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ImageJ软件在显微图像细胞计数中应用的可行性研究
被引量:
9
1
作者
何宝林
杨晚竹
+4 位作者
陈婷
郑昭烽
林芳珍
李迎辉
高瀛岱
《医疗卫生装备》
CAS
2022年第2期13-18,35,共7页
目的:探究开源软件ImageJ在显微图像细胞计数中应用的可行性。方法:使用ImageJ软件对荧光染料4',6-二脒基-2-苯基吲哚(4',6-diamidino-2-phenylindole,DAPI)标记的悬浮细胞和羧基荧光素二醋酸盐琥珀酰亚胺酯(5,6-carboxyfluores...
目的:探究开源软件ImageJ在显微图像细胞计数中应用的可行性。方法:使用ImageJ软件对荧光染料4',6-二脒基-2-苯基吲哚(4',6-diamidino-2-phenylindole,DAPI)标记的悬浮细胞和羧基荧光素二醋酸盐琥珀酰亚胺酯(5,6-carboxyfluorescein diacetate succinimidyl ester,CFSE)标记的半贴壁细胞进行手动计数和自动计数,对脂肪包备蛋白Perilipin标记的脂肪细胞进行手动计数并通过编写程序对其进行自动计数,分别统计2种计数方法的准确率(以手动计数作为金标准)和计数时长。结果:在计数准确率方面,悬浮细胞自动计数的准确率为(98.28±1.59)%,半贴壁细胞自动计数的准确率为(97.43±0.44)%,脂肪细胞自动计数的准确率为(94.11±0.76)%。在计数时长方面,悬浮细胞自动计数较手动计数耗时长[(225.56±7.83)s vs(185.45±8.09)s],P<0.05;半贴壁细胞和脂肪细胞自动计数时长明显短于手动计数时长[(65.66±2.01)s vs(550.10±18.01)s,(218.33±6.38)s vs(776.04±8.72)s],P均<0.05。结论:ImageJ软件能够实现多种类型显微图像的细胞计数,还可兼容各种标记类型细胞显微图像的自主分析,为科研人员的图像分析工作提供了便利。
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关键词
ImageJ软件
显微图像
细胞计数
图像处理
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职称材料
显式知识推理和深度强化学习结合的动态决策
被引量:
1
2
作者
张昊迪
陈振浩
+4 位作者
陈俊扬
周熠
连德富
伍楷舜
林方真
《软件学报》
EI
CSCD
北大核心
2023年第8期3821-3835,共15页
近年来,深度强化学习在序列决策领域被广泛应用并且效果良好,尤其在具有高维输入、大规模状态空间的应用场景中优势明显.然而,深度强化学习相关方法也存在一些局限,如缺乏可解释性、初期训练低效与冷启动等问题.针对这些问题,提出了一...
近年来,深度强化学习在序列决策领域被广泛应用并且效果良好,尤其在具有高维输入、大规模状态空间的应用场景中优势明显.然而,深度强化学习相关方法也存在一些局限,如缺乏可解释性、初期训练低效与冷启动等问题.针对这些问题,提出了一种基于显式知识推理和深度强化学习的动态决策框架,将显式的知识推理与深度强化学习结合.该框架通过显式知识表示将人类先验知识嵌入智能体训练中,让智能体在强化学习中获得知识推理结果的干预,以提高智能体的训练效率,并增加模型的可解释性.将显式知识分为两种,即启发式加速知识与规避式安全知识.前者在训练初期干预智能体决策,加快训练速度;而后者将避免智能体作出灾难性决策,使其训练过程更为稳定.实验表明,该决策框架在不同强化学习算法上、不同应用场景中明显提高了模型训练效率,并增加了模型的可解释性.
