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慈竹4CL基因的克隆及其生物信息学分析 被引量:22
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作者 胡尚连 曹颖 +3 位作者 孙霞 卢学琴 蒋瑶 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2009年第8期204-210,共7页
【目的】克隆慈竹木质素生物合成酶4CL基因,研究其序列特征,为今后利用该基因调控慈竹木质素的生物合成研究奠定基础。【方法】参照其他物种4CL基因保守区,设计简并引物,以慈竹幼笋cDNA为模板,克隆到1条750 bp的4CL基因保守区片段。以... 【目的】克隆慈竹木质素生物合成酶4CL基因,研究其序列特征,为今后利用该基因调控慈竹木质素的生物合成研究奠定基础。【方法】参照其他物种4CL基因保守区,设计简并引物,以慈竹幼笋cDNA为模板,克隆到1条750 bp的4CL基因保守区片段。以这条保守区片段为模板,结合5′RACE和3′RACE克隆4CL基因全长序列,并对其进行了生物信息学分析。【结果】成功克隆了慈竹4CL基因全序列,该序列CDS区全长为1 674 bp,编码558个氨基酸;氨基酸序列中存在两大4CL氨基酸保守域(SSGTTGMPKGV和GEICIRG),其中前一个氨基酸保守域的第7个氨基酸位点变为M,与常见的L不同,表明慈竹的4CL基因发生了一定变异。系统进化分析表明,该基因(Na4CL)与水稻的Os4CL4和黑麦草的Lp4CL2具有很高的同源性。【结论】克隆了慈竹木质素合成酶4CL基因全长序列,在GenBank上注册为EU327341,可能与慈竹木质素生物合成有关。 展开更多
关键词 慈竹 4CL基因 克隆 生物信息学分析
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番茄bZIP转录因子家族的生物信息学分析 被引量:21
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作者 朱芸晔 薛冰 +4 位作者 王安全 王文杰 周昂 刘永 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期767-774,共8页
bZIP转录因子广泛参与了植物生长发育以及抗逆应答的调控,属于重要的转录因子家族.为了系统地阐明番茄bZIP转录因子家族成员特征和基因表达模式,利用生物信息学软件和方法,对番茄基因组中的bZIP转录因子进行了系统的分析研究.结果表明:... bZIP转录因子广泛参与了植物生长发育以及抗逆应答的调控,属于重要的转录因子家族.为了系统地阐明番茄bZIP转录因子家族成员特征和基因表达模式,利用生物信息学软件和方法,对番茄基因组中的bZIP转录因子进行了系统的分析研究.结果表明:番茄基因组共编码70个bZIP转录因子基因,划分为14个亚族,即A、B、C、D、E、F、G、H、I、J、K、L、S和X.番茄、拟南芥和水稻bZIP基因的系统进化树揭示了进化过程中Group 3和Group 4的成员数目大大增加,进化过程较激烈.氨基酸保守域DOG1和MFMR分别特定存在于12个和6个bZIP成员蛋白序列中.在番茄各器官组织中,干旱、盐、细菌和病毒侵染胁迫条件下,43个番茄bZIP基因不同程度地被诱导表达.以基因表达值上调或下调1.5倍为阈值,部分bZIP基因的表达水平被显著地诱导上调或下调表达.这些基因很可能参与了调控番茄的果实等组织的生长发育,以及逆境胁迫条件下的防御应答反应.通过荧光实时定量PCR,其中7个代表性番茄bZIP基因,被进一步验证了在叶片和果实中的表达水平.本研究鉴定得到的番茄bZIP转录因子基因,可用于今后番茄育种及改良的基因工程研究. 展开更多
关键词 番茄 BZIP 转录因子 生物信息学分析
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木质素生物合成酶4CL基因的遗传进化分析 被引量:15
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作者 胡尚连 +3 位作者 孙霞 曹颖 卢学琴 蒋瑶 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2008年第10期199-206,共8页
