基于体外药效学结合分子对接技术研究穿山龙抗心肌缺血的作用机制

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作者 杨小芳 孔韧 +3 位作者 权建野 袁博 闫寒 卜伟 《现代药物与临床》 CAS 2023年第4期767-775,共9页

目的 通过液质联用技术、体外药效学及分子对接技术探究穿山龙抗心肌缺血的物质基础和作用机制。方法 利用UPLC-Q TOF-MS技术确定穿山龙醇提物中的主要成分,比较不同质量浓度(40、10、4、0.4、0.004 mg/mL)的穿山龙醇提物对H9c2心肌细... 目的 通过液质联用技术、体外药效学及分子对接技术探究穿山龙抗心肌缺血的物质基础和作用机制。方法 利用UPLC-Q TOF-MS技术确定穿山龙醇提物中的主要成分,比较不同质量浓度(40、10、4、0.4、0.004 mg/mL)的穿山龙醇提物对H9c2心肌细胞缺氧/复氧(H/R)损伤后细胞活力的影响。应用AutoDock软件对潜在药效物质和关键靶点进行分子对接,相关结果采用Cytoscape 3.6.1进行构图和网络拓扑结构分析。结果 从穿山龙的醇提物中鉴定出7个化学成分,并证明穿山龙醇提物对H/R损伤H9c2心肌细胞具有一定的保护作用。筛选出5种(薯蓣皂苷元、薯蓣皂苷、对羟基苄基酒石酸、原薯蓣皂苷、薯蓣次皂苷A)与抗心肌缺血相关的活性成分,5种活性成分的分子对接结果显示潜在的药效物质与关键靶点内皮一氧化氮合酶(NOS)2、NOS3、环氧化酶/细胞色素C氧化酶多肽Ⅱ(COX2)、热休克蛋白(HSP70)对接结果能量低于-8 kcal/mol。结论 穿山龙中的甾体皂苷类成分可能是其治疗心肌缺血的物质基础,穿山龙治疗心肌缺血是多成分与多靶点相互作用的结果。 展开更多

关键词 穿山龙 抗心肌缺血 UPLC-Q TOF-MS技术 薯蓣皂苷元 薯蓣皂苷 对羟基苄基酒石酸 原薯蓣皂苷 薯蓣次皂苷A

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机器学习预测化合物的雌雄激素受体活性

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作者 胡帅 孔韧 谢良旭 《现代计算机》 2023年第1期16-21,共6页

预测一种化合物的雌雄激素受体的活性,对于避免暴露于环境中类似雌雄激素的化学物质是非常重要的。采用包括支持向量机、随机森林等多种机器学习方法,利用Binding Database数据库建立了预测活性的定量结构-活性关系(quantitative struct... 预测一种化合物的雌雄激素受体的活性,对于避免暴露于环境中类似雌雄激素的化学物质是非常重要的。采用包括支持向量机、随机森林等多种机器学习方法,利用Binding Database数据库建立了预测活性的定量结构-活性关系(quantitative structure-activity relationship,QSAR)模型,并对模型进行验证与评估。评估结果发现,随机森林结合扩展连通性分子指纹对数据集预测准确率为0.83,其受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)得到的数据集曲线下面积(area under curve,AUC)为0.892,表明该模型具有广泛且良好的预测能力。该研究建立的活性预测模型可用于化合物的活性预测,为内分泌化合物的活性评估和风险管理提供参考。 展开更多

关键词 雌雄激素受体 QSAR 活性预测 机器学习

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序列组装在蛋白质测序技术中的方法

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作者 陆翼 葛成 +3 位作者 徐晴 蔡标 孔韧 常珊 《现代计算机》 2023年第4期18-24,48,共8页

从头测序技术是应用于蛋白质组学的测序方法。与其他测序技术相比,从头测序技术的优势是在不依赖数据库搜索和无需PCR扩增的基础上对DNA或者蛋白质进行测序。目前,从头测序技术也广泛应用于蛋白质组学领域。研究人员为了将测序技术所得... 从头测序技术是应用于蛋白质组学的测序方法。与其他测序技术相比,从头测序技术的优势是在不依赖数据库搜索和无需PCR扩增的基础上对DNA或者蛋白质进行测序。目前,从头测序技术也广泛应用于蛋白质组学领域。研究人员为了将测序技术所得的短序列reads进一步组装成一条完整的序列,就需要使用序列组装方法。首先,介绍了测序技术的发展背景、从头测序技术的概念以及序列组装算法的出现;其次,总结了基于Overlap⁃Layout⁃Consensus策略、deBruijn图策略和Greedy策略的序列组装算法的具体概念和成果;最后,阐述了序列组装算法面临的挑战。 展开更多

