小桐子低温胁迫下microRNA实时荧光定量PCR内参的筛选与比较 被引量：7

1

作者 孔春艳 陈永坤 +3 位作者 王莎莎 郝大海 杨宇 龚明 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期25-31,共7页

选择合适的内参对实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果的准确性极其重要,在microRNA(miRNA)的qRT-PCR分析中尤为如此。通过筛选适宜分析小桐子低温胁迫下miRNA定量表达的内参,为小桐子及其他物种miRNA的qRT-PCR分析提供有用的理论参考。基于... 选择合适的内参对实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果的准确性极其重要,在microRNA(miRNA)的qRT-PCR分析中尤为如此。通过筛选适宜分析小桐子低温胁迫下miRNA定量表达的内参,为小桐子及其他物种miRNA的qRT-PCR分析提供有用的理论参考。基于以前的小RNA-seq结果,以低温处理的小桐子为材料,挑选11个候选内参基因,用实时荧光定量PCR技术检测它们在不同样本中的表达量,采用GeNorm、NormFinder和BestKeeper软件进行表达稳定性综合分析。结果表明,表达最稳定的基因是miR6448和U6,miR6448的Ct值为23左右,表达丰度适中;U6的Ct值为10左右,表达丰度高;因此,miR6448可作为小桐子低温胁迫下表达丰度适中的miRNA qRT-PCR的内参基因;U6可作为小桐子低温胁迫下丰度较高的miRNA qRT-PCR的内参基因。 展开更多

关键词 小桐子 实时荧光定量PCR 内参基因 miRNA 低温胁迫

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核桃SPL基因家族的系统进化和表达分析

2

作者 阿丽亚·外力 陈永坤 +2 位作者 克拉热木·克里木江 王宝庆 陈凌娜 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期180-189,共10页

【目的】SQUAMOSA promoter binding protein-like(SPL)转录因子在植物开花诱导中起重要的调控作用。从核桃基因组中鉴定SPL(JrSPL)基因家族成员并分析其表达特性,为探究SPL在核桃开花诱导中的功能研究提供参考。【方法】采用生物信息... 【目的】SQUAMOSA promoter binding protein-like(SPL)转录因子在植物开花诱导中起重要的调控作用。从核桃基因组中鉴定SPL(JrSPL)基因家族成员并分析其表达特性,为探究SPL在核桃开花诱导中的功能研究提供参考。【方法】采用生物信息学方法鉴定JrSPL基因家族成员,并预测其基本理化性质、保守结构域、进化关系、启动子顺式作用元件等;利用转录组测序和RT-qPCR技术分析JrSPL家族成员在核桃不同组织及嫁接诱导开花后的表达水平。【结果】JrSPL家族有28个成员,其基因结构和蛋白结构均高度保守,分布在核桃14条不同的染色体,与拟南芥和毛果杨分别存在17处和24处共线性关系,根据系统发育关系可分为8组。JrSPL启动子存在大量的光响应元件、激素应答元件、胁迫响应元件等。转录组测序分析显示,JrSPL基因在核桃不同组织表达量有差异,在雄花、雌花、顶芽及叶中均有表达,多数基因在雌花中的表达量都比较高,有6个基因最为显著,它们可能在开花诱导中起关键作用。在嫁接诱导核桃开花材料中,检测的12个JrSPLs中除了JrSPL8外,在开花材料中的表达量均高于对照,JrSPL2和JrSPL25在混合花序的雄花中表达显著,JrSPL8在顶芽中高表达。【结论】JrSPL基因在核桃成花中具有重要作用,其高表达是花期提前的主要因素。 展开更多

关键词 核桃 SPL基因 全基因组鉴定 组织特异性表达 开花诱导

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马铃薯块茎形成的生理生化基础和分子机制 被引量：4

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作者 雷春霞 李灿辉 +1 位作者 陈永坤 龚明 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期44-57,共14页

马铃薯(Solanum tuberosum L.)块茎诱导和形成是其生长发育和产量决定最重要的事件,涉及多重环境因素与植物激素及信号分子的互作以及这种互作对大量关键基因及多条信号转导与代谢途径的调控。概述了马铃薯块茎形成的生理生化基础,包括... 马铃薯(Solanum tuberosum L.)块茎诱导和形成是其生长发育和产量决定最重要的事件,涉及多重环境因素与植物激素及信号分子的互作以及这种互作对大量关键基因及多条信号转导与代谢途径的调控。概述了马铃薯块茎形成的生理生化基础,包括块茎形成的过程及影响块茎形成的内源因素和环境条件;讨论了块茎诱导形成过程中信号转导途径及相关基因、蛋白、miRNAs、激素和第二信使分子等对块茎形成的调节;构建了块茎诱导形成过程中可能的分子互作网络;展望了未来研究的方向和可能的突破点,旨在为将来通过精准分子育种手段来培育高产优质的马铃薯品种提供借鉴和新思路。 展开更多

