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肉苁蓉治疗骨质疏松作用机制的网络药理学研究 被引量:20
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作者 王延涛 杨智华 +5 位作者 陈怡 黄嘉华 孙治中 周驰 李伟宽 《中国药房》 CAS 北大核心 2019年第5期645-651,共7页
目的:采用网络药理学方法研究肉苁蓉治疗骨质疏松的作用机制。方法:通过检索中药系统药理学分析平台(TCMSP)获取肉苁蓉的活性成分,采用反向分子对接服务器DRAR-CPI及相关数据库GeneCards、OMIM筛选肉苁蓉活性成分治疗骨质疏松的作用靶标... 目的:采用网络药理学方法研究肉苁蓉治疗骨质疏松的作用机制。方法:通过检索中药系统药理学分析平台(TCMSP)获取肉苁蓉的活性成分,采用反向分子对接服务器DRAR-CPI及相关数据库GeneCards、OMIM筛选肉苁蓉活性成分治疗骨质疏松的作用靶标;采用软件Cytoscape构建肉苁蓉的"成分-靶标"网络,结合数据库String和Cytoscape绘制靶标间相互作用关系;通过服务器Systems Dock WebSite将靶标与活性成分进行分子对接评估二者间的结合活性以进行验证;最后再利用数据库DAVID对靶标基因进行基因本体分类富集分析与京都基因与基因组百科全书通路富集分析。结果:从肉苁蓉中筛选出的活性成分有13个,主要为毛蕊花糖苷、益母草碱、京尼平酸等;活性成分作用的潜在靶标有43个,主要有成骨分化特异性转录分子2(RUNX2)、血管内皮生长因子(VEGF)、白细胞介素6(IL-6)、骨生长蛋白因子(BGP)、肿瘤坏死因子(TNF)等;靶标作用涉及的信号通路有多条,主要为WNT(Wingless/Integrated)、VEGF、TNF等。结论:本研究初步探讨并验证了肉苁蓉治疗骨质疏松的主要靶标和通路,为后续进一步研究其作用机制奠定了基础。 展开更多
关键词 肉苁蓉 骨质疏松 网络药理学 活性成分 靶标 分子对接 信号通路
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基于网络药理学探究“黄芪-当归”治疗慢性再生障碍性贫血的作用机制 被引量:16
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作者 杨志文 何靖 +1 位作者 刘增慧 《中国中医基础医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期253-259,共7页
目的:基于网络药理学理念,探讨“黄芪-当归”治疗慢性再生障碍性贫血(CAA)的作用机制。方法:利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)与Pubchem数据库获取黄芪、当归的活性成分及其平面结构图与结构式,通过SwissTargetPrediction服务器和人... 目的:基于网络药理学理念,探讨“黄芪-当归”治疗慢性再生障碍性贫血(CAA)的作用机制。方法:利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)与Pubchem数据库获取黄芪、当归的活性成分及其平面结构图与结构式,通过SwissTargetPrediction服务器和人类基因数据库(GeneCards)获取该药对治疗CAA的成分-疾病靶标及其Uniprot ID。根据成分-疾病靶标与活性成分的作用关系,筛选出有效成分,根据成分-疾病靶标之间的相互作用关系筛选出5个核心靶标,并利用systemsDock在线工具进行分子对接验证。通过DAVID6.8在线工具进行成分-疾病靶标的基因本体论(GO)分析与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:筛选出黄芪-当归活性成分共20个,可作用于144个靶标,主要是调控PI3K-Akt信号通路和VEGF信号通路。结论:“黄芪-当归”可能是通过改善造血微环境、促进红细胞生成、增加血管新生等多方面调节造血功能治疗CAA。 展开更多
关键词 黄芪 当归 慢性再生障碍性贫血 网络药理学
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基于网络药理学的“柴胡-白术”药对治疗乳腺增生的作用机制探讨 被引量:13
