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基于生物信息学探索肺腺癌预后相关基因及免疫浸润分析 被引量：4
1
作者 黄宏玉 巫艳彬 覃寿明 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期1358-1365,共8页
目的:筛选出肺腺癌(LUAD)的预后相关因子,并分析LUAD中免疫细胞浸润情况。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载LUAD转录组RNA——Seq数据集,应用反卷积算法(CIBERSORT)和估计算法(ESTIMATE)计算患者肿瘤浸润性免疫细胞(TIC)的比例... 目的:筛选出肺腺癌(LUAD)的预后相关因子,并分析LUAD中免疫细胞浸润情况。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载LUAD转录组RNA——Seq数据集,应用反卷积算法(CIBERSORT)和估计算法(ESTIMATE)计算患者肿瘤浸润性免疫细胞(TIC)的比例以及免疫和基质成分的数量。利用R软件鉴定LUAD患者与正常人的差异表达基因(DEGs),并进行功能和通路富集分析。采用单变量Cox回归分析和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络构建方法对DEGs交叉分析,确定LUAD预后相关因子,并选择其中一个预后因子进行单基因分析,最后利用CIBERSORT分析LUAD中免疫细胞浸润情况。结果:共鉴定出363个DEGs,对DEGs进行Cox回归分析和PPI网络构建后,交叉分析得到7个预后相关基因,分别为CCR2、CD79A、BTK、CD19、CD22、CD28、PTPRC。选定CD22进行单基因分析,发现CD22的表达与LUAD患者的临床病理特征(临床分期、肿瘤浸润)呈负相关,与LUAD患者的生存期呈正相关。基因集富集分析(GSEA)显示,免疫相关活性基因集主要富集于CD22高表达组,而代谢途径基因集主要富集于CD22低表达组。CIBERSORT分析表明其中记忆B细胞、幼稚B细胞、静息肥大细胞、静息的CD4+记忆T细胞、CD8+T细胞、调节T细胞与CD22表达呈正相关,提示CD22可能对TME中的免疫优势存在起重要作用。结论:CCR2、CD79A、BTK、CD19、CD22、CD28和PTPRC表达水平可能有助于预测和解释LUAD患者预后,其中CD22还可以作为区分TME免疫活跃状态和代谢活动状态的指标,为LUAD的治疗提供新思路。免疫细胞浸润分析结果为LUAD的分子机制研究提供新思路。 展开更多
关键词 CD22 肺腺癌 预后因子 免疫细胞浸润 肿瘤免疫微环境
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轻便型高效氙灯电源
2
作者 黄宏玉 《影视技术》 2000年第12期40-40,54,共2页
关键词 氙灯 电源 主电路 控制电路 工作原理
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小功率氙灯电源的制作
3
作者 黄宏玉 《电影机械》 1994年第4期9-11,共3页
关键词 电影放映 氙灯 电源 电路
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