【目的】4CL是木质素生物合成途径中的关键合成酶,通过对4CL基因的遗传进化分析,为其研究和利用提供理论依据。【方法】利用生物信息学手段,对4CL基因完整cDNA和编码氨基酸序列进行数据挖掘,利用Mega软件、ExPASy的Prosite数据库、NCBI... 【目的】4CL是木质素生物合成途径中的关键合成酶,通过对4CL基因的遗传进化分析,为其研究和利用提供理论依据。【方法】利用生物信息学手段,对4CL基因完整cDNA和编码氨基酸序列进行数据挖掘,利用Mega软件、ExPASy的Prosite数据库、NCBI的Conserved Domains数据库,进行4CL基因核酸和蛋白质水平上的遗传进化分析。【结果】构建了4CL基因的系统发生树,揭示出植物中的4CL基因聚类与植物分类大体一致,主要以基因家族的形式存在,但基因家族中部分基因存在着结构和功能的分化,4CL基因中存在着GC含量偏高和偏低两大类基因。4CL基因编码的氨基酸序列保守区高度相似,但是在单、双子叶两大类植物之间,其氨基酸平均含量存在着较大差异。【结论】在植物的进化过程中,虽然4CL基因较保守,但部分4CL基因发生了分化,体现在基因的结构和功能方面,在4CL基因的研究中必须充分考虑到这种分化。 展开更多
关键词 木质素 4CL基因 遗传进化分析
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基于中华猕猴桃“红阳”转录组序列开发EST-SSR分子标记(英文) 被引量:16
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作者 孟蒙 唐维 +6 位作者 刘嘉 余进德 刘方方 林琳 张霞 刘永 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期564-570,共7页
为开发猕猴桃EST-SSR标记,了解28个品种猕猴桃间的遗传多样性和遗传关系,对中华猕猴桃"红阳"的转录组序列进行分析,并根据分析结果设计SSR引物.之后采用CTAB法提取28个品种猕猴桃的DNA作为SSR-PCR的扩增模板,并根据扩增结果... 为开发猕猴桃EST-SSR标记,了解28个品种猕猴桃间的遗传多样性和遗传关系,对中华猕猴桃"红阳"的转录组序列进行分析,并根据分析结果设计SSR引物.之后采用CTAB法提取28个品种猕猴桃的DNA作为SSR-PCR的扩增模板,并根据扩增结果进行聚类分析.研究中共得到包含SSR的序列21 848条,其中重复单元为单碱基、双碱基、三碱基、四碱基、五碱基和六碱基的序列分别为1 642、15 965、3 141、248、368和484条,随机选择其中46条序列设计SSR引物.根据初步的PCR扩增,筛选出32对条带较少且明亮的引物分别对28个品种猕猴桃的DNA样本进行扩增,并对引物对应的SSR序列进行定位.结果显示,32对引物对应的序列中有19条能够得到完整的所在基因、染色体以及染色体中具体位置的信息.这些引物中有26对具有多态性,共统计到等位基因120个,每对引物得到1-11个等位基因,平均3.75个.28个猕猴桃品种之间的遗传相似性系数在0.53-0.97之间,在遗传相似系数为0.72的水平上,可将它们分为5大类,分类结果与传统形态学的划分基本一致.本研究揭示的各样本间的遗传关系可为未来猕猴桃的种质改良提供依据. 展开更多
关键词 中华猕猴桃 遗传分析 转录组 重复单元 SSR 种质资源
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色素万寿菊不同栽培品种农艺性状和叶黄素量的比较 被引量:15
5
作者 田丽 冯国栋 +3 位作者 刘莹 刘永 牛向丽 《合肥工业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2018年第5期703-707,共5页
万寿菊是提取天然叶黄素的重要植物资源,我国已成为世界万寿菊叶黄素的主产地。文章将国内外培育的8个色素万寿菊栽培品种在安徽合肥进行小量试种,并对农艺性状、叶黄素的量进行测定,以初步筛选适合本地规模种植的种质材料。实验结果表... 万寿菊是提取天然叶黄素的重要植物资源,我国已成为世界万寿菊叶黄素的主产地。文章将国内外培育的8个色素万寿菊栽培品种在安徽合肥进行小量试种,并对农艺性状、叶黄素的量进行测定,以初步筛选适合本地规模种植的种质材料。实验结果表明,所有试验栽培品种均表现较好的生长适应性,高效液相色谱检测显示橙色花叶黄素质量比高于黄色花。从农艺性状、色素质量比综合分析,国内培育栽培品种"菊王"可用于本地规模种植及新品种培育的种质资源。该研究为万寿菊在色素合成调控的进一步研究和在安徽本地的产业化发展提供了基础。 展开更多
