圈养不同性别林麝粪便菌群多样性研究 被引量：11

1

作者 赵贵军 竭航 +5 位作者 朱吉彬 郑程莉 曾德军 张承露 戚文华 封孝兰 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2019年第7期1652-1658,I0001,共8页

【目的】采用16S rRNA高通量测序技术来揭露雄性和雌性林麝的粪便菌群的结构和组成。【方法】选取10只雌性和10只雄性林麝作为试验动物,采集其新鲜粪便,提取微生物总DNA,用细菌通用引物PCR扩增16S rRNA的V3~V4区,用Illumina MiSeq测序... 【目的】采用16S rRNA高通量测序技术来揭露雄性和雌性林麝的粪便菌群的结构和组成。【方法】选取10只雌性和10只雄性林麝作为试验动物,采集其新鲜粪便,提取微生物总DNA,用细菌通用引物PCR扩增16S rRNA的V3~V4区,用Illumina MiSeq测序平台对扩增产物进行高通量测序,用QIIME等软件对测序序列进行分析统计。【结果】雄性样本、雌性样本分别平均为57 504±8187条、50 190±6963条有效序列。在α多样性分析中雌雄微生物丰富度和多样性在组间均无显著差异(P>0.05),但雄性微生物的丰富度、多样性高于雌性。门水平中,Firmicutes,Proteobacteria和Bacteroidetes为雌雄主要3个优势门类,其中Bacteroidetes在雌性所占比例较雄性高。科水平中Ruminococcaceae,Lachnospiraceae和*Clostridiales为雌雄主要3个优势科类,此外雌性含有更多的*Bacteroidales,雄性含有更多的Pseudomonadaceae和Enterobacteriaceae。主成分分析和以偏最小二乘回归的判别模型和菌群代谢功能聚类分析都反映出雌性和雄性存在差异,而且发现雄性的样本重复性好于雌性的重复性,但都存在一定的个体差异。【结论】雄性和雌性林麝粪便中细菌组成成分没有显著差异,但同类细菌在不同个体和分组上存在比例上的高低差异,雄性微生物组成包含更多的潜在致病菌例如Pseudomonadaceae,而雌性微生物包含更多有益菌*Bacteroidales,这可能反映出雄性和雌性对于疾病抵抗能力的不同。 展开更多

关键词 林麝 不同性别 粪便微生物 高通量测序 致病菌

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成年与未成年圈养林麝粪便菌群多样性的比较 被引量：10

2

作者 赵贵军 封孝兰 +5 位作者 朱吉彬 郑程莉 竭航 曾德军 张承露 戚文华 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期266-275,共10页

本研究旨在解析林麝未成年组(n=10)和成年组(n=10)之间的菌群差异。收集林麝新鲜粪便,提取总DNA,利用带标签的通用引物扩增16S rRNA V3-V4区,使用Illumina Miseq 300PE测序平台对扩增产物进行Miseq双端测序,通过计算ACE和Shannon等多样... 本研究旨在解析林麝未成年组(n=10)和成年组(n=10)之间的菌群差异。收集林麝新鲜粪便,提取总DNA,利用带标签的通用引物扩增16S rRNA V3-V4区,使用Illumina Miseq 300PE测序平台对扩增产物进行Miseq双端测序,通过计算ACE和Shannon等多样性指数,以及微生物组成成分和距离聚类分析,揭示组成结构与差异。α多样性分析表明成年组微生物的多样性丰富度略高于未成年组,但不存在显著差异性(P>0.05)。未成年组和成年组均是厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和变形菌门(Proteobacteria)所占的比例较高。成年组Proteobacteria比例明显高,而Firmicutes比例较低。LEfSe分析表明有12个显著差异的细菌分类。两组在Firmicutes门存在显著差异的细菌较少,而在Proteobacteria上存在显著差异的细菌较多。本研究证明在不同年龄阶段,微生物的丰富度和多样性不存在显著差异,细菌的组成成分也相同。但是在组成比例上存在差异性,间接反映了不同年龄阶段营养吸收的不同需求。 展开更多

关键词 林麝 不同年龄 肠道微生物 变形菌门

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圈养林麝产麝香中麝香酮含量测定分析 被引量：6

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作者 郑程莉 蒋桂梅 +7 位作者 吴杰 王建明 陈凤 冯达勇 竭航 赵贵军 周磊 王欢 《中国现代中药》 CAS 2020年第12期2021-2025,2052,共6页

