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基于SLAF-BSA技术挖掘大豆酸性磷酸酶候选基因及标记开发
被引量:
4
1
作者
刘渊
孔佑宾
+1 位作者
李喜焕
张彩英
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期164-173,共10页
磷利用效率与大豆产量密切相关,根尖酸性磷酸酶活性是筛选大豆品种磷效率的重要指标。挖掘酸性磷酸酶活性候选基因并开发其功能标记对获得磷高效功能基因、解析磷利用分子机制和培育磷高效大豆新品种意义重大。本研究利用酸性磷酸酶活...
磷利用效率与大豆产量密切相关,根尖酸性磷酸酶活性是筛选大豆品种磷效率的重要指标。挖掘酸性磷酸酶活性候选基因并开发其功能标记对获得磷高效功能基因、解析磷利用分子机制和培育磷高效大豆新品种意义重大。本研究利用酸性磷酸酶活性重组自交系群体F12构建了2个极端性状混池DNA文库,通过SLAF-BSA技术,获得了268个与大豆酸性磷酸酶活性关联的SNP,包括12个非同义突变,其中亲本间7个,后代混池间5个;在2个关联候选区域,获得79个酸性磷酸酶活性相关基因,其中第3号染色体的20138271~20268154间4个,17号染色体的14368648~15526449间75个;对该区域内基因进行了功能注释。开发了非同义突变基因Glyma.17G166200.1功能标记GMsnp-B,用该标记检测169份大豆栽培品种基因型,与表型符合率达到82.8%。
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关键词
大豆
酸性磷酸酶
SLAF-BSA
候选基因
功能标记
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职称材料
不同土壤地力条件下农大豆2号适宜密度与施肥量研究
被引量:
2
2
作者
李文龙
李喜焕
+1 位作者
常文锁
张彩英
《安徽农业科学》
CAS
2019年第4期50-52,62,共4页
[目的]研究高产优质抗病大豆新品种农大豆2号在不同土壤地力条件下的适宜密度和施肥量。[方法]采用裂区设计,分别在3种不同土壤地力条件下分析农大豆2号产量及其相关性状。[结果]土壤地力条件不同,施肥量和密度以及二者之间的互作对农大...
[目的]研究高产优质抗病大豆新品种农大豆2号在不同土壤地力条件下的适宜密度和施肥量。[方法]采用裂区设计,分别在3种不同土壤地力条件下分析农大豆2号产量及其相关性状。[结果]土壤地力条件不同,施肥量和密度以及二者之间的互作对农大豆2号产量及其相关性状影响不同。在低土壤地力条件下,单株粒数和单株粒重在不同施肥量及密度间的差异达到显著水平,高密高肥处理(密度25.5万株/hm^2,复合肥375 kg/hm^2)的产量较高;中等地力条件下,单株荚数、单株粒数在不同施肥量及密度间的差异达到显著和极显著水平,中密中肥处理(密度18.0万株/hm^2,复合肥225 kg/hm^2)的产量较高;较高地力条件下,不同施肥量及密度间的单株粒重差异达到显著和极显著水平,中密高肥处理(18.0万株/hm^2,复合肥375 kg/hm^2)的产量较高。[结论]该研究为农大豆2号在不同土壤地力条件下高产栽培和大面积示范推广提供了依据。
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关键词
大豆新品种
农大豆2号
施肥量
密度
产量
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职称材料
大豆需磷关键时期磷高效利用遗传位点挖掘
被引量:
2
3
作者
张华
田蕊
+4 位作者
褚佳豪
邢馨竹
陈士亮
李喜焕
张彩英
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期991-1001,共11页
土壤有效磷缺乏已成为影响大豆产量和品质的重要因素,深入挖掘大豆需磷关键时期磷高效利用遗传位点成为实现其分子遗传改良的重要前提。鉴于此,本研究利用SoySNP6K(5403个SNP标记)通过全基因组关联分析挖掘大豆需磷关键时期磷高效利用1...