关键词 万寿菊 天然色素 叶黄素 农艺性状 高效液相色谱
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中国赛艇优秀男子轻量级运动员技术特征分析 被引量:13
6
作者 郑伟涛 +4 位作者 韩久瑞 马勇 周洪生 娇战训 刘建 《武汉体育学院学报》 CSSCI 北大核心 2004年第1期65-68,共4页
通过研制的赛艇实船力量测试系统对我国优秀男子轻量级运动员技术特点进行了测试分析。结果表明该系统为科学地评定、改进和完善赛艇技术提供了强有力的工具。目前我国男子轻量级多人艇技术配合上的主要问题是身体移动、停止、再启动时... 通过研制的赛艇实船力量测试系统对我国优秀男子轻量级运动员技术特点进行了测试分析。结果表明该系统为科学地评定、改进和完善赛艇技术提供了强有力的工具。目前我国男子轻量级多人艇技术配合上的主要问题是身体移动、停止、再启动时机不一致,身体的整体重心回位不够及时,另外,桨叶入水时拉桨不够迅速、圆滑,腿部蹬力过大。经过测试分析以后,包括老运动员在内,技术动作得到明显的改进和完善。 展开更多
关键词 赛艇 技术分析 男子轻量级
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黄花石蒜中的黄酮类成分 被引量:10
7
作者 杨郁 +2 位作者 赵毅民 赵勤实 孙汉董 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 2005年第5期539-541,共3页
通过对黄花石蒜(Lycoris aurea)乙醇提取物的乙酸乙酯溶解部分进行分离纯化,得到7个化合物。经物理方法和波谱分析,分别鉴定为(2S)-4′-羟基-7-甲氧基黄烷(1)(、2S)-3′,7-二羟基-4′-甲氧基黄烷(2)(、2S)-4′,7-二羟基黄烷(3)(、2S)-4... 通过对黄花石蒜(Lycoris aurea)乙醇提取物的乙酸乙酯溶解部分进行分离纯化,得到7个化合物。经物理方法和波谱分析,分别鉴定为(2S)-4′-羟基-7-甲氧基黄烷(1)(、2S)-3′,7-二羟基-4′-甲氧基黄烷(2)(、2S)-4′,7-二羟基黄烷(3)(、2S)-4′,7-二羟基-8-甲基黄烷(4)(、2S)-4′,7-二羟基-3′-甲氧基-8-甲基黄烷(5)、(2S)-4′,5,7-三羟基-8-甲基黄烷酮(6)、2,4′-二羟基-4-甲氧基二氢查尔酮(7)。所有化合物均为首次从该属植物中分离得到,另外,本文首次归属了化合物5、6、7的13C NMR信号。 展开更多
关键词 黄花石蒜 石蒜科 黄酮
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植物纤维素合成酶基因的进化分析 被引量:9
8
作者 李益 胡尚连 +3 位作者 卢学琴 蒋瑶 李向前 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2008年第2期101-105,共5页
从基因库中调取已完成测序的纤维素合成酶CesA(Cellulose synthase)基因序列和氨基酸序列,共涉及15个物种的89个基因,基于以上氨基酸序列,应用常用的系统发生关系树生成软件MEGA3.1,做出这89个基因的系统发生关系树。综合已知的模式植物... 从基因库中调取已完成测序的纤维素合成酶CesA(Cellulose synthase)基因序列和氨基酸序列,共涉及15个物种的89个基因,基于以上氨基酸序列,应用常用的系统发生关系树生成软件MEGA3.1,做出这89个基因的系统发生关系树。综合已知的模式植物CesA基因的功能(仅指初生壁或次生壁形成特异性),可推测某些未知功能基因的可能功能。研究还发现绿竹CesA基因与玉米和大麦CesA基因在系统发生关系和同源性方面关系密切。CesA一级结构可变区中半胱氨酸、丙氨酸、甘氨酸和丝氨酸等氨基酸的含量变化较大,在同一位点半胱氨酸多是与丙氨酸、丝氨酸和缬氨酸发生相互替换。 展开更多
关键词 纤维素合成酶 基因功能 系统发生关系
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拟南芥bZIP基因家族系统发育树比较分析 被引量:6
9