关键词 从头测序 序列组装算法 deBruijn图

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基于Transformer网络的抗癌肽的预测 被引量：1

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作者 蔡标 葛成 +3 位作者 徐晴 陆翼 孔韧 常珊 《现代计算机》 2022年第18期9-15,共7页

癌症是造成人类死亡的一个重要原因。抗癌肽(ACPs)是一系列由10~60个氨基酸组成的短肽,可以抑制肿瘤细胞的增殖或迁移,不易引起耐药性。将肽序列作为输入,搭建基于Transformer网络的抗癌肽模型并预测,模型自动将序列信息通过字符嵌入的... 癌症是造成人类死亡的一个重要原因。抗癌肽(ACPs)是一系列由10~60个氨基酸组成的短肽,可以抑制肿瘤细胞的增殖或迁移,不易引起耐药性。将肽序列作为输入,搭建基于Transformer网络的抗癌肽模型并预测,模型自动将序列信息通过字符嵌入的方法映射为特征向量,实现了使用Transformer网络模型来自动识别抗癌肽和非抗癌肽。五倍交叉验证实验结果表明,该模型在数据集ACP240和ACP740上的准确率分别达到87.92%和83.75%。该模型能够有效地预测抗癌肽。 展开更多

关键词 TRANSFORMER 抗癌肽 预测 肽序列

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蛋白质分子机器结构的特性分析及去折叠研究 被引量：1

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作者 张莉莉 蒋益锋 +2 位作者 谢良旭 孔韧 常珊 《数据采集与处理》 CSCD 北大核心 2022年第5期1126-1133,共8页

分子机器是指由分子尺度的物质构成且能行使某种加工功能的机器,主要构件是蛋白质等生物分子。三维空间结构决定了蛋白质的相关特性和功能,理解蛋白质的氨基酸(残基)序列如何折叠成特定的三维空间结构,即蛋白质结构的折叠机制及其特性... 分子机器是指由分子尺度的物质构成且能行使某种加工功能的机器,主要构件是蛋白质等生物分子。三维空间结构决定了蛋白质的相关特性和功能,理解蛋白质的氨基酸(残基)序列如何折叠成特定的三维空间结构,即蛋白质结构的折叠机制及其特性对于分子机器的研究具有重要意义。因此,使用一种快速简单的研究蛋白质结构折叠机制信息的模拟方法很有必要。本文主要基于蛋白质的自然状态拓扑,采用高斯网络模型研究了蛋白质GB1,分析了其结构特性及其结构的展开过程,与相关实验和分子动力学模拟数据吻合良好,表明该弹性网络模型适用于蛋白质结构的研究。 展开更多

关键词 蛋白质 弹性网络模型 结构特性 去折叠 GB1

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有机磷酸酯阻燃剂2-乙基己基二苯基磷酸酯多代暴露对大型溞生殖、发育及相关基因转录的影响

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作者 王云泽 袁思亮 +3 位作者 孔任 钱址松 李博群 刘春生 《杭州师范大学学报（自然科学版）》 CAS 2022年第6期609-619,共11页

2-乙基己基二苯基磷酸酯(EHDPP)是一种典型的有机磷酸酯阻燃剂,近年来在水环境和水生生物组织中有着较高的检出率.为探究低浓度EHDPP对浮游动物的发育和生殖毒性及母体传递效应,以0、0.1、1、10和100μg/L的EHDPP对甲壳类浮游生物大型... 2-乙基己基二苯基磷酸酯(EHDPP)是一种典型的有机磷酸酯阻燃剂,近年来在水环境和水生生物组织中有着较高的检出率.为探究低浓度EHDPP对浮游动物的发育和生殖毒性及母体传递效应,以0、0.1、1、10和100μg/L的EHDPP对甲壳类浮游生物大型溞进行三代慢性暴露,研究EHDPP暴露对大型溞生殖、发育及相关基因转录的影响.研究发现100μg/L EHDPP慢性暴露下F0大型溞体长下降,F1新生儿体长下降并出现雄性个体.继续开展F1和F2大型溞的21 d连续多代暴露试验,并设置恢复组(无EHDPP暴露)进行大型溞的21 d恢复实验.结果发现100μg/L EHDPP恢复组和连续暴露组中F1大型溞的体长均受到显著抑制,F2中均观察到雄性个体出现,说明EHDPP对大型溞生长的影响持续到了F2代.基因表达结果显示,EHDPP暴露下调了细胞循环途径相关基因的表达,上调了幼年激素酯酶基因的表达量,说明EHDPP可能通过引起细胞周期紊乱和激素水平变化进而干扰大型溞正常的生长生殖.综上所述,EHDPP长期暴露引起了大型溞的发育毒性和生殖毒性,并能对大型溞后代造成持续性影响. 展开更多

