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基于Web的北方粳稻种质资源信息系统开发 被引量:14
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作者 苏京平 刘学军 +3 位作者 马忠 孙林静 冯向阳 李素敏 《天津农业科学》 CAS 2004年第2期51-52,共2页
论述了建立粳稻种质资源信息系统的必要性及国内外种质数据库的发展现状;提出了利用ActiveServerPagesASP技术建立基于Web方式的北方粳稻信息系统的设想,并简要介绍了其开发步骤。
关键词 WEB 北方粳稻 种质资源 信息系统开发
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一种简单快速的DNA提取方法在水稻上的应用 被引量:15
2
作者 孙林静 马忠 +4 位作者 苏京平 刘学军 王春敏 王胜军 闫双勇 《天津农学院学报》 CAS 2007年第3期1-4,共4页
采用了一种简单快速的DNA提取方法来提取水稻DNA,并用提取的DNA进行了PCR扩增。结果表明,该方法提取DNA不需要碾磨、离心等步骤,通过简单的加热、稀释等操作便能制备100个PCR反应的DNA模板,1h能提取96个样品的DNA。本研究成功地将该方... 采用了一种简单快速的DNA提取方法来提取水稻DNA,并用提取的DNA进行了PCR扩增。结果表明,该方法提取DNA不需要碾磨、离心等步骤,通过简单的加热、稀释等操作便能制备100个PCR反应的DNA模板,1h能提取96个样品的DNA。本研究成功地将该方法用于水稻SSR分析、白叶枯抗病基因Xa21的分子标记辅助育种和不育系纯度鉴定等方面。 展开更多
关键词 水稻 DNA提取 聚合酶链式反应
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一种同时适用于水稻种子和叶片的简单快速DNA提取方法 被引量:14
3
作者 闫双勇 苏京平 +6 位作者 王胜军 孙林静 马忠 王春敏 李素敏 刘敏 刘学军 《中国稻米》 2011年第5期11-13,共3页
本文报道了一种同时适用于水稻种子和叶片的简单快速DNA提取方法。该方法通过简单的碾磨、加热、离心等步骤便能制备适合PCR的DNA模板。用该方法单人每小时可以提取48个样品的DNA模板。本研究用该方法提取了132个水稻种子DNA样品及1096... 本文报道了一种同时适用于水稻种子和叶片的简单快速DNA提取方法。该方法通过简单的碾磨、加热、离心等步骤便能制备适合PCR的DNA模板。用该方法单人每小时可以提取48个样品的DNA模板。本研究用该方法提取了132个水稻种子DNA样品及1096个不同生长阶段的水稻叶片DNA样品,用13对PCR引物进行扩增,种子DNA样品PCR扩增成功率为91.0%,3个不同时期取材的叶片DNA样品PCR扩增成功率均在97.0%以上。该方法提取的DNA也可以进行高分辨率熔解曲线分析。 展开更多
关键词 水稻 DNA提取 聚合酶链式反应
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磷细菌筛选及其对土壤无机磷转化的影响 被引量:13
4
作者 于群英 马忠 +1 位作者 汪建飞 卫林 《水土保持学报》 CSCD 北大核心 2012年第5期103-107,共5页
从潮土、水稻土、砂姜黑土和石灰土等土壤的植物根际土壤和根中分离了86株磷细菌,通过液体摇瓶培养3d,培养液水溶磷含量为4.2~387.3mg/L,水溶磷含量与培养液pH呈显著负相关(R2=0.621 6)。用筛选出的1株磷细菌(HCW115)进行玉米盆栽试验... 从潮土、水稻土、砂姜黑土和石灰土等土壤的植物根际土壤和根中分离了86株磷细菌,通过液体摇瓶培养3d,培养液水溶磷含量为4.2~387.3mg/L,水溶磷含量与培养液pH呈显著负相关(R2=0.621 6)。用筛选出的1株磷细菌(HCW115)进行玉米盆栽试验,结果表明,磷细菌处理的玉米干物重和吸磷量与对照相比分别增加了37.5%和40.2%,达到显著差异。磷细菌对土壤Al-P、Fe-P和O-P转化无明显影响,但可以促进土壤Ca2-P、Ca8-P和Ca10-P向有效磷转化而被玉米吸收,与原土相比,Ca2-P、Ca8-P和Ca10-P含量分别减少了74.9%,12.3%和1.51%。 展开更多