作者 蒋瑶 胡尚连 +1 位作者 孙霞 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2008年第1期22-27,共6页
bZIP蛋白是植物中特有的一类转录因子,包含亮氨酸拉链结构域和碱性结构域两部分。在种子贮藏基因表达、光形态发生及器官建成以及植物对ABA、光、厌氧生活和发育信号的反应中,bZIP蛋白家族对调节基因的表达都起到重要的作用。对已鉴定出... bZIP蛋白是植物中特有的一类转录因子,包含亮氨酸拉链结构域和碱性结构域两部分。在种子贮藏基因表达、光形态发生及器官建成以及植物对ABA、光、厌氧生活和发育信号的反应中,bZIP蛋白家族对调节基因的表达都起到重要的作用。对已鉴定出的78个拟南芥bZIP基因(包括-like)中72个bZIP基因(不包括-like和假设蛋白),利用系统发育树分为8个组,以期进一步探讨进化组中的生物特征和功能。 展开更多
关键词 bZIP基因 转录因子 进化 拟南芥
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穿龙薯蓣化学成分的液相色谱-质谱联用分析 被引量:7
10
作者 李锐 +2 位作者 周燕 彭树林 丁立生 《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第z1期89-90,92,共3页
  穿龙薯蓣(Diosorea nipponica Makino)为薯蓣科薯芋属植物,产于内蒙古,黑龙江等省区,其根茎俗称穿山龙,既是生产治疗心血管疾病药物地奥心血康的原料药材,又是用于合成多种甾体激素类药物的原料薯蓣皂苷元的重要来源之一.……
关键词 Diosorea nipponica Chemical constituent HPLC - MSn
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川赤芍的化学成分研究(英文) 被引量:5
11
作者 李鲜 +2 位作者 普建新 孙汉董 《云南植物研究》 CSCD 北大核心 2007年第2期259-262,共4页
从川赤芍Paeonia anomala subsp·veitchii根皮的70%丙酮提取物中,分离鉴定了22个化合物,其中包括一个新的24,30位降常春藤皂苷三萜衍生物,命名为paeonenolide H(1)。化合物2,4,9,10为首次从该植物中分离得到。
关键词 芍药科 川赤芍 三萜化合物
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四川不同地区硬头黄竹RAPD和ISSR分析 被引量:6
12
作者 蒋瑶 胡尚连 +4 位作者 陈其兵 曹颖 孙霞 卢学琴 《竹子研究汇刊》 北大核心 2009年第1期6-11,共6页
以四川不同地区硬头黄为研究对象,通过随机扩增多态性DNA标记(RAPD)和简单序列重复区间(ISSR)标记进行扩增,探讨硬头黄竹的遗传多样性。研究表明,6个RAPD引物扩增出42条条带,多态性高达69.05%;5个ISSR引物扩增出47条条带,... 以四川不同地区硬头黄为研究对象,通过随机扩增多态性DNA标记(RAPD)和简单序列重复区间(ISSR)标记进行扩增,探讨硬头黄竹的遗传多样性。研究表明,6个RAPD引物扩增出42条条带,多态性高达69.05%;5个ISSR引物扩增出47条条带,多态性为61.70%。利用Popgen32和NTYS软件进行聚类分析,可将不同地区硬头黄竹类型区分开来,其遗传距离分别为0.1823~0.6022和0.0435~0.6721,RAPD和ISSR分子标记为硬头黄竹的遗传改良提供理论依据。 展开更多
关键词 硬头黄 遗传多样性 RAPD标记ISSR标记
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常用酰基辅酶A的合成
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作者 徐一心 田恬 +3 位作者 陈银 马小燕 程纯儒 《生物化工》 CAS 2024年第2期1-10,共10页