关键词 大型溞 有机磷酸酯阻燃剂 慢性毒性 发育毒性

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基于CPU和GPU异构的蛋白质分子半柔性对接算法优化 被引量：1

7

作者 陆旭峰 陆振宇 +2 位作者 梅向东 孔韧 常珊 《数据采集与处理》 CSCD 北大核心 2018年第4期603-610,共8页

分子对接是预测蛋白质复合物的有效手段。对于分子对接算法的优化旨在加速分子对接效率,降低计算成本,以及充分发挥计算资源的利用率。本文主要采用3个方案对半柔性对接算法进行优化:(1)方案一在CPU端进行优化;(2)方案二在方案一的基础... 分子对接是预测蛋白质复合物的有效手段。对于分子对接算法的优化旨在加速分子对接效率,降低计算成本,以及充分发挥计算资源的利用率。本文主要采用3个方案对半柔性对接算法进行优化:(1)方案一在CPU端进行优化;(2)方案二在方案一的基础上,利用CUFFT的移植工具CUFFTW为方案一提供部分GPU并行接口;(3)方案三利用GPU并行架构,通过CPU和GPU的协同处理,利用纯并行计算接口进行优化。3种方案对PDB code分别为1PEE,1B6C,4HX3和2SNI的测试蛋白进行结合态和自由态的对接,求得的最小均方根偏差L_(RMSD)小于5?,满足了复合物结构预测竞赛要求的中等精度结构标准,验证了对接结果的正确性。最后在保证结果正确性的前提下,测试了不同蛋白在不同方案下的运行速率;在保证不同蛋白对接效率相同的前提下,以1PPE为例,比较了不同方案下的对接速率。实验结果表明在同等旋转步长并保证程序运行结果正确性的前提下,最终的优化效果可提速近10倍,有效改进了半柔性对接算法的运行速率。 展开更多

关键词 蛋白质 半柔性 分子对接 CPU GPU

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基于Hadoop环境下蛋白质与配体分子对接模拟实验研究

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作者 钦淳 许磊 +2 位作者 王峰 孔韧 常珊 《数据采集与处理》 CSCD 北大核心 2020年第4期672-681,共10页

蛋白质种类和小分子的数量过多,对于药物的模拟开发运算量巨大。而分子对接是研究新药的重要手段,因此提高分子对接实验系统的工作效率十分重要。分子对接主要目的是研究蛋白质受体和配体小分子之间的作用与联系。本文通过模拟实验,搭... 蛋白质种类和小分子的数量过多,对于药物的模拟开发运算量巨大。而分子对接是研究新药的重要手段,因此提高分子对接实验系统的工作效率十分重要。分子对接主要目的是研究蛋白质受体和配体小分子之间的作用与联系。本文通过模拟实验,搭建了一个Hadoop平台,并利用Hadoop强大的并行计算能力对蛋白质(1ppe与1uy6)与多组数量不同的配体小分子进行对接,最后对工作过程进行了相应的比较与优化。实验结果表明,该系统可以有效提高对接效率,并且具有较好的稳定性和便利性。 展开更多

关键词 蛋白质 分子对接 Hadoop环境 并行计算

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计算模型在化合物毒性预测方面的应用及展望

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作者 许志旺 何王秋 孔韧 《现代计算机》 2024年第7期81-85,共5页