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关键词
知识表示与推理
可解释性
深度强化学习
动态序列决策
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职称材料
题名
ImageJ软件在显微图像细胞计数中应用的可行性研究
被引量:
9
1
作者
何宝林
杨晚竹
陈婷
郑昭烽
林芳珍
李迎辉
高瀛岱
机构
中国医学科学院血液病医院
出处
《医疗卫生装备》
CAS
2022年第2期13-18,35,共7页
基金
国家自然科学基金项目(81870083,81970105)。
文摘
目的:探究开源软件ImageJ在显微图像细胞计数中应用的可行性。方法:使用ImageJ软件对荧光染料4',6-二脒基-2-苯基吲哚(4',6-diamidino-2-phenylindole,DAPI)标记的悬浮细胞和羧基荧光素二醋酸盐琥珀酰亚胺酯(5,6-carboxyfluorescein diacetate succinimidyl ester,CFSE)标记的半贴壁细胞进行手动计数和自动计数,对脂肪包备蛋白Perilipin标记的脂肪细胞进行手动计数并通过编写程序对其进行自动计数,分别统计2种计数方法的准确率(以手动计数作为金标准)和计数时长。结果:在计数准确率方面,悬浮细胞自动计数的准确率为(98.28±1.59)%,半贴壁细胞自动计数的准确率为(97.43±0.44)%,脂肪细胞自动计数的准确率为(94.11±0.76)%。在计数时长方面,悬浮细胞自动计数较手动计数耗时长[(225.56±7.83)s vs(185.45±8.09)s],P<0.05;半贴壁细胞和脂肪细胞自动计数时长明显短于手动计数时长[(65.66±2.01)s vs(550.10±18.01)s,(218.33±6.38)s vs(776.04±8.72)s],P均<0.05。结论:ImageJ软件能够实现多种类型显微图像的细胞计数,还可兼容各种标记类型细胞显微图像的自主分析,为科研人员的图像分析工作提供了便利。
关键词
ImageJ软件
显微图像
细胞计数
图像处理
Keywords
ImageJ software
microscopy image
cell counting
image processing
分类号
R318 [医药卫生—生物医学工程]
TP317.4 [医药卫生—基础医学]
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职称材料
题名
显式知识推理和深度强化学习结合的动态决策
被引量:
1
2
作者
张昊迪
陈振浩
陈俊扬
周熠
连德富
伍楷舜
林方真
机构
深圳大学计算机与软件学院
上海脑科学与类脑研究中心
中国科学技术大学计算机科学与技术学院
香港科技大学计算机科学与工程系
出处
《软件学报》
EI
CSCD
北大核心
2023年第8期3821-3835,共15页
基金
国家自然科学基金(61806132,U2001207,61872248)
广东省自然科学基金(2017A030312008)
+2 种基金
深圳市自然科学基金(ZDSYS20190902092853047,R2020A045)
珠江人才计划(2019ZT08X603)
广东省普通高校创新团队项目(2019KCXTD005)。
文摘
近年来,深度强化学习在序列决策领域被广泛应用并且效果良好,尤其在具有高维输入、大规模状态空间的应用场景中优势明显.然而,深度强化学习相关方法也存在一些局限,如缺乏可解释性、初期训练低效与冷启动等问题.针对这些问题,提出了一种基于显式知识推理和深度强化学习的动态决策框架,将显式的知识推理与深度强化学习结合.该框架通过显式知识表示将人类先验知识嵌入智能体训练中,让智能体在强化学习中获得知识推理结果的干预,以提高智能体的训练效率,并增加模型的可解释性.将显式知识分为两种,即启发式加速知识与规避式安全知识.前者在训练初期干预智能体决策,加快训练速度;而后者将避免智能体作出灾难性决策,使其训练过程更为稳定.实验表明,该决策框架在不同强化学习算法上、不同应用场景中明显提高了模型训练效率,并增加了模型的可解释性.
关键词
知识表示与推理
可解释性
深度强化学习
动态序列决策
Keywords
knowledge representation and reasoning
interpretability
deep reinforcement learning(DRL)
sequential decision making
分类号
TP18 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
ImageJ软件在显微图像细胞计数中应用的可行性研究
何宝林
杨晚竹
陈婷
郑昭烽
林芳珍
李迎辉
高瀛岱
《医疗卫生装备》
CAS
2022
9
下载PDF
职称材料
2
显式知识推理和深度强化学习结合的动态决策
张昊迪
陈振浩
陈俊扬
周熠
连德富
伍楷舜
林方真
《软件学报》
EI
CSCD
北大核心
2023
1
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职称材料
已选择
0
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