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鸡快慢羽性状遗传学基础分析综合实验探索与实践 被引量:3
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作者 张丽 徐海冬 +7 位作者 冷奇颖 刘艳芬 赵志辉 效梅 吴江 张权 安立龙 李辉 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期250-256,共7页
随着全国"卓越农林人才教育培养计划"的开展,我校动物科学专业设置了"卓越班",以突出培养学生的系统思维和创新创业能力为目标开展了系列教育教学管理和课程改革。为此,我们以"鸡快、慢羽性状"为实验对象... 随着全国"卓越农林人才教育培养计划"的开展,我校动物科学专业设置了"卓越班",以突出培养学生的系统思维和创新创业能力为目标开展了系列教育教学管理和课程改革。为此,我们以"鸡快、慢羽性状"为实验对象,设计了"鸡快慢羽性状遗传学基础分析"综合实验,突出培养学生用理论知识解决生产实践问题的思维和能力。本文重点介绍了该实验作为动物遗传学实验教学案例的实施过程及效果,首先从鸡的表型观察逐步深入到遗传学基础分析,利用遗传学理论指导鸡快、慢羽品系培育的育种实践。实验内容涉及伴性遗传规律和性别决定机制等遗传学理论知识,同时还涉及基因组DNA提取、基因扩增、酶切及电泳分析等一系列分子遗传学的技术方法。不仅有利于学生综合分析能力和专业技能的掌握,还有助于培养学生对动物科学专业的科研兴趣和创新意识。此综合性实验还展现了用遗传学理论指导动物品种培育实践过程,符合动物科学专业复合应用型人才培养目标的要求,其中的教学理念和方法可推广应用于其他生物学实验教学。 展开更多
关键词 动物遗传学 快慢羽 综合实验 动物科学
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选择性多聚腺苷酸化的生物学效应及其调控机制研究进展 被引量:3
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作者 徐海冬 宁博林 +2 位作者 牟芳 李辉 王宁 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期4-15,共12页
真核生物基因的前体mRNA(pre-mRNA)及一些lncRNA在成熟过程中其3'端会发生剪切和多聚腺苷酸化反应(cleavage and polyadenylation, C/P),C/P的发生需要多聚腺苷酸化信号(polyadenylation signal, PAS)的存在。选择性多聚腺苷酸化(al... 真核生物基因的前体mRNA(pre-mRNA)及一些lncRNA在成熟过程中其3'端会发生剪切和多聚腺苷酸化反应(cleavage and polyadenylation, C/P),C/P的发生需要多聚腺苷酸化信号(polyadenylation signal, PAS)的存在。选择性多聚腺苷酸化(alternative cleavage and polyadenylation, APA)是指具有多个PAS的基因,在其mRNA3'端成熟过程中,由于选择不同的PAS,导致产生出多个3'UTR长度和序列组成不同的转录异构体。3'UTR长度和序列的不同会影响mRNA的稳定性、翻译效率、运输和细胞定位等,因此APA是真核生物的一个重要转录后调控方式。近年来,对大量动物、植物及酵母的基因组测序分析发现,APA在真核生物广泛存在,针对APA的生物学效应和调控机制开展了一系列研究。目前已鉴定出许多APA调控的顺式调控元件和反式作用因子。本文重点介绍了APA生物学效应和调控机制的最新研究进展,并探讨了未来APA调控的研究方向。 展开更多
关键词 基因表达调控 选择性多聚腺苷酸化 多聚腺苷酸化信号 顺式调控元件 反式作用因子
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过渡金属催化烯烃和炔烃合成1,3-共轭二烯化合物研究进展
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作者 徐光利 许静 +2 位作者 徐海东 崔香 舒兴中 《有机化学》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2023年第6期1899-1933,共35页