毒性研究是一项重要且复杂的科学工作,涉及到评估化学物质及其他物质对人类健康的潜在危害,也对环境保护和可持续发展起着重要作用。传统的基于分子、细胞与动物模型的毒理学实验,除了成本高昂且耗时的问题,还存在对动物不友好的局限性... 毒性研究是一项重要且复杂的科学工作,涉及到评估化学物质及其他物质对人类健康的潜在危害,也对环境保护和可持续发展起着重要作用。传统的基于分子、细胞与动物模型的毒理学实验,除了成本高昂且耗时的问题,还存在对动物不友好的局限性。随着计算机技术的迅猛发展,出现了计算毒理学模型的开发研究。相比于传统的毒理学实验,计算毒理学模型具有高效率、低成本、方便快捷的特点,逐渐成为毒理学研究的热点方向之一。介绍了包括机器学习在内的计算模型预测化合物毒性的研究方法及其在环境保护、毒性风险评估和药物设计等领域的应用,并进一步讨论了计算模型在毒性预测中存在的不足之处及可能的发展方向。 展开更多

关键词 计算毒理学 机器学习 毒性预测

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计算机模拟技术在SARS-CoV-2病毒分子机制研究中的应用

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作者 刘凯 许志旺 +2 位作者 何王秋 常珊 孔韧 《现代计算机》 2023年第7期9-15,22,共8页

由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引发的严重急性呼吸系统综合症到目前为止仍然是影响人类健康的重要问题,病毒突变体的不断出现给药物治疗以及疫苗设计带来了严重的挑战。因此,对于新冠病毒生命周期的分子机制及其突变逃逸机制的研究十分重... 由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引发的严重急性呼吸系统综合症到目前为止仍然是影响人类健康的重要问题,病毒突变体的不断出现给药物治疗以及疫苗设计带来了严重的挑战。因此,对于新冠病毒生命周期的分子机制及其突变逃逸机制的研究十分重要。包括分子动力学模拟在内的计算机模拟方法在病毒机制研究方面得到了广泛的应用,故对近年来模拟技术在SARS-CoV-2病毒研究方面的发展状况进行调查,特别探究了分子动力学模拟在刺突蛋白(S蛋白)及其突变体和ACE2以及中和抗体的结合中的应用。 展开更多

关键词 SARS-CoV-2 分子动力学模拟 刺突蛋白 中和抗体

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一株富含α-亚麻酸栅藻的异养培养条件优化 被引量：2

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作者 孟霞 高宏 +1 位作者 孔任秋 徐旭东 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期819-823,共5页

HSJ296是本实验室分离纯化的1株能够异养生长、富含α-亚麻酸的栅藻(Scenedesmus sp.)。研究比较了不同温度、氮源和葡萄糖浓度对其生长的影响,结果显示,其最适培养条件为30℃、4 g/L尿素和20—40 g/L葡萄糖。通过分析不同培养条件下HSJ... HSJ296是本实验室分离纯化的1株能够异养生长、富含α-亚麻酸的栅藻(Scenedesmus sp.)。研究比较了不同温度、氮源和葡萄糖浓度对其生长的影响,结果显示,其最适培养条件为30℃、4 g/L尿素和20—40 g/L葡萄糖。通过分析不同培养条件下HSJ296总脂中的脂肪酸组成,发现主要含有十六碳脂肪酸(C16:0)、油酸(C18:1)、亚油酸(C18:2)和α-亚麻酸(α-C18:3),并且α-亚麻酸的含量稳定在35%—45%。栅藻HSJ296发酵产品或可用作鱼类饲料添加剂以补充α-亚麻酸等营养。 展开更多

关键词 栅藻HSJ296 Α-亚麻酸 异养生长

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两种技术对不同手术标本进行检测诊断胸壁结核的价值 被引量：2

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作者 任航空 段李明 郑琴芳 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2020年第1期74-78,共5页

