目的克隆细粒棘球绦虫糖转运体早期响应脱水蛋白(Sugar transporter early responsive to dehydration 6 of Echinococcus granulosus,EgERD6)基因序列,并进行生物信息学分析。方法从细粒棘球绦虫中通过RT-PCR方法扩增EgERD6基因全长序...目的克隆细粒棘球绦虫糖转运体早期响应脱水蛋白(Sugar transporter early responsive to dehydration 6 of Echinococcus granulosus,EgERD6)基因序列,并进行生物信息学分析。方法从细粒棘球绦虫中通过RT-PCR方法扩增EgERD6基因全长序列,结合生物信息学方法预测EgERD6蛋白分子的生物学特性,并进行系统发育、同源序列比对以及多蛋白相互作用关系分析。结果克隆获得EgERD6基因全长序列,共1470 bp,编码488 aa蛋白,该蛋白具有主要协同转运蛋白超家族(Major facilitator superfamily,MFS)特征结构域。生物信息学分析该蛋白为疏水性蛋白,二级结构以α螺旋为主,约占50.92%。氨基酸序列比对显示该蛋白与多房棘球绦虫的同源性为97.48%,与其他物种同源性较低。系统进化分析显示,细粒棘球绦虫ERD6与人ERD6亲缘关系较远。该蛋白可与细粒棘球绦虫内啡肽-A3、网格蛋白、肝细胞生长因子调节的酪氨酸激酶底物等多种蛋白质共同参与内吞作用和囊泡介导转运等生物学过程。结论成功克隆了EgERD6基因,生物信息学分析其编码蛋白含有MFS保守的功能结构域,可能参与虫体多种重要物质及能量代谢过程,为囊型棘球蚴病的致病机制研究和新的临床治疗方案的探索奠定了基础。展开更多
腺苷酸活化蛋白激酶(AMP-activated protein kinase,AMPK)是一种AMP依赖性的蛋白激酶,负责调节细胞能量的合成与分解,是细胞生长、繁殖和自噬的关键调节剂。AMPK及其信号通路在病毒、细菌和寄生虫等感染中发挥了重要作用,有望成为一种...腺苷酸活化蛋白激酶(AMP-activated protein kinase,AMPK)是一种AMP依赖性的蛋白激酶,负责调节细胞能量的合成与分解,是细胞生长、繁殖和自噬的关键调节剂。AMPK及其信号通路在病毒、细菌和寄生虫等感染中发挥了重要作用,有望成为一种药物新靶点。本文将对近年来AMPK信号通路在感染性疾病中的研究展开综述。展开更多
目的克隆细粒棘球绦虫腺苷酸活化蛋白激酶β(AMP-activated protein kinaseβof Echinococcus granulosus sensu stricto,EgAMPKβ)基因全长序列,并进行生物信息学分析。方法提取细粒棘球绦虫原头蚴总RNA,利用PCR技术克隆EgAMPKβ基因...目的克隆细粒棘球绦虫腺苷酸活化蛋白激酶β(AMP-activated protein kinaseβof Echinococcus granulosus sensu stricto,EgAMPKβ)基因全长序列,并进行生物信息学分析。方法提取细粒棘球绦虫原头蚴总RNA,利用PCR技术克隆EgAMPKβ基因全长序列,并采用生物信息学技术对该基因编码蛋白的理化性质、磷酸化位点、抗原表位、结构域、二级结构、三级结构、多序列分析和亲缘性比较等进行生物信息学分析。结果EgAMPKβ的cDNA全长981 bp,编码326个氨基酸,相对分子质量为35.23585×10^(3),属于亲水性蛋白,无信号肽序列和跨膜区,具有22个丝氨酸磷酸化位点,15个苏氨酸磷酸化位点,含有5个酪氨酸磷酸化位点;4个B细胞抗原表位,具有碳水化合物结合模块(Carbohydrate-binding module,CBM)和αγ亚单位相互作用域(αγ-subunits interaction domain,αγ-SID)。EgAMPKβ基因与多房棘球绦虫和人AMPKβ基因序列相似性分别为98.47%和39.57%,与多房棘球绦虫、微口膜壳绦虫同属于绦虫纲,与人、猩猩和小鼠等哺乳纲动物的进化关系较远。结论成功克隆了EgAMPKβ基因,生物信息学分析其编码蛋白具有保守的功能结构域,对细粒棘球绦虫的能量代谢具有调控作用,为进一步了解细粒棘球绦虫能量代谢机制及其新型抗包虫病药物靶点开发提供了研究基础。展开更多
文摘目的克隆细粒棘球绦虫糖转运体早期响应脱水蛋白(Sugar transporter early responsive to dehydration 6 of Echinococcus granulosus,EgERD6)基因序列,并进行生物信息学分析。方法从细粒棘球绦虫中通过RT-PCR方法扩增EgERD6基因全长序列,结合生物信息学方法预测EgERD6蛋白分子的生物学特性,并进行系统发育、同源序列比对以及多蛋白相互作用关系分析。结果克隆获得EgERD6基因全长序列,共1470 bp,编码488 aa蛋白,该蛋白具有主要协同转运蛋白超家族(Major facilitator superfamily,MFS)特征结构域。生物信息学分析该蛋白为疏水性蛋白,二级结构以α螺旋为主,约占50.92%。氨基酸序列比对显示该蛋白与多房棘球绦虫的同源性为97.48%,与其他物种同源性较低。系统进化分析显示,细粒棘球绦虫ERD6与人ERD6亲缘关系较远。该蛋白可与细粒棘球绦虫内啡肽-A3、网格蛋白、肝细胞生长因子调节的酪氨酸激酶底物等多种蛋白质共同参与内吞作用和囊泡介导转运等生物学过程。结论成功克隆了EgERD6基因,生物信息学分析其编码蛋白含有MFS保守的功能结构域,可能参与虫体多种重要物质及能量代谢过程,为囊型棘球蚴病的致病机制研究和新的临床治疗方案的探索奠定了基础。
文摘腺苷酸活化蛋白激酶(AMP-activated protein kinase,AMPK)是一种AMP依赖性的蛋白激酶,负责调节细胞能量的合成与分解,是细胞生长、繁殖和自噬的关键调节剂。AMPK及其信号通路在病毒、细菌和寄生虫等感染中发挥了重要作用,有望成为一种药物新靶点。本文将对近年来AMPK信号通路在感染性疾病中的研究展开综述。