目的:采用气相色谱法(GC)测定圈养林麝所产麝香中的麝香酮含量,为快速判定麝香质量提供参考。方法:统一取香后,分别于每份麝香样品中称取新鲜麝香1 g,采用GC测定其中麝香酮的含量,以期找到不同年龄林麝所产麝香、不同麝香产量、麝香色... 目的:采用气相色谱法(GC)测定圈养林麝所产麝香中的麝香酮含量,为快速判定麝香质量提供参考。方法:统一取香后,分别于每份麝香样品中称取新鲜麝香1 g,采用GC测定其中麝香酮的含量,以期找到不同年龄林麝所产麝香、不同麝香产量、麝香色泽与麝香酮含量的相关性。结果:根据年龄分组,1岁龄林麝麝香产量不是最高,但水分含量低,麝香酮含量最高;7岁及以上林麝所产的麝香质量较低;根据同一年龄阶段林麝的麝香产量分组,发现鲜产量>10 g的麝香中麝香酮质量分数>2.0%,麝香品质较高;从麝香色泽进行分析,红棕色的麝香中麝香酮含量最高,水分含量最低,为品质好的麝香,白色麝香质量最差。结论:根据现场取香结果,可以判定初产麝香的质量和产量高于10 g的麝香品质较高,并且红棕色的麝香为优质麝香。 展开更多

关键词 林麝 麝香产量 麝香酮 含水量 麝香净重

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成熟麝香、白香及麝鼠香的扫描电镜观察研究

4

作者 竭航 赵贵军 +3 位作者 曾德军 封孝兰 张承露 郑程莉 《西南大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期105-111,共7页

通过光学显微镜观察与电镜扫描对比分析成熟麝香、白香和麝鼠香3种样品之间的差异,并对林麝香囊皮肤进行了观测,旨在探究麝香的生理分泌机理.结果表明:成熟麝香主要由10~200μm不规则云状团块组成,在团块上附着或者周围散布着较为模糊... 通过光学显微镜观察与电镜扫描对比分析成熟麝香、白香和麝鼠香3种样品之间的差异,并对林麝香囊皮肤进行了观测,旨在探究麝香的生理分泌机理.结果表明:成熟麝香主要由10~200μm不规则云状团块组成,在团块上附着或者周围散布着较为模糊的星云状物质.白香的均一性较好,光镜下显示为高密度星云状,电镜下呈现为葡萄状样颗粒簇,单一颗粒直径约为0.2μm,夹杂少许椭球形细胞结构和干酪样不规则团块.麝鼠香视野在电镜下较为模糊,但也呈现为葡萄状样颗粒簇,单一颗粒大小为0.5~2μm.林麝香囊颈部皮肤存在多个约2 mm^(2)的排泄小孔,直径约100μm.香囊内壁皮肤也观测到少许20~100μm的排泄小孔. 展开更多

关键词 麝香 白香 麝鼠香 扫描电镜

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麝香不同成熟阶段化学成分变化规律 被引量：4

5

作者 竭航 张承露 +3 位作者 曾德军 赵贵军 封孝兰 雷美艳 《中成药》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期144-148,共5页

目的探索不同成熟阶段麝香中化学成分变化规律。方法通过“活麝取香”法采集不同成熟阶段麝香,测定含水量,并通过GC-MS分析其主要成分含量变化规律。结果6月底麝香平均含水量为55.921%,高于10月底的36.029%(P<0.05)。从6月到8月和10... 目的探索不同成熟阶段麝香中化学成分变化规律。方法通过“活麝取香”法采集不同成熟阶段麝香,测定含水量,并通过GC-MS分析其主要成分含量变化规律。结果6月底麝香平均含水量为55.921%,高于10月底的36.029%(P<0.05)。从6月到8月和10月,麝香中成分种类呈先升后降的变化趋势。6月底麝香中检测到55种成分,低于8月底(P<0.05)。8月底麝香中酮类占大多数,而10月底麝香中烷烃类和酮类较多。在6月底麝香中没有检测到麝香酮和8-环十六烯-1-酮,而8月底和10月底麝香中其相对含量较高。结论麝香酮及8-环十六烯-1-酮的生成很有可能是在林麝分泌香液后的成熟过程中产生,从而造成了在初香液并不具备麝香特有的香味,而是具有浓烈的腥臭味。 展开更多

关键词 麝香 成熟阶段 化学成分 含水量

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林麝香囊组织结构及其发育特点分析 被引量：2

6

作者 郑程莉 竭航 +3 位作者 周磊 吴杰 龚杭 张恬 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2021年第16期126-129,154-156,共7页

