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题名中国人群中抗结核药物引发肝损伤的易感基因标记研究
被引量:2
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作者
周晨希
李沫
怀聪
贺林
秦胜营
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机构
上海交通大学Bio-X研究院
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出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期374-379,共6页
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基金
国家自然科学基金项目(编号:81773818,81273596,30900799,81671326)
上海市浦江人才计划项目(编号:17PJD020)资助。
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文摘
为系统性研究中国人群中抗结核药物引发肝损伤的易感基因标记,本研究以41例抗结核药物引发肝损伤的病人和39例健康对照为研究对象,采用Haloplex捕获测序的方法对其基因组中药物代谢、转运和免疫相关通路的109个基因进行靶向测序。用Plink软件对DNA突变位点与肝损伤的发生进行关联分析,以千人基因组计划东亚人群作为对照组,对显著性位点进行验证,并用SIFT和Polyphen2软件对预测显著关联的位点进行功能预测。结果发现UGT1A4 rs2011404(X^2=4.6809,P=0.0305)是抗结核药物引发的肝损伤的易感基因标记,且rs2011404突变可能引起UGT1A4蛋白的功能障碍。本研究为临床上对抗结核药物的合理用药提供了有益的参考。
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关键词
抗结核药物
肝损伤
关联分析
UGT1A4
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Keywords
anti-tuberculosis drug
liver injury
association study
UGT1A4
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分类号
R52
[医药卫生—内科学]
R575
[医药卫生—临床医学]
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题名通过时间基因表达谱分析探究异烟肼引起肝损伤的机制
被引量:1
- 2
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作者
田子钊
周晨希
周伟
李沫
褚云鹏
怀聪
秦胜营
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机构
上海交通大学Bio-X研究院
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出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期501-509,共9页
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基金
国家自然科学基金项目(编号:81773818,82003856)资助。
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文摘
抗结核药物异烟肼具有肝脏毒性,其发生机制需要进一步阐明。本研究使用异烟肼处理肝细胞,分析不同处理时间表达谱的差异。通过对差异表达基因进行聚类分析和功能富集分析,共得到6个与肝脏毒性相关的基因簇和一系列相关通路;进一步通过蛋白互作分析和时间序列差异分析方法,筛选出表达水平具有时间依赖性的13个关键基因。本研究结果为理解异烟肼引发肝脏毒性过程提供了思路,为今后药物性肝脏毒性的监测以及治疗提供了新的靶基因。
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关键词
异烟肼
肝细胞
肝脏毒性
时间序列分析
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Keywords
isoniazid
hepatocytes
liver toxicity
time series analysis
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分类号
R96
[医药卫生—药理学]
Q811.4
[医药卫生—药学]
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