1,3-共轭二烯是许多天然产物和药物的关键结构单元.由于共轭烯烃具有特殊的化学性质,它们在有机合成和材料科学中起着核心作用.目前,1,3-共轭二烯的合成主要是通过过渡金属催化的方法实现,通过该方法科研工作者构建了一系列1,3-二烯骨架... 1,3-共轭二烯是许多天然产物和药物的关键结构单元.由于共轭烯烃具有特殊的化学性质,它们在有机合成和材料科学中起着核心作用.目前,1,3-共轭二烯的合成主要是通过过渡金属催化的方法实现,通过该方法科研工作者构建了一系列1,3-二烯骨架,丰富了共轭二烯类化合物的结构多样性,同时也扩展了二烯化合物的应用范围.以过渡金属催化剂的种类不同为主线,分类对1,3-二烯的合成进行了综述,并对其发展前景予以展望. 展开更多
关键词 过渡金属催化 1 3-共轭二烯 有机合成 应用
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鸡NRG4基因组及转录本结构分析 被引量:1
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作者 高智慧 黄佳新 +7 位作者 罗昊玉 徐海冬 娄明 宁博林 邢晓旭 牟芳 李辉 王宁 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期447-458,共12页
神经调节蛋白4(neuregulin 4,NRG4)是一个重要的脂肪细胞因子,在维持哺乳动物能量平衡、调节糖脂代谢和预防非酒精性脂肪性肝病中起着非常重要的作用。目前,人NRG4基因的基因组结构、转录异构体和蛋白异构体等已有深入的研究。本实验室... 神经调节蛋白4(neuregulin 4,NRG4)是一个重要的脂肪细胞因子,在维持哺乳动物能量平衡、调节糖脂代谢和预防非酒精性脂肪性肝病中起着非常重要的作用。目前,人NRG4基因的基因组结构、转录异构体和蛋白异构体等已有深入的研究。本实验室前期研究显示,鸡脂肪组织也表达NRG4,但是目前有关鸡NRG4(chicken NRG4,cNRG4)基因的基因组结构、转录异构体和蛋白异构体尚不清楚。为此,本研究采用RACE(rapid-amplification of cDNA ends)和RT-PCR(reverse transcription-PCR)等技术,系统开展了cNRG4基因的基因组和转录本的结构分析。结果发现,cNRG4基因编码区很小,但该基因却非常复杂,存在选择性转录起始位点、选择性拼接、内含子滞留、隐匿外显子和选择性多聚腺苷酸化,这导致cNRG4基因产生4种不同的5ʹUTR异构体(cNRG4 A、cNRG4 B、cNRG4 C和cNRG4 D)和6种不同的3ʹUTR异构体(cNRG4 a、cNRG4 b、cNRG4 c、cNRG4 d、cNRG4 e和cNRG4 f)。基因组结构分析发现,cNRG4基因跨越基因组21,969 bp(Chr.10:3,490,314~3,512,282),由11个外显子和10个内含子构成。与NCBI数据库中的cNRG4基因mRNA序列(NM_001030544.4)相比,本研究发现了cNRG4基因的2个新外显子和1个隐匿外显子。生物信息学分析、RT-PCR、克隆和测序分析发现,cNRG4基因能编码3种蛋白异构体(cNRG4-1、cNRG4-2和cNRG4-3)。本研究为进一步开展cNRG4基因的功能和调控研究奠定了基础。 展开更多
关键词 NRG4 基因组结构 转录异构体 蛋白异构体
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鸡胰岛素降解酶基因环状转录本克隆及其表达规律
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作者 冷奇颖 郑嘉辉 +4 位作者 徐海冬 Patricia Adu-Asiamah 张颖 杜炳旺 张丽 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期1129-1137,共9页