为了了解林麝香囊组织结构及其发育和分泌情况,试验采用离体解剖、H.E.染色结合数字全景切片扫描技术,对林麝香囊组织形态结构、组织学切片结构、不同年龄阶段香囊腺泡发育情况、泌香期和非泌香期腺泡直径变化情况和腺泡分泌情况及皮脂... 为了了解林麝香囊组织结构及其发育和分泌情况,试验采用离体解剖、H.E.染色结合数字全景切片扫描技术,对林麝香囊组织形态结构、组织学切片结构、不同年龄阶段香囊腺泡发育情况、泌香期和非泌香期腺泡直径变化情况和腺泡分泌情况及皮脂腺发育与分泌情况进行分析。结果表明:林麝香囊位于肚脐与睾丸之间,为一外观隆起的扁圆形囊,由外向内依次为毛囊皮质层、外层香腺组织层、肌肉层、内层香腺组织层、皮脂层;香囊腺体中部横向夹有的肌肉层使之明显分为外层腺泡和内层腺泡。腺泡在0岁仔麝的香囊中已经开始发育;0岁与1岁、10岁的非泌香期外层腺泡直径均差异极显著(P<0.01),但1岁和10岁之间的差异不显著(P>0.05);3个年龄阶段的内层腺泡直径差异极显著(P<0.01),且随着年龄增长,内层腺泡直径在变大。在非泌香期,内层腺泡直径比外层腺泡大,且部分外层腺泡有分泌物析出,内层腺泡细胞紧密排列成环状;在泌香期,内层腺泡直径比外层腺泡小,但内层腺泡内有以顶浆分泌方式排出的初香分泌物,外层腺泡同样有分泌物蓄积。皮脂层的皮脂腺在仔麝出生时就已发育,但未见分泌物;而1岁和11岁的皮脂腺及其导管均存在分泌物,且无论是否在泌香期均有皮脂腺的分泌。说明林麝香囊腺泡由两种腺细胞组成,存在形态学差异,且皮脂腺是持续分泌的腺体。 展开更多

关键词 林麝 香囊 腺泡 皮脂腺 麝香

原文传递

永生化麝鼠香腺成纤维细胞的转录组学分析 被引量：3

7

作者 竭航 赵春容 +4 位作者 谌颖莲 赵贵军 张承露 封孝兰 曾德军 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2021年第6期772-777,共6页

【目的】探索永生化对麝鼠香腺成纤维细胞转录组的影响。【方法】在获得永生化的麝鼠香腺成纤维细胞后,采用二代测序的方法对其永生化前后转录组进行检测,并通过生物信息学方法进行差异分析。【结果】用Trinity软件对麝鼠永生化和原代... 【目的】探索永生化对麝鼠香腺成纤维细胞转录组的影响。【方法】在获得永生化的麝鼠香腺成纤维细胞后,采用二代测序的方法对其永生化前后转录组进行检测,并通过生物信息学方法进行差异分析。【结果】用Trinity软件对麝鼠永生化和原代香腺细胞测序数据进行基因组装,总共发现62 152 unigenes,富集分析结果显示,上述基因主要聚集在细胞代谢、细胞生物学调控、蛋白结合和酶催化等基因的细胞基础代谢活动。基于DESeq2包的基因表达差异分析结果表明,永生化和原代细胞表达差异的基因总共有8 690个,其中上调基因3 414个,下调基因5 276个,上调基因主要富集于DNA复制、同源重组、错配修复、细胞周期和RNA代谢通路,下调基因主要富集于氧化磷酸化、帕金森病和阿尔茨海默病疾病通路中。【结论】永生化过程对麝鼠原代细胞基因的影响较大,可为后续建立永生化香腺细胞体外泌香体系提供理论支撑。 展开更多

关键词 麝鼠 香腺细胞 永生化 转录组

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药用全蝎毒液的蛋白差异分析 被引量：1

8

作者 卫秋阳 邓小书 +3 位作者 竭航 鲁增辉 石萍 陈仕江 《亚太传统医药》 2023年第5期42-47,共6页

目的:药用全蝎市场需求旺盛,导致市面上出现了大量易混肴种,急需对基原性状与成分差异进行评价。方法:通过收集不同产区资源,鉴定基原与蛋白成分差异,评价其性状优劣。结果:经鉴定,采集的蝎子除东亚钳蝎外,还鉴定出细尖狼蝎、条纹木蝎;... 目的:药用全蝎市场需求旺盛,导致市面上出现了大量易混肴种,急需对基原性状与成分差异进行评价。方法:通过收集不同产区资源,鉴定基原与蛋白成分差异,评价其性状优劣。结果:经鉴定,采集的蝎子除东亚钳蝎外,还鉴定出细尖狼蝎、条纹木蝎;就毒囊来看,东亚钳蝎的毒囊尺寸与蛋白含量最优,为422.87μm×293.74μm与(601.6±432.3)μg/mL;而对抗癫痫肽类成分进行分析,东亚钳蝎中Na^(+)/K^(+)毒素肽、蝎毒素类物质含量最高,其次为细尖狼蝎,而条纹木蝎中仅对部分Ca^(2+)毒素肽存在较高表达。结论:东亚钳蝎在毒囊尺寸与蛋白成分上均要优于其他蝎种,是全蝎类药材的优质基原。 展开更多

关键词 东亚钳蝎 细尖狼蝎 条纹木蝎 毒液 癫痫

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林麝繁育性状候选基因IGF-1的生物信息学分析及遗传效应研究 被引量：1

9

作者 郑程莉 竭航 +6 位作者 杨营 冯达勇 唐婕 付文龙 程建国 蒋桂梅 周磊 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2019年第1期214-218,共5页