关键词 马铃薯 块茎形成 诱导 信号转导 分子机制

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微小容差检测系统中基准源的设计与应用

4

作者 陈禹竺 汪龙祺 +4 位作者 于涛 隋延林 陈泳锟 刘鑫 薛科 《仪表技术与传感器》 CSCD 北大核心 2023年第5期25-29,共5页

为进一步提高fF级微小容差数据采集系统精度,满足10^(-4)~1 Hz测量频带内μV级电路噪声测试需求,采用平均值电路形式的AD780基准源电路,替代原有采集系统中模数转换芯片AD7712的内部电压基准。仿真分析AD780基准源的频域噪声满足指标要... 为进一步提高fF级微小容差数据采集系统精度,满足10^(-4)~1 Hz测量频带内μV级电路噪声测试需求,采用平均值电路形式的AD780基准源电路,替代原有采集系统中模数转换芯片AD7712的内部电压基准。仿真分析AD780基准源的频域噪声满足指标要求,实测对比AD780与AD7712内部电压基准的时域、频域噪声,以及2种基准源下系统的采集精度与频域本底噪声。实测结果表明:在AD780提供外部电压基准的条件下,指标频点处噪声分辨率为0.5μV/Hz^(1/2),对比内部基准条件下提高了3.34倍。该设计进一步提高了系统检测精度,为分析测试微小容差检测电路的低频噪声特性及提高电容传感分辨率提供了必要条件。 展开更多

关键词 微小容差检测 频域噪声 高精度数据采集 基准源

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海南地区居民冠心病的相关基因表达差异性分析

5

作者 张顺利 谢彩婵 +3 位作者 廖陆枭 陈永昆 张石龙 王小啟 《海南医学院学报》 CAS 2023年第11期831-837,共7页

目的:探索冠心病相关基因与海南地区住院患者冠心病之间的相关性,为丰富海南地区冠心病高危人群筛选手段,优化防治策略提供理论依据。方法:选取2020年1月1日~2022年6月30日到海南医学院第二附属医院就诊的住院病人,海南籍贯、年龄大于3... 目的:探索冠心病相关基因与海南地区住院患者冠心病之间的相关性,为丰富海南地区冠心病高危人群筛选手段,优化防治策略提供理论依据。方法:选取2020年1月1日~2022年6月30日到海南医学院第二附属医院就诊的住院病人,海南籍贯、年龄大于30岁的成年人,将病人分为冠心病组和非冠心病组。使用PCR实时荧光定量测基因表达量,运用Spearman相关性分析,探讨冠心病基因表达量与冠心病的相关性。结果:本研究共收集55位非冠心病人群全血样本(其中女性26名,男性29名),中位年龄为57岁,170位冠心病患者全血样本(其中女性44名,男性126名),中位年龄63.17。载脂蛋白B基因(ApoB)在冠心病组中显著高表达,P<0.0001;AGT基因(P=0.0158)、ApoE基因(P=0.0126)、FGB基因(P=0.005)、GNB基因(P=0.0151)、MTFHR基因(P=0.0119)、SELE基因(P=0.005)、TNF基因(P=0.0298)在非冠心病组显著高表达,NOS3基因(P=0.3047)、IL6基因(P=0.7239)、ACE基因(P=0.7852)在两组间的表达没有差异。冠心病与AGT基因呈负相关(r=−0.163,P=0.011,P<0.05)、APOB基因呈正相关(r=0.75,P=0,P<0.01)、FGB基因呈负相关(r=−0.163,P=0.011,P<0.05),GNB基因呈负相关(r=−0.165,P=0.011,P<0.05)、SELE基因呈负相关(r=−0.171,P=0.007,P<0.01)、MHTHR基因呈负相关(r=−0.210,P=0.001,P<0.01)、TNF基因呈负相关(r=−0.131,P=0.04,P<0.05),与APOE、NOS3、ACE、IL6等基因无相关性(P>0.05)。冠心病ApoB基因与甘油三酯呈负向相关,相关系数(r=−0.461,P=0.000),与年龄呈正相关,相关系数(r=0.173,P=0.009),与总胆固醇呈正相关,相关系数为(r=0.499,P=0.000),与高密度脂蛋白呈负相关,相关系数(r=−0.181,P=0.007),与低密度脂蛋白呈负相关,相关系数(r=−0.143,P=0.031)。结论:(1)载脂蛋白B基因表达检测可能作为海南地区冠人群冠心病筛查的一个指标,可能通过影响总胆固醇的水平增加冠心病的发病风险,仍需要更大样本的研究。(2)AGT、ApoE、FGB、GN 展开更多

