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具有独立轮轻轨列车的脱轨问题及轮缘侧面磨耗研究
被引量:
11
1
作者
沈钢
王浩川
韩明
盛
《铁道学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2006年第4期49-53,共5页
针对目前具有独立轮转向架的低地板面轻轨列车所发生的脱轨问题和轮缘严重磨耗问题,从轮轨系统的基本关系出发,分析了传统刚性轮对与独立轮对的导向机理和特点,建立了具有独立轮特点的计算机仿真模型,采用MATLAB/SIMULINK仿真工具计算...
针对目前具有独立轮转向架的低地板面轻轨列车所发生的脱轨问题和轮缘严重磨耗问题,从轮轨系统的基本关系出发,分析了传统刚性轮对与独立轮对的导向机理和特点,建立了具有独立轮特点的计算机仿真模型,采用MATLAB/SIMULINK仿真工具计算模拟了实际脱轨现象,并对各种可能导致脱轨和轮缘磨耗的因素进行了分析。对可以控制的因素,如踏面外形、轮轨润滑、运行速度、护轨间隙等进行了综合治理,使轮轨磨耗大为降低,抑制了脱轨事故,获得良好的经济和社会效益。在设计、运用和维护3个方面,提出了如何提高脱轨安全性和轮缘减磨的系统性建议。
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关键词
独立轮
脱轨
轮缘磨耗
轻轨列车
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职称材料
砷暴露诱导小鼠心肌细胞程序性坏死作用初探
2
作者
李瑞华
原晓红
+3 位作者
韩明
盛
胡鑫
李雪华
马艳琴
《中华地方病学杂志》
CAS
北大核心
2023年第6期453-458,共6页
目的探讨砷暴露对小鼠心肌细胞程序性坏死通路和炎症反应的影响。方法将60只雄性C57BL/6J小鼠,采用随机数字表法按体重分为对照组(C组)及低、中、高剂量砷暴露组(L、M、H组),每组15只,分别饮用去离子水配制的0.00、0.15、1.50、15.00 m...
目的探讨砷暴露对小鼠心肌细胞程序性坏死通路和炎症反应的影响。方法将60只雄性C57BL/6J小鼠,采用随机数字表法按体重分为对照组(C组)及低、中、高剂量砷暴露组(L、M、H组),每组15只,分别饮用去离子水配制的0.00、0.15、1.50、15.00 mg/L三氧化二砷(As_(2)O_(3))溶液,暴露周期为12周。采用苏木素-伊红(HE)和Masson三色染色光镜下观察心脏组织病理学变化;透射电镜下观察心肌细胞超微结构改变;实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测心脏组织程序性坏死通路相关基因[受体相互作用蛋白(RIP)1、3和混合谱系激酶域样蛋白(MLKL)]及炎症基因[肿瘤坏死因子(TNF)-α和白细胞介素(IL)-6]mRNA表达水平;蛋白免疫印迹法检测心脏组织RIP1、RIP3蛋白表达水平。结果光镜下组织病理学检测结果显示,M、H组呈现心肌细胞肿胀、炎性细胞浸润、胶原纤维增生等改变。透射电镜检测结果显示,M、H组呈现肌原纤维断裂,肌节Z线断裂,线粒体排列混乱,线粒体肿胀空泡化,嵴断裂甚至消失等改变。与C组(1.00±0.00)比较,H组心脏组织RIP1 mRNA表达水平较高(1.41±0.06,P<0.05);M、H组RIP3(1.29±0.14、1.56±0.08),MLKL(1.23±0.05、1.36±0.07),TNF-α(2.20±0.10、2.23±0.18)及IL-6(1.87±0.16、1.63±0.15)mRNA表达水平均较高(均P<0.05)。M、H组RIP1(0.43±0.04、0.50±0.04)和RIP3(0.68±0.02、0.84±0.05)蛋白表达水平均高于C组(0.25±0.01、0.45±0.04,均P<0.05)。结论亚慢性砷暴露可引起小鼠心肌坏死、心肌纤维化等病理改变,诱导心肌细胞发生程序性坏死和炎症反应。
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关键词
砷中毒
心肌细胞
程序性坏死
原文传递
基于转录组测序分析砷暴露影响小鼠认知功能的机制
3
作者
原晓红
胡鑫
+2 位作者
杨鸣宇
韩明
盛
马艳琴
《生态毒理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期217-224,共8页
砷暴露引起认知障碍的问题已引起科学家的广泛关注。本研究基于转录组测序技术研究砷影响小鼠神经行为学的潜在分子机制。雄性C57BL/6J小鼠随机分为4组:对照组(C组)、低剂量(L组)、中剂量(M组)和高剂量砷暴露组(H组),分别饮含0、0.15、...