【目的】本研究建立了林麝标记辅助选择技术体系,为林麝的品系选育提供理论依据。【方法】通过基因克隆研究林麝胰岛素样生长因子(IGF-1)的基本功能和蛋白质结构,采用PCR-SSCP技术检测IGF-1基因在林麝中的多态性,分析其与产仔数的关联... 【目的】本研究建立了林麝标记辅助选择技术体系,为林麝的品系选育提供理论依据。【方法】通过基因克隆研究林麝胰岛素样生长因子(IGF-1)的基本功能和蛋白质结构,采用PCR-SSCP技术检测IGF-1基因在林麝中的多态性,分析其与产仔数的关联效应。【结果】①IGF-1基因序列全长465 bp,编码153个氨基酸残基,经生物信息学分析,发现该蛋白含有15个磷酸化位点,是一个分泌性蛋白,大部分位于细胞膜上,含有Insulin家族典型的保守结构功能域;②本试验设计IGF-1基因的PCR-SSCP扩增片段长度均为300 bp左右,引物扩增片段用10%的聚丙烯酰胺凝胶进行检测,发现扩增片段没有特异性条带。为证明PCR-SSCP扩增结果,选择其中一条引物对所得的毛发样品进行扩增,测序发现所有PCR产物的序列完全一致,没有多态性。【结论】研究表明不能选择IGF-1基因作为林麝的分子遗传标记,但为林麝产香性能的分子遗传标记选育提供了基本思路。 展开更多

关键词 林麝 胰岛素样生长因子(IGF-1)基因 生物信息学 分子遗传标记

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不同成熟阶段麝香中微生物区系变化规律的研究 被引量：1

10

作者 竭航 赵贵军 +4 位作者 曾德军 封孝兰 张承露 梁正杰 雷美艳 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第20期4448-4453,共6页

名贵中药麝香呈深棕色,并散发浓郁的香气,而未成熟的麝香则为白色且具有腥臭味。鉴于微生物区系在气味物质的生成过程中发挥重要作用,该研究通过“活麝取香”法无菌采集3个不同成熟阶段的麝香,然后采用二代测序法对麝香样品中微生物区... 名贵中药麝香呈深棕色,并散发浓郁的香气,而未成熟的麝香则为白色且具有腥臭味。鉴于微生物区系在气味物质的生成过程中发挥重要作用,该研究通过“活麝取香”法无菌采集3个不同成熟阶段的麝香,然后采用二代测序法对麝香样品中微生物区系进行检测。结果表明,6月底(初香液)、8月底(成熟中)和10月底(成熟)麝香样品平均OTUs数量分别为47 116. 00±1 567. 24(SE),52 009. 00±8 958. 75(SE),50 004. 67±4 135. 57(SE)。微生物群落主要为细菌,3个阶段麝香中细菌的质量分数分别为98. 82%,99. 95%,99. 58%,物种注释共获得52个门、418个属。Firmicutes在8月底麝香和10月底麝香中丰度最高,分别占32. 75%,39. 19%,而6月底麝香中丰度最高的则为Proteobacteria(49. 14%)。PICRUSt分析揭示,6月底麝香中的细菌功能主要与分泌功能密切相关,而8月底和10月底麝香中微生物主要涉及到氨基酸等物质代谢,这与林麝的泌香生理过程一致。鉴于此,厚菌门、变形菌门、放线菌门等细菌很有可能参与到麝香的物质转化过程中来。该研究首次开展了不同成熟阶段麝香中微生物区系的研究,为该方向的下一步发展提供参考。 展开更多

关键词 林麝 麝香 成熟阶段 微生物区系

原文传递

重庆金佛山鸟类区系调查 被引量：1

11

作者 赵贵军 刘嘉 +5 位作者 苗小猛 曾德军 竭航 封孝兰 张承露 陈强 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2020年第2期205-212,共8页

【目的】进一步了解重庆金佛山自然保护区的鸟类组成。【方法】采用样线法于2014—2016年对本区鸟类进行了调查和研究。【结果】在金佛山地区共记录鸟类227种,分属16目49科,并以雀形目为主体。繁殖鸟类(留鸟和夏候鸟)共计180种,占金佛... 【目的】进一步了解重庆金佛山自然保护区的鸟类组成。【方法】采用样线法于2014—2016年对本区鸟类进行了调查和研究。【结果】在金佛山地区共记录鸟类227种,分属16目49科,并以雀形目为主体。繁殖鸟类(留鸟和夏候鸟)共计180种,占金佛山鸟类种数的79.29%。鸟类区系则为东洋种最多(60.79%),古北种次之(24.23%),广布种最少(14.98%)。从数量上看,留鸟是鸟类的构建主体。在不同生境中,鸟类多样性指数由高到低的排序依次为阔叶林﹥针叶林﹥竹林﹥草丛﹥灌丛,均匀度指数灌丛﹥针叶林﹥阔叶林﹥竹林﹥草丛,优势度指数灌丛﹥阔叶林﹥竹林﹥针叶林﹥草丛。不同生境鸟类群落间聚类看,针叶林与灌丛生境的鸟类群落结构最接近,与其他3种生境的差异较大。全年鸟金佛山鸟类群体中包含了黑鹳(Ciconia nigra)、金雕(Aquila chrysaetos)、四川山鹧鸪(Arborophilarufipectus)、红喉雉鹑(Tetraophasis obscurus)等30种珍稀鸟类,占比13.22%。【结论】本研究证明金佛山地区鸟类资源丰富,为该地生态系统的了解和保护提供了参考依据。 展开更多

