shannon’s信息指数(I)平均值为1.1548;观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)平均值分别为0.4308和0.5819。60份荷花品种的遗传相似系数(GS)为0.38~0.92,平均值为0.67;在GS为0.60处将60份荷花种质分为3大种群。GLM模型分析共检测到31个SSR位点,表型解释率为15.72%~76.76%;MLM模型分析共检测到13个SSR位点,表型解释率为20.25%~78.40%;其中有10个位点被二者同时检测到。此外有9个SSR标记的位点在2~5个花器官性状中被检测到,表现出显著的“一因多效”现象。展开更多
文摘为了挖掘与荷花花器官性状显著相关的分子标记,对60份荷花种质资源的18个花器官性状进行鉴定描述,用筛选得到的16个具有多态性的SSR标记进行遗传多样性分析,并使用TASSEL5.0软件的广义线性模型(general linear mode,GLM)和混合线性模型(mixed linear mode,MLM)对18个花器官性状进行关联分析。研究结果显示,16个SSR标记以二核苷酸重复和三核苷酸重复类型为主,两者占比均为43.75%;在60份荷花种质中扩增出105个多态性位点,平均多态性位点为6.5625;引物多态性含量(PIC)为0.2898~0.7029,平均值为0.5242;Shannon’s信息指数(I)平均值为1.1548;观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)平均值分别为0.4308和0.5819。60份荷花品种的遗传相似系数(GS)为0.38~0.92,平均值为0.67;在GS为0.60处将60份荷花种质分为3大种群。GLM模型分析共检测到31个SSR位点,表型解释率为15.72%~76.76%;MLM模型分析共检测到13个SSR位点,表型解释率为20.25%~78.40%;其中有10个位点被二者同时检测到。此外有9个SSR标记的位点在2~5个花器官性状中被检测到,表现出显著的“一因多效”现象。