本课题组前期通过高通量测序发现,鸡胰岛素降解酶(insulin degrading enzyme, IDE)基因可能存在一个环状转录本。为确定IDE基因环状转录本(circIDE)的真实存在,探究其表达规律,本研究以吉林芦花鸡为研究对象,通过PCR扩增和测序验证了cir... 本课题组前期通过高通量测序发现,鸡胰岛素降解酶(insulin degrading enzyme, IDE)基因可能存在一个环状转录本。为确定IDE基因环状转录本(circIDE)的真实存在,探究其表达规律,本研究以吉林芦花鸡为研究对象,通过PCR扩增和测序验证了circIDE的真实存在,通过RNase R处理和反转录证实了circIDE的环形结构,通过qRT-PCR分析circIDE和IDE mRNA的时空表达规律,并对比分析了circIDE和线性IDE mRNA在正常体型芦花鸡和GHR突变的矮小体型芦花鸡中的表达差异。结果表明:鸡circIDE全长为1332 nt,由IDE基因外显子2~11环化形成。RNase R耐受性分析表明,鸡circIDE具备环形分子的一般特征,不易被RNase R降解。与oligo-d(T)18引物相比,随机引物对circIDE具有较高的反转录效率,进一步说明circIDE是一个不含poly(A)的环状结构分子。组织表达谱结果表明,circIDE在1周龄和12周龄正常体型芦花鸡肝脏和心脏高表达,在胸肌和腿肌中低表达;circIDE在肝脏组织的时序表达谱结果表明,circIDE在鸡6周龄之前为低表达,在8周龄以后表现为高表达;正常与矮小体型芦花鸡品系间circIDE表达量对比分析表明,正常体型芦花鸡circIDE表达水平高于矮小体型芦花鸡,其中在肝脏组织中差异显著(P<0.05)。本研究证实了鸡IDE基因存在一个环状转录本circIDE,并初步揭示了circIDE的表达规律,circIDE在正常体型和矮小体型芦花鸡肝脏组织中表达量存在差异,本研究结果为深入开展鸡circIDE的生物学功能及其在鸡生长发育过程中的作用机制奠定了基础。 展开更多
关键词 胰岛素降解酶 环状RNA 可变剪接
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外温变化下小鼠肝细胞18s rRNA降解与死亡时间关系研究 被引量:6
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作者 姜竹青 赵东 +8 位作者 张海东 王旭 尤萌 陈曦 朱晓旭 钟伟 冯时 常林 杨天潼 《中国法医学杂志》 CSCD 2016年第5期441-443,共3页
目的探讨在外界环境温度变化条件下,小鼠肝细胞18s rRNA降解与死亡时间的关系。方法小鼠断颈处死后置于10℃、15℃、20℃、25℃、和30℃温度下保存;从死后6h至72h,每6h分别提取肝细胞组织中总RNA。利用实时荧光定量PCR检测18s rRNA循环... 目的探讨在外界环境温度变化条件下,小鼠肝细胞18s rRNA降解与死亡时间的关系。方法小鼠断颈处死后置于10℃、15℃、20℃、25℃、和30℃温度下保存;从死后6h至72h,每6h分别提取肝细胞组织中总RNA。利用实时荧光定量PCR检测18s rRNA循环阈值(Ct值)的变化。应用插值函数进行分析拟合,建立死亡时间推断方程。结果各温度组Ct值随死亡时间延长均呈上升趋势,对所得数据进行插值拟合,得到一定温度变化区间内(10℃~30℃),Ct值变化与PMI关系的三元五次曲面方程:f(x,y)=-426.9+30.82x+44.48y-1.297x^2-1.837xy-1.388y^2+0.034 38x^3+0.038 17x^2y+0.038 67xy^2+0.028 77y3-0.000 612 9x^4-3.897e^(-7)x^3y-0.001 223x^2y^2+0.000256 6xy3-0.000 537 4y^4+3.606e^(-6)x^5-2.846e^(-6)x^4y+1.009e^(-5)x^3y^2-3.439e^(-6)x^2y3-2.556e^(-7)xy^4+2.664e^(-6)y^5(r2=0.999 4)。结论在外界温度变化条件下,小鼠肝细胞18s rRNA降解与死亡时间关系符合三元五次方程分布,利用插值函数拟合的方法可在外界环境温度变化条件下进行死亡时间推断。 展开更多
关键词 法医病理学 死亡时间 插值函数 RNA
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