关键词 重庆金佛山 鸟类组成 生物区划

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饲粮粗蛋白质水平对麝鼠泌香性能的影响

12

作者 马茹月 方远晶 +4 位作者 王颖 杨钦麟 曾德军 竭航 宋代军 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期8001-8012,共12页

为探究饲粮不同粗蛋白质(CP)水平对麝鼠泌香性能的影响,试验选取1周岁健康麝鼠60只,随机分为5组(每组6个重复,每个重复雌、雄麝鼠各1只,仅对雄性麝鼠取样),分别饲喂CP水平为16%、18%、20%、22%和24%的饲粮。预试期10 d,正试期73 d。结... 为探究饲粮不同粗蛋白质(CP)水平对麝鼠泌香性能的影响,试验选取1周岁健康麝鼠60只,随机分为5组(每组6个重复,每个重复雌、雄麝鼠各1只,仅对雄性麝鼠取样),分别饲喂CP水平为16%、18%、20%、22%和24%的饲粮。预试期10 d,正试期73 d。结果表明:1)试验第12天取香时,22%组麝鼠泌香量最高,24%组麝鼠泌香量最低,且显著低于18%、20%和22%组(P<0.05);试验第36、63天取香时,22%组麝鼠泌香量显著高于其他组(P<0.05),其他各组之间差异不显著(P>0.05)。随着饲粮CP水平的提高,18%和20%组麝鼠总泌香量有所上升,22%组麝鼠总泌香量最高,且显著高于其他组(P<0.05);当饲粮CP水平进一步提高到24%时,麝鼠总泌香量开始下降且低于其他试验组,但差异不显著(P>0.05)。2)各组香液水分含量差异不显著(P>0.05),22%组香液中环十五烷酮含量显著高于其他组(P<0.05),24%组香液中环十五烷酮含量最低。3)血液中睾酮(T)和雌二醇(E2)的含量随饲粮CP水平提高有上升趋势,且20%、22%、24%组血清T和E2的含量显著高于16%组(P<0.05)。4)16%组麝鼠血清中尿素氮(UN)的含量最低且显著低于其他组(P<0.05),22%组麝鼠血清中UN的含量最高,显著高于20%组(P<0.05);血清总蛋白(TP)含量在24%组最低,显著低于其他组(P<0.05);血清白蛋白(ALB)含量在16%组最低,显著低于其他组(P<0.05),20%组最高且显著高于16%和24%组(P<0.05)。由此可见,饲粮CP水平会影响麝鼠的泌香性能,当饲粮CP水平为22%时,麝鼠的泌香量最多、产香品质较好。 展开更多

关键词 麝鼠 泌香性能 性激素 蛋白质代谢

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基于代谢组学的麝鼠香腺上皮细胞中降麝香酮生物合成机制研究 被引量：1

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作者 赵贵军 谌颖莲 +4 位作者 曾德军 竭航 张承露 吴佳勇 封孝兰 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第10期2462-2468,共7页

【目的】构建麝鼠香腺上皮细胞的睾酮体外诱导模型,测定分析睾酮诱导培养的香腺上皮细胞代谢物差异表达情况,探究诱导刺激模型下环碳分子架构的生物合成过程,解析麝鼠香腺上皮细胞中降麝香酮生物合成机制。【方法】取9只12~18月龄繁殖... 【目的】构建麝鼠香腺上皮细胞的睾酮体外诱导模型,测定分析睾酮诱导培养的香腺上皮细胞代谢物差异表达情况,探究诱导刺激模型下环碳分子架构的生物合成过程,解析麝鼠香腺上皮细胞中降麝香酮生物合成机制。【方法】取9只12~18月龄繁殖期雄性麝鼠,将其香腺组织分离后,通过组织块培养获取离体香腺上皮细胞,使用睾酮诱导培养,以繁殖期麝鼠的香腺和肝组织样本为对照,采用LC-MS非靶向代谢组学技术测定其代谢物表达情况,再对过滤后的高质量数据进行主成分分析、差异代谢物KEGG通路富集分析。【结果】睾酮诱导离体培养香腺上皮细胞48 h后,在TP诱导组细胞培养液中能够检测出大量雄性激素类似物(睾酮、睾酮β-D-葡糖苷酸、甲羟孕酮、前列腺素等)的高表达,以及甲氧麻黄酮、犬尿酸、N-乙酰-L-谷氨酸和黄曲霉素G1类分子的低表达;色氨酸、精氨酸和长链脂肪酸代谢物呈显著高表达,提示睾酮诱导能够促进麝香上皮细胞的脂肪酸碳链和部分氨基酸的生物合成;分析繁殖期麝鼠香腺和肝脏组织中的差异代谢物,结果显示相对于肝脏组织,肌苷、乙酰肉碱、苏氨酸等代谢物在香腺中高表达,进一步提示降麝香酮的生物合成涉及氨基酸和长链脂肪酸代谢。【结论】睾酮诱导离体培养麝鼠香腺上皮细胞后,其色氨酸、精氨酸和长链脂肪酸代谢通路发生显著变化;繁殖期麝鼠香腺组织中肌苷、乙酰肉碱、苏氨酸等代谢物含量较肝脏中高,提示麝鼠中降麝香酮生物合成涉及氨基酸和长链脂肪酸代谢,为解析麝鼠香的生物合成机制提供基础数据和新研究方向。 展开更多