关键词 磷细菌 土壤 玉米 无机磷组分
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我国转基因水稻研究的现状 被引量:11
5
作者 苏京平 闫双勇 +4 位作者 孙林静 刁金男 马忠 王胜军 刘学军 《天津农业科学》 CAS 2007年第4期7-11,共5页
综合分析了我国转基因技术在水稻抗虫、抗病、抗除草剂、抗逆境和高产优质等方面的育种研究进展及存在问题,并对中国今后转基因水稻的发展提出了建议。
关键词 水稻 转基因 抗虫 抗病 育种
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影响天津杂交粳稻发展的几个主要问题 被引量:12
6
作者 马忠 刘学军 +1 位作者 孙林静 刘瑞符 《天津农业科学》 CAS 1998年第4期55-56,共2页
对困扰天津杂交粳稻发展的3个主要问题的表现特点、产生原因及相应对策进行了简要分析。指出在有效解决存在问题基础上,天津水稻界已选出一批优良的杂粳组合。几年后,这批组合将大面积应用于生产。
关键词 杂交粳稻 品质 制种 粳稻 杂种优势 产量
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水稻抗条纹叶枯病基因Stvb-i的分子标记检测 被引量:9
7
作者 孙林静 马忠 +4 位作者 苏京平 刘学军 王春敏 王胜军 闫双勇 《天津农业科学》 CAS 2007年第3期9-11,共3页
为了能将与条纹叶枯病基因Stvb-i完全连锁的分子标记ST10用于分子标记辅助育种中,利用该标记检测了47份水稻材料,同时对材料进行了田间抗性调查。在5个亲本材料及7个育种中间材料中扩增出了ST10特异条带,这些材料田间表现高抗条纹叶枯... 为了能将与条纹叶枯病基因Stvb-i完全连锁的分子标记ST10用于分子标记辅助育种中,利用该标记检测了47份水稻材料,同时对材料进行了田间抗性调查。在5个亲本材料及7个育种中间材料中扩增出了ST10特异条带,这些材料田间表现高抗条纹叶枯病;4份高抗条纹叶枯病的材料中未扩出特异条带,这些材料中可能有其它抗性基因。 展开更多
关键词 水稻 条纹叶枯病 分子标记辅助选择
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水稻籼粳交F_2、F_6群体遗传连锁图谱的比较分析 被引量:8
8
作者 梁永书 彭勇 +4 位作者 叶少平 李平 孙林静 马忠 李艳萍 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第9期1110-1120,共11页
以部分基因组和全基因组测序水稻籼稻(O sativa L.indica)品种"培矮64S"(Pei'ai64S♀)和粳稻(O sativa L.japonica)品种"日本晴"(Nipponbare♂)为构图亲本,选取F2代180个株系为作图群体,构建含138个微卫星位点... 以部分基因组和全基因组测序水稻籼稻(O sativa L.indica)品种"培矮64S"(Pei'ai64S♀)和粳稻(O sativa L.japonica)品种"日本晴"(Nipponbare♂)为构图亲本,选取F2代180个株系为作图群体,构建含138个微卫星位点的水稻遗传连锁图谱,覆盖基因组2046.2cM,平均图距17.1cM,即F2图谱;采用单粒传法获得F2:6代330个株系,用相同的多态性标记分析F6群体,构建含92个标记连锁图谱,覆盖基因组2563.5cM,平均图距27.86cM,即F6图谱;F2、F6图谱在连锁群数、定位标记数、标记的位置顺序、遗传图距、平均图距等方面发生了较大变化,并对产生这些差异的原因进行了初步分析。 展开更多
关键词 水稻 微卫星标记 F2 F6遗传图谱 比较分析 偏分离
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我国杂交粳稻恢复系的遗传多样性 被引量:10
9
作者 闫双勇 马忠 +2 位作者 范俊山 张春和 李素敏 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2011年第10期1-4,共4页