关键词 冠心病 易感基因 热带海岛地区 海南

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基于δ-SPH方法的多孔潜堤共振反射数值模拟研究 被引量：3

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作者 史宝凯 陈永焜 +1 位作者 刘勇 DOMENICO D.MERINGOLO 《水道港口》 2020年第3期249-256,共8页

基于δ-SPH方法,通过在控制方程中引入介质阻力项,建立波浪与多孔潜堤相互作用的数值波浪水槽。对比数值模拟结果与物理模型试验结果,发现二者符合良好,验证了数值模型的可靠性。通过数值算例分析,研究了波浪参数、多孔潜堤参数等对双... 基于δ-SPH方法,通过在控制方程中引入介质阻力项,建立波浪与多孔潜堤相互作用的数值波浪水槽。对比数值模拟结果与物理模型试验结果,发现二者符合良好,验证了数值模型的可靠性。通过数值算例分析,研究了波浪参数、多孔潜堤参数等对双排梯形多孔潜堤Bragg共振反射的影响。研究表明:当入射波长约为2倍潜堤中心间距时,潜堤发生主频共振反射;波浪未破碎情况下,入射波高的变化对共振反射影响较小;降低堤顶水深、增加潜堤中心间距或增加潜堤宽度能够增强共振反射;当梯形潜堤顶宽固定时,主频反射系数随坡度增大而减小,当潜堤底宽固定时,主频反射系数随坡度增大而增大。文章数值模型能够有效模拟波浪与多孔介质潜堤的相互作用,可为工程设计提供参考。 展开更多

关键词 δ-SPH方法 多孔介质 潜堤 共振反射

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新型带反浪弧浮箱式防波堤消浪特性的数值和试验研究 被引量：3

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作者 王晓亮 陈永焜 +1 位作者 刘勇 王兴刚 《水道港口》 2021年第5期567-581,共15页

基于δ-SPH方法(Smoothed Particle Hydrodynamics;光滑粒子流体动力学方法),建立了波浪与浮式防波堤相互作用的数值模型,开展了波浪与新型带反浪弧浮箱式防波堤相互作用的物理模型试验,利用模型试验结果验证了数值模拟结果的合理性。... 基于δ-SPH方法(Smoothed Particle Hydrodynamics;光滑粒子流体动力学方法),建立了波浪与浮式防波堤相互作用的数值模型,开展了波浪与新型带反浪弧浮箱式防波堤相互作用的物理模型试验,利用模型试验结果验证了数值模拟结果的合理性。通过改变波浪参数和锚链长度,对比分析了带反浪弧浮箱式防波堤和矩形浮箱式防波堤的透射系数、反射系数、运动响应及流场特性,探讨了带反浪弧浮箱式防波堤的消浪机理。研究表明:新型带反浪弧浮箱式防波堤对较长周期波浪具有更好的掩护效果;与矩形浮箱式防波堤相比,带反浪弧浮箱式防波堤在波浪作用下会产生更多的涡旋,耗散更多的波浪能量;当锚链为部分拖地状态时,继续增大锚链长度对两种浮式防波堤运动响应和透射系数影响较小。 展开更多

关键词 δ-SPH方法 浮箱式防波堤 反浪弧 消浪特性 运动响应

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小桐子JcMAPK3基因的克隆及低温表达分析

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作者 杨宇 陈永坤 +1 位作者 孔春艳 龚明 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2020年第11期2439-2447,共9页