砷暴露引起认知障碍的问题已引起科学家的广泛关注。本研究基于转录组测序技术研究砷影响小鼠神经行为学的潜在分子机制。雄性C57BL/6J小鼠随机分为4组:对照组(C组)、低剂量(L组)、中剂量(M组)和高剂量砷暴露组(H组),分别饮含0、0.15、1.5和15 mg·L^(-1)As_(2)O_(3)的去离子水。暴露12周后,采用新事物识别实验评价小鼠认知功能。利用转录组测序获得高剂量组和对照组大脑前额皮质差异表达基因,进行GO分析和KEGG分析,并采用实时荧光定量PCR法验证基因表达水平。构建蛋白互作网络并筛选其中最紧密连接的模块以获得枢纽基因。结果显示,砷暴露组小鼠探索指数和对新旧事物的分辨指数与对照组相比显著降低。共筛选出181个差异表达基因,GO分析得到包括行为学、多细胞生物过程的调节、学习或记忆、认知等217条显著富集条目。KEGG分析获得包括胆碱能突触、多巴胺突触、神经营养素信号通路等38条通路。筛选蛋白互作网络中最紧密连接的模块共获得7个枢纽基因,分别为fos、tac1、gad2、drd2、ppp1r1b、chat和drd1a。实时荧光定量PCR验证了测序结果的可靠性。砷暴露显著降低了小鼠的认知功能。本研究筛选出的关键基因和通路为深入研究砷影响小鼠神经行为学改变的机制提供了线索。
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关键词
砷
小鼠
神经行为学
前额皮质
转录组
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职称材料
三阴性乳腺癌相关miRNA筛选及其靶基因的生物信息学分析
被引量:
2
4
作者
胡鑫
麻慧慈
+3 位作者
韩明
盛
原晓红
杨鸣宇
马艳琴
《生物技术进展》
2022年第2期296-304,共9页
应用生物信息学方法筛选并分析三阴性乳腺癌(triple-negativebreastcancer,TNBC)相关miRNA及其靶基因,为TNBC的研究提供潜在的分子靶点。采用GEO2R分析TNBC相关miRNA芯片数据集,筛选差异表达倍数最大的5个上调和5个下调miRNA。miRWalk、...
应用生物信息学方法筛选并分析三阴性乳腺癌(triple-negativebreastcancer,TNBC)相关miRNA及其靶基因,为TNBC的研究提供潜在的分子靶点。采用GEO2R分析TNBC相关miRNA芯片数据集,筛选差异表达倍数最大的5个上调和5个下调miRNA。miRWalk、TargetScan和miRDB预测靶基因并进行Veen分析取交集。利用DAVID对靶基因进行GO富集分析和KEGG通路分析。利用STRING数据库构建蛋白互作网络,并结合Cytoscape构建miRNA-靶基因调控网络,从而筛选出关键的miRNA及其关键靶基因。利用GEPIA2数据库对靶基因进行生存分析。GEO2R筛选出486个差异miRNA,上调和下调的miRNA分别有298个和188个。对差异倍数最大的5个上调和5个下调miRNA的靶基因进行富集分析显示,靶基因主要参与ErbB信号通路、癌症中转录调控紊乱和cGMP-PKG信号通路等。miRNA-靶基因调控网络显示,表达上调的关键miRNA为miR-611,其关键靶基因为CDC27、UBE2D2、UBR1、SPSB1、HERC2和RLIM;表达下调的关键miRNA为miR-1205,其关键靶基因为WSB1、FBXL8、UBE2W、PTPN11、ARF6、DNAJC6和COPS2。生存分析表明,UBR1(P=0.0072)和PTPN11(P=0.029)表达上调可显著降低TNBC患者的整体生存率。经筛选获得的关键miRNA及其关键靶基因可作为潜在分子标记物用于TNBC的早期诊断、治疗靶点选择和预后判断,并为后续的研究提供参考依据。
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关键词
三阴性乳腺癌
GEO数据库
微小RNA
靶基因
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职称材料
胚胎期砷暴露对成年小鼠海马神经炎症反应的影响
被引量:
2
5
作者
李瑞华
韩明
盛
+1 位作者
李雪华
马艳琴
《山西医药杂志》
CAS
2019年第14期1647-1650,共4页
目的研究胚胎期砷暴露对成年小鼠海马组织神经炎症反应相关基因表达的影响,探讨砷影响认知发育的毒理学机制。方法7周龄雌性和雄性ICR小鼠以2∶1的比例合笼交配,受孕小鼠随机分为4组,对照组饮用去离子水,低、中、高砷暴露组分别饮用含0....