土壤有效磷缺乏已成为影响大豆产量和品质的重要因素,深入挖掘大豆需磷关键时期磷高效利用遗传位点成为实现其分子遗传改良的重要前提。鉴于此,本研究利用SoySNP6K(5403个SNP标记)通过全基因组关联分析挖掘大豆需磷关键时期磷高效利用10个相关性状遗传位点,结果发现,T1关键时期(四叶期)适磷条件检测到78个关联SNP,以根系干重与植株总干重SNP较多;低磷条件检测到134个关联SNP,以植株总干重检测SNP最多,并在8号、13号、20号染色体分别检测到同时控制地上部干重和总干重、地上部鲜重和干重与总干重SNP簇;T2关键时期(六叶期)适磷条件检测到83个SNP,以株高和地上部干重检测SNP较多,低磷条件检测到53个SNP,以株高和根冠比SNP较多,并在18号染色体检测到同时控制根干重和总干重SNP簇,在11号、16号、18号染色体分别检测到3个一因多效SNP;上述关联SNP中有9个SNP同时在T1与T2时期被检测到,分别与地上部鲜重、干重、根冠比、株高等关联,为大豆磷素高效利用分子标记辅助育种以及候选基因克隆等提供了依据。
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关键词
大豆
磷高效利用
关联分析
一因多效
共关联SNP
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职称材料
大豆紫色酸性磷酸酶GmPAP17克隆与功能分析
被引量:
1
4
作者
颜硕
孔佑宾
+3 位作者
李喜焕
杜汇
李文龙
张彩英
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期22-28,共7页
土壤磷多以植物不能直接吸收利用的植酸盐形式存在,而紫色酸性磷酸酶具有分解利用植酸磷,提高磷素利用效率的功能。为进一步发掘该类基因,本研究利用磷高效大豆‘中黄15’与磷低效种质‘牛毛黄’,克隆并分析紫色酸性磷酸酶基因GmPAP17...
土壤磷多以植物不能直接吸收利用的植酸盐形式存在,而紫色酸性磷酸酶具有分解利用植酸磷,提高磷素利用效率的功能。为进一步发掘该类基因,本研究利用磷高效大豆‘中黄15’与磷低效种质‘牛毛黄’,克隆并分析紫色酸性磷酸酶基因GmPAP17的生物学功能。结果发现:GmPAP17具有996bp开放阅读框,编码331个氨基酸残基,编码蛋白具有较高的酸性磷酸酶与植酸酶活性;植酸磷处理条件下,GmPAP17在磷高效大豆中的表达量显著高于低效种质,且以胁迫处理后30~42d差异最大,说明该基因与大豆开花结荚期磷素高效利用相关;进一步分析超表达转GmPAP17拟南芥发现,3个转基因株系在植酸磷胁迫下的植株生物重与磷浓度显著高于野生型对照,证实GmPAP17具有提高转基因拟南芥植酸磷利用效率的功能。
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关键词
大豆
植酸磷
紫色酸性磷酸酶
磷素利用效率
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职称材料
微量肉汤稀释法药敏试验的误差分析
被引量:
13
5
作者
张筝
赵俊杰
+4 位作者
李运喜
赵敏
刘焕奇
刘玉庆
吴润
《中国抗生素杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第11期858-864,共7页
药敏试验是抗菌药理学的重要内容,也是临床施药的重要依据。在严格参照CLSI药敏试验标准的情况下,测定的最低抑菌浓度(MIC)结果依然波动。本文分析了微量肉汤稀释法存在的试验误差和差异,包括同一个菌落的重复试验、同一菌株的不...
药敏试验是抗菌药理学的重要内容,也是临床施药的重要依据。在严格参照CLSI药敏试验标准的情况下,测定的最低抑菌浓度(MIC)结果依然波动。本文分析了微量肉汤稀释法存在的试验误差和差异,包括同一个菌落的重复试验、同一菌株的不同菌落测定值、同一只鸡肠道分离的不同菌株测定值、以及试验操作人员测定值、同一鸡舍不同鸡测定值。结果表明,前3项因素差异不显著,整体试验存在1~2个梯度的误差,主要是由于菌株群体MIC的离散性、倍比设置的抗生素梯度的离散性,以及肉眼观察浊度的主观误差造成。值得注意的是,同一鸡舍不同鸡个体差异可能较大,在条件允许的情况下,尽可能多采集几只鸡样品,以MIC频率分布表征菌群整体的抗药性水平。
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关键词
药敏试验
MIC
误差
大肠埃希菌
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职称材料
题名
基于SLAF-BSA技术挖掘大豆酸性磷酸酶候选基因及标记开发
被引量:
4
1
作者
刘渊
孔佑宾
李喜焕
张彩英
机构
河北农业大学农学院/分子遗传育种实验室
河北农业大学生命科学学院/植物资源开发与利用实验室
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期164-173,共10页
基金
现代农业科技奖励性后补助资金项目(17927670H)
河北省科技计划项目(16227516D).