【目的】低温严重影响着能源植物小桐子的生长发育及桐油产量,对小桐子抗冷性相关基因的挖掘和抗冷性机理的研究显得尤为重要,探究小桐子JcMAPK3基因在低温下的表达规律,为深入研究JcMAPK3基因在小桐子抗冷性形成中的功能提供理论基础... 【目的】低温严重影响着能源植物小桐子的生长发育及桐油产量,对小桐子抗冷性相关基因的挖掘和抗冷性机理的研究显得尤为重要,探究小桐子JcMAPK3基因在低温下的表达规律,为深入研究JcMAPK3基因在小桐子抗冷性形成中的功能提供理论基础。【方法】基于小桐子低温锻炼条件下的转录组数据,通过RT-PCR技术克隆小桐子JcMAPK3基因,进行生物信息学分析,采用实时荧光定量qRT-PCR研究JcMAPK3在小桐子不同器官中的表达差异,以及在12℃低温锻炼和1℃低温胁迫下的表达模式。【结果】克隆到的JcMAPK3基因开放阅读框为1119 bp,编码372个氨基酸,含有STKcTEYMAPK激酶催化结构域,蛋白相对分子量为42.82 kD,理论等电点为5.6,分子式为C1920H2985N521O551S20。qRT-PCR分析显示,JcMAPK3基因在根中表达量最高,叶片中表达量最低。在1℃低温胁迫下72 h表达量最高,为对照(0 h)的13.5倍;在12℃低温锻炼下,JcMAPK3基因表达量在24 h最高,为对照(0 h)的5.58倍。【结论】小桐子JcMAPK3在12℃低温锻炼和1℃低温胁迫下受到低温诱导表达显著,表明该基因参与小桐子对低温的响应与适应过程。 展开更多

关键词 小桐子 JcMAPK3 基因克隆 低温胁迫 表达分析

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儿科医学影像公共网络教学的发展现状及展望 被引量：2

9

作者 马维 钦斌 +8 位作者 王翠 李伟 冯川 范晓 陈勇 朱昆 张雨婷 陈欣 徐晔 《中华医学教育探索杂志》 2017年第10期1065-1067,共3页

计算机网络教学已渗透到传统医学教学的各阶段,使医学教育水平不断提升,网络化教学已经成为现代教育模式的研究热点.尽管医学网络教育产业发展态势良好,因诸多因素制约,儿科医学影像网络教学发展却相对缓慢.本研究尝试通过比较国内外儿... 计算机网络教学已渗透到传统医学教学的各阶段,使医学教育水平不断提升,网络化教学已经成为现代教育模式的研究热点.尽管医学网络教育产业发展态势良好,因诸多因素制约,儿科医学影像网络教学发展却相对缓慢.本研究尝试通过比较国内外儿科医学影像网站建设现状,分析国内儿科医学影像公共网络教学的不足,探讨儿科医学影像网络教学建设的现实意义和策略,以此构建儿科影像医学教育资源网络平台,推动我国儿科影像学教育工作. 展开更多

关键词 儿科 医学影像学 网络教学 网站建设

原文传递

带有限缓冲区生产线脆性量化评估

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作者 胡江飞 张定 +1 位作者 刘强 陈勇坤 《机械设计与制造》 北大核心 2021年第8期135-140,共6页

针对产线存在的失效时间窗口问题,分析了弹性制造系统脆性的时空属性,对产线进行了脆性定量分析。脆性的量化评估是一个瞬时性能动态求解过程,求解过程中,首先,对失效时间窗问题进行建模;其次,利用威布尔分布函数对单元失效模型进行拟合... 针对产线存在的失效时间窗口问题,分析了弹性制造系统脆性的时空属性,对产线进行了脆性定量分析。脆性的量化评估是一个瞬时性能动态求解过程,求解过程中,首先,对失效时间窗问题进行建模;其次,利用威布尔分布函数对单元失效模型进行拟合,确定了设备故障率函数,结合产能损失对产线进行瞬态脆性、稳态脆性定量分析;最后以手机装配线项目案例加以分析验证,结果证明对产线的脆性分析有助于优化产线缓冲区配置从而提高产线稳定性。 展开更多

关键词 有限缓冲区 失效时间 装配线 定量分析 时空属性 量化评估 项目案例 脆性分析

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面向源网互动的智能配电网日前调度研究 被引量：2

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作者 顾雪楠 陈星莺 +3 位作者 王勇 余昆 廖迎晨 沈兵兵 《电网与清洁能源》 北大核心 2017年第4期57-63,共7页

面向源网互动的日前调度问题需要考虑多项目标,同时针对多个时段进行优化。在分析互动资源特性基础上,将可控型DG的出力及端电压、微电网与配电网的交换功率、开关状态作为控制量,提出考虑电压偏移、网损、负荷波动、开关动作次数几项指... 面向源网互动的日前调度问题需要考虑多项目标,同时针对多个时段进行优化。在分析互动资源特性基础上,将可控型DG的出力及端电压、微电网与配电网的交换功率、开关状态作为控制量,提出考虑电压偏移、网损、负荷波动、开关动作次数几项指标,基于矩阵编码的智能配电网日前调度方法。以86节点配电网为基础设计仿真算例,仿真结果证明了模型和算法的有效性。 展开更多

关键词 智能配电网 日前调度 源网互动 时段划分

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