对我国杂交粳稻38个恢复系进行了亲缘系数分析,并探讨了其遗传多样性。结果表明:约12%的材料间的亲缘系数(COP)值为0,COP值变异范围为0~0.75,平均值仅为0.09。经COP聚类分析供试材料可聚为4个类群:第一类群共有24个恢复系,核心亲本为C... 对我国杂交粳稻38个恢复系进行了亲缘系数分析,并探讨了其遗传多样性。结果表明:约12%的材料间的亲缘系数(COP)值为0,COP值变异范围为0~0.75,平均值仅为0.09。经COP聚类分析供试材料可聚为4个类群:第一类群共有24个恢复系,核心亲本为C57;第二类群共有4个恢复系,都是IR8的衍生系;第三类群只有超优1号1个材料;第四类群包含9个材料,均是香晴的衍生系。分析认为,多数材料恢复系均是C57或者IR8的衍生系,遗传背景单一。研究结果对恢复系改良具有指导意义。 展开更多
关键词 杂交粳稻 恢复系 亲缘系数 遗传多样性
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微型反向重复转座元件(MITE)靶区域扩增多态性:一种基于MITE的分子标记方法在水稻及其他植物上的应用 被引量:8
10
作者 马忠 苏京平 +6 位作者 孙林静 刘学军 王春敏 王胜军 曾斌 梁永书 闫双勇 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期459-463,共5页
利用根据水稻微型反向重复转座元件(miniature inverted repeat transposable element,MITE)序列设计的特异引物,以及靶区域扩增多态性(target region amplification polymorphism,TRAP)方法中的随机引物及扩增程序对不同的水稻... 利用根据水稻微型反向重复转座元件(miniature inverted repeat transposable element,MITE)序列设计的特异引物,以及靶区域扩增多态性(target region amplification polymorphism,TRAP)方法中的随机引物及扩增程序对不同的水稻材料进行PCR扩增来检测MITE侧翼为基因区域的多态性,称之为微型反向重复转座元件靶区域扩增多态性(MITE-TRAP)。每次扩增能产生1条或多条清晰条带,条带的大小为100~1500bp,可在1.5%的琼脂糖凝胶上分离,有较好的可重复性,并发现了不同水稻品种间的多态性条带。进一步用基于水稻预测的MITE序列设计的特异引物对来自棉花、番茄及拟南芥的DNA样品进行MITE-TRAP扩增,均能成功扩增出条带,显示这种方法可以直接在其他植物中应用。还进一步讨论了该方法的优点及其可能的应用。 展开更多
关键词 微型反向重复转座元件 靶区域扩增多态性 分子标记 引物设计 水稻 棉花 番茄 拟南芥
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黄山地区红豆杉中产紫杉醇内生真菌的分离和筛选 被引量:8
11
作者 马忠 +2 位作者 胡丰林 樊美珍 李增智 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期1624-1627,共4页
从黄山地区红豆杉中分离得到107株内生真菌,利用薄层层析(TLC)方法对107株内生真菌的发酵代谢物进行了初筛,首次筛出8株可产紫杉醇或其类似物的菌株。再通过高效液相色谱(HPLC)对其作了进一步分析,发现有1株内生真菌菌株发酵代谢物的吸... 从黄山地区红豆杉中分离得到107株内生真菌,利用薄层层析(TLC)方法对107株内生真菌的发酵代谢物进行了初筛,首次筛出8株可产紫杉醇或其类似物的菌株。再通过高效液相色谱(HPLC)对其作了进一步分析,发现有1株内生真菌菌株发酵代谢物的吸收峰与紫杉醇标准品吸收峰保留时间一致。同时结合以中国仓鼠卵巢CHO细胞株作为肿瘤细胞模型,用Resazurin法检测生长抑制率,对经筛选出的1株内生真菌次生代谢产物进行体外抗肿瘤活性试验,该菌株的代谢物对CHO细胞的抑制率高达71.28%。通过对该菌株的显微形态观察,从菌丝、孢子的形态和产孢子的特征等初步判定HQ-24是曲霉(Aspergillus sp.)。 展开更多