文摘
磷利用效率与大豆产量密切相关,根尖酸性磷酸酶活性是筛选大豆品种磷效率的重要指标。挖掘酸性磷酸酶活性候选基因并开发其功能标记对获得磷高效功能基因、解析磷利用分子机制和培育磷高效大豆新品种意义重大。本研究利用酸性磷酸酶活性重组自交系群体F12构建了2个极端性状混池DNA文库,通过SLAF-BSA技术,获得了268个与大豆酸性磷酸酶活性关联的SNP,包括12个非同义突变,其中亲本间7个,后代混池间5个;在2个关联候选区域,获得79个酸性磷酸酶活性相关基因,其中第3号染色体的20138271~20268154间4个,17号染色体的14368648~15526449间75个;对该区域内基因进行了功能注释。开发了非同义突变基因Glyma.17G166200.1功能标记GMsnp-B,用该标记检测169份大豆栽培品种基因型,与表型符合率达到82.8%。
关键词
大豆
酸性磷酸酶
SLAF-BSA
候选基因
功能标记
Keywords
soybean
acid phosphatase
SLAF-BSA
candidate gene
functional marker
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
不同土壤地力条件下农大豆2号适宜密度与施肥量研究
被引量:
2
2
作者
李文龙
李喜焕
常文锁
张彩英
机构
河北农业大学教育部华北作物种质资源研究与利用重点实验室
出处
《安徽农业科学》
CAS
2019年第4期50-52,62,共4页
基金
现代农业科技奖励性后补助项目(17927670H)
河北省科技计划项目(16227516D-1)
文摘
[目的]研究高产优质抗病大豆新品种农大豆2号在不同土壤地力条件下的适宜密度和施肥量。[方法]采用裂区设计,分别在3种不同土壤地力条件下分析农大豆2号产量及其相关性状。[结果]土壤地力条件不同,施肥量和密度以及二者之间的互作对农大豆2号产量及其相关性状影响不同。在低土壤地力条件下,单株粒数和单株粒重在不同施肥量及密度间的差异达到显著水平,高密高肥处理(密度25.5万株/hm^2,复合肥375 kg/hm^2)的产量较高;中等地力条件下,单株荚数、单株粒数在不同施肥量及密度间的差异达到显著和极显著水平,中密中肥处理(密度18.0万株/hm^2,复合肥225 kg/hm^2)的产量较高;较高地力条件下,不同施肥量及密度间的单株粒重差异达到显著和极显著水平,中密高肥处理(18.0万株/hm^2,复合肥375 kg/hm^2)的产量较高。[结论]该研究为农大豆2号在不同土壤地力条件下高产栽培和大面积示范推广提供了依据。
关键词
大豆新品种
农大豆2号
施肥量
密度
产量
Keywords
Soybean new variety
Nongdadou 2
Fertilizer application amount
Density
Yield
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
大豆需磷关键时期磷高效利用遗传位点挖掘
被引量:
2
3
作者
张华
田蕊
褚佳豪
邢馨竹
陈士亮
李喜焕
张彩英
机构
河北农业大学农学院/教育部华北作物种质资源研究与利用重点实验室
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期991-1001,共11页
基金
现代农业科技奖励性后补助资金项目(17927670H)
河北省科技计划项目(16227516D-1)
河北省重点研发计划项目(19226356D)。
文摘
土壤有效磷缺乏已成为影响大豆产量和品质的重要因素,深入挖掘大豆需磷关键时期磷高效利用遗传位点成为实现其分子遗传改良的重要前提。鉴于此,本研究利用SoySNP6K(5403个SNP标记)通过全基因组关联分析挖掘大豆需磷关键时期磷高效利用10个相关性状遗传位点,结果发现,T1关键时期(四叶期)适磷条件检测到78个关联SNP,以根系干重与植株总干重SNP较多;低磷条件检测到134个关联SNP,以植株总干重检测SNP最多,并在8号、13号、20号染色体分别检测到同时控制地上部干重和总干重、地上部鲜重和干重与总干重SNP簇;T2关键时期(六叶期)适磷条件检测到83个SNP,以株高和地上部干重检测SNP较多,低磷条件检测到53个SNP,以株高和根冠比SNP较多,并在18号染色体检测到同时控制根干重和总干重SNP簇,在11号、16号、18号染色体分别检测到3个一因多效SNP;上述关联SNP中有9个SNP同时在T1与T2时期被检测到,分别与地上部鲜重、干重、根冠比、株高等关联,为大豆磷素高效利用分子标记辅助育种以及候选基因克隆等提供了依据。
关键词
大豆
磷高效利用
关联分析
一因多效
共关联SNP
Keywords
soybean
high phosphorus efficiency
association analysis
pleiotropism
co-associated SNPs
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
