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广东省地方鸡线粒体遗传多样性与母系起源
被引量:
8
1
作者
黄勋和
余哲琪
+7 位作者
翁茁先
何丹林
易振华
李威娜
陈洁波
张细权
杜炳旺
钟福生
《生物多样性》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期238-247,共10页
系统评估地方鸡的遗传变异水平并追溯其母系起源,可为保护利用优质家禽种质资源库提供科学依据。本研究测定了广东省和邻省共12个地方鸡品种的线粒体DNA D-loop序列,分析品种间的遗传距离与系统关系,并构建单倍型系统发生树和中介网络图...
系统评估地方鸡的遗传变异水平并追溯其母系起源,可为保护利用优质家禽种质资源库提供科学依据。本研究测定了广东省和邻省共12个地方鸡品种的线粒体DNA D-loop序列,分析品种间的遗传距离与系统关系,并构建单倍型系统发生树和中介网络图。360份样品共检测到60个突变位点,均为转换。定义了85种单倍型,归属于单倍型类群A、B、C和E,在12个鸡品种中均有分布,其中B是优势单倍型类群(187个,51.94%),E次之(76个,21.11%)。B02和C01是优势单倍型(85个,23.61%;48个,13.33%),为12个鸡品种共有;E03位居第三(35个,9.72%),杏花鸡、黄郎鸡和宁都三黄鸡未见此单倍型。杏花鸡集中分布在单倍型类群B,惠阳胡须鸡和中山沙栏鸡则主要分布在单倍型类群E;怀乡鸡的单倍型数量最多,中山沙栏鸡的最少。广东地方鸡品种间遗传距离为0.012–0.015,单倍型多样性0.805±0.047至0.949±0.026,核苷酸多样性0.0102±0.0017至0.0138±0.0009。邻接树和中介网络图将85种单倍型划分为进化枝A、B、C和E,广东省与邻省地方鸡单倍型的地理分布模式相似。中性检验显示广东地方鸡未经历明显的群体历史扩张。结果表明广东地方鸡处于较好的保护状态,遗传多样性水平较高,品种的形成受到邻省和北方家鸡的影响,东南亚红原鸡对广东地方鸡也有重要的遗传贡献。
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关键词
广东地方鸡
线粒体DNA
D-LOOP
遗传多样性
起源
原文传递
转录组测序揭示细胞周期通路参与鸡腹脂沉积
被引量:
6
2
作者
陈家辉
任学义
+9 位作者
李丽敏
卢诗意
程湉
谭量天
梁少东
何丹林
罗庆斌
聂庆华
张细权
罗文
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第10期962-973,共12页
近年来,随着生长性状和饲料转化率的提高,中国地方品种肉鸡腹脂率不断增加,大大降低了肉鸡的品质。过多的腹脂沉积不仅降低了肉鸡的屠宰率和抗病力,而且由于脂肪较难处理,导致其被随意丢弃,污染环境。为了挖掘与中国地方品种肉鸡腹脂沉...
近年来,随着生长性状和饲料转化率的提高,中国地方品种肉鸡腹脂率不断增加,大大降低了肉鸡的品质。过多的腹脂沉积不仅降低了肉鸡的屠宰率和抗病力,而且由于脂肪较难处理,导致其被随意丢弃,污染环境。为了挖掘与中国地方品种肉鸡腹脂沉积相关的基因和调控通路,本研究对杏花鸡分别进行高脂和普通饲料的喂养,检测腹脂沉积情况,并利用转录组测序检测高脂饲养对肝脏和腹脂组织中基因表达的影响。结果表明,喂养两周后高脂组肉鸡腹脂重和腹脂率显著增加,且腹脂细胞的直径和面积也显著增大。对两组鸡的腹脂和肝脏进行转录组测序,发现在腹脂中显著差异表达基因主要富集于细胞周期通路、PPAR(peroxisome proliferator-activated receptor)信号通路和ECM(extracellular matrix)受体信号通路中;而在肝脏中,显著差异表达基因同样显著富集于细胞周期通路中,同时也显著富集于类固醇生物合成和PPAR信号通路中。通过分析腹脂和肝脏组织中共同差异表达的基因,发现这些基因同样显著富集于细胞周期中。进一步以鸡肝癌细胞系LMH(chicken hepatoma cell)细胞和鸡前脂肪细胞系ICP(immortalized chicken preadipocytes)细胞进行体外验证,利用高脂培养基和普通培养基进行培养,结果发现48h后,高脂培养基可显著促进细胞周期进程,增加处于S期的细胞数。同时,qRT-PCR结果发现高脂培养基可显著促进细胞周期相关基因的表达。综上所述,本研究通过基因表达差异分析,发现高脂饲养可能通过激活鸡脂肪组织的细胞周期来促进前脂肪细胞增殖,进而增加腹脂沉积。该研究结果为进一步了解优质肉鸡腹脂沉积的机制提供了理论依据。
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关键词
杏花鸡
高脂饲料
腹脂沉积
细胞周期
差异表达基因
下载PDF
职称材料
题名
广东省地方鸡线粒体遗传多样性与母系起源
被引量:
8
1
作者
黄勋和
余哲琪
翁茁先
何丹林
易振华
李威娜
陈洁波
张细权
杜炳旺
钟福生
机构
嘉应学院生命科学学院
广东省五华三黄鸡科技创新中心
湖南农业大学动物科学技术学院
华南农业大学动物科学学院
广东海洋大学农学院
出处
《生物多样性》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期238-247,共10页
基金
广东省自然科学基金(2014A030307018)
广东省公益研究与能力建设项目(2015A020208020
+1 种基金
2016A030303068)
嘉应学院省市共建重点建设项目(嘉院(2017)27号)