关键词 内生真菌 紫杉醇 肿瘤细胞模型 分离鉴定
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水稻根际高效解磷菌菌株的筛选 被引量:7
12
作者 祝凌云 马忠 +3 位作者 唐欣昀 常慧萍 韦兵 姚丽娟 《安徽农学通报》 2008年第15期43-44,共2页
以选择性培养基从水稻根际分离出81株解磷细菌,再利用FITC标记的稻胚凝集素从中筛选出21株能够和稻胚凝集素发生特异性作用的解磷菌株。将这些菌株在培养液中振荡培养7d,分别取10ml培养液进行消煮,测定其含磷量;选择解磷能力强的7个菌... 以选择性培养基从水稻根际分离出81株解磷细菌,再利用FITC标记的稻胚凝集素从中筛选出21株能够和稻胚凝集素发生特异性作用的解磷菌株。将这些菌株在培养液中振荡培养7d,分别取10ml培养液进行消煮,测定其含磷量;选择解磷能力强的7个菌株在平板上进行水稻栽培试验,结果表明有2株解磷菌株对水稻生长有明显的促生效果,鲜重增产幅度超过45%,可作为研制微生物肥料的出发菌株。 展开更多
关键词 稻胚凝集素 荧光标记 解磷细菌 促生效果
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粳型不育系津3A的开花习性初步观察 被引量:8
13
作者 刘学军 苏京平 +3 位作者 孙林静 马忠 闫双勇 闵元军 《天津农业科学》 CAS 2005年第2期28-29,共2页
对粳型不育系津3A的日开颖比率、午前花率等开花习性进行了初步研究,结果表明:津3A开花历期约为7d,始花后第2天即进入盛花期;每日11:30—12:30为盛花时间,比C418约迟30min,在制种中应该注意适当喷施花时调节剂,提早津3A花时,使父母本盛... 对粳型不育系津3A的日开颖比率、午前花率等开花习性进行了初步研究,结果表明:津3A开花历期约为7d,始花后第2天即进入盛花期;每日11:30—12:30为盛花时间,比C418约迟30min,在制种中应该注意适当喷施花时调节剂,提早津3A花时,使父母本盛花期、盛花时相遇,提高制种产量。 展开更多
关键词 不育系 粳稻 午前花率 花时 花期
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病毒诱导的基因沉默的发展及在植物生物逆境上的应用 被引量:8
14
作者 姚丙晨 孙玥 +3 位作者 孙林静 马忠 苏京平 刘学军 《中国农学通报》 2016年第9期131-136,共6页
病毒诱导的基因沉默(Virus-indcued gene silencing,VIGS)技术是指带一段包基因序列的重组病毒侵染植物,引起植物同源基因沉默与表型变异,进而通过表型变异进行基因功能分析的方法,是近年发展起来的植物基因功能研究的新技术。为了进一... 病毒诱导的基因沉默(Virus-indcued gene silencing,VIGS)技术是指带一段包基因序列的重组病毒侵染植物,引起植物同源基因沉默与表型变异,进而通过表型变异进行基因功能分析的方法,是近年发展起来的植物基因功能研究的新技术。为了进一步探讨VIGS应用策略,笔者归纳了VIGS的分子机理、VIGS的载体开发和VIGS技术在植物生物逆境方面的研究应用3个方面近些年的研究进展,得出了VIGS在植物生物逆境方面的问题及应用价值。 展开更多
关键词 病毒诱导的基因沉默 病毒载体 生物逆境
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磷细菌筛选及其对苗期玉米生长的影响 被引量:7
15
作者 于群英 陈世勇 +2 位作者 马忠 汪建飞 卫林 《生态环境学报》 CSCD 北大核心 2012年第7期1257-1261,共5页