关键词 麝鼠 代谢组学 睾酮 降麝香酮 香腺组织

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金钱草药渣堆肥理化特性研究 被引量：1

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作者 杨天建 竭航 +3 位作者 韩量 全健 余中莲 雷美艳 《亚太传统医药》 2022年第6期93-98,共6页

目的:研究不同微生物菌剂对金钱草药渣堆肥理化特性的影响,为金钱草药渣合理利用提供科学依据。方法:以金钱草药渣为研究对象,分别添加5种商品发酵菌剂,采用条垛式堆肥系统进行堆肥试验,分析堆肥过程中温度、有机质、N、P、K、pH、重金... 目的:研究不同微生物菌剂对金钱草药渣堆肥理化特性的影响,为金钱草药渣合理利用提供科学依据。方法:以金钱草药渣为研究对象,分别添加5种商品发酵菌剂,采用条垛式堆肥系统进行堆肥试验,分析堆肥过程中温度、有机质、N、P、K、pH、重金属等的变化规律。结果:有机肥完全腐熟后有机质含量在61.47%~70.06%之间,N含量在2.58%~3.35%之间,P_(2)O_(5)含量在0.54%~0.79%之间,K_(2)O含量在1.74%~2.28%之间,总养分含量在5.20%~5.88%之间,pH在7.01~7.35。该研究所用发酵剂均可腐熟金钱草药渣,发酵结束后药渣的各项指标均符合《有机肥料》(NY525-2012)中的要求。结论:金钱草药渣有机质含量高,钾元素含量丰富,腐熟周期短,肥料转化率高,具有较好的开发应用前景。 展开更多

关键词 金钱草药渣 发酵 理化特性 有机肥

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林麝FASN基因CDS区克隆及序列分析

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作者 谌颖莲 竭航 +4 位作者 赵贵军 封孝兰 张承露 吴佳勇 曾德军 《野生动物学报》 北大核心 2022年第2期370-378,共9页

为了解林麝(Moschus berezovskii)脂肪酸合酶(Fatty acid synthase,FASN)基因mRNA序列信息及解析麝香的生物机制,通过转录组测序、Trinity拼接、反转录PCR扩增和Singer测序获取林麝FASN基因mRNA序列,并对FASN蛋白序列进化树构建、二级... 为了解林麝(Moschus berezovskii)脂肪酸合酶(Fatty acid synthase,FASN)基因mRNA序列信息及解析麝香的生物机制,通过转录组测序、Trinity拼接、反转录PCR扩增和Singer测序获取林麝FASN基因mRNA序列,并对FASN蛋白序列进化树构建、二级结构、三级结构、互作蛋白、磷酸化分析及miRNAs结合预测,筛选与麝鼠(Ondatra zibethicus)FASN相同且与牛(Bos taurus)、山羊(Capra hircus)和绵羊(Ovis aries)不同的氨基酸位点作为麝香生物合成有关的关键位点。获取了林麝FASN基因的mRNA序列(GenBank ID:MW570770),其具有一定的物种保守性,筛选出16个关键位点,其中第307、602、657和1334位氨基酸能够改变蛋白羟基活性,预测出10个蛋白磷酸化位点,miR-1307-5p和miR-669与3′-UTR亲和能力较强。林麝FASN基因序列与其他物种之间的差异信息可为解析麝香生物合成机制提供参考。 展开更多

关键词 林麝 FASN 蛋白序列分析 麝香生物合成 MIRNAS

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牛血红蛋白源抗菌肽P3及其类似肽的生物信息学分析 被引量：10

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作者 李杰 杭柏林 +2 位作者 秦爱建 钱琨 胡建和 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第1期59-64,共6页