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作者 吴代陆 +5 位作者 陈怡 陈宝艳 张璐 孙治中 孙伟鹏 黄梅 《中国药房》 CAS 北大核心 2019年第18期2525-2531,共7页
目的:挖掘"柴胡-白术"药对治疗乳腺增生的活性成分、靶点及通路,全面系统地探究其潜在作用机制。方法:基于网络药理学方法,通过TCMSP、DRAR-CPI、Genecards、OMIM等数据库检索获得"柴胡-白术"药对的主要活性成分及... 目的:挖掘"柴胡-白术"药对治疗乳腺增生的活性成分、靶点及通路,全面系统地探究其潜在作用机制。方法:基于网络药理学方法,通过TCMSP、DRAR-CPI、Genecards、OMIM等数据库检索获得"柴胡-白术"药对的主要活性成分及其治疗乳腺增生的潜在作用靶标;采用Cytoscape 3.6.0软件构建活性成分-潜在作用靶标网络和潜在作用靶标的相互作用网络,并筛选出5个潜在核心靶标,以分子对接法验证其与活性成分的结合亲和性。对潜在作用靶标进行基因本体和KEGG通路富集分析,获得关键通路,进而构建活性成分-潜在作用靶标-关键通路网络。结果:共获得"柴胡-白术"药对的活性成分17个、活性成分-潜在作用靶标47个。共获得核心靶标5个,包括丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1、α型蛋白激酶C、C型蛋白激酶、转化蛋白p21、磷脂酰肌醇4,5-二磷酸3-激酶催化亚基α亚型,pi3-激酶亚基α等;主要涉及5个信号通路,包括丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)通路、磷脂酰肌醇3-激酶/丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶通路、小G蛋白通路、雌激素通路、骨形态发生蛋白通路。结论:"柴胡-白术"药对治疗乳腺增生不仅具有通过多成分作用于多靶标的特点,而且会通过潜在作用靶标之间的相互影响发挥复杂的网络调节作用。 展开更多
关键词 柴胡 白术 药对 乳腺增生 网络药理学 靶标 通路 机制
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基于网络药理学的地榆-槐花药对治疗直肠癌作用机制的研究 被引量:12
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作者 陈芝强 陈怡 +3 位作者 林瑞婷 孙玲玲 林丽珠 《中药新药与临床药理》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期837-845,共9页
目的基于网络药理学,探究地榆-槐花药对治疗直肠癌可能的作用机制。方法利用TCMSP数据库,获取地榆-槐花药对的活性成分及活性成分所对应的靶标。通过Genecards数据库和OMIM数据库,收集与直肠癌相关的靶标,并与药物成分所对应的靶标相比... 目的基于网络药理学,探究地榆-槐花药对治疗直肠癌可能的作用机制。方法利用TCMSP数据库,获取地榆-槐花药对的活性成分及活性成分所对应的靶标。通过Genecards数据库和OMIM数据库,收集与直肠癌相关的靶标,并与药物成分所对应的靶标相比较,筛选出共同部分,作为药对的预测作用靶标。利用string数据库获取预测作用靶标之间的相互关系,根据相互关系大小筛选出核心靶标。通过Systems Dock WebSite网络服务器进行核心靶标与活性成分的分子对接。在DAVID数据库中进行核心靶标的KEGG通路富集分析和GO分类富集分析。利用Cytoscape 3.6.0软件,绘制'药物-成分-作用靶标'网络图、核心靶标相互作用网络图以及'成分-靶标-通路'网络关系图。利用Omicshare平台绘制直肠癌靶标与药对靶标匹配图、KEGG通路富集分析结果图、GO分类富集分析结果图、分子对接柱状图。结果收集到地榆-槐花药对的12个活性成分,包括β-谷甾醇(beta-sitosterol)、山奈酚(kaempferol)、槲皮素(quercetin)等,主要作用于Akt1、TP53、IL6、VEGFA、TNF 5个靶标,涉及PI3K-Akt、MAPK、TNF、RAS、Toll-like receptor等通路发挥治疗直肠癌的作用。结论本研究基于网络药理学的方法,初步探究了地榆-槐花药对治疗直肠癌可能的靶标和通路,其作用特点与中医药治疗疾病的特点相符合,可为地榆-槐花药对的临床应用提供参考。 展开更多
