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题名新冠病毒基因序列S蛋白信息熵可视化分布
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作者
吴可
张月晴
黄嘉政
董芯宇
张舒智
郑智捷
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机构
云南大学软件学院
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出处
《计算生物学》
2021年第1期12-19,共8页
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文摘
新冠肺炎(COVID-19)在全球范围爆发,至今仍未得到有效控制。新冠病毒(SARS-CoV-2)表面的刺突蛋白(spike protein, S)在病毒传播中起着十分重要的作用,针对它的分析在疾病预防与免疫中具有重要的应用价值。本文分析了新型冠状病毒基因序列的碱基分布及S蛋白基因的突变情况。针对相关新冠病毒基因序列进行多种可视化处理及分析,选择多条S蛋白基因序列,运用BLAST以及MEGA6软件进行信息比对、对齐,再进行信息熵的计算、展示可视化分布及相关分析。结果显示,新冠病毒基因碱基的整体分布具有对称性,由于选择的S蛋白数量不大变异量较小,其信息熵可视化分布呈现的特征聚点数目也较少。
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关键词
COVID-19
SARS-CoV-2
S蛋白
信息熵
可视化分布
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分类号
TP3
[自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
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