大豆紫色酸性磷酸酶GmPAP17克隆与功能分析
被引量:
1
4
作者
颜硕
孔佑宾
李喜焕
杜汇
李文龙
张彩英
机构
河北农业大学教育部华北作物种质资源研究与利用重点实验室
出处
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期22-28,共7页
基金
转基因生物新品种培育科技重大专项(2014ZX0800404B)
河北省科技计划项目(16227516D-1)
现代农业科技奖励性后补助资金项目(17927670H)
文摘
土壤磷多以植物不能直接吸收利用的植酸盐形式存在,而紫色酸性磷酸酶具有分解利用植酸磷,提高磷素利用效率的功能。为进一步发掘该类基因,本研究利用磷高效大豆‘中黄15’与磷低效种质‘牛毛黄’,克隆并分析紫色酸性磷酸酶基因GmPAP17的生物学功能。结果发现:GmPAP17具有996bp开放阅读框,编码331个氨基酸残基,编码蛋白具有较高的酸性磷酸酶与植酸酶活性;植酸磷处理条件下,GmPAP17在磷高效大豆中的表达量显著高于低效种质,且以胁迫处理后30~42d差异最大,说明该基因与大豆开花结荚期磷素高效利用相关;进一步分析超表达转GmPAP17拟南芥发现,3个转基因株系在植酸磷胁迫下的植株生物重与磷浓度显著高于野生型对照,证实GmPAP17具有提高转基因拟南芥植酸磷利用效率的功能。
关键词
大豆
植酸磷
紫色酸性磷酸酶
磷素利用效率
Keywords
soybean
phytate phosphorus
purple acid phosphatase
phosphorus utilization efficiency
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
微量肉汤稀释法药敏试验的误差分析
被引量:
13
5
作者
张筝
赵俊杰
李运喜
赵敏
刘焕奇
刘玉庆
吴润
机构
山东省农业科学院畜牧兽医研究所、山东省畜禽疫病防控与繁育重点实验室
山东大学农学院
甘肃农业大学动物医学院
青岛农业大学动物科技学院
出处
《中国抗生素杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第11期858-864,共7页
文摘
药敏试验是抗菌药理学的重要内容,也是临床施药的重要依据。在严格参照CLSI药敏试验标准的情况下,测定的最低抑菌浓度(MIC)结果依然波动。本文分析了微量肉汤稀释法存在的试验误差和差异,包括同一个菌落的重复试验、同一菌株的不同菌落测定值、同一只鸡肠道分离的不同菌株测定值、以及试验操作人员测定值、同一鸡舍不同鸡测定值。结果表明,前3项因素差异不显著,整体试验存在1~2个梯度的误差,主要是由于菌株群体MIC的离散性、倍比设置的抗生素梯度的离散性,以及肉眼观察浊度的主观误差造成。值得注意的是,同一鸡舍不同鸡个体差异可能较大,在条件允许的情况下,尽可能多采集几只鸡样品,以MIC频率分布表征菌群整体的抗药性水平。
关键词
药敏试验
MIC
误差
大肠埃希菌
Keywords
Antimicrobial susceptibility testing
MIC
Testing errors
Escherichia coli
分类号
R978 [医药卫生—药品]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于SLAF-BSA技术挖掘大豆酸性磷酸酶候选基因及标记开发
刘渊
孔佑宾
李喜焕
张彩英
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
4
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职称材料
2
不同土壤地力条件下农大豆2号适宜密度与施肥量研究
李文龙
李喜焕
常文锁
张彩英
《安徽农业科学》
CAS
2019
2
下载PDF
职称材料
3
大豆需磷关键时期磷高效利用遗传位点挖掘
张华
田蕊
褚佳豪
邢馨竹
陈士亮
李喜焕
张彩英
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
2
下载PDF
职称材料
4
大豆紫色酸性磷酸酶GmPAP17克隆与功能分析
颜硕
孔佑宾
李喜焕
杜汇
李文龙
张彩英
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
1
下载PDF
职称材料
5
微量肉汤稀释法药敏试验的误差分析
张筝
赵俊杰
李运喜
赵敏
刘焕奇
刘玉庆
吴润
《中国抗生素杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016
13
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职称材料
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