目的探讨GeneXpert MTB/RIF技术(简称“GeneXpert”)、BACTEC MGIT 960液体培养(简称“MGIT 960”)对不同手术标本进行检测诊断胸壁结核的价值。方法搜集2016年6月至2019年7月西安市胸科医院收治的疑似胸壁结核患者214例,通过外科手术... 目的探讨GeneXpert MTB/RIF技术(简称“GeneXpert”)、BACTEC MGIT 960液体培养(简称“MGIT 960”)对不同手术标本进行检测诊断胸壁结核的价值。方法搜集2016年6月至2019年7月西安市胸科医院收治的疑似胸壁结核患者214例,通过外科手术获得病灶中的脓液152份、干酪样坏死组织128份及肉芽组织138份,同时采用GeneXpert及MGIT 960对上述标本进行检测。通过临床综合诊断、病理学检查确诊胸壁结核174例,非结核性胸壁疾病40例。以临床诊断结果为参考标准,评价GeneXpert及MGIT 960诊断胸壁结核的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、Kappa值;对3种标本采用GeneXpert及MGIT 960的检测结果(阳性率差异)进行比较,统计学分析采用χ^2检验,以P<0.05为差异有统计学意义。结果214例疑似胸壁结核患者通过术前血液化验、影像学资料及术后病理结果临床最终诊断为胸壁结核174例,非结核性胸壁疾病40例(其中化脓性胸壁脓肿18例,胸壁囊肿并发普通细菌感染9例,软组织肿瘤8例,肋骨骨髓炎3例,胸壁放线菌病2例)。以临床诊断结果为标准,GeneXpert检测诊断胸壁结核的敏感度为82.18%(143/174),特异度为97.50%(39/40),阳性预测值为99.31%(143/144),阴性预测值为55.71%(39/70),Kappa值为0.618;MGIT 960检测诊断胸壁结核的敏感度为52.30%(91/174),特异度为100.00%(40/40),阳性预测值为100.00%(91/91),阴性预测值为32.52%(40/123),Kappa值为0.291。上述2种技术对3种类型手术标本的检测阳性率分别是:肉芽组织为81.9%(113/138),干酪样坏死组织为68.8%(88/128),脓液为44.7%(68/152);脓液与干酪样坏死组织两组之间的阳性率比较,χ^2=16.23,P<0.001;干酪样坏死组织和肉芽组织两组之间的阳性率比较,χ^2=4.19,P=0.013;肉芽组织和脓液两组之间的阳性率比较,χ^2=42.54,P<0.001。结论GeneXpert检测诊断胸壁结核的敏感度明显高于MGIT 960,而特异度接近,可用于手术标本的快速� 展开更多

关键词 结核 胸壁 标本制备 实验室技术和方法 诊断 评价研究

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多变鱼腥藻ATCC 29413基因的一步插入失活

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作者 雷棋琴 戢水玲 +3 位作者 黄任衡 高宏 徐旭东 孔任秋 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期48-53,共6页

多变鱼腥藻ATCC 29413有潜力发展为异养生长产异形胞蓝藻的研究模式种,但由于细胞内的限制-修饰系统等原因,其基因转移效率极低。研究克隆了该藻株的两个甲基化酶(M.AvaⅠ和M.AvrⅡ)基因ava_3181和ava_4359,构建了辅助质粒pHB6088,对运... 多变鱼腥藻ATCC 29413有潜力发展为异养生长产异形胞蓝藻的研究模式种,但由于细胞内的限制-修饰系统等原因,其基因转移效率极低。研究克隆了该藻株的两个甲基化酶(M.AvaⅠ和M.AvrⅡ)基因ava_3181和ava_4359,构建了辅助质粒pHB6088,对运载质粒进行甲基化保护以避免被细胞中的限制酶切割。以ava_1237和ava_4412基因为例,研究证明利用该辅助质粒和接合转移系统可通过双交换对多变鱼腥藻ATCC 29413的基因实现一步插入失活。 展开更多

关键词 多变鱼腥藻ATCC 29413 接合转移 辅助质粒 甲基化酶基因 基因插入失活

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gvpA-C间隔区在微囊藻株系分型中的应用

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作者 李小栋 王雅丽 +2 位作者 高宏 徐旭东 孔任秋 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期1098-1103,共6页

从暴发水华的水体分离微囊藻(Microcystis)株,并依据gvpA-C间隔区和16S rDNA序列对其分型和比较。在gvpA-C间隔区序列中,有的类型具有一段172—176 bp的额外序列。以不包括额外序列的0.27 kb序列相比较,不同类型之间差异碱基位点达50余... 从暴发水华的水体分离微囊藻(Microcystis)株,并依据gvpA-C间隔区和16S rDNA序列对其分型和比较。在gvpA-C间隔区序列中,有的类型具有一段172—176 bp的额外序列。以不包括额外序列的0.27 kb序列相比较,不同类型之间差异碱基位点达50余个。在16S rDNA碱基变异集中的0.69 kb序列中,不同类型之间有差异的碱基位点共有8个。与16S rDNA序列相比,微囊藻gvpA-C间隔区序列具有高度变异性,并且其PCR扩增可一步完成,不受其他细菌污染,因而可用于微囊藻株系分型。由于横向转移,2种分型存在交叉关系。此外,原本含有或不含有额外序列的微囊藻gvpA-C间隔区序列在系统进化树中分别聚成一簇。 展开更多