目的研究胚胎期砷暴露对成年小鼠海马组织神经炎症反应相关基因表达的影响,探讨砷影响认知发育的毒理学机制。方法7周龄雌性和雄性ICR小鼠以2∶1的比例合笼交配,受孕小鼠随机分为4组,对照组饮用去离子水,低、中、高砷暴露组分别饮用含0.15mg/L,1.5mg/L,15mg/L三氧化二砷的去离子水,攻毒处理至仔鼠出生,试验组母鼠停止砷暴露。各组分别选12只雌性仔鼠,于65日龄麻醉处死并分离海马组织,Trizol法提取总RNA,采用实时荧光定量-聚合酶链反应(qRT-PCR)技术检测相关基因的表达。结果与对照组相比,低浓度砷暴露组小鼠海马组织同种异体移植炎性因子-1(Aif-1)的表达显著升高(P<0.01);胶质纤维酸性蛋白(GFAP)的表达在低、中、高浓度砷暴露组均升高;CC趋化因子配体3(CCL3)的表达在中浓度砷暴露组中显著升高(P<0.05);N-甲基-D-天冬氨酸受体(NMDAR)亚基NR1的表达在中浓度砷暴露组中显著降低(P<0.05);NR2B的表达在中浓度砷暴露组中显著降低(P<0.01)。结论胚胎期砷暴露会引起小鼠成年期海马组织胶质细胞活化继而释放大量促炎症因子,并降低NMDAR有关亚基的表达,这是砷影响小鼠认知发育的分子机制之一。
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关键词
砷暴露
砷中毒
认知障碍
小鼠
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职称材料
基于GEO数据库筛选乳腺癌分子标志物
被引量:
2
6
作者
韩明
盛
麻慧慈
+3 位作者
胡鑫
李瑞华
李冬
马艳琴
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第2期170-176,共7页
目的:运用生物信息学方法筛选与乳腺癌发生发展有关的差异表达基因,并对其进行相关生物学分析以获得乳腺癌相关分子标志物。方法:从GEO数据库中寻找出3个乳腺癌相关芯片数据集,使用GEO2R筛选差异表达基因并作Venn图获取交集差异共表达...
目的:运用生物信息学方法筛选与乳腺癌发生发展有关的差异表达基因,并对其进行相关生物学分析以获得乳腺癌相关分子标志物。方法:从GEO数据库中寻找出3个乳腺癌相关芯片数据集,使用GEO2R筛选差异表达基因并作Venn图获取交集差异共表达基因。通过DAVID进行GO功能富集分析和KEGG信号通路分析。在STRING网站中对差异表达基因构建蛋白质-蛋白质相互用(protein-protein interaction,PPI)网络图,并通过MCODE分析PPI中最重要的模块,其中评分≥10的鉴定为枢纽基因(Hub基因)。利用UCSC对Hub基因进行层次聚类分析,利用cBioPortal构建Hub基因的共表达网络和生存曲线。结果:筛选出3个数据集的差异共表达基因65个。通过分析获得CTNNB1、CDKN1A、CXCR4、RUNX3、CASP8、TNFRSF10B、CFLAR和NRG1等共8个Hub基因,这些基因在细胞黏附、细胞增殖、凋亡调控等方面有重要作用。聚类分析表明,基因CTNNB1、CFLAR、NRG1和CXCR4表达的改变与乳腺癌的发生有关。生存曲线分析表明,CDKN1A表达的升高使得乳腺癌患者总体生存率显著降低(P<0.01)。结论:本研究中鉴定的Hub基因可作为乳腺癌分子标志物,为乳腺癌的诊断和治疗靶点选择及预后判断提供参考。
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关键词
乳腺癌
基因表达数据库
分子标志物
差异表达基因
枢纽基因
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职称材料
亚慢性砷暴露对小鼠心肌细胞凋亡的影响
被引量:
1
7
作者
李瑞华
韩明
盛
+1 位作者
胡鑫
马艳琴
《山西农业科学》
2020年第6期923-926,共4页
为研究砷暴露对小鼠心肌组织损伤及细胞凋亡的影响,试验选用40只5周龄C57BL/6小鼠,随机分为4组(对照组饮用去离子水,低、中、高剂量砷暴露组分别饮用含0.15、1.50、15.00 mg/L三氧化二砷的去离子水),90 d后检测各组心脏脏器系数、血清...
