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基于生物信息学和机器学习算法鉴定PDR铁死亡关键基因
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作者 徐径舟 黄晋 +2 位作者 李智豪 张赟 陈鼎 《中华眼视光学与视觉科学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期204-212,共9页
目的:联合生物信息学分析方法和机器学习算法筛选增殖性糖尿病视网膜病变(PDR)中铁死亡关键基因和治疗靶点。方法:从GEO数据库和FerrDb数据库中下载PDR转录组测序数据集、基因芯片数据集和铁死亡相关基因列表;筛选出铁死亡相关差异基因... 目的:联合生物信息学分析方法和机器学习算法筛选增殖性糖尿病视网膜病变(PDR)中铁死亡关键基因和治疗靶点。方法:从GEO数据库和FerrDb数据库中下载PDR转录组测序数据集、基因芯片数据集和铁死亡相关基因列表;筛选出铁死亡相关差异基因并行功能富集分析;通过WGCNA分析方法筛选PDR中铁死亡相关疾病特征基因;综合LASSO算法与SVM-RFE算法筛选出铁死亡关键基因并通过受试者工作特征曲线评估诊断能力;对铁死亡关键基因行GSEA分析;通过DGIdb数据库构建铁死亡关键基因的药物调控网络;应用CIBERSORT算法分析PDR中免疫细胞浸润分布特征。组间比较采用独立样本t检验或Mann-Whitney U检验。Pearson相关分析用于不同基因模块与临床性状之间的相关性分析。结果:从3678个差异基因中筛选出83个铁死亡相关差异基因。功能富集分析结果显示,这些基因参与铁死亡、长寿调节、自噬等信号通路。通过WGCNA分析方法从中筛选出17个铁死亡相关疾病特征基因。联合LASSO算法与SVM-RFE算法从17个疾病特征基因中筛选出3个铁死亡关键基因为PPARA、ABCC5、TSC1,并证明这些基因有很高的诊断效能。单基因GSEA分别展示了3个关键基因高低表达组中富集到的信号通路。从DGIdb数据库中筛选出20个相关药物并构建3个关键基因的药物调控网络。CIBERSORT结果显示,M1巨噬细胞、中性粒细胞等在PDR样本中浸润程度较高。结论:本研究分析鉴定出PDR中3个铁死亡关键基因,为进一步研究PDR的病理分子机制和诊断治疗靶点提供了新的思路与参考。 展开更多
关键词 生物信息学 机器学习 糖尿病视网膜病变 铁死亡
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不同教育层次军校医学生的网课需求差异及原因探究:以某军医大学为例
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作者 徐淑雨 苏彤 +3 位作者 王浩 徐静舟 刘鹏 唐云翔 《中华医学教育探索杂志》 2021年第11期1334-1338,共5页
目的探究本、硕、博3种不同教育层次的学员之间的学习状态稳定性、对于网课的态度、网课需求是否存在差异,并进一步探究其原因。方法采用具有良好信效度的自编问卷,利用整群抽样的方法以某军医大学全体学员为研究对象,发放网络问卷进行... 目的探究本、硕、博3种不同教育层次的学员之间的学习状态稳定性、对于网课的态度、网课需求是否存在差异,并进一步探究其原因。方法采用具有良好信效度的自编问卷,利用整群抽样的方法以某军医大学全体学员为研究对象,发放网络问卷进行数据收集。使用SPSS 26.0进行数据处理。结果①在学习状态稳定性方面,居家学习时间变化程度博士生(2.41±1.30)<硕士生(2.10±1.17)和本科生(2.15±0.99);网课使用频率变化本科生(4.18±1.10)>硕士生(3.29±1.16)和博士生(3.29±0.98)。②网课态度方面,必要性本科生(4.14±1.01)>硕士生(3.93±1.05)和博士生(3.78±1.03);熟悉度本科生(3.42±0.91)>硕士生(3.27±0.97);适应程度方面本科生(3.79±0.91)>硕士生(3.58±0.94)和博士生(3.63±0.97);喜欢程度方面本科生(3.36±1.04)>硕士生(3.25±0.96)和博士生(3.17±1.01);教学效果方面本科生(2.80±1.04)>硕士生(2.67±1.01)和博士生(2.61±1.03)。③网课需求方面,理想人数本科生(2.52±1.27)>硕士生(2.11±1.21)和博士生(2.01±1.25);上课方式方面本科生(1.77±0.94)>硕士生(2.00±0.92)和博士生(2.04±1.83)。两个维度之间本科生与研究生差异均有统计学意义(P<0.01或P<0.05)。结论本科生学习状态的稳定性相对最低;本科生对网课的总体态度最为积极;不同的教育层次对网课的需求不同。 展开更多
关键词 网课 教育层次 军校学生 医学生
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