从潮土、水稻土、砂姜黑土、石灰土上植物根际土壤和根中分离了86株磷细菌,通过NBRIP液体摇瓶培养3 d,培养液水溶磷质量浓度为4.2~387.3 mg.L^-1,水溶磷质量浓度与培养液pH呈显著负相关(r^2=0.621 6)。筛选出3株磷细菌进行玉米盆栽试... 从潮土、水稻土、砂姜黑土、石灰土上植物根际土壤和根中分离了86株磷细菌,通过NBRIP液体摇瓶培养3 d,培养液水溶磷质量浓度为4.2~387.3 mg.L^-1,水溶磷质量浓度与培养液pH呈显著负相关(r^2=0.621 6)。筛选出3株磷细菌进行玉米盆栽试验,结果表明,1株磷细菌处理的玉米干物质量和吸磷量与对照(处理4)相比无显著差异,2株磷细菌处理的玉米干物质量和吸磷量与对照相比有明显增加,干物质量增加了19.6%~37.5%,吸磷量增加了22.7%~40.2%,其中编号为HCW115解磷菌株的效果相当于施用无机磷(P)10 mg.kg^-1处理。 展开更多
关键词 磷细菌 土壤 玉米
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生物化学课程与实验教学方法改革初探 被引量:7
16
作者 周成 孙玉军 +1 位作者 朱琳 马忠 《安徽农学通报》 2016年第8期146-147,共2页
生物化学是一门在分子水平上揭示生物体的化学组成与结构的学科。由于生物化学是从化学和生理学中脱离并兴起的一门学科,其理论知识都比较抽象,生物体中的代谢反应十分复杂且密切关联,导致了不同专业的学生普遍反映生物化学是一门较难... 生物化学是一门在分子水平上揭示生物体的化学组成与结构的学科。由于生物化学是从化学和生理学中脱离并兴起的一门学科,其理论知识都比较抽象,生物体中的代谢反应十分复杂且密切关联,导致了不同专业的学生普遍反映生物化学是一门较难理解和掌握的课程。然而,目前生物化学课程以及实验教学存在一些教学内容、方法和手段滞后等问题。因此,必须对传统的生物化学教学方法进行进一步的优化。该文通过课程和实验教学方法等一系列改革,探索并发展一种新的生物化学教学模式和课程体系,对培养学生学习生物化学理论知识和实验操作技能具有重要的意义。 展开更多
关键词 生物化学 实验教学 教学方法 改革
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植物SNP数据库及转化CAPS的方法 被引量:4
17
作者 刘学军 闫双勇 +4 位作者 刘小红 苏京平 马忠 孙林静 卢百关 《分子植物育种》 CAS CSCD 2006年第3期443-447,共5页
单核苷酸多态性(SNP)在植物基因组中广泛存在,基于SNP的分子标记也正越来越广泛地应用到植物基因定位、图位克隆及分子标记辅助育种等方面。模式植物拟南芥和水稻的全基因组序列测定已经完成,拟南芥有两种生态型完成了全序列测定,水稻... 单核苷酸多态性(SNP)在植物基因组中广泛存在,基于SNP的分子标记也正越来越广泛地应用到植物基因定位、图位克隆及分子标记辅助育种等方面。模式植物拟南芥和水稻的全基因组序列测定已经完成,拟南芥有两种生态型完成了全序列测定,水稻有两个品种完成了全序列测定。许多植物有来自不同品种或不同组织器官或生长发育阶段的大量的EST序列。这些序列是植物SNP开发的重要资源。利用生物信息学手段对全基因组序列或EST序列进行分析已经形成了许多SNP位点数据库,这些数据库的建立为基于SNP的基因功能研究及分子标记开发提供了宝贵的资源。本文对植物SNP位点开发涉及的数据库资源及已经形成的SNP位点数据库进行了总结,并讨论了将SNP位点转化成CAPS或dCAPS标记的方法和相应的工具软件。 展开更多
关键词 单核苷酸多态性 SNP数据库 酶切扩增多态性序列
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粳型三系杂交稻亲本开花习性研究 被引量:7
18
作者 王胜军 王广峰 +7 位作者 范俊山 张春和 闫双勇 童继平 马忠 苏京平 孙林静 刘学军 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2009年第12期12-14,17,共4页
研究了4个杂交粳稻不育系、15个恢复系的开花习性,结果表明:不育系的开花历期平均为7.0d,而恢复系的开花历期平均2.5d,二者差别达3.5d;不育系的午前花率平均为58.8%,而恢复系的午前花率平均为73.9%;多数恢复系的开花高峰... 研究了4个杂交粳稻不育系、15个恢复系的开花习性,结果表明:不育系的开花历期平均为7.0d,而恢复系的开花历期平均2.5d,二者差别达3.5d;不育系的午前花率平均为58.8%,而恢复系的午前花率平均为73.9%;多数恢复系的开花高峰出现在开花后第2~3d,而不育系却出现在开花后4~5d(中作59A除外)。除不育系3A外,其它不育系的日开花高峰均晚于恢复系。不同的恢复系之间在开花习性上也存在差异。研究粳稻不育系和恢复系的开花习性,能够有效调控其亲本的花期、花时,提高制种产量。 展开更多