为研究牛血红蛋白源抗菌肽P3及其类似肽(JH-0、JH-1、JH-2、JH-3)的生物学功能,本研究利用在线软件分析了抗菌肽P3及其类似肽的生物信息学特性,发现这5个抗菌肽均带正电荷,等电点均大于8.00,均为疏水蛋白,定位于细胞外,不含有跨膜区、... 为研究牛血红蛋白源抗菌肽P3及其类似肽(JH-0、JH-1、JH-2、JH-3)的生物学功能,本研究利用在线软件分析了抗菌肽P3及其类似肽的生物信息学特性,发现这5个抗菌肽均带正电荷,等电点均大于8.00,均为疏水蛋白,定位于细胞外,不含有跨膜区、信号肽序列和糖基化位点,P3和JH-2的二级结构为α-螺旋+β-折叠,JH-3为100%的α-螺旋,JH-0和JH-1为无规则卷曲结构,P3、JH-2和JH-3在第13位氨基酸即苏氨酸(Thr,T)有一个糖基化位点。根据分析结果推测抗菌肽P3及其类似肽可作用于细胞壁或细胞膜,从而使菌体死亡。 展开更多

关键词 牛血红蛋白 抗菌肽 类似肽 生物信息学

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健康与腹泻林麝肠道菌群的多态性 被引量：5

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作者 杜欣颖 夏介英 +3 位作者 李东晓 张春梅 周静 竭航 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2021年第7期745-751,共7页

目的分析圈养状态下正常林麝和腹泻林麝粪便菌群的组成差异,找到能够影响肠道总菌群稳态的标志菌,为减少林麝腹泻提供防治新策略。方法测序分析54只健康林麝(正常组)和18只有腹泻症状的林麝(腹泻组)肠道菌群总DNA中16S rRNA基因V3-V4区... 目的分析圈养状态下正常林麝和腹泻林麝粪便菌群的组成差异,找到能够影响肠道总菌群稳态的标志菌,为减少林麝腹泻提供防治新策略。方法测序分析54只健康林麝(正常组)和18只有腹泻症状的林麝(腹泻组)肠道菌群总DNA中16S rRNA基因V3-V4区,注释微生物种类和数量。计算Chao1、Ace、Shannon和Simpson等多样性指数,进行聚类分析。结果正常组和腹泻组之间共有的可操作分类单元(OTUs)2 366个,正常组特有的OTUs 409个,腹泻组特有的OTUs 150个。按组计算α多样性指数,结果表明腹泻组Chao1指数(1 352.766±75.497,t=10.798 7,P<0.000 1)、Ace指数(1 381.480±75.937,t=11.037 5,P<0.000 1)均高于正常组(1 126.655±81.090,1 149.175±81.370),Shannon指数(6.839±0.546,t=1.810 3,P=0.053 0)、Simpson指数(0.937±0.041,t=3.644 4,P<0.000 1)均低正常组(7.097±0.448,0.974±0.025)。通过Wilcoxon秩和检验,MRPP分析计算比较值A为0.072 4,组间差异大于组内差异(Significance=0.01),差异有统计学意义。2组门水平上比较,找到5个差异物种,分别为拟杆菌门(Bacteroidetes)、螺旋体门(Spirochaetes)、放线菌门(Actinobacteria)、广古菌门(Euryarchaeota)和黑水仙菌门(Melainabacteria)。属分类水平上,找到差异物种23个,其中有代表性的物种为拟杆菌属(Bacteroides)、另枝菌属(Alistipes)、不动杆菌属(Agathobacter)、甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter)、根瘤菌属(Rhizobiaceae)和黄金杆菌属(Chryseobacterium)。结论腹泻发生时,林麝的肠道菌群丰富度和多样性有所下降,菌群总量显著增加。拟杆菌门物种丰富度极显著性减少的同时,作为潜在致病菌标志的变形菌门(Proteobacteria)比例上升,Chryseobacterium数量极显著升高,研究结果丰富了对林麝腹泻基于肠道菌群变化的认识。 展开更多

关键词 林麝 腹泻 16S rRNA 粪便菌群

原文传递

基于SWChen系统预测靶向林麝(Moschusberezovskii)FASN、HMGCR和CYP11A1基因miRNAs的研究 被引量：2

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作者 谌颖莲 曾德军 +4 位作者 赵贵军 封孝兰 张承露 吴佳勇 竭航 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期880-890,共11页

【目的】预测靶向林麝(Moschus berezovskii)FASN、HMGCR和CYP11A1基因的miRNAs,为麝香的生物合成机制研究提供参考。【方法】通过林麝麝香的代谢组学测序,获取麝香中的主要化学组分,确定相应化学组分合成的关键酶;通过转录组测序获取... 【目的】预测靶向林麝(Moschus berezovskii)FASN、HMGCR和CYP11A1基因的miRNAs,为麝香的生物合成机制研究提供参考。【方法】通过林麝麝香的代谢组学测序,获取麝香中的主要化学组分,确定相应化学组分合成的关键酶;通过转录组测序获取林麝基因mRNA序列及miRNAs序列,利用自主编写的离线SWChen系统对调控关键酶基因表达的miRNA进行预测,并以人FSAN基因对系统准确性进行验证,同时以牛(Bos taurus)、山羊(Capra hircus)和绵羊(Ovis aries)预测结果进行比较和集合论分析,获取调控林麝基因的候选miRNAs。【结果】麝香的化学成分主要包括脂肪酸碳链类衍生物、芳香族、固醇类和甾类等衍生物质;预测调控FASN基因表达的miRNA主要为miR-24-3p和miR-30b-3p,调控HMGCR基因表达的为miR-29b、miR-146a、miR-181b-3p和miR-429家族,调控CYP11A1基因表达的为miR-532-3p和let-7家族,共同调控3个基因表达的主要为miR-205家族和miR-143家族。【结论】上述miRNAs为靶向调控林麝FASN、HMGCR和CYP11A1基因表达的候选miRNAs,对解析林麝麝香的生物合成机制具有参考价值。 展开更多