关键词 微囊藻 gvpA-C间隔区序列 16S RDNA 分型

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人转运蛋白SR2的原核表达及其与HIV-1整合酶体外相互作用的检测

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作者 许晓双 张大为 孔韧 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期38-41,共4页

人转运蛋白SR2(TRN-SR2)与HIV-1整合酶(IN)相互作用是抗HIV治疗的有效靶点,寻找和设计该靶点的高效抑制剂具有重要的临床意义和广阔的应用前景。因此为了开展以TRN-SR2与HIV-1IN相互作用为靶点的抑制剂筛选研究,以pGEX-2T为载体的重组质... 人转运蛋白SR2(TRN-SR2)与HIV-1整合酶(IN)相互作用是抗HIV治疗的有效靶点,寻找和设计该靶点的高效抑制剂具有重要的临床意义和广阔的应用前景。因此为了开展以TRN-SR2与HIV-1IN相互作用为靶点的抑制剂筛选研究,以pGEX-2T为载体的重组质粒pGST-TRN-SR2在大肠杆菌Rosetta(DE3)中进行原核表达,并利用亲和层析纯化得到浓度为0.80mg/mL的重组TRN-SR2蛋白;然后采用生物膜干涉技术(BLI)进行体外检测重组TRN-SR2蛋白与HIV-1IN的相互作用和结合情况。结果表明,重组TRN-SR2蛋白与HIV-1IN相互结合信号明显升高,且测得平衡解离常数KD值为45.2nmol/L。最后利用均相时间分辨荧光技术(HTRF)和交叉滴定实验确定了TRN-SR2与HIV-1IN在该靶点抑制剂筛选实验体系中的最适反应浓度分别为20和40nmol/L。以上研究结果说明原核表达的重组TRN-SR2蛋白的活性较好且与HIV-1IN体外相互作用明显,同时在筛选实验体系中TRN-SR2与HIV-1IN最适浓度的确定也为后续抑制剂的筛选提供了相应的研究基础。 展开更多

关键词 HIV-1整合酶 TRN-SR2 蛋白-蛋白相互作用 BLI HTRF

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基于新型冠状病毒SARS-CoV-2主蛋白酶结构的小分子抑制剂虚拟筛选

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作者 徐浩 薛瑞 +5 位作者 李娟 李波 陈舟 朴莲花 常珊 孔韧(指导) 《江苏理工学院学报》 2021年第2期65-71,共7页

通过使用分子对接与虚拟筛选技术,以SARS-CoV-2主蛋白酶(Main Protease,Mpro)为靶点,利用Autodock Vina软件和Python脚本进行分子对接,结合小分子的对接评分与结合模式分析,筛选出特异性作用于主蛋白酶的小分子抑制剂。结果发现,以SARS-... 通过使用分子对接与虚拟筛选技术,以SARS-CoV-2主蛋白酶(Main Protease,Mpro)为靶点,利用Autodock Vina软件和Python脚本进行分子对接,结合小分子的对接评分与结合模式分析,筛选出特异性作用于主蛋白酶的小分子抑制剂。结果发现,以SARS-CoV-2主蛋白酶原配体N3为对照,Reactive blue 2等分子具有更好的对接打分与合理的结合模式,或可成为潜在的主蛋白酶小分子抑制剂,可为寻找抗新冠病毒治疗药物提供线索。 展开更多

关键词 分子对接 COVID-19 虚拟筛选 主蛋白酶 小分子抑制剂

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基于深度强化学习与自学习的多无人机近距空战机动策略生成算法 被引量：11

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作者 孔维仁 周德云 +1 位作者 赵艺阳 杨婉莎 《控制理论与应用》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第2期352-362,共11页