酰基辅酶A作为重要的酰基活化形式在代谢中起着重要作用,而获得酰基辅酶A是进行相关代谢过程研究的基础。目前酰基辅酶A的合成方法主要为化学合成和酶法合成两类,不同结构的酰基辅酶A适用的合成方法有所不同。本文采用化学合成(酸酐合... 酰基辅酶A作为重要的酰基活化形式在代谢中起着重要作用,而获得酰基辅酶A是进行相关代谢过程研究的基础。目前酰基辅酶A的合成方法主要为化学合成和酶法合成两类,不同结构的酰基辅酶A适用的合成方法有所不同。本文采用化学合成(酸酐合成、咪唑基活化和PyBOP一步合成)和酶法合成(辅酶A连接酶和酰基转移酶完成体外催化),合成了苯乳酰辅酶A、异戊酰辅酶A、苯甲酰辅酶A、对香豆酰辅酶A和肉桂酰辅酶A,并对合成结果进行了评价。结果表明,酶法具有转化率高,专一性强的优势,化学合成具有高效快速合成的特点。本文为将来合理选择酰基辅酶的合成方法提供了参考。 展开更多
关键词 苯乳酰辅酶A 异戊酰辅酶A 苯甲酰辅酶A 对香豆酰辅酶A 肉桂酰辅酶A 合成方法
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多组学数据揭示藜麦RLP基因的进化特征和胁迫应答差异
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作者 陈思宇 蒋礼玲 +8 位作者 李益 何晶晶 刘洋 孙珂嵘 刘凯旋 杨宇若 王明雪 贾举庆 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期559-568,共10页
类受体蛋白RLP(receptor-like protein)属于植物细胞表面受体.大量RLP被证明参与了植物的非生物胁迫耐受和生物胁迫的防御应答反应.基于基因组和转录组数据,利用生物信息学方法对藜麦RLP基因进行全基因组范围的挖掘、序列特征阐述、进... 类受体蛋白RLP(receptor-like protein)属于植物细胞表面受体.大量RLP被证明参与了植物的非生物胁迫耐受和生物胁迫的防御应答反应.基于基因组和转录组数据,利用生物信息学方法对藜麦RLP基因进行全基因组范围的挖掘、序列特征阐述、进化动力解析、不同组织器官和多个非生物逆境胁迫下表达模式分析和编码蛋白互作网络构建.在藜麦基因组中鉴定得到106个RLP基因;其中40个RLP基因涉及串联倍增事件.系统进化树中RLP基因聚成4个大组;RLP基因编码蛋白序列的保守结构域组成具有明显的组别特异性.串联倍增与全基因组倍增被证明是藜麦RLP基因数目扩张的主要动力.转录组数据表明12个RLP基因在藜麦花簇、叶片和茎中呈现出组织特异性的表达模式.干旱、高温、盐、低磷胁迫下,CqRLP003、CqRLP010、CqRLP12、CqRLP052和CqRLP061的表达水平在多个胁迫条件下显著地降低.胁迫转录组中差异表达基因编码蛋白的互作网络显示CqRLP001、CqRLP070、CqRLP082和AUR62007584是网络中重要的调控因子.本研究结果表明藜麦RLP基因家族成员进化特征差异明显,且广泛参与了调控藜麦的多种非生物胁迫耐受能力.(图12参36) 展开更多
关键词 藜麦 类受体蛋白 进化 比较基因组 转录组 蛋白互作网络
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中华猕猴桃EIN3/EIL转录因子家族的成员鉴定、系统进化和基因表达模式 被引量:7
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作者 陈强 刘建 +6 位作者 陈丹阳 于丰源 江梦柯 郑玉凤 牛向丽 刘永 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期315-321,共7页
EIN3/EIL家族是一类非常重要的转录因子,调控植物包括果实成熟在内的众多生长发育过程. 对中华猕猴桃EIN3/EIL家族进行系统的生物信息学和比较基因组学研究,在中华猕猴桃基因组中鉴定得到8个EIN3/EIL转录因子;其蛋白序列包括1个酸性... EIN3/EIL家族是一类非常重要的转录因子,调控植物包括果实成熟在内的众多生长发育过程. 对中华猕猴桃EIN3/EIL家族进行系统的生物信息学和比较基因组学研究,在中华猕猴桃基因组中鉴定得到8个EIN3/EIL转录因子;其蛋白序列包括1个酸性氨基酸富集区、1个脯氨酸富集区以及5-7个碱性氨基酸富集区. 包括中华猕猴桃在内的20种植物的EIN3/EIL成员的系统进化树表明,EIN3/EIL基因在众多植物基因组中同时存在趋同和趋异的进化趋势. 中华猕猴桃EIN3/EIL基因家族成员的增加主要源于其进化过程中发生的全基因组三倍化倍增事件. 在果实成熟过程中,中华猕猴桃EIN3/EIL基因呈现组成型的高或低表达两种截然相反的基因表达趋势. 本研究鉴定得到了中华猕猴桃EIN3/EIL家族的成员,系统揭示了其成员蛋白序列中的保守区域、在不同植物物种中的进化趋势,植物基因组倍增所导致的家族成员增加,以及果实发育过程中表现出的显著的基因表达水平差异,可为中华猕猴桃EIN3/EIL基因的功能研究提供候选基因以及数据基础. (图5 表2 参25) 展开更多
