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NME家族成员在乳腺癌中的表达和预后价值 被引量:5
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作者 郭金帅 南仿美 +4 位作者 吕明钰 高华 李思欣 谢龙祥 郭向前 《河南大学学报(医学版)》 CAS 2019年第4期249-257,共9页
〔目的〕通过探究NME基因家族成员表达水平和乳腺癌不同亚型、临床病理特征及预后的关系,以期阐明NME基因家族成员在乳腺癌中的潜在作用。〔方法〕利用Oncomine数据库.Kaplan-Meier plotter数据库、人类蛋白质图谱数据库(The Human Prot... 〔目的〕通过探究NME基因家族成员表达水平和乳腺癌不同亚型、临床病理特征及预后的关系,以期阐明NME基因家族成员在乳腺癌中的潜在作用。〔方法〕利用Oncomine数据库.Kaplan-Meier plotter数据库、人类蛋白质图谱数据库(The Human Protein Atlas)分析乳腺癌NME所有家族成员的mRNA、蛋白质表达及其与乳腺癌患者整体生存率的相关性等内容。〔结果〕(1)NME1、NME2、NME3和NME4 mRNA在大多数癌症中显著高表达,而NME5则低表达。NME1、NME2、NME3、NME8、NME9和NME10在乳腺癌中高表达。(2)NME1、NME2低表达和NME3、NME5、NME7高表达乳腺癌患者的整体生存率较好。对于不同亚型乳腺癌患者,不同NME家族成员有不同的预后表现。(3)NME2高表达和NME3、NME5、NME9及NME8低表达分别与不同淋巴结状态和p53状态的乳腺癌患者整体生存率恶化有关。〔结论〕(1)NME1、NME2、NME3、NME5和NME7可以作为乳腺癌的预后生物标志物。(2)NME1、NME3、NME5、NME7和NME9可以作为不同乳腺癌亚型的预后生物标志物,其中NME1低表达和NME5 mRNA水平高表达是Luminal A型乳腺癌良好预后标志物,而NME3、NME5 mRNA水平低表达和NME9 mRNA水平高表达水平高表达对于Basal like型乳腺癌有较好的预后作用,NME7 mRNA水平高表达对于HER2+型乳腺癌有较好的预后作用。(3)NME家族成员在乳腺癌组织中的mRNA表达水平和患者预后、病理分级、淋巴结状态和P53状态相关。 展开更多
关键词 NME家族 乳腺癌 表达水平 预后价值
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混合Filter与改进自适应GA的特征选择方法 被引量:4
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作者 邱云飞 高华 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2021年第11期95-102,共8页
针对高维度小样本数据在特征选择时出现的维数灾难和过拟合的问题,提出一种混合Filter模式与Wrapper模式的特征选择方法(ReFS-AGA)。该方法结合ReliefF算法和归一化互信息,评估特征的相关性并快速筛选重要特征;采用改进的自适应遗传算法... 针对高维度小样本数据在特征选择时出现的维数灾难和过拟合的问题,提出一种混合Filter模式与Wrapper模式的特征选择方法(ReFS-AGA)。该方法结合ReliefF算法和归一化互信息,评估特征的相关性并快速筛选重要特征;采用改进的自适应遗传算法,引入最优策略平衡特征多样性,同时以最小化特征数和最大化分类精度为目标,选择特征数作为调节项设计新的评价函数,在迭代进化过程中高效获得最优特征子集。在基因表达数据上利用不同分类算法对简化后的特征子集分类识别,实验结果表明,该方法有效消除了不相关特征,提高了特征选择的效率,与ReliefF算法和二阶段特征选择算法mRMR-GA相比,在取得最小特征子集维度的同时平均分类准确率分别提高了11.18个百分点和4.04个百分点。 展开更多
关键词 特征选择 Filter模式 RELIEFF算法 归一化互信息 自适应遗传算法
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教学用模拟患者血清标本的制备与评价 被引量:3
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作者 高华 王晓明 +2 位作者 张丽丽 吴大畅 沙珊珊 《中国医药导报》 CAS 2016年第5期25-27,45,共4页
目的获得具有典型生化特征、教学用的模拟患者血清标本,并确定其贮存温度和保质时间。方法制备1%的酵母提取物溶液作为基底液。向基底液中添加14.0 mmol/L的葡萄糖和10.0 mmol/L的三酰甘油(TG),制备模拟的糖尿病血清标本;向基底液中添加... 目的获得具有典型生化特征、教学用的模拟患者血清标本,并确定其贮存温度和保质时间。方法制备1%的酵母提取物溶液作为基底液。向基底液中添加14.0 mmol/L的葡萄糖和10.0 mmol/L的三酰甘油(TG),制备模拟的糖尿病血清标本;向基底液中添加10.0 mmol/L的TG,制备模拟的高甘油三酯血症血清标本;向基底液中添加28.0 g/L的白蛋白和10.0 mmol/L的TG,制备模拟的肾病综合征血清标本;向基底液中添加28.0 g/L的白蛋白和60 U/L的谷草转氨酶,制备模拟的肝硬化患者血清标本。测定各标本在室温、4℃和-20℃条件下,存放1、7、30 d后各生化指标的变化情况。结果模拟的患者血清标本外观与临床血清标本基本一致。模拟的糖尿病血清标本具有葡萄糖、TG升高的特征;模拟的高甘油三酯血症血清标本具有TG升高的特征;模拟的肾病综合征血清标本具有TG升高、白蛋白降低的特征;模拟的肝硬化血清标本具有谷草转氨酶升高、白蛋白降低的特征。4种标本均可在-20℃保存30 d,除了模拟肾病综合征的白蛋白以外,其余各指标的变化差异均无统计学意义(P>0.05)。结论获得了4种可供实验教学使用的模拟患者血清标本,确定了它们的最适贮存温度和保质时间。 展开更多
关键词 生物化学 实验教学 血清标本 贮存温度 保质时间
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