为解决多无人机近距空战机动决策问题,提出一种基于参数共享Q网络与虚拟自我对局的多无人机近距空战机动策略生成算法.首先,设计一种适用于不同无人机编队规模的混合马尔可夫博弈模型与多无人机机动决策策略生成强化学习框架—参数共享... 为解决多无人机近距空战机动决策问题,提出一种基于参数共享Q网络与虚拟自我对局的多无人机近距空战机动策略生成算法.首先,设计一种适用于不同无人机编队规模的混合马尔可夫博弈模型与多无人机机动决策策略生成强化学习框架—参数共享Q网络,并通过自编码器对状态空间进行压缩以提高策略学习效率.然后,使用虚拟自我对局方法使机动策略收敛至纳什均衡策略.最后对自编码器的参数选择、策略生成算法的训练过程与机动策略的合理性与迁移性进行了仿真实验.通过仿真结果表明,引入自编码器可以有效地提高策略学习效率,并且使用该算法生成的多无人机近距空战机动策略具有合理性与良好的迁移性. 展开更多

关键词 空战决策 多无人机协同 强化学习 虚拟自我对局

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二次再热机组一次调频特性分析 被引量：8

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作者 储墨 高林 +3 位作者 孔源 任永军 杨柏依 苏永宁 《热力发电》 CAS 北大核心 2017年第8期123-126,共4页

电网对火电机组的一次调频性能的要求越来越严格,而我国目前已投运的二次再热机组均存在一次调频调节品质差等问题。本文在IEEE经典模型的基础上,建立了二次再热机组一次调频模型,采用遗传算法对模型参数进行辨识,并通过测试数据分析了... 电网对火电机组的一次调频性能的要求越来越严格,而我国目前已投运的二次再热机组均存在一次调频调节品质差等问题。本文在IEEE经典模型的基础上,建立了二次再热机组一次调频模型,采用遗传算法对模型参数进行辨识,并通过测试数据分析了二次再热机组的一次调频特性,一次调频模型参数辨识结果仿真与实测曲线的对比证明了所提出模型的有效性。分析结果表明,二次再热机组设备的固有特性,使二次再热机组的一次调频性能受到极大限制,难以仅依靠控制逻辑优化实现一次调频性能显著改善。 展开更多

关键词 火电机组 电网 一次调频 二次再热 参数辨识 数学模型

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爆炸场电磁辐射特性测试技术研究 被引量：7

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作者 崔元博 商飞 +1 位作者 孔德仁 王良全 《火工品》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期1-5,共5页

为了研究高能含能材料爆炸时产生的电磁辐射特性,设计了一套由宽频天线、信号放大器、高速采集卡组成的电磁辐射测试系统,对某型弹云爆过程的电磁辐射进行测量及分析研究。研究结果表明:在某型弹起爆后出现较短时间的强信号,间隔一段时... 为了研究高能含能材料爆炸时产生的电磁辐射特性,设计了一套由宽频天线、信号放大器、高速采集卡组成的电磁辐射测试系统,对某型弹云爆过程的电磁辐射进行测量及分析研究。研究结果表明:在某型弹起爆后出现较短时间的强信号,间隔一段时间后再次出现较长时间的强电磁信号,第2时间段内的电磁脉冲持续性明显强于第1时间段,不同测试点采集得到的电磁信号呈现不同的传递特性;云爆过程中产生的电磁辐射频率主要分布于21MHz以内,在11~17MHz频段分布尤为明显,爆炸产生的电磁场强度超过300V/m。 展开更多

关键词 含能材料 电磁辐射 短波天线 频谱分析

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国民经济动员链潜力释放机理研究 被引量：6

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作者 孔昭君 任鹏燕 《北京理工大学学报（社会科学版）》 CSSCI 2016年第6期114-118,共5页

国民经济动员链是动员任务的载体,也是国民经济动员潜力释放的渠道与途径。国民经济动员链系统的运作机理表现为资源流动性、各参与部门间的相互链接关系,所以国民经济动员潜力建设应注重于资源间的依赖性与配套性,着重解决短板问题。... 国民经济动员链是动员任务的载体,也是国民经济动员潜力释放的渠道与途径。国民经济动员链系统的运作机理表现为资源流动性、各参与部门间的相互链接关系,所以国民经济动员潜力建设应注重于资源间的依赖性与配套性,着重解决短板问题。同时应强化各参与者之间的合作机制建设、适应性和应变能力建设,着力提高国民经济动员链的系统效能。 展开更多

关键词 国民经济 动员潜力 动员链 运作机理

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