关键词 地榆 槐花 直肠癌 靶标 通路
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基于网络药理学探讨二至丸治疗肝细胞癌的作用机制 被引量:10
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作者 陈芝强 陈怡 +3 位作者 杨智华 钟崇 李菁 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期166-174,共9页
目的:基于网络药理学方法,探究二至丸治疗肝细胞癌(HCC)的可能作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)以及文献查阅,检索并收集二至丸成分--女贞子和墨旱莲的候选活性成分及其对应的靶标。利用Uni Prot数据库和人类... 目的:基于网络药理学方法,探究二至丸治疗肝细胞癌(HCC)的可能作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)以及文献查阅,检索并收集二至丸成分--女贞子和墨旱莲的候选活性成分及其对应的靶标。利用Uni Prot数据库和人类基因组注释数据库(Genecards)结果相比对,获得二至丸与肝细胞癌重合的潜在靶标基因。使用Cytoscape3.6.0软件构建二至丸的"候选成分-作用靶标"网络。使用omicshare平台将药物靶蛋白和疾病靶点相映射,并绘制Venn图。结合String数据库及Cytoscape软件中的Generate style from statistics工具,构建蛋白质相互作用网络。通过Systems Dock Web Site网络服务器与二至丸的活性成分进行分子对接。利用Database for Annotation,Visualization and Integration Discovery(DAVID)生物信息资源数据库,对二至丸的作用靶标进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析和GO分类富集分析。结果:共从二至丸中筛选得到21个候选活性成分,包括β-谷甾醇(beta-sitosterol),槲皮素(quercetin),木犀草素(luteolin),去甲蟛蜞菊内酯(demethylwedelolactone),山柰酚(kaempferol)等,和151个作用靶标,包括肿瘤坏死因子(TNF),血管内皮生长因子(VEGF),氨基端激酶(c-JUN),原癌基因(c-MYC),基质金属蛋白酶-9(MMP-9)等,主要涉及乙型肝炎(Hepatitis B),TNF,磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt),肿瘤抑制基因p53,Toll样受体家族(Toll-like receptor)等信号通路。结论:该研究基于网络药理学的方法预测了二至丸治疗肝细胞癌的可能的作用机制,为后续的深入研究提供了方向。 展开更多
关键词 二至丸 肝癌 网络药理学 靶标 信号通路
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基于网络药理学探究三七治疗冠心病的潜在作用机制 被引量:8
6
作者 黄桂锋 郑晓虹 +3 位作者 杨诏钧 林雪莹 李俊哲 《中国药房》 CAS 北大核心 2019年第14期1959-1965,共7页
目的:研究三七治疗冠心病的成分、靶点及通路,探讨其发挥治疗作用的潜在分子机制。方法:基于网络药理学方法,利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索获取三七的活性成分;利用DRAR-CPI服务器、GeneCards和DisGeNET数据库筛选出与三七治... 目的:研究三七治疗冠心病的成分、靶点及通路,探讨其发挥治疗作用的潜在分子机制。