为研究砷暴露对小鼠心肌组织损伤及细胞凋亡的影响,试验选用40只5周龄C57BL/6小鼠,随机分为4组(对照组饮用去离子水,低、中、高剂量砷暴露组分别饮用含0.15、1.50、15.00 mg/L三氧化二砷的去离子水),90 d后检测各组心脏脏器系数、血清心肌酶谱活力、心肌细胞凋亡率及凋亡通路相关基因的表达。结果表明,不同浓度砷暴露组的心脏脏器系数均有所下降,其中,中、高剂量组与对照组相比差异显著;与对照组相比,中、高剂量组血清肌酸激酶(CK)、谷草转氨酶(AST)、乳酸脱氢酶(LDH)、α-羟基丁酸脱氢酶(HBDH)活力显著升高,低剂量组各项指标变化不明显。TUNEL法检测显示,对照组中未发现有凋亡心肌细胞,各剂量砷暴露组心内膜和心外膜下均可见不同数量的凋亡心肌细胞分布。与对照组相比,心肌组织Bax的表达在中、高剂量组显著上调;Bcl-2的表达在中、高剂量组显著下调;Caspase-3的表达在高剂量组显著上调。亚慢性砷暴露对小鼠心肌造成特异性损伤,且随着染毒剂量的增加损伤程度加重;诱导心肌细胞凋亡是砷暴露致心脏毒性的重要机制。
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关键词
砷暴露
心肌
细胞凋亡
损伤
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职称材料
基于GEO数据库筛选胃癌分子标志物
被引量:
1
8
作者
胡鑫
高悦
+4 位作者
田欣涓
韩明
盛
李瑞华
付西峰
马艳琴
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第8期903-910,共8页
目的:运用生物信息学方法结合基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)筛选参与胃癌发生发展的关键基因,以获得用于胃癌诊断、治疗靶标选择及预后判断相关分子标志物。方法:从GEO数据库中下载与胃癌(gastric cancer,GC)相关芯片数...
目的:运用生物信息学方法结合基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)筛选参与胃癌发生发展的关键基因,以获得用于胃癌诊断、治疗靶标选择及预后判断相关分子标志物。方法:从GEO数据库中下载与胃癌(gastric cancer,GC)相关芯片数据集,筛选差异表达基因(differentially expressed gene,DEG),对DEG做功能富集分析,构建蛋白互作网络(proteinprotein interaction network,PPI),筛选关键基因(key gene),进而构建共表达网络、生存曲线以及层次聚类分析。结果:共筛选出261个GC相关DEG,通过分析获得14个关键基因,分别为PLOD1、PLOD3、COL1A1、COL1A2、COL2A1、COL3A1、COL4A1、COL4A2、COL8A1、COL12A1、COL15A1、ITGA2、LUM、SERPINH1。关键基因主要参与胶原纤维的组织、细胞外基质的组织、细胞外结构的组织、皮肤形态发生、胶原的合成及血管的发育等生物学过程。生存曲线分析表明,基因COL3A1(P=0.0241)表达的改变显著降低了胃癌患者整体生存率;基因ITGA2(P=0.0679)的表达改变也显示与GC患者的无病生存率降低有关。与正常胃组织相比,层次聚类分析表明,GC组织中基因PLOD1、PLOD3、COL3A1、ITGA2、COL1A2、COL1A1、COL4A1、LUM、COL12A1、SERPINH1、COL8A1表达上调。结论:经筛选获得的关键基因可作为潜在分子标志物用于GC的早期诊断、治疗靶点选择和预后判断,并为后续的研究提供参考。
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关键词
胃癌
分子标志物
GEO数据库
差异表达基因
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职称材料
题名
具有独立轮轻轨列车的脱轨问题及轮缘侧面磨耗研究
被引量:
11
1
作者
沈钢
王浩川
韩明
盛
机构
同济大学铁道与城市轨道交通研究院
大连现代轨道交通有限公司技术处
出处
《铁道学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2006年第4期49-53,共5页
文摘