关键词 杂交粳稻 不育系 恢复系 开花习性
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LuxAB标记的N2106-L在小麦根圈的定植动态 被引量:6
19
作者 常慧萍 曹媛媛 +3 位作者 马忠 甘旭华 姚丽娟 唐欣昀 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2009年第3期213-216,共4页
目的研究小麦PGPR(植物根际促生菌)菌株的个体生态学及其在小麦根圈的定植动态。方法采用三亲本杂交法将发光酶基因luxAB转人具有固氮能力的小麦根际促生菌Azotobacter N2106菌株中,获得标记菌株N2106-L,将标记菌株接种到灭菌和非... 目的研究小麦PGPR(植物根际促生菌)菌株的个体生态学及其在小麦根圈的定植动态。方法采用三亲本杂交法将发光酶基因luxAB转人具有固氮能力的小麦根际促生菌Azotobacter N2106菌株中,获得标记菌株N2106-L,将标记菌株接种到灭菌和非灭菌的黄褐土、红壤和黄潮土中研究其存活状况,采用根盒试验追踪标记菌株在小麦根圈的定植动态。结果标记菌株N2106-L具有发光活性和对km、str、tet三种抗生素的抗性,且具有较好的遗传稳定性。N2106-L在灭菌土壤中的数量稍高于非灭菌土壤;在3种土壤中的数量依次为:黄褐土〉黄潮土〉红壤。N2106-L在小麦根表定植密度大于根际定植密度;在小麦根际,小麦播种10d时标记菌株在0-2cm深度根际土壤定植达到最大值(2.17±0.25)×10^6CFU/g土,20d时在2-4cm深度的根际土壤中达到最高定植水平(3.92±0.47)×10^5CFU/g土;在小麦根表,标记菌株在小麦播种10d时在所有深度的根段均达到最高定植水平,0-2cm根段定植密度为(3.60±0.60)×10^6CFU/g鲜根,12cm以下根段达到(2.78±0.56)×10^4CFU/g鲜根。结论标记菌株随着根的伸长不断向根尖方向扩散,且较为稳定地在小麦根圈定植,研究结果为小麦PGPR菌株的应用提供了可靠实验数据。 展开更多
关键词 luxAB基因 三亲本杂交 N2106-L菌株 小麦根圈 定植动态 基因标记
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水稻抽穗期控制候选基因的SNP/InDel多态性分析 被引量:4
20
作者 闫双勇 谭振波 +4 位作者 刘学军 苏京平 马忠 孙林静 卢百关 《分子植物育种》 CAS CSCD 2005年第3期335-341,共7页
抽穗期是水稻的一种重要农艺性状,但其遗传控制机理还不清楚。本文利用数据库搜索的方法,搜索并分析了30个与拟南芥光周期调控途径花期控制基因同源的水稻基因。利用水稻多态性数据库,得到了发生在这些基因以及Hd6、Ehd1、OsSOC1上的820... 抽穗期是水稻的一种重要农艺性状,但其遗传控制机理还不清楚。本文利用数据库搜索的方法,搜索并分析了30个与拟南芥光周期调控途径花期控制基因同源的水稻基因。利用水稻多态性数据库,得到了发生在这些基因以及Hd6、Ehd1、OsSOC1上的820个SNP及191个InDel位点。分析表明,这些位点不是平均分布到每个基因上。SNP/InDel含量较高的基因存在SNP/InDel的热点片段。14.1%的SNP位点,及7%的InDel位点分布在基因的编码区。本文也分析了侯选基因侧翼5Kb范围内的SNP/InDel多态性位点。按照侧翼多态性位点数目的分布可以将侯选基因分成4种类型,即两侧保守型、两侧热点型、单侧热点型、一侧热点一侧保守型。 展开更多
关键词 SNP 抽穗期 多态性分析 候选基因 侯选基因 数据库搜索 多态性位点 农艺性状 控制机理 水稻基因 控制基因 调控途径 热点 光周期 拟南芥 820 分析表 分布 编码区 遗传 花期
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