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bHLH转录因子调控药用植物萜类化合物生物合成的研究进展 被引量：14
1
作者 张凯伦 罗祖良 +2 位作者 郭玉华 石宏武 马小军 《中国现代中药》 CAS 2017年第1期142-147,共6页
萜类是种类最多的植物次生代谢产物,具有广泛的药理活性,但含量低是普遍存在的问题。转录因子(transcription factor,TFs)能在转录水平上调控次生代谢合成途径中多个基因的协同表达,与植物的生长发育、形态建成、次生代谢、抗逆反应和... 萜类是种类最多的植物次生代谢产物,具有广泛的药理活性,但含量低是普遍存在的问题。转录因子(transcription factor,TFs)能在转录水平上调控次生代谢合成途径中多个基因的协同表达,与植物的生长发育、形态建成、次生代谢、抗逆反应和激素信号有着密切的关系,其中bHLH类转录因子是最大的转录因子家族之一。随着bHLH转录因子在不同药用植物中被陆续发现,如何在基因工程和代谢工程中应用,提高萜类化合物的产量,实现大规模工业化生产,满足广大患者的需要成为研究的热点。本文主要总结了近年来bHLH转录因子对萜类合成途径的调控作用。 展开更多
关键词 bHLH转录因子 萜类化合物 调控 合成途径
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基于酶约束的代谢网络模型研究进展及其应用 被引量：6
2
作者 赵欣 杨雪 +1 位作者 毛志涛 马红武 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期1914-1924,共11页
基因组尺度代谢网络模型已经成功地应用于指导代谢工程改造,但由于传统通量平衡分析法仅考虑化学计量学和反应方向约束,模拟得到的是理论最优结果,对一些现象如代谢溢流、底物层级利用等无法准确描述。近年来人们通过在代谢网络模型中... 基因组尺度代谢网络模型已经成功地应用于指导代谢工程改造,但由于传统通量平衡分析法仅考虑化学计量学和反应方向约束,模拟得到的是理论最优结果,对一些现象如代谢溢流、底物层级利用等无法准确描述。近年来人们通过在代谢网络模型中引入新的蛋白量、热力学等约束发展了新的约束优化计算方法,可以更准确真实地模拟细胞在不同条件下的代谢行为。文中主要对近年来提出的多种酶约束模型进行评述,对酶约束引入的基本思路、酶约束的数学方程表示及优化目标设定、引入酶约束后对代谢通量计算结果的影响及酶约束模型在代谢工程菌种改造中的应用等进行了全面深入的介绍,并提出了已有各种方法存在的主要问题,展望了相关方法的未来发展方向。通过引入新的约束,代谢网络模型能够更精确模拟和预测细胞在环境和基因扰动下的代谢行为,为代谢工程菌种改造提供更准确可靠的指导。 展开更多
关键词 酶约束 代谢网络模型 代谢工程 酶动力学 热力学
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海洋氮循环过程及基于基因组代谢网络模型的预测 被引量：3
3
作者 张日钊 李斐然 +1 位作者 袁倩倩 马红武 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1130-1147,共18页
海洋氮循环在地球元素循环中充当着必不可少的角色。海洋氮循环是由一系列氧化还原反应构成的生物化学过程。固氮作用和氮同化作用为生态系统提供了生物可用氮(铵盐)。硝化作用可进一步将铵盐氧化为硝酸盐,硝酸盐又可以通过反硝化作用... 海洋氮循环在地球元素循环中充当着必不可少的角色。海洋氮循环是由一系列氧化还原反应构成的生物化学过程。固氮作用和氮同化作用为生态系统提供了生物可用氮(铵盐)。硝化作用可进一步将铵盐氧化为硝酸盐,硝酸盐又可以通过反硝化作用转化为氮气。整个氮循环实现了海洋中不同含氮无机盐间的转换。微生物是海洋氮循环的重要驱动者,海洋氮循环的研究可以帮助理解海洋生物与地球环境相互作用及协同演化的机制,从而更好地保护地球生态环境。随着氮循环关键微生物基因组尺度代谢网络模型的发表,研究者可以利用代谢网络模型来研究不同氮循环过程的效率、环境因子对氮循环过程的影响以及解析氮循环及生物网络的内在机理等,从而帮助人们更深入地研究海洋氮转化机制。本文主要综述了海洋氮循环过程中各个转化过程的主要微生物,以及基因组尺度代谢网络模型在分析氮循环中的应用。 展开更多
关键词 固氮过程 硝化过程 反硝化过程 厌氧氨氧化过程 异化硝酸/亚硝酸还原过程 海洋氮循环
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