针对目前具有独立轮转向架的低地板面轻轨列车所发生的脱轨问题和轮缘严重磨耗问题,从轮轨系统的基本关系出发,分析了传统刚性轮对与独立轮对的导向机理和特点,建立了具有独立轮特点的计算机仿真模型,采用MATLAB/SIMULINK仿真工具计算模拟了实际脱轨现象,并对各种可能导致脱轨和轮缘磨耗的因素进行了分析。对可以控制的因素,如踏面外形、轮轨润滑、运行速度、护轨间隙等进行了综合治理,使轮轨磨耗大为降低,抑制了脱轨事故,获得良好的经济和社会效益。在设计、运用和维护3个方面,提出了如何提高脱轨安全性和轮缘减磨的系统性建议。
关键词
独立轮
脱轨
轮缘磨耗
轻轨列车
Keywords
IRWs
derailment
flange wear
tramway
分类号
U270.33 [机械工程—车辆工程]
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职称材料
题名
砷暴露诱导小鼠心肌细胞程序性坏死作用初探
2
作者
李瑞华
原晓红
韩明
盛
胡鑫
李雪华
马艳琴
机构
山西农业大学生命科学学院生物科学系
新乡学院生命科学与基础医学学院
出处
《中华地方病学杂志》
CAS
北大核心
2023年第6期453-458,共6页
基金
国家自然科学基金(31302155、U1904127)
山西省自然科学基金(201901D111232)
山西省研究生教育教学改革课题(2022YJJG097)。
文摘
目的探讨砷暴露对小鼠心肌细胞程序性坏死通路和炎症反应的影响。方法将60只雄性C57BL/6J小鼠,采用随机数字表法按体重分为对照组(C组)及低、中、高剂量砷暴露组(L、M、H组),每组15只,分别饮用去离子水配制的0.00、0.15、1.50、15.00 mg/L三氧化二砷(As_(2)O_(3))溶液,暴露周期为12周。采用苏木素-伊红(HE)和Masson三色染色光镜下观察心脏组织病理学变化;透射电镜下观察心肌细胞超微结构改变;实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测心脏组织程序性坏死通路相关基因[受体相互作用蛋白(RIP)1、3和混合谱系激酶域样蛋白(MLKL)]及炎症基因[肿瘤坏死因子(TNF)-α和白细胞介素(IL)-6]mRNA表达水平;蛋白免疫印迹法检测心脏组织RIP1、RIP3蛋白表达水平。结果光镜下组织病理学检测结果显示,M、H组呈现心肌细胞肿胀、炎性细胞浸润、胶原纤维增生等改变。透射电镜检测结果显示,M、H组呈现肌原纤维断裂,肌节Z线断裂,线粒体排列混乱,线粒体肿胀空泡化,嵴断裂甚至消失等改变。与C组(1.00±0.00)比较,H组心脏组织RIP1 mRNA表达水平较高(1.41±0.06,P<0.05);M、H组RIP3(1.29±0.14、1.56±0.08),MLKL(1.23±0.05、1.36±0.07),TNF-α(2.20±0.10、2.23±0.18)及IL-6(1.87±0.16、1.63±0.15)mRNA表达水平均较高(均P<0.05)。M、H组RIP1(0.43±0.04、0.50±0.04)和RIP3(0.68±0.02、0.84±0.05)蛋白表达水平均高于C组(0.25±0.01、0.45±0.04,均P<0.05)。结论亚慢性砷暴露可引起小鼠心肌坏死、心肌纤维化等病理改变,诱导心肌细胞发生程序性坏死和炎症反应。
关键词
砷中毒
心肌细胞
程序性坏死
Keywords
Arsenic poisoning
Myocardial cell
Necroptosis
分类号
R114 [医药卫生—卫生毒理学]
原文传递
题名
基于转录组测序分析砷暴露影响小鼠认知功能的机制
3
作者
原晓红
胡鑫
杨鸣宇
韩明
盛
马艳琴
机构
山西农业大学生命科学学院
出处
《生态毒理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期217-224,共8页
基金
山西省自然科学基金项目(201901D111232)
国家自然科学基金项目(31302155)。
文摘
砷暴露引起认知障碍的问题已引起科学家的广泛关注。本研究基于转录组测序技术研究砷影响小鼠神经行为学的潜在分子机制。雄性C57BL/6J小鼠随机分为4组:对照组(C组)、低剂量(L组)、中剂量(M组)和高剂量砷暴露组(H组),分别饮含0、0.15、1.5和15 mg·L^(-1)As_(2)O_(3)的去离子水。暴露12周后,采用新事物识别实验评价小鼠认知功能。利用转录组测序获得高剂量组和对照组大脑前额皮质差异表达基因,进行GO分析和KEGG分析,并采用实时荧光定量PCR法验证基因表达水平。构建蛋白互作网络并筛选其中最紧密连接的模块以获得枢纽基因。结果显示,砷暴露组小鼠探索指数和对新旧事物的分辨指数与对照组相比显著降低。共筛选出181个差异表达基因,GO分析得到包括行为学、多细胞生物过程的调节、学习或记忆、认知等217条显著富集条目。KEGG分析获得包括胆碱能突触、多巴胺突触、神经营养素信号通路等38条通路。筛选蛋白互作网络中最紧密连接的模块共获得7个枢纽基因,分别为fos、tac1、gad2、drd2、ppp1r1b、chat和drd1a。实时荧光定量PCR验证了测序结果的可靠性。砷暴露显著降低了小鼠的认知功能。本研究筛选出的关键基因和通路为深入研究砷影响小鼠神经行为学改变的机制提供了线索。
