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白菜bZIP转录因子基因家族应答春化反应关键基因表达分析
被引量:
4
1
作者
马
李广
张贺龙
+7 位作者
庞小可
王浩
李广
汪承刚
袁凌云
侯金锋
唐小燕
陈国户
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2022年第3期765-774,共10页
为研究白菜(Brassica rapa)碱性亮氨酸拉链(Basic leucine zipper,bZIP)转录因子家族基因(BrbZIP)的相关功能,通过生物信息学分析技术,鉴定全基因组的BrbZIP基因家族成员,并对其染色体分布、进化关系、表达模式及其应答春化反应等进行...
为研究白菜(Brassica rapa)碱性亮氨酸拉链(Basic leucine zipper,bZIP)转录因子家族基因(BrbZIP)的相关功能,通过生物信息学分析技术,鉴定全基因组的BrbZIP基因家族成员,并对其染色体分布、进化关系、表达模式及其应答春化反应等进行了分析。白菜bZIP转录因子基因家族共有118个成员,在染色体上不均等分布。白菜组织转录组分析结果显示,大部分BrbZIP基因在根、茎、叶、花及荚中均有较高的表达丰度,且具有组织表达特异性;春化反应转录组、荧光定量PCR及相关基因互作网络分析结果表明,白菜bZIP基因家族中应答春化反应相关基因上调与下调表达基因数量差异不大,相互之间存在复杂的互作网络,其中4个成员(Bra039631、Bra020620、Bra004550与Bra020471)是应答春化反应的中心节点。
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关键词
白菜
bZIP转录因子
基因家族
春化反应
生物信息学分析
下载PDF
职称材料
题名
白菜bZIP转录因子基因家族应答春化反应关键基因表达分析
被引量:
4
1
作者
马
李广
张贺龙
庞小可
王浩
李广
汪承刚
袁凌云
侯金锋
唐小燕
陈国户
机构
安徽农业大学园艺学院
安徽省皖江蔬菜产业研究院
安徽农业大学皖西南综合试验站
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2022年第3期765-774,共10页
基金
国家自然科学基金项目(31801853)
国家大学生创新创业基金项目(202110364080)
+1 种基金
安徽省大学生创新创业基金项目(S202010364238,S202010364239)
安徽省博士后基金项目(2019B320)。
文摘
为研究白菜(Brassica rapa)碱性亮氨酸拉链(Basic leucine zipper,bZIP)转录因子家族基因(BrbZIP)的相关功能,通过生物信息学分析技术,鉴定全基因组的BrbZIP基因家族成员,并对其染色体分布、进化关系、表达模式及其应答春化反应等进行了分析。白菜bZIP转录因子基因家族共有118个成员,在染色体上不均等分布。白菜组织转录组分析结果显示,大部分BrbZIP基因在根、茎、叶、花及荚中均有较高的表达丰度,且具有组织表达特异性;春化反应转录组、荧光定量PCR及相关基因互作网络分析结果表明,白菜bZIP基因家族中应答春化反应相关基因上调与下调表达基因数量差异不大,相互之间存在复杂的互作网络,其中4个成员(Bra039631、Bra020620、Bra004550与Bra020471)是应答春化反应的中心节点。
关键词
白菜
bZIP转录因子
基因家族
春化反应
生物信息学分析
Keywords
Brassica rapa
bZIP transcription factor
gene family
vernalization
bioinformatics analysis
分类号
S634.3 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
白菜bZIP转录因子基因家族应答春化反应关键基因表达分析
马
李广
张贺龙
庞小可
王浩
李广
汪承刚
袁凌云
侯金锋
唐小燕
陈国户
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2022
4
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