方法:基于网络药理学方法,利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索获取三七的活性成分;利用DRAR-CPI服务器、GeneCards和DisGeNET数据库筛选出与三七治疗冠心病相关的作用靶标;采用Cytoscape3.6.0软件构建三七有效成分-冠心病作用靶标网络;采用String数据库绘制作用靶标的相互作用网络,并运用NetworkAnalyzer工具计算靶标连接度,筛选出潜在核心靶标,然后通过SystemsDockWebSite服务器的分子对接验证核心靶标与有效成分的结合力;利用KEGG通路富集分析和基因本体(GO)分类富集分析获取三七治疗冠心病的重要信号通路和分子功能,并构建重要信号通路的“有效成分-作用靶标-信号通路”网络。结果:筛选出三七中治疗冠心病的5个有效成分(豆甾醇、β-谷固醇、人参皂苷rh2、槲皮素、三七皂苷r1),5个成分共作用于96个靶标并存在134种作用关系;5个核心靶标分别为蛋白激酶B(AKT)、白细胞介素6(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、c-JUN蛋白(c-JUN)、肝磷脂结合表皮生长因子(HB-EGF),其主要通过改变蛋白结合作用以及调控磷酯酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)、低氧诱导因子1(HIF-1)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)等信号通路来发挥治疗冠心病的作用。结论:三七治疗冠心病不仅是通过作用于多个靶标而发挥多种效果,而且可通过靶标之间的相互作用产生复杂的网络调节效果。 展开更多
关键词 三七 冠心病 网络药理学 成分 靶标 通路 作用机制
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基于网络药理学的补肾益心片治疗高血压分子机制研究 被引量:8
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作者 刘云娣 高佳珠 +4 位作者 杨智华 孙治中 李俊哲 温俊茂 《中国中医药信息杂志》 CAS CSCD 2019年第8期104-109,共6页
目的采用网络药理学方法分析补肾益心片治疗高血压的作用机制,为其临床与应用提供参考。方法检索中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)获取补肾益心片活性成分,运用DRAR-CPI服务器、GeneCards和OMIM等数据库筛选活性成分治疗高血压的作... 目的采用网络药理学方法分析补肾益心片治疗高血压的作用机制,为其临床与应用提供参考。方法检索中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)获取补肾益心片活性成分,运用DRAR-CPI服务器、GeneCards和OMIM等数据库筛选活性成分治疗高血压的作用靶点。采用Cytoscape3.6.0软件构建补肾益心片活性成分-高血压靶点网络。结合String数据库和Cytoscape的NetworkAnalyzer分析蛋白相互作用关系。采用Systems Dock Web Site进行活性成分与靶点分子对接。并进行GO分析、KEGG通路富集分析。结果筛选出补肾益心片活性成分30个,作用于62个靶点,主要通过调节肾素-血管紧张素系统、Toll样受体信号通路、PI3K-AKT信号通路和Jak-STAT信号通路等发挥治疗高血压的作用。结论本研究初步揭示了补肾益心片治疗高血压的多成分、多靶点作用机制,可为后续研究提供参考。 展开更多
关键词 补肾益心片 高血压 网络药理学 靶点 通路
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载骨碎补总黄酮磷酸钙骨水泥对骨缺损模型大鼠诱导膜中成骨细胞分化的影响及其机制研究 被引量:8
8
作者 董航 黄嘉华 +8 位作者 陈柏行 黄培镇 蔡群斌 陈超 纪树亮 孙伟鹏 黄尹滢 周琦石 《中国药房》 CAS 北大核心 2019年第10期1321-1327,共7页
