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基于SLAF-BSA技术挖掘大豆酸性磷酸酶候选基因及标记开发
被引量：
4
1
作者
刘渊
孔佑宾
+1 位作者
李喜焕
张彩英
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期164-173,共10页
磷利用效率与大豆产量密切相关,根尖酸性磷酸酶活性是筛选大豆品种磷效率的重要指标。挖掘酸性磷酸酶活性候选基因并开发其功能标记对获得磷高效功能基因、解析磷利用分子机制和培育磷高效大豆新品种意义重大。本研究利用酸性磷酸酶活...
磷利用效率与大豆产量密切相关,根尖酸性磷酸酶活性是筛选大豆品种磷效率的重要指标。挖掘酸性磷酸酶活性候选基因并开发其功能标记对获得磷高效功能基因、解析磷利用分子机制和培育磷高效大豆新品种意义重大。本研究利用酸性磷酸酶活性重组自交系群体F12构建了2个极端性状混池DNA文库,通过SLAF-BSA技术,获得了268个与大豆酸性磷酸酶活性关联的SNP,包括12个非同义突变,其中亲本间7个,后代混池间5个;在2个关联候选区域,获得79个酸性磷酸酶活性相关基因,其中第3号染色体的20138271~20268154间4个,17号染色体的14368648~15526449间75个;对该区域内基因进行了功能注释。开发了非同义突变基因Glyma.17G166200.1功能标记GMsnp-B,用该标记检测169份大豆栽培品种基因型,与表型符合率达到82.8%。
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关键词
大豆
酸性磷酸酶
SLAF-BSA
候选基因
功能标记
下载PDF
职称材料
大豆紫色酸性磷酸酶GmPAP17克隆与功能分析
被引量：
1
2
作者
颜硕
孔佑宾
+3 位作者
李喜焕
杜汇
李文龙
张彩英
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期22-28,共7页
土壤磷多以植物不能直接吸收利用的植酸盐形式存在,而紫色酸性磷酸酶具有分解利用植酸磷,提高磷素利用效率的功能。为进一步发掘该类基因,本研究利用磷高效大豆‘中黄15’与磷低效种质‘牛毛黄’,克隆并分析紫色酸性磷酸酶基因GmPAP17...
土壤磷多以植物不能直接吸收利用的植酸盐形式存在,而紫色酸性磷酸酶具有分解利用植酸磷,提高磷素利用效率的功能。为进一步发掘该类基因,本研究利用磷高效大豆‘中黄15’与磷低效种质‘牛毛黄’,克隆并分析紫色酸性磷酸酶基因GmPAP17的生物学功能。结果发现:GmPAP17具有996bp开放阅读框,编码331个氨基酸残基,编码蛋白具有较高的酸性磷酸酶与植酸酶活性;植酸磷处理条件下,GmPAP17在磷高效大豆中的表达量显著高于低效种质,且以胁迫处理后30~42d差异最大,说明该基因与大豆开花结荚期磷素高效利用相关;进一步分析超表达转GmPAP17拟南芥发现,3个转基因株系在植酸磷胁迫下的植株生物重与磷浓度显著高于野生型对照,证实GmPAP17具有提高转基因拟南芥植酸磷利用效率的功能。
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关键词
大豆
植酸磷
紫色酸性磷酸酶
磷素利用效率
下载PDF
职称材料
大豆紫色酸性磷酸酶基因GmPAP14启动子克隆与功能分析
被引量：
4
3
作者
周悦
赵志华
+1 位作者
张宏宁
孔佑宾
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期590-596,共7页
大豆紫色酸性磷酸酶基因GmPAP14受低磷诱导表达,其超表达显著提高植物有机磷利用效率,为进一步探究其调控机制,本研究以GmPAP14 cDNA序列检索大豆参考基因组,获取基因上游启动子序列,设计引物克隆了中黄15 GmPAP14启动子序列。利用PLACE...
大豆紫色酸性磷酸酶基因GmPAP14受低磷诱导表达,其超表达显著提高植物有机磷利用效率,为进一步探究其调控机制,本研究以GmPAP14 cDNA序列检索大豆参考基因组,获取基因上游启动子序列,设计引物克隆了中黄15 GmPAP14启动子序列。利用PLACE与PlantCARE预测启动子调控元件发现,该序列中含有增强子调控元件、组织特异表达元件,根特异表达元件、转录因子PHR1结合的PIBS元件等。构建了GmPAP14启动子3个5’端缺失片段融合GUS的植物表达载体P_(GmPAP14-2568-)GUS、P_(GmPAP14-2238-)GUS、P_(GmPAP14-1635-)GUS,并通过Floral dip法获得转基因拟南芥。利用GUS染色和活性测定分析GmPAP14启动子不同片段表达活性发现,正常磷条件下各片段转基因拟南芥均在根尖表达,低磷条件下GUS染色可扩展到成熟区和根毛,另外转P_(GmPAP14-2238-)GUS植株的GUS活性最高。这些结果为后续的基因调控研究奠定重要基础。
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关键词
大豆
GmPAP14
启动子
诱导表达
低磷
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职称材料
题名
基于SLAF-BSA技术挖掘大豆酸性磷酸酶候选基因及标记开发
被引量：
4
1
作者
刘渊
孔佑宾
李喜焕
张彩英
机构
河北农业大学农学院/分子遗传育种实验室
河北农业大学生命科学学院/植物资源开发与利用实验室
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期164-173,共10页
基金
现代农业科技奖励性后补助资金项目(17927670H)
河北省科技计划项目(16227516D).