关键词 林麝 FASN HMGCR CYP11A1 MIRNA

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牛科动物转录组微卫星变异分析 被引量：1

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作者 戚文华 李萍 +2 位作者 张婉清 周材权 竭航 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期3420-3427,共8页

微卫星(simples equencere peats, SSRs)广泛分布于生物基因组中,是最常用的分子标记之一。本研究利用生物信息学方法搜索和统计了7种牛科动物转录组中完整型SSRs序列,揭示不同重复类型SSRs变异水平,并对其生物信息学特征进行比较分析... 微卫星(simples equencere peats, SSRs)广泛分布于生物基因组中,是最常用的分子标记之一。本研究利用生物信息学方法搜索和统计了7种牛科动物转录组中完整型SSRs序列,揭示不同重复类型SSRs变异水平,并对其生物信息学特征进行比较分析。在牛科动物转录组中,牛、绵羊和山羊SSRs总丰度较高,三者基本一致(157.98, 157.09 vs 158.52个/Mb);其次是瘤牛和水牛(140.70 vs 129.63个/Mb);牦牛微卫星总丰度较低(96.99个/Mb),藏羚羊微卫星总丰度最低(63.71个/Mb)。牛科动物转录组中SSRs所占比例普遍偏低,范围为0.156%~0.753%,三碱基SSRs占主导地位,并且以(CCG)n和(AGG)n为优势重复基元,这可能与转录组编码区三联体密码子高度保守有关。在这7种牛科动物转录组中,相同单碱基至六碱基SSRs重复拷贝数(repeat copy number, RCN)分布高度一致。通过牛科动物转录组SSRs变异系数(coefficient of variability, CV)分析表明,单碱基SSRs和二碱基SSRs重复拷贝数变异水平较高,其次RCN变异模式如下:三碱基SSRs>四碱基SSRs>六碱基SSRs>五碱基SSRs,六碱基SSRs重复拷贝数变异水平有稍微增加的趋势。本研究为牛科动物SSR标记的开发、遗传多样性评估和遗传育种提供科学依据。 展开更多

关键词 牛科动物 转录组 微卫星序列 变异

原文传递

林麝不同组织miRNA表达谱

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作者 余苗杰 徐忠鲜 +4 位作者 蒋雪梅 王春花 赵婵娟 戚文华 竭航 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期723-733,共11页

林麝(Moschus berezovskii)是药用经济动物,其雄麝分泌的麝香是中成药和香水的重要成分,具有极高的药用价值和经济价值。miRNAs在动物细胞发育、分化、凋亡及疾病发生发展过程中起着至关重要的作用,并且在不同组织中miRNAs选择性表达。... 林麝(Moschus berezovskii)是药用经济动物,其雄麝分泌的麝香是中成药和香水的重要成分,具有极高的药用价值和经济价值。miRNAs在动物细胞发育、分化、凋亡及疾病发生发展过程中起着至关重要的作用,并且在不同组织中miRNAs选择性表达。本研究利用RNA⁃seq技术在Hi⁃seq 2500测序平台对林麝的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和肌肉组织进行高通量测序,运用生物统计学和生物信息学方法分析这6种器官和组织中miRNAs的表达情况,采用RT⁃qPCR对测序结果进行验证。结果表明,林麝的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和肌肉组织中共表达的miRNAs有1650个,特异表达的miRNAs分别有86个、54个、44个、68个、83个和50个(P<0.01),共表达的miRNAs在不同器官和组织中表达水平存在显著差异(P<0.05),林麝心脏中部分特异miRNAs的表达水平远远高于其他5种器官和组织中特异miRNAs的表达水平。KEGG分析表明:林麝肝脏特异表达miR⁃NA靶基因主要涉及Wnt信号通路(ko04310)、cAMP信号通路(ko04024)、ECM受体相互作用(ko04512)、Notch信号途径(ko04330)、AMPK信号通路(ko04152)等(P<0.01)。随机选择9个miRNAs,利用RT⁃qPCR验证其在健康和化脓性林麝肝脏中的表达情况,结果表明其中9个miRNAs的表达趋势与测序结果一致。 展开更多

关键词 MICRORNA 表达谱 表达分析 荧光定量PCR 林麝

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