目的:探究载骨碎补总黄酮磷酸钙骨水泥对骨缺损模型大鼠诱导膜成骨分化的作用及其机制。方法:分别以磷酸钙骨水泥(CPC)、聚甲基丙烯酸甲酯(PMMA)骨水泥为载体,以强骨胶囊内容物(有效成分为骨碎补总黄酮)制备载药CPC和载药PMMA骨水泥。选... 目的:探究载骨碎补总黄酮磷酸钙骨水泥对骨缺损模型大鼠诱导膜成骨分化的作用及其机制。方法:分别以磷酸钙骨水泥(CPC)、聚甲基丙烯酸甲酯(PMMA)骨水泥为载体,以强骨胶囊内容物(有效成分为骨碎补总黄酮)制备载药CPC和载药PMMA骨水泥。选取64只雄性SD大鼠,随机分为载药CPC组、载药PMMA骨水泥组、未载药CPC组、未载药PMMA骨水泥组,每组16只。分离大鼠股骨并行截骨,以制备骨缺损模型,然后分别植入相应骨水泥。造模4周后,各组大鼠切开并保护好诱导膜,取出骨水泥,植入自体松质骨。于造模后第4周对大鼠后肢骨进行X射线拍片;于造模后第4周和植骨后第6周时分别取大鼠骨缺损区诱导膜和新生骨,采用苏木精-伊红染色法观察诱导膜组织形态学,并测定新生骨组织的骨小梁宽度及成骨细胞数;采用免疫组化法检测诱导膜中人骨成型蛋白2(BMP-2)、血管内皮生长因子(VEGF)的蛋白表达水平;采用Western blotting法检测新生骨组织中Smad1、Smad4、Smad7的蛋白表达水平。结果:与其余3组比较,载药CPC组大鼠骨缺损区的骨水泥降解更明显,且可见诱导膜组织形成,骨缺损区域更小;诱导膜中毛细血管内皮细胞丰富、排列有序;新生骨组织中骨小梁宽度及成骨细胞数均显著增加(P<0.05);诱导膜中BMP-2、VEGF的蛋白表达水平和新生骨组织中Smad1、Smad4、Smad7的蛋白表达水平均显著升高(P<0.05)。结论:载骨碎补总黄酮CPC具有促进骨缺损模型大鼠诱导膜成骨的作用。这可能是通过激活BMP-2/Smad通路,从而调节成骨细胞分化;同时通过提高VEGF表达,促进血管内皮细胞分化,加快形成毛细血管网,从而促进骨愈合。 展开更多
关键词 骨碎补 总黄酮 磷酸钙骨水泥 诱导膜 骨缺损 成骨分化 机制 大鼠
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邹旭基于“年长则求之于府”治疗中老年冠心病经验
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作者 刘源 +2 位作者 尚宝令 孙海娇 姚耿圳 《广州中医药大学学报》 CAS 2023年第12期3158-3162,共5页
总结邹旭教授基于《黄帝内经》“年长则求之于府”的思想治疗中老年冠心病患者的临证经验。邹旭教授认为,中老年人因年龄增长而出现“脏虚”,“腑实”(“腑”包括六腑及气血之脉道)常伴随“脏虚”而出现,“腑实”的发生将导致气血津液... 总结邹旭教授基于《黄帝内经》“年长则求之于府”的思想治疗中老年冠心病患者的临证经验。邹旭教授认为,中老年人因年龄增长而出现“脏虚”,“腑实”(“腑”包括六腑及气血之脉道)常伴随“脏虚”而出现,“腑实”的发生将导致气血津液代谢障碍,气血津液代谢障碍是冠心病的重要原因。对此,邹旭教授提出通过“通腑”方法,使机体上下通畅,气血津液的生成及输布正常运行,从而达到治疗中老年冠心病的目的。临证实践中,可在通法的基础上合用归一饮(主要由制附子、干姜、炙甘草组成)促进元气生发,使六腑及气血之脉道通畅,促进气机升降,并通过益气温阳养阴,重视调节心之阴阳平衡。 展开更多
关键词 年长则求之于府 《黄帝内经》 冠心病 中老年 通腑 归一饮 益气温阳养阴 邹旭
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基于网络药理学探究心达康片治疗冠心病心绞痛的作用机制 被引量:3
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作者 关丹丽 刘云娣 +2 位作者 李俊哲 罗川晋 《中国中医急症》 2020年第8期1352-1355,1369,共5页
目的基于网络药理学探究心达康片治疗冠心病心绞痛的作用机制,为临床提供理论依据。方法挖掘文献获取心达康片的有效成分,利用中医药百科全书(ETCM)数据库和人类基因数据库(Gene Cards)获取疗效靶标,使用KOBAS 3.0服务器对靶标进行KEGG... 目的基于网络药理学探究心达康片治疗冠心病心绞痛的作用机制,为临床提供理论依据。方法挖掘文献获取心达康片的有效成分,利用中医药百科全书(ETCM)数据库和人类基因数据库(Gene Cards)获取疗效靶标,使用KOBAS 3.0服务器对靶标进行KEGG通路富集分析,构建"药物-靶标-通路"网络。利用STRING数据库进行对疗效靶标进行蛋白相互作用分析,并利用网络分析工具获取核心靶标。结果心达康片的有效成分为槲皮素、异鼠李素、山柰酚,疗效靶标共490个,其中159个靶标富集在脂质与脂蛋白代谢、PI3酶(PI3K)/丝氨酶/苏氨酸激酶(Akt)信号通路、血小板激活与聚集、HIF-1信号通路和Rap1信号通路这5条重要通路。5个核心靶标分别为INS、AKT1、MAPK3、GAPDH、IL-6。结论心达康片通过多成分、多靶标、多通路治疗冠心病心绞痛,通过抑制炎症、氧化损伤和细胞凋亡,减少冠脉痉挛,减轻冠脉狭窄,改善血供发挥疗效。 展开更多
