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不同粗饲料条件下梅花鹿瘤胃甲烷菌结构的比较分析 被引量:5
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作者 李志鹏 刘晗璐 +2 位作者 司华哲 鲍坤 李光玉 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期2911-2919,共9页
本研究旨在基于高通量测序技术分析比较采食3种常见粗饲料梅花鹿瘤胃甲烷菌结构。选取3只2岁龄的装有永久性瘤胃瘘管的成年雄性梅花鹿为研究对象,采用3×3拉丁方设计,分别饲喂以柞树叶(OL组)、玉米秸秆(CS组)和玉米青贮(CI组... 本研究旨在基于高通量测序技术分析比较采食3种常见粗饲料梅花鹿瘤胃甲烷菌结构。选取3只2岁龄的装有永久性瘤胃瘘管的成年雄性梅花鹿为研究对象,采用3×3拉丁方设计,分别饲喂以柞树叶(OL组)、玉米秸秆(CS组)和玉米青贮(CI组)为主要粗饲料的饲粮。预试期为1周,正试期为4周。采用引物A519F、A976R扩增瘤胃甲烷菌16S rRNA基因V3-V4区,基于Illumina M iseq PE250平台进行测序。结果表明:9个样本共获得600 352条高质量的甲烷菌16S rRNA基因序列,基于97%相似性共归为111个分类操作单元(OTU)。覆盖度指数表明本试验样品覆盖了瘤胃99%的甲烷菌。分类分析结果表明甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter spp.)[OL组:(97.80±6.00)%;CS组:(97.10±1.50)%;CI组:(87.50±5.50)%]是梅花鹿瘤胃优势甲烷菌,但采食3种粗饲料梅花鹿瘤胃甲烷菌在种水平的分布有差异。CI组Methanosphaera stadtmanae相对丰度显著高于OL组与CS组(P〈0.05)。OL组与CI组Methanobrevibacter millerae相对丰度高于CS组(P〉0.05),OL组与CS组Methanobrevibacter boviskoreani相对丰度高于CI组(P〉0.05),而CS组与CI组Methanobrevibacter olleyae相对丰度高于OL组(P〉0.05)。本研究发现Methanobrevibacter spp.是梅花鹿瘤胃优势甲烷菌。 展开更多
关键词 梅花鹿 甲烷菌 Methanobrevibacter spp. 粗饲料
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一种基于M-Bisearch的最大频繁项集挖掘算法研究
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作者 李宝林 周坤 李仕伟 《成都信息工程大学学报》 2016年第5期463-468,共6页
大数据分析的理论核心就是数据挖掘,关联规则挖掘算法是数据挖掘的重要分支,其包含频繁项集的生成和关联规则的产生两个步骤,频繁项集的生成过程中算法开销占据很大成本。从最大频繁项集的性质入手,在改变数据存储结构的基础上采用M-Bis... 大数据分析的理论核心就是数据挖掘,关联规则挖掘算法是数据挖掘的重要分支,其包含频繁项集的生成和关联规则的产生两个步骤,频繁项集的生成过程中算法开销占据很大成本。从最大频繁项集的性质入手,在改变数据存储结构的基础上采用M-Bisearch的思想,通过对存储空间进行压缩来减少扫描次数和降低支持度计算开销,从而达到提升算法执行效率的目的。实验表明,改进算法在处理中长模式的频繁项集挖掘问题时具有明显的优越性。 展开更多
关键词 机器学习 数据挖掘 关联规则 频繁项集 最大频繁项集 M-Bisearch
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