关键词
砷
小鼠
神经行为学
前额皮质
转录组
Keywords
arsenic
mice
neuroethology
prefrontal cortex
transcriptome
分类号
X171.5 [环境科学与工程—环境科学]
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职称材料
题名
三阴性乳腺癌相关miRNA筛选及其靶基因的生物信息学分析
被引量:
2
4
作者
胡鑫
麻慧慈
韩明
盛
原晓红
杨鸣宇
马艳琴
机构
山西农业大学生命科学学院
出处
《生物技术进展》
2022年第2期296-304,共9页
基金
山西省自然科学基金项目(201901D111232)
山西省研究生教育创新项目(2020SY197)。
文摘
应用生物信息学方法筛选并分析三阴性乳腺癌(triple-negativebreastcancer,TNBC)相关miRNA及其靶基因,为TNBC的研究提供潜在的分子靶点。采用GEO2R分析TNBC相关miRNA芯片数据集,筛选差异表达倍数最大的5个上调和5个下调miRNA。miRWalk、TargetScan和miRDB预测靶基因并进行Veen分析取交集。利用DAVID对靶基因进行GO富集分析和KEGG通路分析。利用STRING数据库构建蛋白互作网络,并结合Cytoscape构建miRNA-靶基因调控网络,从而筛选出关键的miRNA及其关键靶基因。利用GEPIA2数据库对靶基因进行生存分析。GEO2R筛选出486个差异miRNA,上调和下调的miRNA分别有298个和188个。对差异倍数最大的5个上调和5个下调miRNA的靶基因进行富集分析显示,靶基因主要参与ErbB信号通路、癌症中转录调控紊乱和cGMP-PKG信号通路等。miRNA-靶基因调控网络显示,表达上调的关键miRNA为miR-611,其关键靶基因为CDC27、UBE2D2、UBR1、SPSB1、HERC2和RLIM;表达下调的关键miRNA为miR-1205,其关键靶基因为WSB1、FBXL8、UBE2W、PTPN11、ARF6、DNAJC6和COPS2。生存分析表明,UBR1(P=0.0072)和PTPN11(P=0.029)表达上调可显著降低TNBC患者的整体生存率。经筛选获得的关键miRNA及其关键靶基因可作为潜在分子标记物用于TNBC的早期诊断、治疗靶点选择和预后判断,并为后续的研究提供参考依据。
关键词
三阴性乳腺癌
GEO数据库
微小RNA
靶基因
Keywords
triple-negative breast cancer
GEO database
miRNA
target gene
分类号
R737.9 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
胚胎期砷暴露对成年小鼠海马神经炎症反应的影响
被引量:
2
5
作者
李瑞华
韩明
盛
李雪华
马艳琴
机构
山西农业大学生命科学学院
河南科技学院动物科学学院
出处
《山西医药杂志》
CAS
2019年第14期1647-1650,共4页
基金
国家自然科学基金(青年)项目(31302155)
文摘
目的研究胚胎期砷暴露对成年小鼠海马组织神经炎症反应相关基因表达的影响,探讨砷影响认知发育的毒理学机制。方法7周龄雌性和雄性ICR小鼠以2∶1的比例合笼交配,受孕小鼠随机分为4组,对照组饮用去离子水,低、中、高砷暴露组分别饮用含0.15mg/L,1.5mg/L,15mg/L三氧化二砷的去离子水,攻毒处理至仔鼠出生,试验组母鼠停止砷暴露。各组分别选12只雌性仔鼠,于65日龄麻醉处死并分离海马组织,Trizol法提取总RNA,采用实时荧光定量-聚合酶链反应(qRT-PCR)技术检测相关基因的表达。结果与对照组相比,低浓度砷暴露组小鼠海马组织同种异体移植炎性因子-1(Aif-1)的表达显著升高(P<0.01);胶质纤维酸性蛋白(GFAP)的表达在低、中、高浓度砷暴露组均升高;CC趋化因子配体3(CCL3)的表达在中浓度砷暴露组中显著升高(P<0.05);N-甲基-D-天冬氨酸受体(NMDAR)亚基NR1的表达在中浓度砷暴露组中显著降低(P<0.05);NR2B的表达在中浓度砷暴露组中显著降低(P<0.01)。结论胚胎期砷暴露会引起小鼠成年期海马组织胶质细胞活化继而释放大量促炎症因子,并降低NMDAR有关亚基的表达,这是砷影响小鼠认知发育的分子机制之一。