关键词 冠心病 心绞痛 心达康片 网络药理学 作用机制
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502例岭南地区扩张型心肌病病人中医临床特征探析 被引量:3
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作者 罗川晋 张璐 +5 位作者 陈悦轩 曾芳冬 周小琦 陈桂仙 吴伟 《中西医结合心脑血管病杂志》 2020年第10期1509-1513,共5页
目的分析岭南地区扩张型心肌病病人的发病规律和中医临床特征。方法分析广州中医药大学第一附属医院嘉和HIS(hospital information system)数据库中502例扩张型心肌病病人一般信息、中医证候、发病与节气的关系、并发症和合并疾病4个方... 目的分析岭南地区扩张型心肌病病人的发病规律和中医临床特征。方法分析广州中医药大学第一附属医院嘉和HIS(hospital information system)数据库中502例扩张型心肌病病人一般信息、中医证候、发病与节气的关系、并发症和合并疾病4个方面。结果502例病人中,男337例,女165例;平均住院天数10.4 d,平均中药服用时间6.81 d;发病率最高的节气是谷雨和清明;中医证型主要有气阴两虚证(49.00%)、阳虚水泛证(20.32%)、心肾阳虚证(12.55%)等;治疗药物中补益剂(53.39%)与理血剂(51.79%)使用频率最高;最常见的并发症是心律失常(40.84%);最常见的合并疾病是高血压(46.61%),两种方剂联合使用支持度最高为理血剂+补益剂(37.27%)与温里剂+祛湿剂(10.24%)。结论在岭南地区,扩张型心肌病高发于春季,病人多在谷雨、清明两个时节入院,常合并高血压,并发症多为心律失常。其主要中医证型为气阴两虚证,补气、活血、祛瘀是治疗扩张型心肌病的主要方法。 展开更多
关键词 扩张型心肌病 岭南地区 中医证候 临床特征
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基于网络药理学的黄蛭口服液治疗心肌缺血再灌注损伤机制研究 被引量:2
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作者 李建功 +2 位作者 李雪山 罗川晋 李俊哲 《中国中医基础医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期1366-1370,共5页
目的:采用网络药理学方法探讨黄蛭口服液治疗心肌缺血再灌注损伤的可能作用机制。方法:利用中国系统药理学平台检索获取黄蛭口服液中主要药物活性成分,采用DRAR-CPI服务器、GeneCards和DisGeNET数据库筛选出与黄蛭口服液治疗心肌缺血再... 目的:采用网络药理学方法探讨黄蛭口服液治疗心肌缺血再灌注损伤的可能作用机制。方法:利用中国系统药理学平台检索获取黄蛭口服液中主要药物活性成分,采用DRAR-CPI服务器、GeneCards和DisGeNET数据库筛选出与黄蛭口服液治疗心肌缺血再灌注损伤相关的作用靶标,用Cytoscape 3.5.1软件构建黄蛭口服液活性成分-心肌缺血再灌注损伤靶标网络并进行相关分析,结合String数据库和Cytoscape 3.5.1的NetworkAnalyzer工具绘制蛋白相互作用关系,通过Systems Dock Web Site对作用靶点与活性成分进行分子对接,利用GO和KEGG富集分析研究黄蛭口服液的作用机制,并绘制活性成分-作用靶标-生物通路多维网络。结果:筛选出黄蛭口服液活性成分13个作用于73个靶标,主要通过改变蛋白结合作用和调节PI3K-AKT、HIF-1、TNF等信号通路来发挥治疗心肌缺血再灌注损伤的作用。结论:本研究初步验证了黄蛭口服液治疗心肌缺血再灌注损伤通过多种活性成分和靶点来发挥作用,为后续机制研究提供理论基础。 展开更多
关键词 黄蛭口服液 心肌缺血再灌注损伤 网络药理学 靶标 通路
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