关键词 中华猕猴桃 EIN3/EIL 系统进化 比较基因组学分析 基因表达模式
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植物次生代谢途径与调控研究进展 被引量:1
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作者 朱三明 郑敏敏 +6 位作者 田恬 余佳益 建萍 赵清 卢山 继荣 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期2188-2216,共29页
植物次生代谢途径是利用初生代谢产物合成小分子化合物的过程。这些小分子化合物也称之为天然产物或者特殊代谢产物。虽然它们不是植物生存所必需的,但在植物与生物和非生物环境因子的互作中发挥着重要作用。因此,次生代谢产物是植物不... 植物次生代谢途径是利用初生代谢产物合成小分子化合物的过程。这些小分子化合物也称之为天然产物或者特殊代谢产物。虽然它们不是植物生存所必需的,但在植物与生物和非生物环境因子的互作中发挥着重要作用。因此,次生代谢产物是植物不断演化的推进剂。植物来源的天然产物与我们人类的营养与健康息息相关,因为很多成分具有促进健康与治疗疾病的功效,是药物研发的先导化合物,而有些则是抗营养因子、甚至具有毒性。近年来,在合成生物学与多组学的推动下,极大地促进了植物次生代谢途径与调控机理的研究。本文将综述植物三大类重要天然产物(类黄酮、萜类与生物碱)的合成与调控的研究进展。 展开更多
关键词 次生代谢途径与调控 类黄酮 萜类 生物碱
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滑桃树内生真菌Fusarium sp. 1RGa-1b中萘醌类代谢产物及其抗菌活性研究 被引量:5
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作者 郁步竹 宋成芝 +3 位作者 杜芝芝 蔡祥海 罗晓东 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 2009年第4期574-576,共3页
从滑桃树内生真菌Fusarium sp.(1RGa-1b)的发酵代谢产物中分离得到6个一系列的萘醌类色素化合物,通过波谱分析将其结构鉴定为:3-methylether-fusarubin(1),anhydrofusarubin(2),2-acetonyl-3-methyl-5-hydro-gen-7-methoxy-naphthazarin... 从滑桃树内生真菌Fusarium sp.(1RGa-1b)的发酵代谢产物中分离得到6个一系列的萘醌类色素化合物,通过波谱分析将其结构鉴定为:3-methylether-fusarubin(1),anhydrofusarubin(2),2-acetonyl-3-methyl-5-hydro-gen-7-methoxy-naphthazarin(3),2-acetonyl-3-methyl-7-methoxy-8-hydrogen-naphthazarin(4),2-acetonyl-3-methyl-7-methoxy-naphthazarin(5),2-isopropanol-3-methyl-7-methoxy-naphthazarin(6)。利用纸片扩散法对这些化合物的抗细菌及抗真菌活性进行了初步测试,实验结果表明:化合物3和4具有弱的抗金黄色葡萄球菌的活性。 展开更多
关键词 滑桃树 内生真菌 FUSARIUM 萘醌
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基于转录组测序数据的青稞WRKY基因家族的生物信息学分析 被引量:5
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作者 蒋礼玲 陈丽华 +3 位作者 尼玛扎西 马晓岗 李高原 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2021年第2期370-379,共10页