文摘
磷利用效率与大豆产量密切相关,根尖酸性磷酸酶活性是筛选大豆品种磷效率的重要指标。挖掘酸性磷酸酶活性候选基因并开发其功能标记对获得磷高效功能基因、解析磷利用分子机制和培育磷高效大豆新品种意义重大。本研究利用酸性磷酸酶活性重组自交系群体F12构建了2个极端性状混池DNA文库,通过SLAF-BSA技术,获得了268个与大豆酸性磷酸酶活性关联的SNP,包括12个非同义突变,其中亲本间7个,后代混池间5个;在2个关联候选区域,获得79个酸性磷酸酶活性相关基因,其中第3号染色体的20138271~20268154间4个,17号染色体的14368648~15526449间75个;对该区域内基因进行了功能注释。开发了非同义突变基因Glyma.17G166200.1功能标记GMsnp-B,用该标记检测169份大豆栽培品种基因型,与表型符合率达到82.8%。
关键词
大豆
酸性磷酸酶
SLAF-BSA
候选基因
功能标记
Keywords
soybean
acid phosphatase
SLAF-BSA
candidate gene
functional marker
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
大豆紫色酸性磷酸酶GmPAP17克隆与功能分析
被引量：
1
2
作者
颜硕
孔佑宾
李喜焕
杜汇
李文龙
张彩英
机构
河北农业大学教育部华北作物种质资源研究与利用重点实验室
出处
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期22-28,共7页
基金
转基因生物新品种培育科技重大专项(2014ZX0800404B)
河北省科技计划项目(16227516D-1)
现代农业科技奖励性后补助资金项目(17927670H)
文摘
土壤磷多以植物不能直接吸收利用的植酸盐形式存在,而紫色酸性磷酸酶具有分解利用植酸磷,提高磷素利用效率的功能。为进一步发掘该类基因,本研究利用磷高效大豆‘中黄15’与磷低效种质‘牛毛黄’,克隆并分析紫色酸性磷酸酶基因GmPAP17的生物学功能。结果发现:GmPAP17具有996bp开放阅读框,编码331个氨基酸残基,编码蛋白具有较高的酸性磷酸酶与植酸酶活性;植酸磷处理条件下,GmPAP17在磷高效大豆中的表达量显著高于低效种质,且以胁迫处理后30~42d差异最大,说明该基因与大豆开花结荚期磷素高效利用相关;进一步分析超表达转GmPAP17拟南芥发现,3个转基因株系在植酸磷胁迫下的植株生物重与磷浓度显著高于野生型对照,证实GmPAP17具有提高转基因拟南芥植酸磷利用效率的功能。
关键词
大豆
植酸磷
紫色酸性磷酸酶
磷素利用效率
Keywords
soybean
phytate phosphorus
purple acid phosphatase
phosphorus utilization efficiency
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
大豆紫色酸性磷酸酶基因GmPAP14启动子克隆与功能分析
被引量：
4
3
作者
周悦
赵志华
张宏宁
孔佑宾
机构
河北农业大学农学院/教育部华北作物种质资源研究与利用重点实验室
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期590-596,共7页
基金
河北省自然科学基金项目(C2018204090)
现代农业科技奖励性后补助资金项目(17927670H)资助。
文摘
大豆紫色酸性磷酸酶基因GmPAP14受低磷诱导表达,其超表达显著提高植物有机磷利用效率,为进一步探究其调控机制,本研究以GmPAP14 cDNA序列检索大豆参考基因组,获取基因上游启动子序列,设计引物克隆了中黄15 GmPAP14启动子序列。利用PLACE与PlantCARE预测启动子调控元件发现,该序列中含有增强子调控元件、组织特异表达元件,根特异表达元件、转录因子PHR1结合的PIBS元件等。构建了GmPAP14启动子3个5’端缺失片段融合GUS的植物表达载体P_(GmPAP14-2568-)GUS、P_(GmPAP14-2238-)GUS、P_(GmPAP14-1635-)GUS,并通过Floral dip法获得转基因拟南芥。利用GUS染色和活性测定分析GmPAP14启动子不同片段表达活性发现,正常磷条件下各片段转基因拟南芥均在根尖表达,低磷条件下GUS染色可扩展到成熟区和根毛,另外转P_(GmPAP14-2238-)GUS植株的GUS活性最高。这些结果为后续的基因调控研究奠定重要基础。
关键词
大豆
GmPAP14
启动子
诱导表达
低磷
Keywords
soybean
GmPAP14
promoter
induced expression
low phosphorus
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
Q943.2 [生物学—植物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于SLAF-BSA技术挖掘大豆酸性磷酸酶候选基因及标记开发
刘渊
孔佑宾
李喜焕
张彩英
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
4
下载PDF
职称材料
2
大豆紫色酸性磷酸酶GmPAP17克隆与功能分析
颜硕
孔佑宾
李喜焕
杜汇
李文龙
张彩英
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
1
下载PDF
职称材料
3
大豆紫色酸性磷酸酶基因GmPAP14启动子克隆与功能分析
周悦
赵志华
张宏宁
孔佑宾
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
4
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职称材料
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