关键词
砷暴露
砷中毒
认知障碍
小鼠
Keywords
Arsenic exposure
Arsenic poisoning
Cognition disorders
Mice
分类号
R114 [医药卫生—卫生毒理学]
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职称材料
题名
基于GEO数据库筛选乳腺癌分子标志物
被引量:
2
6
作者
韩明
盛
麻慧慈
胡鑫
李瑞华
李冬
马艳琴
机构
山西农业大学生命科学学院
山西白求恩医院乳腺外科
出处
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第2期170-176,共7页
基金
山西省“136”兴医工程资助项目(No.2019XY010)。
文摘
目的:运用生物信息学方法筛选与乳腺癌发生发展有关的差异表达基因,并对其进行相关生物学分析以获得乳腺癌相关分子标志物。方法:从GEO数据库中寻找出3个乳腺癌相关芯片数据集,使用GEO2R筛选差异表达基因并作Venn图获取交集差异共表达基因。通过DAVID进行GO功能富集分析和KEGG信号通路分析。在STRING网站中对差异表达基因构建蛋白质-蛋白质相互用(protein-protein interaction,PPI)网络图,并通过MCODE分析PPI中最重要的模块,其中评分≥10的鉴定为枢纽基因(Hub基因)。利用UCSC对Hub基因进行层次聚类分析,利用cBioPortal构建Hub基因的共表达网络和生存曲线。结果:筛选出3个数据集的差异共表达基因65个。通过分析获得CTNNB1、CDKN1A、CXCR4、RUNX3、CASP8、TNFRSF10B、CFLAR和NRG1等共8个Hub基因,这些基因在细胞黏附、细胞增殖、凋亡调控等方面有重要作用。聚类分析表明,基因CTNNB1、CFLAR、NRG1和CXCR4表达的改变与乳腺癌的发生有关。生存曲线分析表明,CDKN1A表达的升高使得乳腺癌患者总体生存率显著降低(P<0.01)。结论:本研究中鉴定的Hub基因可作为乳腺癌分子标志物,为乳腺癌的诊断和治疗靶点选择及预后判断提供参考。
关键词
乳腺癌
基因表达数据库
分子标志物
差异表达基因
枢纽基因
Keywords
breast cancer
Gene Expression Omnibus(GEO)
molecular marker
differentially expressed gene(DEG)
Hub gene
分类号
R737.9 [医药卫生—肿瘤]
R730.43 [医药卫生—临床医学]
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职称材料
题名
亚慢性砷暴露对小鼠心肌细胞凋亡的影响
被引量:
1
7
作者
李瑞华
韩明
盛
胡鑫
马艳琴
机构
山西农业大学生命科学学院
出处
《山西农业科学》
2020年第6期923-926,共4页
基金
山西省自然科学基金项目(201901D111232)。
文摘
为研究砷暴露对小鼠心肌组织损伤及细胞凋亡的影响,试验选用40只5周龄C57BL/6小鼠,随机分为4组(对照组饮用去离子水,低、中、高剂量砷暴露组分别饮用含0.15、1.50、15.00 mg/L三氧化二砷的去离子水),90 d后检测各组心脏脏器系数、血清心肌酶谱活力、心肌细胞凋亡率及凋亡通路相关基因的表达。结果表明,不同浓度砷暴露组的心脏脏器系数均有所下降,其中,中、高剂量组与对照组相比差异显著;与对照组相比,中、高剂量组血清肌酸激酶(CK)、谷草转氨酶(AST)、乳酸脱氢酶(LDH)、α-羟基丁酸脱氢酶(HBDH)活力显著升高,低剂量组各项指标变化不明显。TUNEL法检测显示,对照组中未发现有凋亡心肌细胞,各剂量砷暴露组心内膜和心外膜下均可见不同数量的凋亡心肌细胞分布。与对照组相比,心肌组织Bax的表达在中、高剂量组显著上调;Bcl-2的表达在中、高剂量组显著下调;Caspase-3的表达在高剂量组显著上调。亚慢性砷暴露对小鼠心肌造成特异性损伤,且随着染毒剂量的增加损伤程度加重;诱导心肌细胞凋亡是砷暴露致心脏毒性的重要机制。
关键词
砷暴露
心肌
细胞凋亡
损伤
Keywords
arsenic exposure
myocardium
apoptosis
injure
分类号
Q95-3 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
基于GEO数据库筛选胃癌分子标志物
被引量:
1
8
作者
胡鑫
高悦
田欣涓
韩明
盛
李瑞华
付西峰
马艳琴
机构
山西农业大学生命科学学院
中国药科大学药学院
山西白求恩医院普通外科
出处