文摘
系统评估地方鸡的遗传变异水平并追溯其母系起源,可为保护利用优质家禽种质资源库提供科学依据。本研究测定了广东省和邻省共12个地方鸡品种的线粒体DNA D-loop序列,分析品种间的遗传距离与系统关系,并构建单倍型系统发生树和中介网络图。360份样品共检测到60个突变位点,均为转换。定义了85种单倍型,归属于单倍型类群A、B、C和E,在12个鸡品种中均有分布,其中B是优势单倍型类群(187个,51.94%),E次之(76个,21.11%)。B02和C01是优势单倍型(85个,23.61%;48个,13.33%),为12个鸡品种共有;E03位居第三(35个,9.72%),杏花鸡、黄郎鸡和宁都三黄鸡未见此单倍型。杏花鸡集中分布在单倍型类群B,惠阳胡须鸡和中山沙栏鸡则主要分布在单倍型类群E;怀乡鸡的单倍型数量最多,中山沙栏鸡的最少。广东地方鸡品种间遗传距离为0.012–0.015,单倍型多样性0.805±0.047至0.949±0.026,核苷酸多样性0.0102±0.0017至0.0138±0.0009。邻接树和中介网络图将85种单倍型划分为进化枝A、B、C和E,广东省与邻省地方鸡单倍型的地理分布模式相似。中性检验显示广东地方鸡未经历明显的群体历史扩张。结果表明广东地方鸡处于较好的保护状态,遗传多样性水平较高,品种的形成受到邻省和北方家鸡的影响,东南亚红原鸡对广东地方鸡也有重要的遗传贡献。
关键词
广东地方鸡
线粒体DNA
D-LOOP
遗传多样性
起源
Keywords
Guangdong indigenous chicken
mitochondrial DNA
D-loop
genetic diversity
origin
分类号
S831 [农业科学—畜牧学]
原文传递
题名
转录组测序揭示细胞周期通路参与鸡腹脂沉积
被引量:
6
2
作者
陈家辉
任学义
李丽敏
卢诗意
程湉
谭量天
梁少东
何丹林
罗庆斌
聂庆华
张细权
罗文
机构
华南农业大学动物科学学院广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室农业农村部鸡遗传育种与繁殖重点实验室
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第10期962-973,共12页
基金
国家自然科学基金项目(编号:31702105)
国家肉鸡产业技术体系岗位科学家项目(编号:CARS-41-G03)
广州市科技计划项目重点项目(编号:201804020088)资助~~
文摘
近年来,随着生长性状和饲料转化率的提高,中国地方品种肉鸡腹脂率不断增加,大大降低了肉鸡的品质。过多的腹脂沉积不仅降低了肉鸡的屠宰率和抗病力,而且由于脂肪较难处理,导致其被随意丢弃,污染环境。为了挖掘与中国地方品种肉鸡腹脂沉积相关的基因和调控通路,本研究对杏花鸡分别进行高脂和普通饲料的喂养,检测腹脂沉积情况,并利用转录组测序检测高脂饲养对肝脏和腹脂组织中基因表达的影响。结果表明,喂养两周后高脂组肉鸡腹脂重和腹脂率显著增加,且腹脂细胞的直径和面积也显著增大。对两组鸡的腹脂和肝脏进行转录组测序,发现在腹脂中显著差异表达基因主要富集于细胞周期通路、PPAR(peroxisome proliferator-activated receptor)信号通路和ECM(extracellular matrix)受体信号通路中;而在肝脏中,显著差异表达基因同样显著富集于细胞周期通路中,同时也显著富集于类固醇生物合成和PPAR信号通路中。通过分析腹脂和肝脏组织中共同差异表达的基因,发现这些基因同样显著富集于细胞周期中。进一步以鸡肝癌细胞系LMH(chicken hepatoma cell)细胞和鸡前脂肪细胞系ICP(immortalized chicken preadipocytes)细胞进行体外验证,利用高脂培养基和普通培养基进行培养,结果发现48h后,高脂培养基可显著促进细胞周期进程,增加处于S期的细胞数。同时,qRT-PCR结果发现高脂培养基可显著促进细胞周期相关基因的表达。综上所述,本研究通过基因表达差异分析,发现高脂饲养可能通过激活鸡脂肪组织的细胞周期来促进前脂肪细胞增殖,进而增加腹脂沉积。该研究结果为进一步了解优质肉鸡腹脂沉积的机制提供了理论依据。
关键词
杏花鸡
高脂饲料
腹脂沉积
细胞周期
差异表达基因
Keywords
Xinghua chicken
high-fat diet
abdominal fat deposition
cell cycle
differentially expressed genes
分类号
S831 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
广东省地方鸡线粒体遗传多样性与母系起源
黄勋和
余哲琪
翁茁先
何丹林
易振华
李威娜
陈洁波
张细权
杜炳旺
钟福生
《生物多样性》
CAS
CSCD
北大核心
2018
8
原文传递
2
转录组测序揭示细胞周期通路参与鸡腹脂沉积
陈家辉
任学义
李丽敏
卢诗意
程湉
谭量天
梁少东
何丹林
罗庆斌
聂庆华
张细权
罗文
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2019
6
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职称材料
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参考文献
引证文献
统计分析
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