WRKY是植物中一类重要的转录因子,广泛调控了植物的生长发育和逆境胁迫应答。基于青稞白粉病侵染幼苗的转录组测序数据,本研究鉴定得到41个青稞WRKY转录因子,被划分为3个大组:Ⅰ组(6个)、Ⅱ组(21个)和Ⅲ组(12个)。另外,Hv WRKY40和Hv WR... WRKY是植物中一类重要的转录因子,广泛调控了植物的生长发育和逆境胁迫应答。基于青稞白粉病侵染幼苗的转录组测序数据,本研究鉴定得到41个青稞WRKY转录因子,被划分为3个大组:Ⅰ组(6个)、Ⅱ组(21个)和Ⅲ组(12个)。另外,Hv WRKY40和Hv WRKY41没有分组。青稞WRKY基因进化分析的聚类结果和分组结果一致,进一步支持了我们分组的正确性。包括HvWRKY2、HvWRKY8、HvWRKY13、HvWRKY34和HvWRKY41,以及HvWRKY4、HvWRKY7、HvWRKY20、HvWRKY26和HvWRKY30在内的两组WRKY基因,表现出明显的先升高(36 h和72 h),后降低(168 h)的基因表达趋势。这些WRKY基因很可能参与了调控青稞抗白粉病的分子应答机制。青稞WRKY家族的蛋白相互作用网络中,Hv WRKY3、Hv WRKY8、Hv WRKY9属于网络中的主要中心节点。此外,Hv WRKY3、Hv WRKY8、Hv WRKY9、Hv WRKY30、HvWRKY34、Hv WRKY38、Hv WRKY39彼此之间相互作用,是蛋白互作网络的核心网络。本研究挖掘了青稞的WRKY家族成员,系统分析了家族成员的分组、家族成员的WRKY保守域特点、家族成员之间的进化关系、白粉菌侵染下的基因表达水平和家族成员的蛋白互作网络。本研究可为今后青稞的抗逆研究提供优良的候选WRKY基因。 展开更多
关键词 WRKY 青稞 转录组 系统进化 蛋白互作网络
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腺叶蔷薇果实化学成分的HPLC-MS分析 被引量:4
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作者 周燕 李锐 +1 位作者 丁立生 《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第z1期91-92,共2页
  蔷薇属植物广泛分布于世界各地,在我国有80余种,其中许多具有药用价值[1,2].该属植物的叶片和果实中含有槲皮素、山奈酚、芦丁等多种黄酮类化合物和齐墩果酸、乌苏酸等三萜化合物[2].……
关键词 Rosa kokanica Chemical constituent HPLC - MS
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链霉菌Kib015次级代谢产物及其抗菌活性研究
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作者 邓陈洁 郭晓为 +1 位作者 刘兴勇 《生物化工》 2023年第2期22-27,共6页
目的:挖掘三七植物内生菌来源链霉菌Kib015的次级代谢产物。方法:利用硅胶柱色谱、凝胶柱色谱和高效液相色谱等方法对链霉菌Kib015发酵产物进行分离纯化,并通过核磁共振NMR确定了化合物结构。结果:共分离得到11个已知化合物,经核磁共振... 目的:挖掘三七植物内生菌来源链霉菌Kib015的次级代谢产物。方法:利用硅胶柱色谱、凝胶柱色谱和高效液相色谱等方法对链霉菌Kib015发酵产物进行分离纯化,并通过核磁共振NMR确定了化合物结构。结果:共分离得到11个已知化合物,经核磁共振确定化合物分别是邻氨基苯甲酸(1)、对羟基苯乙酸甲酯(2)、邻苯二甲酸二丁酯(3)、9-hydroxy-4-megastigmen-3-one(4)、阿魏酸(5)、对羟基肉桂酸(6)、3,5-二羟基苯甲酸(7)、3,5-二羟基苯乙酸(8)、3-羟基-2-甲基-4-吡喃酮(9)、(2E)-3-(2-aminophenyl)-2-propenoic acid(10)和Tetillapyrone(11)。抗菌实验结果显示,化合物(5)对金黄色葡萄球菌有显著的抑制作用;化合物(6)对白色念珠菌有显著的抑制作用。结论:从链霉菌Kib015发酵液中分离鉴定了多个具有抗菌活性的次级代谢产物,丰富了抗菌药物前体的结构多样性,能够为抗菌药物的开发提供结构基础。 展开更多
关键词 链霉菌Kib015 代谢产物 抗菌活性 结构鉴定
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