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第8期903-910,共8页
基金
山西省自然科学基金资助项目(No.201901D111412,201901D111232)
山西省研究生教育创新项目资助(No.2020SY197)。
文摘
目的:运用生物信息学方法结合基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)筛选参与胃癌发生发展的关键基因,以获得用于胃癌诊断、治疗靶标选择及预后判断相关分子标志物。方法:从GEO数据库中下载与胃癌(gastric cancer,GC)相关芯片数据集,筛选差异表达基因(differentially expressed gene,DEG),对DEG做功能富集分析,构建蛋白互作网络(proteinprotein interaction network,PPI),筛选关键基因(key gene),进而构建共表达网络、生存曲线以及层次聚类分析。结果:共筛选出261个GC相关DEG,通过分析获得14个关键基因,分别为PLOD1、PLOD3、COL1A1、COL1A2、COL2A1、COL3A1、COL4A1、COL4A2、COL8A1、COL12A1、COL15A1、ITGA2、LUM、SERPINH1。关键基因主要参与胶原纤维的组织、细胞外基质的组织、细胞外结构的组织、皮肤形态发生、胶原的合成及血管的发育等生物学过程。生存曲线分析表明,基因COL3A1(P=0.0241)表达的改变显著降低了胃癌患者整体生存率;基因ITGA2(P=0.0679)的表达改变也显示与GC患者的无病生存率降低有关。与正常胃组织相比,层次聚类分析表明,GC组织中基因PLOD1、PLOD3、COL3A1、ITGA2、COL1A2、COL1A1、COL4A1、LUM、COL12A1、SERPINH1、COL8A1表达上调。结论:经筛选获得的关键基因可作为潜在分子标志物用于GC的早期诊断、治疗靶点选择和预后判断,并为后续的研究提供参考。
关键词
胃癌
分子标志物
GEO数据库
差异表达基因
Keywords
gastric cancer
molecular marker
Gene Expression Omnibus(GEO)database
differentially expressed gene
分类号
R735.2 [医药卫生—肿瘤]
R730 [医药卫生—临床医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
具有独立轮轻轨列车的脱轨问题及轮缘侧面磨耗研究
沈钢
王浩川
韩明
盛
《铁道学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2006
11
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职称材料
2
砷暴露诱导小鼠心肌细胞程序性坏死作用初探
李瑞华
原晓红
韩明
盛
胡鑫
李雪华
马艳琴
《中华地方病学杂志》
CAS
北大核心
2023
0
原文传递
3
基于转录组测序分析砷暴露影响小鼠认知功能的机制
原晓红
胡鑫
杨鸣宇
韩明
盛
马艳琴
《生态毒理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
4
三阴性乳腺癌相关miRNA筛选及其靶基因的生物信息学分析
胡鑫
麻慧慈
韩明
盛
原晓红
杨鸣宇
马艳琴
《生物技术进展》
2022
2
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职称材料
5
胚胎期砷暴露对成年小鼠海马神经炎症反应的影响
李瑞华
韩明
盛
李雪华
马艳琴
《山西医药杂志》
CAS
2019
2
下载PDF
职称材料
6
基于GEO数据库筛选乳腺癌分子标志物
韩明
盛
麻慧慈
胡鑫
李瑞华
李冬
马艳琴
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020
2
下载PDF
职称材料
7
亚慢性砷暴露对小鼠心肌细胞凋亡的影响
李瑞华
韩明
盛
胡鑫
马艳琴
《山西农业科学》
2020
1
下载PDF
职称材料
8
基于GEO数据库筛选胃癌分子标志物
胡鑫
高悦
田欣涓
韩明
盛
李瑞华
付西峰
马艳琴
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020
1
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职称材料
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